概括
基因 1956年
Symbol egfr
Synonyms erbb | erbb1 | her1 | nisbd2 | pig61 | mena
Description 表皮生长因子受体
Reference MIM:131550|HGNC:HGNC:3236|ENSEMBL:ENSG00000146648|HPRD:00579|Vega:Otthumg0000000023661
Gene type 蛋白质编码
地图位置 7p12
Pascal p-value 0.251
胎儿β -0.918
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 A combined odds ratio method (Sun et al. 2008), association studies 1 链接到Szgene
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:2.8135

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 Position 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
cg20706768 7 55225183 egfr 4.973E-4 0.384 0.047 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
NOTCH3 0.71 0.68
SYDE1 0.70 0.69
APLN 0.69 0.62
FGFR3 0.68 0.52
NFKB2 0.68 0.67
CASKIN2 0.68 0.65
AC020763.2 0.68 0.68
inppl1 0.67 0.65
SLC2A1 0.67 0.65
PLXNB1 0.65 0.61
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
TMEM70 -0.47 -0.48
THOC7 -0.47 -0.52
ZCCHC17 -0.44 -0.47
GLMN -0.44 -0.48
AP4S1 -0.44 -0.48
C8orf38 -0.44 -0.46
BEX5 -0.44 -0.47
TCEAL7 -0.42 -0.49
C2ORF80 -0.42 -0.44
MTIF3 -0.42 -0.48

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0005006 表皮生长因子受体活性 艾达 12435727
GO:0005006 表皮生长因子受体活性 NAS 2790960|6325948
去:0004888 transmembrane receptor activity 艾达 7736574
去:0003690 双链DNA结合 NAS 6325948
GO:0030235 一氧化物合酶调节剂活性 艾达 12828935
GO:0004710 地图/ERK激酶激酶活性 NAS 15542601
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
去:0051015 actin filament binding 艾达 14702346
GO:0042802 相同的蛋白质结合 IPI 16777603
GO:0046982 protein heterodimerization activity 艾达 10572067
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0001503 骨化 NAS 12925580
GO:0007202 activation of phospholipase C activity 塔斯 12435727
GO:0007173 表皮生长因子受体signaling pathway 艾达 12435727
去:0006950 对压力的反应 NAS 12828935
GO:0007166 cell surface receptor linked signal transduction 艾达 7736574
GO:0016337 cell-cell adhesion 小鬼 12435727
GO:0042327 positive regulation of phosphorylation 艾达 15082764
去:0050999 regulation of nitric-oxide synthase activity 艾达 12828935
GO:0051205 protein insertion into membrane 塔斯 12435727
去:0030335 细胞迁移的阳性调节 小鬼 12435727
GO:0043406 MAP激酶活性的阳性调节 艾达 10572067
GO:0043006 calcium-dependent phospholipase A2 activation 塔斯 12435727
去:0050679 positive regulation of epithelial cell proliferation 艾达 10572067
去:0050730 调节肽基 - 酪氨酸磷酸化 小鬼 12435727
GO:0045786 细胞周期的负调控 IEA -
GO:0046777 蛋白氨基酸自磷酸化 IEA -
GO:0045429 一氧化氮生物合成过程的阳性调节 艾达 12828935
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 extracellular space NAS 9103388
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 nucleus 艾达 12828935
去:0005737 cytoplasm 艾达 12435727
去:0005768 内体 艾达 14702346
去:0005783 内质网 艾达 18029348
GO:0030122 AP-2适配器复合物 塔斯 14702346
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 EXP 8493579|8639530|8845374
|9356464|9544989
|10567358|10648629
|10734310|10913131
|11823423|11894095
|122181
去:0005886 质膜 艾达 15465819
GO:0016323 基底外侧质膜 IEA -
GO:0030139 endocytic vesicle IEA -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B 实验 Source PubMed ID
AMH Mif |错误 抗毛刺激素 - HPRD 8596488
ar AIS |DHTR |Humara |KD |NR3C4 |SBMA |smax1 |TFM 雄激素受体 亲和力捕获 - 韦斯特恩
Co-localization
Biogrid 15288768|15305378
AREG ar |crdgf |MGC13647 |SDGF 两次凝聚蛋白 - HPRD,Biogrid 10085134
ARF4 ARF2 ADP-ribosylation factor 4 - HPRD,Biogrid 12446727
ATP5C1 ATP5C | ATP5CL1 ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, gamma polypeptide 1 两个杂交 Biogrid 16169070
BTC - betacellulin - HPRD 9528863
平静1 Calml2 |CAMI |DD132 |PHKD calmodulin 1 (phosphorylase kinase, delta) egfrinteracts with calmodulin 绑定 14960328
CAMLG CAML |MGC163197 calcium modulating ligand - HPRD,Biogrid 12919676
CASP1 冰|IL1BC |P45 caspase 1,与凋亡相关的半胱氨酸肽酶(白介素1,β,转化酶) - HPRD,Biogrid 11226410
CAV1 cav |MSTP085 |VIP21 小窝蛋白1,小窝蛋白,22KDA - HPRD,Biogrid 9374534
cav3 lgmd1c |LQT9 |MGC126100 |MGC126101 |MGC126129 |VIP-21 |VIP21 小窝林3 - HPRD,Biogrid 9374534
CBL C-CBL | CBL2 | RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10086340|12061819
CBL C-CBL | CBL2 | RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 - HPRD 8662998
CBL C-CBL | CBL2 | RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 表皮生长因子受体与CBL的未指明的同种型。 绑定 15735736
CBL C-CBL | CBL2 | RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 c-Cbl ubiquitinates an unspecified isoform of EGFR. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between c-Cbl and EGFR, both from an unspecified species. 绑定 12234920
CBLB DKFZp686J10223 | DKFZp779A0729 | DKFZp779F1443 | FLJ36865 | FLJ41152 | Nbla00127 | RNF56 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列B - HPRD,Biogrid 10086340
CBLC CBL-3 |CBL-SL |RNF57 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列C - HPRD,Biogrid 10362357
CCND1 BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 cyclin D1 EGFR的未指定同工型与细胞周期蛋白D1启动子结合。 绑定 15950906
CD44 CDW44 |CSPG8 |ECMR-III |hcell |在|lhr |MC56 |mdu2 |mdu3 |MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 CD44分子(印度血型) CD44与EGFR相互作用。 绑定 12093135
CD44 CDW44 |CSPG8 |ECMR-III |hcell |在|lhr |MC56 |mdu2 |mdu3 |MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 CD44分子(印度血型) - HPRD,Biogrid 12093135
CD82 4f9 |C33 |Gr15 |IA4 |kai1 |R2 |SAR2 |ST6 |TSPAN27 CD82分子 - HPRD,Biogrid 10985391
cdc25a CDC25A2 细胞分裂周期25同源物A(S. Pombe) - HPRD,Biogrid 11912208
CDH1 Arc-1 | CD324 | CDHE | ECAD | LCAM | UVO cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) egfrinteracts with E-cadherin 绑定 14681060
CDH1 Arc-1 | CD324 | CDHE | ECAD | LCAM | UVO cadherin 1, type 1, E-cadherin (epithelial) - HPRD,Biogrid 10969083
CEBPB C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β - HPRD,Biogrid 12095417
CRK crkii v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian) - HPRD,Biogrid 9642287
CSK MGC117393 C-SRC酪氨酸激酶 亲和力捕获ms Biogrid 16729043
CTNNB1 CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA - HPRD,Biogrid 9233779
CTNND1 cas |ctnnd |KIAA0384 |P120CAS |P120CTN |P120 Catenin(钙粘蛋白相关蛋白),三角洲1 重构的复合物 Biogrid 9535896
DCN CSCD | DSPG2 | PG40 | PGII | PGS2 | SLRR1B 装饰 - HPRD,Biogrid 9988678|12105206
DEGS1 DEGS |des1 |DES-1 |FADS7 |MGC5079 |Mig15 |MLD degenerative spermatocyte homolog 1, lipid desaturase (Drosophila) - HPRD 9188692
DOK2 p56DOK | p56dok-2 docking protein 2, 56kDa - HPRD,Biogrid 10508618
dusp3 VHR 双重特异性磷酸酶3 生化活动 Biogrid 1281549
EGF HOMG4 | URG 表皮生长因子(β-尿肿) - HPRD 10788520|12093292
|12620237 | 12093292
EGF HOMG4 | URG 表皮生长因子(β-尿肿) EGF与EGFR相互作用。 绑定 15837620
EGF HOMG4 | URG 表皮生长因子(β-尿肿) - HPRD,Biogrid 12093292
EGF HOMG4 | URG 表皮生长因子(β-尿肿) egfrinteracts with EGF. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between EGFR from human and EGF from mouse. 绑定 8413296
EGF HOMG4 | URG 表皮生长因子(β-尿肿) EGFR的未指定同工型与EGF相互作用。 绑定 15950906
egfr 嗯BB | ERBB1 | HER1 | PIG61 | mENA 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) egfrinteracts with EGFR. 绑定 15284455
egfr 嗯BB | ERBB1 | HER1 | PIG61 | mENA 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 14576349
eppk1 EPIPL | EPIPL1 Epiplakin 1 - HPRD 12577067
EPS15 AF-1P | AF1P | MLLT5 表皮生长因子受体途径底物15 - HPRD,Biogrid 9049247
EPS8 - 表皮生长因子受体途径底物8 - HPRD 7532293|12127568
嗯BB2 CD340 | HER-2 | HER-2/neu | HER2 | NEU | NGL | TKR1 v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) - HPRD 11500850
嗯BB2 CD340 | HER-2 | HER-2/neu | HER2 | NEU | NGL | TKR1 v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) EGFR与ERBB2相互作用。 绑定 15652750
嗯BB3 ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 3 (avian) - HPRD,Biogrid 10527633
EREG 上环蛋白 - HPRD,Biogrid 9419975
ESR1 DKFZp686N23123 | ER | ESR | ESRA | Era | NR3A1 estrogen receptor 1 - HPRD,Biogrid 11887937
FER TYK3 FER(FPS/FES相关)酪氨酸激酶 - HPRD,Biogrid 7623846
fos AP-1 |c-fos v-fos FBJ murine osteosarcoma viral oncogene homolog An unspecified isoform of EGFR binds to c-fos promoter. 绑定 15950906
GAB1 - GRB2-associated binding protein 1 - HPRD,Biogrid 11432805
GNAI2 GIP |gnai2b |H_LUCA15.1 |H_LUCA16.1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),α抑制活性多肽2 - HPRD 11286993
GRB10 grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS growth factor receptor-bound protein 10 GRB10与EGFR相互作用。 绑定 9506989
GRB10 grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS growth factor receptor-bound protein 10 - HPRD,Biogrid 9006901|9506989
GRB14 - growth factor receptor-bound protein 14 - HPRD,Biogrid 8647858
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 growth factor receptor-bound protein 2 GRB2互动s with an unspecified isoform of EGFR. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human GRB2, and rat EGFR. 绑定 15782189
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 growth factor receptor-bound protein 2 - HPRD 1322798|7527043
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 growth factor receptor-bound protein 2 EGFR与GRB2相互作用。 绑定 8305738
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 growth factor receptor-bound protein 2 亲和力捕获ms
亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 1322798|7510700
|7527043|8647858
|9050991|10026169
|10085134|11960376
|12577067|16729043
GRB7 - growth factor receptor-bound protein 7 - HPRD 9710451
HBEGF DTR | DTS | DTSF | HEGFL 肝素结合EGF样生长因子 - HPRD,Biogrid 12725245
HSP90AA1 FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class A member 1 EGFR与HSP90相互作用。这种相互作用是基于未指定物种与人类HSP90的EGFR之间的相互作用进行建模的。 绑定 12471035
htt 高清|IT15 亨廷顿 - HPRD,Biogrid 9079622
IGF1R CD221 |igfir |JTK13 |MGC142170 |MGC142172 |MGC18216 胰岛素样生长因子1受体 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 17047074
inppl1 Ship2 肌醇聚磷酸磷酸酶样1 - HPRD,Biogrid 11349134
itga5 CD49E |fnra |VLA5A 整合素,α5(纤连蛋白受体,α多肽) - HPRD 10888683
JAK2 JTK10 Janus激酶2(蛋白酪氨酸激酶) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10358079
JUP ARVD12 |ctnng |dp3 |dpiii |PDGB |PKGB junction plakoglobin 重构的复合物 Biogrid 9535896
KRT17 K17 |PC |PC2 |PCHC1 keratin 17 - HPRD 12577067
KRT18 CYK18 | K18 keratin 18 - HPRD 12577067
KRT7 CK7 | K2C7 | K7 | MGC129731 | MGC3625 | SCL 角蛋白7 - HPRD 12577067
KRT8 卡2 |CK8 |cyk8 |K2C8 |K8 |ko 角蛋白8 - HPRD 12577067
LRSAM1 FLJ31641 |步枪|塔尔 leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 15256501
MAP3K14 ftdcr1b |HS |hsnik |尼克 mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 - HPRD,Biogrid 11116146
MAP4K1 HPK1 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶激酶1 - HPRD,Biogrid 9346925
MAPK14 CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 生化活动 Biogrid 7535770
MUC1 CD227 |EMA |H23AG |mam6 |Pem |Pemt |棕榈 粘蛋白1,细胞表面相关 - HPRD,Biogrid 11278868|11483589
MUC1 CD227 |EMA |H23AG |mam6 |Pem |Pemt |棕榈 粘蛋白1,细胞表面相关 MUC1 interacts with and is tyrosine-phosphorylated by EGFR. 绑定 11483589
NCK1 MGC12668 |NCK |nckalpha NCK适配器蛋白1 - HPRD,Biogrid 9362449
NCK2 grb4 |NCKBETA NCK适配器蛋白2 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 9737977|10026169
NCK2 grb4 |NCKBETA NCK适配器蛋白2 - HPRD 1333047|9737977
NRG1 arIA | GGF | GGF2 | HGL | HRG | HRG1 | HRGA | NDF | SMDF 神经结合蛋白1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 7730382
NRG1 arIA | GGF | GGF2 | HGL | HRG | HRG1 | HRGA | NDF | SMDF 神经结合蛋白1 - HPRD 8702572
PAK1 MGC130000 |MGC130001 |pakalpha P21蛋白(CDC42/RAC)激活激酶1 Tyrosine-phosphorylated EGFR interacts with PAK1. 绑定 12522133
PDGFRB CD140B | JTK12 | PDGF-R-beta | PDGFR | PDGFR1 血小板衍生的生长因子受体,β多肽 - HPRD,Biogrid 9506992
PIK3C2B C2-PI3K | DKFZp686G16234 磷酸肌醇-3-激酶,2类,β​​多肽 - HPRD,Biogrid 11533253
PIK3R1 GRB1 | p85 | p85-ALPHA 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) - HPRD 8662998
PIK3R1 GRB1 | p85 | p85-ALPHA 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) egfrinteracts with p85. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human EGFR and bovine p85. 绑定 1372092
PIK3R2 P85B |P85 |p85-beta 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基2(beta) Tyrosine phosphorlyated EGFR interacts with p85-beta. 绑定 11172806
PITPNA MGC99649 |pitpn |vib1a 磷脂酰肌醇转移蛋白,α - HPRD,Biogrid 7761838
PLCG1 PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 phospholipase C, gamma 1 - HPRD,Biogrid 9207933
PLCG1 PLC-II |PLC1 |PLC148 |Plcgamma1 phospholipase C, gamma 1 EGFR与PLC-GAMMA相互作用。这种相互作用是在人类EGFR和牛PLC-gamma之间的相互作用上建模的。 绑定 2173144|2176151
PLD2 - 磷脂酶D2 - HPRD,Biogrid 9837959
PLD2 - 磷脂酶D2 EGFR与PLD1相互作用。这种相互作用是在人EGFR和小鼠PLD2之间的相互作用上建模的。 绑定 9837959
PLEC1 EBS1 |EBSO |HD1 |PCN |PLEC1B |PLTN PLECTIN 1,中间丝结合蛋白500KDA - HPRD 12577067
PLSCR1 mmtra1b phospholipid scramblase 1 - HPRD,Biogrid 12009895
PLSCR1 mmtra1b phospholipid scramblase 1 - HPRD 12009895|12871937
Prkaca MGC102831 |MGC48865 |pkaca 蛋白激酶,cAMP依赖性,催化,α - HPRD,Biogrid 9050991
prkar1a CAR | CNC | CNC1 | DKFZp779L0468 | MGC17251 | PKR1 | PPNAD1 | PRKAR1 | TSE1 蛋白激酶,cAMP依赖性,调节性,I型,α(组织特异性灭火器1) - HPRD,Biogrid 9050991
prkca AAG6 |MGC129900 |MGC129901 |PKC-Alpha |PKCA |Prkaca protein kinase C, alpha - HPRD,Biogrid 12878187
PTK2 FADK | FAK | FAK1 | pp125FAK PTK2protein tyrosine kinase 2 - HPRD,Biogrid 10806474
ptk2b CADTK | CAKB | FADK2 | FAK2 | FRNK | PKB | PTK | PYK2 | RAFTK PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β - HPRD,Biogrid 10777553
PTK6 BRK |FLJ42088 PTK6protein tyrosine kinase 6 - HPRD,Biogrid 8940083
PTPN1 PTP1B protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1 - HPRD,Biogrid 7540771|8621392
|10889023|12573287
PTPN11 BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 - HPRD,Biogrid 7673163
PTPN6 HCP |HCPH |HPTP1C |PTP-1C |SH-PTP1 |SHP-1 |SHP-1L |SHP1 protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 - HPRD,Biogrid 9733788
ptprj CD148 |dep1 |hptpeta |R-PTP-ETA |SCC1 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,J - HPRD 9115287
RASA1 CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 重构的复合物 Biogrid 8647858
RASA1 CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 GAP interacts with EGFR. 绑定 1385407|1850098
|2176151
RASA1 CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 - HPRD 1633149
RGS16 A28-RGS14 | A28-RGS14P | RGS-R G蛋白信号的调节剂16 - HPRD,Biogrid 11602604
RIPK1 FLJ39204 | RIP | RIP1 受体(TNFRSF) - 互动丝氨酸 - 硫代激酶1 - HPRD,Biogrid 11116146
ROS1 MCF3 |罗斯|C-ROS-1 C-ROS癌基1,受体酪氨酸激酶 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11094073
SGSM2 KIAA0397 |rutbc1 小G蛋白信号调节器2 两个杂交 Biogrid 16169070
SH2D3A NSP1 含3A的SH2域 - HPRD,Biogrid 10187783
SH3BGRL MGC117402 | SH3BGR SH3结构域结合富含谷氨酸的蛋白 亲和力捕获ms Biogrid 16729043
SH3KBP1 CIN85 | GIG10 | MIG18 SH3-domain kinase binding protein 1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 11894095|12177062
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 SHC与激活的EGFR相互作用。 绑定 1623525
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 ShcA interacts with EGFR. 绑定 8610109
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 ShcA interacts with the EGFR. 绑定 8577769|8610109
|8943228
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 - HPRD,Biogrid 9544989
SHC1 FLJ26504 | SHC | SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 EGF-R与SHC相互作用。这种相互作用是在人类EGF-R和小鼠SHC之间证明的相互作用上建模的。 绑定 8887653
SHC3 N-SHC |NSHC |Rai |shcc SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白3 - HPRD,Biogrid 9507002
SNRPD2 SMD2 |SNRPD1 小核核糖核蛋白D2多肽16.5KDA - HPRD 12577067
SNX1 HST17379 |MGC8664 |SNX1A |VPS5 排序Nexin 1 - HPRD,Biogrid 8638121|9819414
SNX2 MGC5204 |TRG-9 排序Nexin 2 - HPRD,Biogrid 9819414
SNX4 - 排序Nexin 4 - HPRD,Biogrid 9819414
SNX6 MGC3157 | MSTP010 | TFAF2 排序Nexin 6 - HPRD,Biogrid 11279102
SOCS1 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 抑制细胞因子信号传导1 - HPRD,Biogrid 12070153
SOCS3 atod4 |顺式3 |cish3 |MGC71791 |SOCS-3 |SSI-3 |SSI3 抑制细胞因子信号传导3 - HPRD,Biogrid 12070153
SOS1 GF1 |GGF1 |gingf |HGF |NS4 son of sevenless homolog 1 (Drosophila) - HPRD,Biogrid 9447973
SOS2 FLJ25596 son of sevenless homolog 2 (Drosophila) - HPRD,Biogrid 10675333
src ASV | SRC1 | c-SRC | p60-Src V-SRC肉瘤(Schmidt-Ruppin A-2)病毒癌基因同源物(Avian) - HPRD,Biogrid 10971656
Stat1 DKFZP686B04100 |ISGF-3 |Stat91 signal transducer and activator of transcription 1, 91kDa - HPRD,Biogrid 12070153
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10358079|15485908
Stat3 APRF |FLJ20882 |hies |MGC16063 转录3的信号换能器和激活因子(急性相反应因子) 酪氨酸颗粒化的EGFR与STAT3相互作用。 绑定 12873986
Stat5a MGF | STAT5 signal transducer and activator of transcription 5A - HPRD,Biogrid 10358079
Stat5b Stat5 signal transducer and activator of transcription 5B - HPRD,Biogrid 10558875
TGFA TFGA transforming growth factor, alpha - HPRD,Biogrid 12297049
TJP1 DKFZP686M05161 |MGC133289 |zo-1 tight junction protein 1 (zona occludens 1) - HPRD,Biogrid 12708492
TNC HXB | MGC167029 | TN Tenascin c - HPRD 11470832
TNK2 ACK | ACK1 | FLJ44758 | FLJ45547 | p21cdc42Hs 酪氨酸激酶,非受体,2 - HPRD 8497321|8647288
VAV1 VAV VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 - HPRD,Biogrid 10938113
VAV2 - vav 2 guanine nucleotide exchange factor 酪氨酸磷酸化的EGFR与VAV2相互作用并磷酸化。 绑定 12454019
VAV2 - vav 2 guanine nucleotide exchange factor - HPRD,Biogrid 10618391|10938113
VAV3 FLJ40431 vav 3 guanine nucleotide exchange factor 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10938113
VAV3 FLJ40431 vav 3 guanine nucleotide exchange factor - HPRD 11094073
WAS IMD2 |THC |黄蜂 Wiskott-Aldrich综合征(湿疹 - 肉毒细胞减少症) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9307968
XPO6 EXP6 |FLJ22519 |KIAA0370 |RANBP20 导出6 - HPRD 14592989
XRCC6 CTC75 |CTCBF |G22P1 |ku70 |ML8 |TLAA X射线修复补充中国仓鼠细胞中有缺陷的修复6 - HPRD 9430697
ywhaz KCIP-1 | MGC111427 | MGC126532 | MGC138156 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,Zeta多肽 EGFR与14-3-3-zeta相互作用。 绑定 15225635
ZNF259 MGC110983 |ZPR1 zinc finger protein 259 - HPRD 8650580|10938113|10938113
ZNF259 MGC110983 |ZPR1 zinc finger protein 259 - HPRD 10938113


V.途径注释

Pathway name 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
kegg mapk信号通路 267 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ERBB SIGNALING PATHWAY 87 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg钙信号通路 178 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg dorso腹轴形成 25 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg焦点粘附 201 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG ADHERENS JUNCTION 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg间隙交界处 90 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路 101 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
幽门螺杆菌感染中的KEGG上皮细胞信号传导 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg胰腺癌 70 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG子宫内膜癌 52 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg神经胶质瘤 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG前列腺癌 89 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG MELANOMA 71 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg膀胱癌 42 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG非小细胞肺癌 54 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA AGR PATHWAY 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AT1R途径 36 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CBL途径 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EGF途径 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ERK途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物质体角质形成细胞途径 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EGFR Smrte途径 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta McAlpain途径 25 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Cardiacegf途径 18 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA HER2 PATHWAY 22 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Spry途径 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Tel Pathway 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta TFF途径 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST G ALPHA I PATHWAY 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST ADRENERGIC 36 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径 66 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ARF6途径 35 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TXA2PATHWAY 57 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID SHP2途径 58 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID端粒酶途径 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1受体近端途径 35 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid ajdiss 2Pathway 48 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID P53 DOWNSTREAM PATHWAY 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1 DOWNSTREAM PATHWAY 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid upa upar途径 42 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ecadherin角质形成细胞途径 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB网络途径 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1内部化途径 41 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ecadherin稳定途径 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID A6B1 A6B4整合素途径 46 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 3途径 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的Reactome信号传导 101 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY CONSTITUTIVELY ACTIVE EGFR 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GRB2 EVENTS IN ERBB2 SIGNALING 22 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EGFR在癌症中的反应组信号传导 109 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2信号中的Reactome PI3K事件 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME GASTRIN CREB SIGNALLING PATHWAY VIA PKC AND MAPK 205 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME EGFR DOWNREGULATION 25 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GAB1信号体 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
egfr信号中的Reactome SHC1事件 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL TRANSDUCTION BY L1 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TURASHVILI BREAST LOBULAR CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS BASAL DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 DN 48 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOJIMA SFRP2 TARGETS DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAEGER METASTASIS DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAPASPYRIDONOS UNSTABLE ATEROSCLEROTIC PLAQUE DN 43 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE FIMA UP 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1目标12小时DN 209 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge Hif1a靶向​​DN 91 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的甲状腺癌间变性 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 CHRONIC LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F UP 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ozanne AP1靶向 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APPIERTO RESPONSE TO FENRETINIDE DN 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Breuhahn生长因子信号传导肝癌 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木在口腔癌中放大 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
myllykangas放大热点29 11 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯尼德斯在头部和颈部肿瘤中放大 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan UV响应正常DN 33 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Simbulan UV响应永生的DN 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hasina NOL7目标DN 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU NASOPHARYNGEAL CARCINOMA 70 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOCKWOOD AMPLIFIED IN LUNG CANCER 214 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤DN 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH EED TARGETS 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 480 HELA 164 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JEON SMAD6 TARGETS DN 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUNG METASTASIS STROMA DN 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TCGA胶质母细胞瘤副本编号 75 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DING LUNG CANCER MUTATED SIGNIFICANTLY 26 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONDER CDH1 TARGETS 1 UP 140 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER CIPROFIBRATE DN 66 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC TGFA DN 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER ACOX1 DN 65 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC DN 63 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌E2F1 DN 64 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AFFAR YY1 TARGETS UP 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN 408 274 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血成熟细胞 293 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang Smarce1靶向DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAYO AGING MUSCLE DN 123 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH对砷C4的反应 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chiba对TSA DN的响应 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
su胎盘 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KYNG DNA DAMAGE BY 4NQO OR GAMMA RADIATION 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏 226 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
koNDO EZH2 TARGETS 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhang GATA6靶向DN 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DE YY1 TARGETS DN 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BRAIN UP 39 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID乳腺癌腔B DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萧述三乳腺癌基底 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH UP 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄达沙替尼的抵抗 81 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUIZ TNC TARGETS DN 142 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS FIBROBLAST UP 84 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAN SATB1 TARGETS UP 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DING LUNG CANCER MUTATED RECURRENTLY 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TCGA GLIOBLASTOMA MUTATED 8 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIELSEN SCHWANNOMA DN 18 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VERHAAK GLIOBLASTOMA CLASSICAL 162 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向低血清 100 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHGUCHI LIVER HNF4A TARGETS DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS DN 229 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
朱凯尔的目标 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
koINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDERSEN METASTASIS BY ERBB2 ISOFORM 3 20 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2的611CTF同工型的PEDERSEN目标 76 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu IL13启动模型 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong tnf响应不是通过p38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟DN 99 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER CLUSTER 3 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-128 200 206 1A hsa-miR-128a UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
hsa-miR-128b UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
mir-27 200 207 1A,M8 HSA-MIR-27Abrain uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27Bbrain uucacaguggcuaaguucugc