概括
基因 1958年
象征 Egr1
同义词 AT225 | G0S30 | KROX-24 | NGFI-A | TIS8 | ZIF-268 | ZNF225
描述 早期增长反应1
参考 MIM:128990|HGNC:HGNC:3238|Ensembl:ENSG00000120738|HPRD:00549|Vega:Otthumg00000129197
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31.1
Pascal P值 4.406E-7
Sherlock P值 0.277
胎儿β -3.345
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2189803 CHR5 137684661 Egr1 1958年 4.396E-4 顺式
RS17100274 CHR1 77774412 Egr1 1958年 0.1 反式
RS1387353 CHR1 164414740 Egr1 1958年 0.14 反式
RS6666937 CHR1 170286842 Egr1 1958年 0.01 反式
RS6673109 CHR1 207253132 Egr1 1958年 0 反式
RS17038084 CHR2 85192280 Egr1 1958年 0.17 反式
RS4149509 CHR2 101023698 Egr1 1958年 0.12 反式
RS6707117 CHR2 136855504 Egr1 1958年 8.926E-6 反式
RS7608942 CHR2 182820100 Egr1 1958年 0.05 反式
RS16829401 CHR2 233538391 Egr1 1958年 0.11 反式
RS9863778 CHR3 55375950 Egr1 1958年 0.02 反式
RS997245 CHR3 61844600 Egr1 1958年 0 反式
RS4469113 CHR4 41461062 Egr1 1958年 0.08 反式
RS10040715 CHR5 57594207 Egr1 1958年 1.863E-4 反式
SNP_A-4217300 0 Egr1 1958年 0.09 反式
RS2141482 CHR5 136760477 Egr1 1958年 0.06 反式
RS2189803 CHR5 137684661 Egr1 1958年 0.04 反式
RS259913 CHR5 169370782 Egr1 1958年 0.09 反式
RS2116811 CHR5 171820051 Egr1 1958年 0.17 反式
RS2030024 CHR6 131014624 Egr1 1958年 0.05 反式
RS10485094 CHR6 131071433 Egr1 1958年 0.01 反式
RS17059517 CHR6 131076254 Egr1 1958年 0.05 反式
RS9402280 CHR6 131102770 Egr1 1958年 0.03 反式
RS10872699 CHR6 153544252 Egr1 1958年 0.12 反式
RS12701006 CHR7 30147298 Egr1 1958年 0.1 反式
RS1419793 CHR7 34697630 Egr1 1958年 0.02 反式
RS11779237 CHR8 1227664 Egr1 1958年 0.01 反式
RS1457044 CHR8 59257567 Egr1 1958年 0.05 反式
RS7465259 0 Egr1 1958年 0.11 反式
RS10104622 CHR8 63333773 Egr1 1958年 0.11 反式
RS2218911 CHR8 63371015 Egr1 1958年 0.11 反式
RS1551199 CHR8 63388117 Egr1 1958年 0.11 反式
RS1733950 CHR8 90062516 Egr1 1958年 1.387E-4 反式
RS1240028 CHR8 90093357 Egr1 1958年 0.06 反式
RS318307 CHR8 90185459 Egr1 1958年 0.12 反式
RS2280828 CHR8 118762435 Egr1 1958年 0.14 反式
RS9298651 Chr9 10076275 Egr1 1958年 0.02 反式
RS16931013 Chr9 10076859 Egr1 1958年 0.02 反式
RS16931018 Chr9 10077048 Egr1 1958年 0.02 反式
RS3780642 Chr9 87553144 Egr1 1958年 0.03 反式
RS11029807 Chr11 27075421 Egr1 1958年 0.16 反式
RS8490 CHR12 51453904 Egr1 1958年 0.12 反式
RS1344796 CHR12 76397104 Egr1 1958年 0.04 反式
RS7982110 CHR13 59723428 Egr1 1958年 0.14 反式
RS7327697 CHR13 83227456 Egr1 1958年 0.13 反式
RS8022005 CHR14 61345380 Egr1 1958年 0.05 反式
RS289171 CHR15 62576053 Egr1 1958年 0.2 反式
RS289161 CHR15 62589888 Egr1 1958年 0.19 反式
RS9635390 CHR15 90809632 Egr1 1958年 0.02 反式
RS8047151 CHR16 17209696 Egr1 1958年 0.02 反式
RS4271578 CHR16 17213886 Egr1 1958年 0.1 反式
RS3829495 CHR16 17221986 Egr1 1958年 0.08 反式
RS1942464 CHR18 70509877 Egr1 1958年 0.19 反式
RS234337 CHR19 40458724 Egr1 1958年 0.07 反式
RS234363 CHR19 40474607 Egr1 1958年 0.11 反式
RS10409262 CHR19 58154954 Egr1 1958年 0.12 反式
RS6109425 CHR20 12443786 Egr1 1958年 0.17 反式
RS16978981 Chrx 13538144 Egr1 1958年 0.03 反式
RS7879159 Chrx 19481591 Egr1 1958年 0.06 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PGD 0.97 0.96
塔布 0.97 0.96
EIF3L 0.97 0.95
IP6K2 0.96 0.96
prPSAP2 0.96 0.95
trafd1 0.96 0.90
RBM4 0.96 0.96
Smarcb1 0.96 0.94
ILF2 0.96 0.95
C4orf14 0.96 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HLA-F -0.76 -0.81
AIFM3 -0.76 -0.81
C5orf53 -0.76 -0.78
AF347015.27 -0.75 -0.91
AF347015.33 -0.74 -0.91
AF347015.31 -0.74 -0.88
MT-CO2 -0.73 -0.89
hepn1 -0.73 -0.78
S100B -0.72 -0.83
aldoc -0.72 -0.72

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 艾达 12560508
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000122 RNA聚合酶II启动子的转录负调控 IEA -
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0030217 T细胞分化 IEA -
GO:0045941 转录的正调节 艾达 12560508
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 艾达 14744935

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CEBPB C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β - HPRD,Biogrid 12947119
CEBPB C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β EGR1与C/EBP-beta相互作用。这种相互作用是在小鼠EGR1与人C/EBP-beta之间的相互作用上建模的。 绑定 12947119
克雷布 CBP |kat3a |RST CREB结合蛋白 - HPRD,Biogrid 9806899
克雷布 CBP |kat3a |RST CREB结合蛋白 CBP与EGR1启动子相互作用。 绑定 15225550
克雷布 CBP |kat3a |RST CREB结合蛋白 CBP启动子与EGR1相互作用。 绑定 15225550
EP300 kat3b |P300 E1a结合蛋白p300 P300与EGR1启动子相互作用。 绑定 15225550
EP300 kat3b |P300 E1a结合蛋白p300 - HPRD,Biogrid 9806899
EP300 kat3b |P300 E1a结合蛋白p300 P300与EGR1相互作用。 绑定 15225550
ERBB3 ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 V-ERB-B2红细胞白血病病毒癌基因同源物3(Avian) 两个杂交 Biogrid 12840049
GADD45A ddit1 |GADD45 生长停滞和DNA损伤诱导的α EGR-1与GADD45A启动子相互作用。 绑定 15616591
GADD45B DKFZP566B133 |gadd45beta |myd118 生长停滞和DNA损伤诱导,beta EGR-1与GADD45B启动子相互作用。 绑定 15616591
六月 AP-1 |AP1 |C-Jun Jun Oncogene - HPRD 11278640
NAB1 - NGFI-A结合蛋白1(EGR1结合蛋白1) - HPRD,Biogrid 7624335
NAB2 玛德|MGC75085 NGFI-A结合蛋白2(EGR1结合蛋白2) - HPRD,Biogrid 8668170
NFATC1 MGC138448 |NF-ATC |NFAT2 |NFATC 活化的T细胞,细胞质,钙调蛋白依赖性1的核因子1 重构的复合物 Biogrid 12560487
NFATC2 KIAA0611 |NFAT1 |NFATP 活化的T细胞,细胞质,钙调蛋白依赖性2的核因子2 - HPRD 12560487
PITX1 Bft |POTX |PTX1 成对的同源域1 - HPRD,Biogrid 10082522
PSMA3 HC8 |MGC12306 |MGC32631 |PSC3 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,Alpha型,3 重构的复合物
两个杂交
Biogrid 12379479
Rela MGC131774 |NFKB3 |P65 V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) - HPRD,Biogrid 10671503
Rela MGC131774 |NFKB3 |P65 V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) Rela与EGR-1启动子相互作用。 绑定 15616591
SP1 - SP1转录因子 EGR1与SP1相互作用。这种相互作用是在人EGR1和小鼠SP1之间的相互作用上建模的。 绑定 12569082
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 肿瘤蛋白p53 - HPRD,Biogrid 11251186


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Prion疾病 35 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CDK5途径 11 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PC12细胞中的ST分化途径 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PRL信号事件途径 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid nfat tfpathway 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid reg gr途径 82 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR TF途径 53 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ERBB1下游途径 105 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1途径 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MAPK TRK途径 34 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PI3K PLC TRK途径 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR下游途径 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素αβ信号传导 64 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome干扰素信号传导 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
早期的粉刺开发 21 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房导管癌与导管正常DN 198 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima EGF信号向上 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向 214 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌变性DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
yemelyanov gr目标dn 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno岩石信号不是通过Rhoa DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性洛夫 115 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤DN 67 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
汇款皮肤伤口 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIZ红细胞分化12小时 43 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53和TP63目标 205 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rodrigues NTN1和DCC目标 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射1的响应1 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 DN 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dirmeier LMP1响应早期 66 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
科科拉畸胎瘤 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson遗传毒性签名 105 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borlak肝癌EGF UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wiemann端粒缩短和慢性肝损害DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍林青春期乳腺 69 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Khetchoumian Trim24靶向 47 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗里德曼衰老DN 13 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应40 HELA 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应40 MCF10A 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amit EGF响应60 MCF10A 39 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应40 MCF10A 32 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿米特血清反应60 mcf10a 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jechlinger上皮到间充质转变DN 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu IL4信号传导 94 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 126 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hemin的addya红斑分化 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vernell视网膜母细胞瘤路径 70 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后 63 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应6小时DN 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chuang氧化应激反应向上 28 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindvall因TERT DN永生 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素抵抗时的肉食正常 34 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周TNF信号30分钟 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weng Portaks全球DN 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线24小时 20 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标30分钟 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 8小时 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成9 92 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild HRAS致癌特征 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein神经元标记 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LSD1目标DN 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jepsen SMRT目标 33 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO或伽马辐射 15 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mishra癌相关的成纤维细胞 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk中央女性生育 29 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk luteal基因 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 125 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向6小时 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
对Salirasib的反应 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSAI对放射治疗的反应 32 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vilimas Notch1靶向 52 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SEKI炎症反应LPS 77 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hunsberger运动调节基因 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF DN的响应 235 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 DN 170 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤课程DN 210 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Uzonyi对白三烯和凝血酶的反应 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tian tnf信令不通过NFKB 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
村上紫外线响应1小时DN 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染2小时 39 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
li诱导了自然杀手 307 182 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向衰老 572 352 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标增长 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5A靶向 217 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙通过TSC1敏感血清 23 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移1 46 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu IL13启动模型 15 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
phong TNF靶向 63 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman daunorubicin B全部 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时DN的响应 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 2类由EGF瞬时诱导 51 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hecker IFNB1目标 95 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 838 844 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 769 775 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-181 924 930 1a HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-183 411 417 M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-191 636 643 1A,M8 HSA-MIR-191 caacggaaucccaaaagcagcu
mir-203.1 290 296 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-23 446 452 1a HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-30-3p 982 989 1A,M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-377 777 783 M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu