概括
基因 1954年
象征 megf8
同义词 c19orf49 | crpt2 | egfl4 | sbp1
描述 多个EGF类似域8
参考 MIM:604267|HGNC:HGNC:3233|ENSEMBL:ENSG00000105429|HPRD:10370|Vega:Otthumg00000150342
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q12
Pascal P值 0.03
Sherlock P值 0.789
胎儿β -0.388
DMG 1(#研究)
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG00712136 19 42829564 megf8 1.26E-8 -0.022 5.1E-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ERCC3 0.93 0.93
KIAA0406 0.92 0.92
KIAA0174 0.92 0.91
RNPS1 0.91 0.92
smyd5 0.91 0.92
prPSAP1 0.91 0.92
WDR5 0.91 0.91
TBP 0.91 0.91
Qrich1 0.91 0.92
BRD8 0.91 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.84 -0.87
MT-CO2 -0.83 -0.86
AF347015.27 -0.83 -0.86
AF347015.8 -0.81 -0.86
mt-cyb -0.81 -0.84
AF347015.33 -0.79 -0.82
AF347015.21 -0.79 -0.88
AF347015.15 -0.78 -0.84
AF347015.2 -0.77 -0.83
ifi27 -0.75 -0.80

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时DN 178 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤经典 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA分泌因素 344 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因