基因页:B3GNT6
概括?
基因 | 192134 |
象征 | B3GNT6 |
同义词 | B3GN-T6 | BGNT-6 | beta-1,3-gn-t6 | beta3gn-t6 |
描述 | UDP-GLCNAC:β-1,3-N-乙酰葡萄糖氨基转移酶6 |
参考 | MIM:615315|HGNC:HGNC:24141|ENSEMBL:ENSG00000198488|HPRD:16534|Vega:Otthumg00000181633 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13.4 |
Pascal P值 | 0.182 |
Sherlock P值 | 0.664 |
胎儿β | -0.158 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Ambalavanan_2016 | 整个外显子组测序 | 该数据集包括在17个cos概率中检测到的20个从头突变。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
B3GNT6 | Chr11 | 76751147 | C | G | NM_138706 | p。(ASP184GLU) | 非单词snv | 0.998 | 儿童期精神分裂症 | DNM:Ambalavanan_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/B3GNT6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg o glycan生物合成 | 30 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组o粘蛋白的糖基化 | 59 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌11q12 Q14 Amplicon | 158 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI葡萄糖剥夺 | 60 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |