基因页:megf8
概括?
基因 | 1954年 |
象征 | megf8 |
同义词 | c19orf49 | crpt2 | egfl4 | sbp1 |
描述 | 多个EGF类似域8 |
参考 | MIM:604267|HGNC:HGNC:3233|ENSEMBL:ENSG00000105429|HPRD:10370|Vega:Otthumg00000150342 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q12 |
Pascal P值 | 0.03 |
Sherlock P值 | 0.789 |
胎儿β | -0.388 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG00712136 | 19 | 42829564 | megf8 | 1.26E-8 | -0.022 | 5.1E-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/MEGF8_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ERCC3 | 0.93 | 0.93 |
KIAA0406 | 0.92 | 0.92 |
KIAA0174 | 0.92 | 0.91 |
RNPS1 | 0.91 | 0.92 |
smyd5 | 0.91 | 0.92 |
prPSAP1 | 0.91 | 0.92 |
WDR5 | 0.91 | 0.91 |
TBP | 0.91 | 0.91 |
Qrich1 | 0.91 | 0.92 |
BRD8 | 0.91 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.84 | -0.87 |
MT-CO2 | -0.83 | -0.86 |
AF347015.27 | -0.83 | -0.86 |
AF347015.8 | -0.81 | -0.86 |
mt-cyb | -0.81 | -0.84 |
AF347015.33 | -0.79 | -0.82 |
AF347015.21 | -0.79 | -0.88 |
AF347015.15 | -0.78 | -0.84 |
AF347015.2 | -0.77 | -0.83 |
ifi27 | -0.75 | -0.80 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤经典 | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA分泌因素 | 344 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |