基因页:egfr
概括?
基因 | 1956年 |
Symbol | egfr |
Synonyms | erbb | erbb1 | her1 | nisbd2 | pig61 | mena |
Description | 表皮生长因子受体 |
Reference | MIM:131550|HGNC:HGNC:3236|ENSEMBL:ENSG00000146648|HPRD:00579|Vega:Otthumg0000000023661 |
Gene type | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p12 |
Pascal p-value | 0.251 |
胎儿β | -0.918 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
CV:PGCnp | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
PMID:cooccur | High-throughput literature-search | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | A combined odds ratio method (Sun et al. 2008), association studies | 1 | 链接到Szgene |
Literature | High-throughput literature-search | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:2.8135 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | Position | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg20706768 | 7 | 55225183 | egfr | 4.973E-4 | 0.384 | 0.047 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EGFR_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
前10个积极共表达的基因 | ||
Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
NOTCH3 | 0.71 | 0.68 |
SYDE1 | 0.70 | 0.69 |
APLN | 0.69 | 0.62 |
FGFR3 | 0.68 | 0.52 |
NFKB2 | 0.68 | 0.67 |
CASKIN2 | 0.68 | 0.65 |
AC020763.2 | 0.68 | 0.68 |
inppl1 | 0.67 | 0.65 |
SLC2A1 | 0.67 | 0.65 |
PLXNB1 | 0.65 | 0.61 |
Top 10 negatively co-expressed genes | ||
Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
TMEM70 | -0.47 | -0.48 |
THOC7 | -0.47 | -0.52 |
ZCCHC17 | -0.44 | -0.47 |
GLMN | -0.44 | -0.48 |
AP4S1 | -0.44 | -0.48 |
C8orf38 | -0.44 | -0.46 |
BEX5 | -0.44 | -0.47 |
TCEAL7 | -0.42 | -0.49 |
C2ORF80 | -0.42 | -0.44 |
MTIF3 | -0.42 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
GO:0005006 | 表皮生长因子受体活性 | 艾达 | 12435727 | |
GO:0005006 | 表皮生长因子受体活性 | NAS | 2790960|6325948 | |
去:0004888 | transmembrane receptor activity | 艾达 | 7736574 | |
去:0003690 | 双链DNA结合 | NAS | 6325948 | |
GO:0030235 | 一氧化物合酶调节剂活性 | 艾达 | 12828935 | |
GO:0004710 | 地图/ERK激酶激酶活性 | NAS | 15542601 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
去:0051015 | actin filament binding | 艾达 | 14702346 | |
GO:0042802 | 相同的蛋白质结合 | IPI | 16777603 | |
GO:0046982 | protein heterodimerization activity | 艾达 | 10572067 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001503 | 骨化 | NAS | 12925580 | |
GO:0007202 | activation of phospholipase C activity | 塔斯 | 12435727 | |
GO:0007173 | 表皮生长因子受体signaling pathway | 艾达 | 12435727 | |
去:0006950 | 对压力的反应 | NAS | 12828935 | |
GO:0007166 | cell surface receptor linked signal transduction | 艾达 | 7736574 | |
GO:0016337 | cell-cell adhesion | 小鬼 | 12435727 | |
GO:0042327 | positive regulation of phosphorylation | 艾达 | 15082764 | |
去:0050999 | regulation of nitric-oxide synthase activity | 艾达 | 12828935 | |
GO:0051205 | protein insertion into membrane | 塔斯 | 12435727 | |
去:0030335 | 细胞迁移的阳性调节 | 小鬼 | 12435727 | |
GO:0043406 | MAP激酶活性的阳性调节 | 艾达 | 10572067 | |
GO:0043006 | calcium-dependent phospholipase A2 activation | 塔斯 | 12435727 | |
去:0050679 | positive regulation of epithelial cell proliferation | 艾达 | 10572067 | |
去:0050730 | 调节肽基 - 酪氨酸磷酸化 | 小鬼 | 12435727 | |
GO:0045786 | 细胞周期的负调控 | IEA | - | |
GO:0046777 | 蛋白氨基酸自磷酸化 | IEA | - | |
GO:0045429 | 一氧化氮生物合成过程的阳性调节 | 艾达 | 12828935 | |
Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | extracellular space | NAS | 9103388 | |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | nucleus | 艾达 | 12828935 | |
去:0005737 | cytoplasm | 艾达 | 12435727 | |
去:0005768 | 内体 | 艾达 | 14702346 | |
去:0005783 | 内质网 | 艾达 | 18029348 | |
GO:0030122 | AP-2适配器复合物 | 塔斯 | 14702346 | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | EXP | 8493579|8639530|8845374 |9356464|9544989 |10567358|10648629 |10734310|10913131 |11823423|11894095 |122181 |
|
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 15465819 | |
GO:0016323 | 基底外侧质膜 | IEA | - | |
GO:0030139 | endocytic vesicle | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | Aliases B | Official full name B | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
AMH | Mif |错误 | 抗毛刺激素 | - | HPRD | 8596488 |
ar | AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM | 雄激素受体 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Co-localization |
Biogrid | 15288768|15305378 |
AREG | ar |crdgf |MGC13647 |SDGF | 两次凝聚蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 10085134 |
ARF4 | ARF2 | ADP-ribosylation factor 4 | - | HPRD,Biogrid | 12446727 |
ATP5C1 | ATP5C | ATP5CL1 | ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, gamma polypeptide 1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
BTC | - | betacellulin | - | HPRD | 9528863 |
平静1 | Calml2 |CAMI |DD132 |PHKD | calmodulin 1 (phosphorylase kinase, delta) | egfrinteracts with calmodulin | 绑定 | 14960328 |
CAMLG | CAML |MGC163197 | calcium modulating ligand | - | HPRD,Biogrid | 12919676 |
CASP1 | 冰|IL1BC |P45 | caspase 1,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶(白介素1,β,转化酶) | - | HPRD,Biogrid | 11226410 |
CAV1 | cav |MSTP085 |VIP21 | 小窝蛋白1,小窝蛋白,22KDA | - | HPRD,Biogrid | 9374534 |
cav3 | lgmd1c |LQT9 |MGC126100 |MGC126101 |MGC126129 |VIP-21 |VIP21 | 小窝林3 | - | HPRD,Biogrid | 9374534 |
CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10086340|12061819 |
CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | - | HPRD | 8662998 |
CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | 表皮生长因子受体与CBL的未指明的同种型。 | 绑定 | 15735736 |
CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | c-Cbl ubiquitinates an unspecified isoform of EGFR. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between c-Cbl and EGFR, both from an unspecified species. | 绑定 | 12234920 |
CBLB | DKFZp686J10223 | DKFZp779A0729 | DKFZp779F1443 | FLJ36865 | FLJ41152 | Nbla00127 | RNF56 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列B | - | HPRD,Biogrid | 10086340 |
CBLC | CBL-3 |CBL-SL |RNF57 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列C | - | HPRD,Biogrid | 10362357 |
CCND1 | BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 | cyclin D1 | EGFR的未指定同工型与细胞周期蛋白D1启动子结合。 | 绑定 | 15950906 |
CD44 | CDW44 |CSPG8 |ECMR-III |hcell |在|lhr |MC56 |mdu2 |mdu3 |MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 | CD44分子(印度血型) | CD44与EGFR相互作用。 | 绑定 | 12093135 |
CD44 | CDW44 |CSPG8 |ECMR-III |hcell |在|lhr |MC56 |mdu2 |mdu3 |MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 | CD44分子(印度血型) | - | HPRD,Biogrid | 12093135 |
CD82 | 4f9 |C33 |Gr15 |IA4 |kai1 |R2 |SAR2 |ST6 |TSPAN27 | CD82分子 | - | HPRD,Biogrid | 10985391 |
cdc25a | CDC25A2 | 细胞分裂周期25同源物A(S. Pombe) | - | HPRD,Biogrid | 11912208 |
CDH1 | Arc-1 | CD324 | CDHE | ECAD | LCAM | UVO | cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) | egfrinteracts with E-cadherin | 绑定 | 14681060 |
CDH1 | Arc-1 | CD324 | CDHE | ECAD | LCAM | UVO | cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) | - | HPRD,Biogrid | 10969083 |
CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β | - | HPRD,Biogrid | 12095417 |
CRK | crkii | v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian) | - | HPRD,Biogrid | 9642287 |
CSK | MGC117393 | C-SRC酪氨酸激酶 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16729043 |
CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA | - | HPRD,Biogrid | 9233779 |
CTNND1 | cas |ctnnd |KIAA0384 |P120CAS |P120CTN |P120 | Catenin(钙粘蛋白相关蛋白),三角洲1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9535896 |
DCN | CSCD | DSPG2 | PG40 | PGII | PGS2 | SLRR1B | 装饰 | - | HPRD,Biogrid | 9988678|12105206 |
DEGS1 | DEGS |des1 |DES-1 |FADS7 |MGC5079 |Mig15 |MLD | degenerative spermatocyte homolog 1, lipid desaturase (Drosophila) | - | HPRD | 9188692 |
DOK2 | p56DOK | p56dok-2 | docking protein 2, 56kDa | - | HPRD,Biogrid | 10508618 |
dusp3 | VHR | 双重特异性磷酸酶3 | 生化活动 | Biogrid | 1281549 |
EGF | HOMG4 | URG | 表皮生长因子(β-尿肿) | - | HPRD | 10788520|12093292 |12620237 | 12093292 |
EGF | HOMG4 | URG | 表皮生长因子(β-尿肿) | EGF与EGFR相互作用。 | 绑定 | 15837620 |
EGF | HOMG4 | URG | 表皮生长因子(β-尿肿) | - | HPRD,Biogrid | 12093292 |
EGF | HOMG4 | URG | 表皮生长因子(β-尿肿) | egfrinteracts with EGF. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between EGFR from human and EGF from mouse. | 绑定 | 8413296 |
EGF | HOMG4 | URG | 表皮生长因子(β-尿肿) | EGFR的未指定同工型与EGF相互作用。 | 绑定 | 15950906 |
egfr | 嗯BB | ERBB1 | HER1 | PIG61 | mENA | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | egfrinteracts with EGFR. | 绑定 | 15284455 |
egfr | 嗯BB | ERBB1 | HER1 | PIG61 | mENA | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14576349 |
eppk1 | EPIPL | EPIPL1 | Epiplakin 1 | - | HPRD | 12577067 |
EPS15 | AF-1P | AF1P | MLLT5 | 表皮生长因子受体途径底物15 | - | HPRD,Biogrid | 9049247 |
EPS8 | - | 表皮生长因子受体途径底物8 | - | HPRD | 7532293|12127568 |
嗯BB2 | CD340 | HER-2 | HER-2/neu | HER2 | NEU | NGL | TKR1 | v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) | - | HPRD | 11500850 |
嗯BB2 | CD340 | HER-2 | HER-2/neu | HER2 | NEU | NGL | TKR1 | v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) | EGFR与ERBB2相互作用。 | 绑定 | 15652750 |
嗯BB3 | ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 | v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 3 (avian) | - | HPRD,Biogrid | 10527633 |
EREG | 嗯 | 上环蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 9419975 |
ESR1 | DKFZp686N23123 | ER | ESR | ESRA | Era | NR3A1 | estrogen receptor 1 | - | HPRD,Biogrid | 11887937 |
FER | TYK3 | FER(FPS/FES相关)酪氨酸激酶 | - | HPRD,Biogrid | 7623846 |
fos | AP-1 |c-fos | v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog | An unspecified isoform of EGFR binds to c-fos promoter. | 绑定 | 15950906 |
GAB1 | - | GRB2-associated binding protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 11432805 |
GNAI2 | GIP |gnai2b |H_LUCA15.1 |H_LUCA16.1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),α抑制活性多肽2 | - | HPRD | 11286993 |
GRB10 | grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS | growth factor receptor-bound protein 10 | GRB10与EGFR相互作用。 | 绑定 | 9506989 |
GRB10 | grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS | growth factor receptor-bound protein 10 | - | HPRD,Biogrid | 9006901|9506989 |
GRB14 | - | growth factor receptor-bound protein 14 | - | HPRD,Biogrid | 8647858 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | GRB2互动s with an unspecified isoform of EGFR. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human GRB2, and rat EGFR. | 绑定 | 15782189 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | - | HPRD | 1322798|7527043 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | EGFR与GRB2相互作用。 | 绑定 | 8305738 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 1322798|7510700 |7527043|8647858 |9050991|10026169 |10085134|11960376 |12577067|16729043 |
GRB7 | - | growth factor receptor-bound protein 7 | - | HPRD | 9710451 |
HBEGF | DTR | DTS | DTSF | HEGFL | 肝素结合EGF样生长因子 | - | HPRD,Biogrid | 12725245 |
HSP90AA1 | FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 | heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class A member 1 | EGFR与HSP90相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人类HSP90的EGFR之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 12471035 |
htt | 高清|IT15 | 亨廷顿 | - | HPRD,Biogrid | 9079622 |
IGF1R | CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 | 胰岛素样生长因子1受体 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 17047074 |
inppl1 | Ship2 | 肌醇聚磷酸磷酸酶样1 | - | HPRD,Biogrid | 11349134 |
itga5 | CD49E |fnra |VLA5A | 整合素,α5(纤连蛋白受体,α多肽) | - | HPRD | 10888683 |
JAK2 | JTK10 | Janus激酶2(蛋白酪氨酸激酶) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10358079 |
JUP | ARVD12 |ctnng |dp3 |dpiii |PDGB |PKGB | junction plakoglobin | 重构的复合物 | Biogrid | 9535896 |
KRT17 | K17 |PC |PC2 |PCHC1 | keratin 17 | - | HPRD | 12577067 |
KRT18 | CYK18 | K18 | keratin 18 | - | HPRD | 12577067 |
KRT7 | CK7 | K2C7 | K7 | MGC129731 | MGC3625 | SCL | 角蛋白7 | - | HPRD | 12577067 |
KRT8 | 卡2 |CK8 |cyk8 |K2C8 |K8 |ko | 角蛋白8 | - | HPRD | 12577067 |
LRSAM1 | FLJ31641 |步枪|塔尔 | leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15256501 |
MAP3K14 | ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 | mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 | - | HPRD,Biogrid | 11116146 |
MAP4K1 | HPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 9346925 |
MAPK14 | CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA | 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 | 生化活动 | Biogrid | 7535770 |
MUC1 | CD227 |EMA |H23AG |mam6 |Pem |Pemt |棕榈 | 粘蛋白1,细胞表面相关 | - | HPRD,Biogrid | 11278868|11483589 |
MUC1 | CD227 |EMA |H23AG |mam6 |Pem |Pemt |棕榈 | 粘蛋白1,细胞表面相关 | MUC1 interacts with and is tyrosine-phosphorylated by EGFR. | 绑定 | 11483589 |
NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9362449 |
NCK2 | grb4 |NCKBETA | NCK适配器蛋白2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 9737977|10026169 |
NCK2 | grb4 |NCKBETA | NCK适配器蛋白2 | - | HPRD | 1333047|9737977 |
NRG1 | arIA | GGF | GGF2 | HGL | HRG | HRG1 | HRGA | NDF | SMDF | 神经结合蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7730382 |
NRG1 | arIA | GGF | GGF2 | HGL | HRG | HRG1 | HRGA | NDF | SMDF | 神经结合蛋白1 | - | HPRD | 8702572 |
PAK1 | MGC130000 |MGC130001 |pakalpha | P21蛋白(CDC42/RAC)激活激酶1 | Tyrosine-phosphorylated EGFR interacts with PAK1. | 绑定 | 12522133 |
PDGFRB | CD140B | JTK12 | PDGF-R-beta | PDGFR | PDGFR1 | 血小板衍生的生长因子受体,β多肽 | - | HPRD,Biogrid | 9506992 |
PIK3C2B | C2-PI3K | DKFZp686G16234 | 磷酸肌醇-3-激酶,2类,β多肽 | - | HPRD,Biogrid | 11533253 |
PIK3R1 | GRB1 | p85 | p85-ALPHA | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | - | HPRD | 8662998 |
PIK3R1 | GRB1 | p85 | p85-ALPHA | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | egfrinteracts with p85. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human EGFR and bovine p85. | 绑定 | 1372092 |
PIK3R2 | P85B |P85 |p85-beta | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基2(beta) | Tyrosine phosphorlyated EGFR interacts with p85-beta. | 绑定 | 11172806 |
PITPNA | MGC99649 |pitpn |vib1a | 磷脂酰肌醇转移蛋白,α | - | HPRD,Biogrid | 7761838 |
PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | - | HPRD,Biogrid | 9207933 |
PLCG1 | PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | EGFR与PLC-GAMMA相互作用。这种相互作用是在人类EGFR和牛PLC-gamma之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 2173144|2176151 |
PLD2 | - | 磷脂酶D2 | - | HPRD,Biogrid | 9837959 |
PLD2 | - | 磷脂酶D2 | EGFR与PLD1相互作用。这种相互作用是在人EGFR和小鼠PLD2之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 9837959 |
PLEC1 | EBS1 |EBSO |HD1 |PCN |PLEC1B |PLTN | PLECTIN 1,中间丝结合蛋白500KDA | - | HPRD | 12577067 |
PLSCR1 | mmtra1b | phospholipid scramblase 1 | - | HPRD,Biogrid | 12009895 |
PLSCR1 | mmtra1b | phospholipid scramblase 1 | - | HPRD | 12009895|12871937 |
Prkaca | MGC102831 |MGC48865 |pkaca | 蛋白激酶,cAMP依赖性,催化,α | - | HPRD,Biogrid | 9050991 |
prkar1a | CAR | CNC | CNC1 | DKFZp779L0468 | MGC17251 | PKR1 | PPNAD1 | PRKAR1 | TSE1 | 蛋白激酶,cAMP依赖性,调节性,I型,α(组织特异性灭火器1) | - | HPRD,Biogrid | 9050991 |
prkca | AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca | protein kinase C, alpha | - | HPRD,Biogrid | 12878187 |
PTK2 | FADK | FAK | FAK1 | pp125FAK | PTK2protein tyrosine kinase 2 | - | HPRD,Biogrid | 10806474 |
ptk2b | CADTK | CAKB | FADK2 | FAK2 | FRNK | PKB | PTK | PYK2 | RAFTK | PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β | - | HPRD,Biogrid | 10777553 |
PTK6 | BRK |FLJ42088 | PTK6protein tyrosine kinase 6 | - | HPRD,Biogrid | 8940083 |
PTPN1 | PTP1B | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1 | - | HPRD,Biogrid | 7540771|8621392 |10889023|12573287 |
PTPN11 | BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 | - | HPRD,Biogrid | 7673163 |
PTPN6 | HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 | - | HPRD,Biogrid | 9733788 |
ptprj | CD148 |dep1 |hptpeta |R-PTP-ETA |SCC1 | 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,J | - | HPRD | 9115287 |
RASA1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 | 重构的复合物 | Biogrid | 8647858 |
RASA1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 | GAP interacts with EGFR. | 绑定 | 1385407|1850098 |2176151 |
RASA1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 | - | HPRD | 1633149 |
RGS16 | A28-RGS14 | A28-RGS14P | RGS-R | G蛋白信号的调节剂16 | - | HPRD,Biogrid | 11602604 |
RIPK1 | FLJ39204 | RIP | RIP1 | 受体(TNFRSF) - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 11116146 |
ROS1 | MCF3 |罗斯|C-ROS-1 | C-ROS癌基1,受体酪氨酸激酶 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11094073 |
SGSM2 | KIAA0397 |rutbc1 | 小G蛋白信号调节器2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SH2D3A | NSP1 | 含3A的SH2域 | - | HPRD,Biogrid | 10187783 |
SH3BGRL | MGC117402 | SH3BGR | SH3结构域结合富含谷氨酸的蛋白 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 16729043 |
SH3KBP1 | CIN85 | GIG10 | MIG18 | SH3-domain kinase binding protein 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11894095|12177062 |
SHC1 | FLJ26504 | SHC | SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | SHC与激活的EGFR相互作用。 | 绑定 | 1623525 |
SHC1 | FLJ26504 | SHC | SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | ShcA interacts with EGFR. | 绑定 | 8610109 |
SHC1 | FLJ26504 | SHC | SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | ShcA interacts with the EGFR. | 绑定 | 8577769|8610109 |8943228 |
SHC1 | FLJ26504 | SHC | SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 9544989 |
SHC1 | FLJ26504 | SHC | SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | EGF-R与SHC相互作用。这种相互作用是在人类EGF-R和小鼠SHC之间证明的相互作用上建模的。 | 绑定 | 8887653 |
SHC3 | N-SHC |NSHC |Rai |shcc | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白3 | - | HPRD,Biogrid | 9507002 |
SNRPD2 | SMD2 |SNRPD1 | 小核核糖核蛋白D2多肽16.5KDA | - | HPRD | 12577067 |
SNX1 | HST17379 |MGC8664 |SNX1A |VPS5 | 排序Nexin 1 | - | HPRD,Biogrid | 8638121|9819414 |
SNX2 | MGC5204 |TRG-9 | 排序Nexin 2 | - | HPRD,Biogrid | 9819414 |
SNX4 | - | 排序Nexin 4 | - | HPRD,Biogrid | 9819414 |
SNX6 | MGC3157 | MSTP010 | TFAF2 | 排序Nexin 6 | - | HPRD,Biogrid | 11279102 |
SOCS1 | 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 | 抑制细胞因子信号传导1 | - | HPRD,Biogrid | 12070153 |
SOCS3 | atod4 |顺式3 |cish3 |MGC71791 |SOCS-3 |SSI-3 |SSI3 | 抑制细胞因子信号传导3 | - | HPRD,Biogrid | 12070153 |
SOS1 | GF1 |GGF1 |gingf |HGF |NS4 | son of sevenless homolog 1 (Drosophila) | - | HPRD,Biogrid | 9447973 |
SOS2 | FLJ25596 | son of sevenless homolog 2 (Drosophila) | - | HPRD,Biogrid | 10675333 |
src | ASV | SRC1 | c-SRC | p60-Src | V-SRC肉瘤(Schmidt-Ruppin A-2)病毒癌基因同源物(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 10971656 |
Stat1 | DKFZP686B04100 |ISGF-3 |Stat91 | signal transducer and activator of transcription 1, 91kDa | - | HPRD,Biogrid | 12070153 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10358079|15485908 |
Stat3 | APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 | 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) | 酪氨酸颗粒化的EGFR与STAT3相互作用。 | 绑定 | 12873986 |
Stat5a | MGF | STAT5 | signal transducer and activator of transcription 5A | - | HPRD,Biogrid | 10358079 |
Stat5b | Stat5 | signal transducer and activator of transcription 5B | - | HPRD,Biogrid | 10558875 |
TGFA | TFGA | transforming growth factor, alpha | - | HPRD,Biogrid | 12297049 |
TJP1 | DKFZP686M05161 |MGC133289 |zo-1 | tight junction protein 1 (zona occludens 1) | - | HPRD,Biogrid | 12708492 |
TNC | HXB | MGC167029 | TN | Tenascin c | - | HPRD | 11470832 |
TNK2 | ACK | ACK1 | FLJ44758 | FLJ45547 | p21cdc42Hs | 酪氨酸激酶,非受体,2 | - | HPRD | 8497321|8647288 |
VAV1 | VAV | VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 | - | HPRD,Biogrid | 10938113 |
VAV2 | - | vav 2 guanine nucleotide exchange factor | 酪氨酸磷酸化的EGFR与VAV2相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 12454019 |
VAV2 | - | vav 2 guanine nucleotide exchange factor | - | HPRD,Biogrid | 10618391|10938113 |
VAV3 | FLJ40431 | vav 3 guanine nucleotide exchange factor | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10938113 |
VAV3 | FLJ40431 | vav 3 guanine nucleotide exchange factor | - | HPRD | 11094073 |
WAS | IMD2 |THC |黄蜂 | Wiskott-Aldrich综合征(湿疹 - 肉毒细胞减少症) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9307968 |
XPO6 | EXP6 |FLJ22519 |KIAA0370 |RANBP20 | 导出6 | - | HPRD | 14592989 |
XRCC6 | CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA | X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 | - | HPRD | 9430697 |
ywhaz | KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,Zeta多肽 | EGFR与14-3-3-zeta相互作用。 | 绑定 | 15225635 |
ZNF259 | MGC110983 |ZPR1 | zinc finger protein 259 | - | HPRD | 8650580|10938113|10938113 |
ZNF259 | MGC110983 |ZPR1 | zinc finger protein 259 | - | HPRD | 10938113 |
V.途径注释
Pathway name | 路径大小 | # SZGR 2.0 genes in pathway | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ERBB SIGNALING PATHWAY | 87 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg dorso腹轴形成 | 25 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG ADHERENS JUNCTION | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
幽门螺杆菌感染中的KEGG上皮细胞信号传导 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg胰腺癌 | 70 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg神经胶质瘤 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG前列腺癌 | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG MELANOMA | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg膀胱癌 | 42 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG非小细胞肺癌 | 54 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA AGR PATHWAY | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta AT1R途径 | 36 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CBL途径 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta EGF途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ERK途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物质体角质形成细胞途径 | 46 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta EGFR Smrte途径 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta McAlpain途径 | 25 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Cardiacegf途径 | 18 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BIOCARTA HER2 PATHWAY | 22 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Spry途径 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Tel Pathway | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta TFF途径 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST G ALPHA I PATHWAY | 35 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ST ADRENERGIC | 36 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID溶物磷脂途径 | 66 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ARF6途径 | 35 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCPTP途径 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TXA2PATHWAY | 57 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SHP2途径 | 58 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID端粒酶途径 | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1受体近端途径 | 35 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid ajdiss 2Pathway | 48 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P53 DOWNSTREAM PATHWAY | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1 DOWNSTREAM PATHWAY | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid upa upar途径 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Ecadherin角质形成细胞途径 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB网络途径 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1内部化途径 | 41 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Ecadherin稳定途径 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID A6B1 A6B4整合素途径 | 46 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Syndecan 3途径 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的Reactome信号传导 | 101 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNALING BY CONSTITUTIVELY ACTIVE EGFR | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GRB2 EVENTS IN ERBB2 SIGNALING | 22 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EGFR在癌症中的反应组信号传导 | 109 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2信号中的Reactome PI3K事件 | 44 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME EGFR DOWNREGULATION | 25 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GAB1信号体 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
egfr信号中的Reactome SHC1事件 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome L1CAM相互作用 | 86 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME SIGNAL TRANSDUCTION BY L1 | 34 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 DN | 48 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NOJIMA SFRP2 TARGETS DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAEGER METASTASIS DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAPASPYRIDONOS UNSTABLE ATEROSCLEROTIC PLAQUE DN | 43 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DMOG的Elvidge缺氧 | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge Hif1a靶向DN | 91 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARKEY RB1 CHRONIC LOF DN | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP | 185 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ozanne AP1靶向 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APPIERTO RESPONSE TO FENRETINIDE DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Breuhahn生长因子信号传导肝癌 | 22 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
铃木在口腔癌中放大 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
myllykangas放大热点29 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯尼德斯在头部和颈部肿瘤中放大 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Simbulan UV响应正常DN | 33 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Simbulan UV响应永生的DN | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hasina NOL7目标DN | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIU NASOPHARYNGEAL CARCINOMA | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LOCKWOOD AMPLIFIED IN LUNG CANCER | 214 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤DN | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BENPORATH EED TARGETS | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA | 164 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JEON SMAD6 TARGETS DN | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SUNG METASTASIS STROMA DN | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TCGA胶质母细胞瘤副本编号 | 75 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DING LUNG CANCER MUTATED SIGNIFICANTLY | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ONDER CDH1 TARGETS 1 UP | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER CIPROFIBRATE DN | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER MYC TGFA DN | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER ACOX1 DN | 65 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER MYC DN | 63 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌E2F1 DN | 64 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AFFAR YY1 TARGETS UP | 214 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血成熟细胞 | 293 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang Smarce1靶向DN | 371 | 218 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KAYO AGING MUSCLE DN | 123 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YIH对砷C4的反应 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiba对TSA DN的响应 | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯对trabectedin dn的反应 | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
su胎盘 | 30 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KYNG DNA DAMAGE BY 4NQO OR GAMMA RADIATION | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏 | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
koNDO EZH2 TARGETS | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhang GATA6靶向DN | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DE YY1 TARGETS DN | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BRAIN UP | 39 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
萧述三乳腺癌基底 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄达沙替尼的抵抗 | 81 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUIZ TNC TARGETS DN | 142 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 | 91 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP | 84 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HAN SATB1 TARGETS UP | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DING LUNG CANCER MUTATED RECURRENTLY | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TCGA GLIOBLASTOMA MUTATED | 8 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NIELSEN SCHWANNOMA DN | 18 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VERHAAK GLIOBLASTOMA CLASSICAL | 162 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向低血清 | 100 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
OHGUCHI LIVER HNF4A TARGETS DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
朱凯尔的目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
koINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 3 | 20 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 | 76 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu IL13启动模型 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38部分的phong TNF响应 | 160 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong tnf响应不是通过p38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟DN | 99 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FARMER BREAST CANCER CLUSTER 3 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | Target position | miRNA ID | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-128 | 200 | 206 | 1A | hsa-miR-128a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
hsa-miR-128b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
mir-27 | 200 | 207 | 1A,M8 | HSA-MIR-27Abrain | uucacaguggcuaaguuccgc |
HSA-MIR-27Bbrain | uucacaguggcuaaguucugc |