基因页:Egr1
概括?
基因 | 1958年 |
象征 | Egr1 |
同义词 | AT225 | G0S30 | KROX-24 | NGFI-A | TIS8 | ZIF-268 | ZNF225 |
描述 | 早期增长反应1 |
参考 | MIM:128990|HGNC:HGNC:3238|Ensembl:ENSG00000120738|HPRD:00549|Vega:Otthumg00000129197 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q31.1 |
Pascal P值 | 4.406E-7 |
Sherlock P值 | 0.277 |
胎儿β | -3.345 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2189803 | CHR5 | 137684661 | Egr1 | 1958年 | 4.396E-4 | 顺式 | ||
RS17100274 | CHR1 | 77774412 | Egr1 | 1958年 | 0.1 | 反式 | ||
RS1387353 | CHR1 | 164414740 | Egr1 | 1958年 | 0.14 | 反式 | ||
RS6666937 | CHR1 | 170286842 | Egr1 | 1958年 | 0.01 | 反式 | ||
RS6673109 | CHR1 | 207253132 | Egr1 | 1958年 | 0 | 反式 | ||
RS17038084 | CHR2 | 85192280 | Egr1 | 1958年 | 0.17 | 反式 | ||
RS4149509 | CHR2 | 101023698 | Egr1 | 1958年 | 0.12 | 反式 | ||
RS6707117 | CHR2 | 136855504 | Egr1 | 1958年 | 8.926E-6 | 反式 | ||
RS7608942 | CHR2 | 182820100 | Egr1 | 1958年 | 0.05 | 反式 | ||
RS16829401 | CHR2 | 233538391 | Egr1 | 1958年 | 0.11 | 反式 | ||
RS9863778 | CHR3 | 55375950 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS997245 | CHR3 | 61844600 | Egr1 | 1958年 | 0 | 反式 | ||
RS4469113 | CHR4 | 41461062 | Egr1 | 1958年 | 0.08 | 反式 | ||
RS10040715 | CHR5 | 57594207 | Egr1 | 1958年 | 1.863E-4 | 反式 | ||
SNP_A-4217300 | 0 | Egr1 | 1958年 | 0.09 | 反式 | |||
RS2141482 | CHR5 | 136760477 | Egr1 | 1958年 | 0.06 | 反式 | ||
RS2189803 | CHR5 | 137684661 | Egr1 | 1958年 | 0.04 | 反式 | ||
RS259913 | CHR5 | 169370782 | Egr1 | 1958年 | 0.09 | 反式 | ||
RS2116811 | CHR5 | 171820051 | Egr1 | 1958年 | 0.17 | 反式 | ||
RS2030024 | CHR6 | 131014624 | Egr1 | 1958年 | 0.05 | 反式 | ||
RS10485094 | CHR6 | 131071433 | Egr1 | 1958年 | 0.01 | 反式 | ||
RS17059517 | CHR6 | 131076254 | Egr1 | 1958年 | 0.05 | 反式 | ||
RS9402280 | CHR6 | 131102770 | Egr1 | 1958年 | 0.03 | 反式 | ||
RS10872699 | CHR6 | 153544252 | Egr1 | 1958年 | 0.12 | 反式 | ||
RS12701006 | CHR7 | 30147298 | Egr1 | 1958年 | 0.1 | 反式 | ||
RS1419793 | CHR7 | 34697630 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS11779237 | CHR8 | 1227664 | Egr1 | 1958年 | 0.01 | 反式 | ||
RS1457044 | CHR8 | 59257567 | Egr1 | 1958年 | 0.05 | 反式 | ||
RS7465259 | 0 | Egr1 | 1958年 | 0.11 | 反式 | |||
RS10104622 | CHR8 | 63333773 | Egr1 | 1958年 | 0.11 | 反式 | ||
RS2218911 | CHR8 | 63371015 | Egr1 | 1958年 | 0.11 | 反式 | ||
RS1551199 | CHR8 | 63388117 | Egr1 | 1958年 | 0.11 | 反式 | ||
RS1733950 | CHR8 | 90062516 | Egr1 | 1958年 | 1.387E-4 | 反式 | ||
RS1240028 | CHR8 | 90093357 | Egr1 | 1958年 | 0.06 | 反式 | ||
RS318307 | CHR8 | 90185459 | Egr1 | 1958年 | 0.12 | 反式 | ||
RS2280828 | CHR8 | 118762435 | Egr1 | 1958年 | 0.14 | 反式 | ||
RS9298651 | Chr9 | 10076275 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS16931013 | Chr9 | 10076859 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS16931018 | Chr9 | 10077048 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS3780642 | Chr9 | 87553144 | Egr1 | 1958年 | 0.03 | 反式 | ||
RS11029807 | Chr11 | 27075421 | Egr1 | 1958年 | 0.16 | 反式 | ||
RS8490 | CHR12 | 51453904 | Egr1 | 1958年 | 0.12 | 反式 | ||
RS1344796 | CHR12 | 76397104 | Egr1 | 1958年 | 0.04 | 反式 | ||
RS7982110 | CHR13 | 59723428 | Egr1 | 1958年 | 0.14 | 反式 | ||
RS7327697 | CHR13 | 83227456 | Egr1 | 1958年 | 0.13 | 反式 | ||
RS8022005 | CHR14 | 61345380 | Egr1 | 1958年 | 0.05 | 反式 | ||
RS289171 | CHR15 | 62576053 | Egr1 | 1958年 | 0.2 | 反式 | ||
RS289161 | CHR15 | 62589888 | Egr1 | 1958年 | 0.19 | 反式 | ||
RS9635390 | CHR15 | 90809632 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS8047151 | CHR16 | 17209696 | Egr1 | 1958年 | 0.02 | 反式 | ||
RS4271578 | CHR16 | 17213886 | Egr1 | 1958年 | 0.1 | 反式 | ||
RS3829495 | CHR16 | 17221986 | Egr1 | 1958年 | 0.08 | 反式 | ||
RS1942464 | CHR18 | 70509877 | Egr1 | 1958年 | 0.19 | 反式 | ||
RS234337 | CHR19 | 40458724 | Egr1 | 1958年 | 0.07 | 反式 | ||
RS234363 | CHR19 | 40474607 | Egr1 | 1958年 | 0.11 | 反式 | ||
RS10409262 | CHR19 | 58154954 | Egr1 | 1958年 | 0.12 | 反式 | ||
RS6109425 | CHR20 | 12443786 | Egr1 | 1958年 | 0.17 | 反式 | ||
RS16978981 | Chrx | 13538144 | Egr1 | 1958年 | 0.03 | 反式 | ||
RS7879159 | Chrx | 19481591 | Egr1 | 1958年 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EGR1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
PGD | 0.97 | 0.96 |
塔布 | 0.97 | 0.96 |
EIF3L | 0.97 | 0.95 |
IP6K2 | 0.96 | 0.96 |
prPSAP2 | 0.96 | 0.95 |
trafd1 | 0.96 | 0.90 |
RBM4 | 0.96 | 0.96 |
Smarcb1 | 0.96 | 0.94 |
ILF2 | 0.96 | 0.95 |
C4orf14 | 0.96 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-F | -0.76 | -0.81 |
AIFM3 | -0.76 | -0.81 |
C5orf53 | -0.76 | -0.78 |
AF347015.27 | -0.75 | -0.91 |
AF347015.33 | -0.74 | -0.91 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.88 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.89 |
hepn1 | -0.73 | -0.78 |
S100B | -0.72 | -0.83 |
aldoc | -0.72 | -0.72 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | 艾达 | 12560508 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0000122 | RNA聚合酶II启动子的转录负调控 | IEA | - | |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0030217 | T细胞分化 | IEA | - | |
GO:0045941 | 转录的正调节 | 艾达 | 12560508 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 14744935 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β | - | HPRD,Biogrid | 12947119 |
CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP),β | EGR1与C/EBP-beta相互作用。这种相互作用是在小鼠EGR1与人C/EBP-beta之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12947119 |
克雷布 | CBP |kat3a |RST | CREB结合蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 9806899 |
克雷布 | CBP |kat3a |RST | CREB结合蛋白 | CBP与EGR1启动子相互作用。 | 绑定 | 15225550 |
克雷布 | CBP |kat3a |RST | CREB结合蛋白 | CBP启动子与EGR1相互作用。 | 绑定 | 15225550 |
EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | P300与EGR1启动子相互作用。 | 绑定 | 15225550 |
EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | - | HPRD,Biogrid | 9806899 |
EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | P300与EGR1相互作用。 | 绑定 | 15225550 |
ERBB3 | ERBB-3 |Her3 |LCCS2 |MDA-BF-1 |MGC88033 |C-ERBB-3 |C-ERBB3 |ERBB3-S |P180-ERBB3 |p45-serbb3 | p85-sErbB3 | V-ERB-B2红细胞白血病病毒癌基因同源物3(Avian) | 两个杂交 | Biogrid | 12840049 |
GADD45A | ddit1 |GADD45 | 生长停滞和DNA损伤诱导的α | EGR-1与GADD45A启动子相互作用。 | 绑定 | 15616591 |
GADD45B | DKFZP566B133 |gadd45beta |myd118 | 生长停滞和DNA损伤诱导,beta | EGR-1与GADD45B启动子相互作用。 | 绑定 | 15616591 |
六月 | AP-1 |AP1 |C-Jun | Jun Oncogene | - | HPRD | 11278640 |
NAB1 | - | NGFI-A结合蛋白1(EGR1结合蛋白1) | - | HPRD,Biogrid | 7624335 |
NAB2 | 玛德|MGC75085 | NGFI-A结合蛋白2(EGR1结合蛋白2) | - | HPRD,Biogrid | 8668170 |
NFATC1 | MGC138448 |NF-ATC |NFAT2 |NFATC | 活化的T细胞,细胞质,钙调蛋白依赖性1的核因子1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12560487 |
NFATC2 | KIAA0611 |NFAT1 |NFATP | 活化的T细胞,细胞质,钙调蛋白依赖性2的核因子2 | - | HPRD | 12560487 |
PITX1 | Bft |POTX |PTX1 | 成对的同源域1 | - | HPRD,Biogrid | 10082522 |
PSMA3 | HC8 |MGC12306 |MGC32631 |PSC3 | 蛋白酶体(Prosome,宏观)亚基,Alpha型,3 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 12379479 |
Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 10671503 |
Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) | Rela与EGR-1启动子相互作用。 | 绑定 | 15616591 |
SP1 | - | SP1转录因子 | EGR1与SP1相互作用。这种相互作用是在人EGR1和小鼠SP1之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12569082 |
TP53 | FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 | 肿瘤蛋白p53 | - | HPRD,Biogrid | 11251186 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Prion疾病 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CDK5途径 | 11 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PC12细胞中的ST分化途径 | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PRL信号事件途径 | 23 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid nfat tfpathway | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid reg gr途径 | 82 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AR TF途径 | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID ERBB1下游途径 | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AP1途径 | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID MAPK TRK途径 | 34 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PI3K PLC TRK途径 | 36 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素αβ信号传导 | 64 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome干扰素信号传导 | 159 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 | 270 | 204 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
早期的粉刺开发 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房导管癌与导管正常DN | 198 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿松石 | 79 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima NRG1信号向上发出 | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima EGF信号向上 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔维奇缺氧 | 171 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DMOG的Elvidge缺氧 | 130 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN | 104 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹fungoides cd4 up | 64 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
yemelyanov gr目标dn | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno岩石信号不是通过Rhoa DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向 | 191 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
汇款皮肤伤口 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RIZ红细胞分化12小时 | 43 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53和TP63目标 | 205 | 145 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rodrigues NTN1和DCC目标 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射1的响应1 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应 | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 DN | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应早期 | 66 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
科科拉畸胎瘤 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson遗传毒性签名 | 105 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borlak肝癌EGF UP | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wiemann端粒缩短和慢性肝损害DN | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林青春期乳腺 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Khetchoumian Trim24靶向 | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 156 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 | 142 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗里德曼衰老DN | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应40 HELA | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应40 MCF10A | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应60 MCF10A | 39 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应40 MCF10A | 32 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿米特血清反应60 mcf10a | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体 | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jechlinger上皮到间充质转变DN | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu IL4信号传导 | 94 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 126 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hemin的addya红斑分化 | 73 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vernell视网膜母细胞瘤路径 | 70 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莫迪海马后产后 | 63 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线响应6小时DN | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chuang氧化应激反应向上 | 28 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindvall因TERT DN永生 | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素抵抗时的肉食正常 | 34 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周TNF信号30分钟 | 54 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Weng Portaks全球DN | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线24小时 | 20 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标30分钟 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 8小时 | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成9 | 92 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bild HRAS致癌特征 | 261 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
monnier tradiatiation肿瘤逃脱DN | 373 | 196 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein神经元标记 | 69 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LSD1目标DN | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jepsen SMRT目标 | 33 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损坏4NQO或伽马辐射 | 15 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sarrio上皮间质转变DN | 154 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mishra癌相关的成纤维细胞 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk中央女性生育 | 29 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk luteal基因 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bhati G2M被2methoxyestradiol逮捕 | 125 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向6小时 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen Hoxa5靶向9小时 | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSAI对放射治疗的反应 | 32 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vilimas Notch1靶向 | 52 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SEKI炎症反应LPS | 77 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hunsberger运动调节基因 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 DN | 170 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Uzonyi对白三烯和凝血酶的反应 | 37 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tian tnf信令不通过NFKB | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
村上紫外线响应1小时DN | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染2小时 | 39 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5A靶向 | 217 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙通过TSC1敏感血清 | 23 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移1 | 46 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huang GATA2靶向DN | 72 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu IL13启动模型 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
phong TNF靶向 | 63 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Holleman daunorubicin B全部 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时DN的响应 | 114 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang 2类由EGF瞬时诱导 | 51 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hecker IFNB1目标 | 95 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-124.1 | 838 | 844 | 1a | HSA-MIR-124A | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
mir-124/506 | 769 | 775 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-181 | 924 | 930 | 1a | HSA-MIR-181A脑 | aacauucaacgcugucggugagu |
HSA-MIR-181BSZ | aacauucauugcugucggggg | ||||
HSA-MIR-181C脑 | aacauucaaccugucggugagu | ||||
HSA-MIR-181D脑 | aacauucauuguugucggggguggguu | ||||
mir-183 | 411 | 417 | M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
mir-191 | 636 | 643 | 1A,M8 | HSA-MIR-191脑 | caacggaaucccaaaagcagcu |
mir-203.1 | 290 | 296 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-23 | 446 | 452 | 1a | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-30-3p | 982 | 989 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-3P | cuuucagucggauguugcagc |
HSA-MIR-30E-3P | cuuucagucggauguauacagc | ||||
mir-377 | 777 | 783 | M8 | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |