基因页：EFNA1

Summary？
基因ID 1942年
Symbol EFNA1
同义词 b61 | ecklg | efl1 | eplg1 | lerk-1 | lerk1 | tnfaip4
描述 ephrin-a1
参考 MIM：191164|HGNC：HGNC：3221|ENSEMBL：ENSG00000169242|HPRD:01858|Vega：Otthumg0000000035312
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q21-Q22
Sherlock P值 0.385
胎儿β -0.786
主持人 小脑半球
小脑

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00814
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SEL1L 0.95 0.96
CPEB4 0.94 0.95
KIAA1219 0.94 0.96
ATRN 0.93 0.95
PDE12 0.92 0.94
陶克1 0.92 0.94
ABHD2 0.92 0.94
阿达 0.92 0.94
PDPK1 0.92 0.95
exoc6b 0.92 0.94
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
higd1b -0.66 -0.73
AF347015.31 -0.66 -0.71
FXYD1 -0.65 -0.70
MT-CO2 -0.65 -0.71
AF347015.21 -0.64 -0.73
C1orf54 -0.63 -0.77
S100A16 -0.63 -0.68
ifi27 -0.63 -0.69
CST3 -0.62 -0.68
CXCL14 -0.62 -0.68

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0046875 肾上腺素受体结合 塔斯 2233719
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 8660976
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005886 质膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 8660976
GO：0031225 锚定在膜上 IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID HIF2Pathway 34 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID ARF6途径 35 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Epha FWDPathway 34 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID Ecadherin稳定途径 42 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID EPHA2 FWD途径 19 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
家长mtor信号向上 567 375 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Senese HDAC3靶向 501 327 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 All SZGR 2.0 genes in this pathway
EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 329 219 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 All SZGR 2.0 genes in this pathway
林格伦膀胱癌集群1 DN 378 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过小径dn 186 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dauer Stat3靶向 49 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
patil肝癌 747 453 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 UP 309 199 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath PRC2目标 652 441 All SZGR 2.0 genes in this pathway
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nikolsky乳腺癌1Q21 AMPLICON 38 18 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Onder CDH1目标2 DN 464 276 All SZGR 2.0 genes in this pathway
通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 83 58 All SZGR 2.0 genes in this pathway
羔羊CCND1靶标 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Frasor对雌二醇DN的反应 82 52 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Osawa TNF目标 10 6 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伦纳德缺氧 47 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON UP 77 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bochkis foxa2目标 425 261 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
mirlet7a3的Brueckner目标 111 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
冬季缺氧metagene 242 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MIZUKAMI HYPOXIA UP 12 12 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
米利假足型haptotaxis dn 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G12 UP 39 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染12小时DN 33 25 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染24小时DN 43 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染32小时DN 39 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DORN腺病毒感染48小时DN 40 29 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇6的时间反应6 75 48 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP 104 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Qi缺氧 140 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 6HR DN 91 56 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DUTERTRE ESTRADIOL RESPONSE 24HR DN 505 328 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 88 61 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 82 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
FEVR CTNNB1靶向 682 433 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DELACROIX RARG BOUND MEF 367 231 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Delacroix Rar Bound ES 462 273 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向 279 155 All SZGR 2.0 genes in this pathway
phong tnf响应不是通过p38 337 236 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
MiR-200BC/429 152 159 1A，M8 hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-223 400 406 M8 hsa-miR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-485-5p 136 143 1A，M8 hsa-miR-485-5p aggcuggccgugaugauuc
mir-9 273 279 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga