基因页:Egr4
概括?
基因 | 1961年 |
象征 | Egr4 |
同义词 | ngfi-c | ngfic | pat133 |
描述 | 早期增长反应4 |
参考 | MIM:128992|HGNC:HGNC:3241|ENSEMBL:ENSG00000135625|HPRD:00550|Vega:Otthumg00000129774 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2P13 |
Pascal P值 | 1.631E-6 |
Sherlock P值 | 0.938 |
胎儿β | -2.285 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7607353 | CHR2 | 72577225 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 顺式 | ||
RS12059674 | CHR1 | 57630277 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS17126801 | CHR1 | 65098162 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS7511937 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | |||
RS2782784 | CHR1 | 71195282 | Egr4 | 1961年 | 0.17 | 反式 | ||
RS17689089 | CHR1 | 77740105 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS17100231 | CHR1 | 77761339 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS17100274 | CHR1 | 77774412 | Egr4 | 1961年 | 4.884e-5 | 反式 | ||
RS6664544 | CHR1 | 92524192 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS12403481 | CHR1 | 109503655 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS17029293 | CHR1 | 112567844 | Egr4 | 1961年 | 0.2 | 反式 | ||
RS17649760 | CHR1 | 150425940 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS16837984 | CHR1 | 157042626 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS16837989 | CHR1 | 157046286 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | ||
RS16838012 | CHR1 | 157048974 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS16838014 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | |||
RS6666937 | CHR1 | 170286842 | Egr4 | 1961年 | 1.092E-5 | 反式 | ||
RS12071422 | CHR1 | 185573879 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS16843112 | CHR1 | 198420657 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS697455 | CHR1 | 202512075 | Egr4 | 1961年 | 0.17 | 反式 | ||
RS3748669 | CHR1 | 207077022 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS6673109 | CHR1 | 207253132 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS12034521 | CHR1 | 239717679 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
SNP_A-1990354 | 0 | Egr4 | 1961年 | 7.102E-4 | 反式 | |||
RS6432434 | CHR2 | 14160930 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS12329305 | CHR2 | 19552912 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS12611832 | CHR2 | 31196248 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS12614732 | CHR2 | 31199913 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS7560081 | CHR2 | 62793238 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS17029079 | CHR2 | 64736071 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS17038084 | CHR2 | 85192280 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS17024035 | CHR2 | 100968559 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS7574684 | CHR2 | 100992911 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS17024129 | CHR2 | 100995144 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS17024136 | CHR2 | 100995382 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS7585898 | CHR2 | 100998292 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS6716367 | CHR2 | 101000013 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS1370627 | CHR2 | 101009384 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS4149509 | CHR2 | 101023698 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS6707117 | CHR2 | 136855504 | Egr4 | 1961年 | 7.911E-8 | 反式 | ||
RS10189091 | CHR2 | 143471999 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
SNP_A-2198363 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | |||
RS16838911 | CHR2 | 156087569 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS7608942 | CHR2 | 182820100 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS16829401 | CHR2 | 233538391 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS17040622 | CHR3 | 4440673 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS17684934 | CHR3 | 4443547 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS17040633 | CHR3 | 4446836 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS17756483 | CHR3 | 4451309 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS17685441 | CHR3 | 4465165 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS9863778 | CHR3 | 55375950 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS997245 | CHR3 | 61844600 | Egr4 | 1961年 | 6.689E-5 | 反式 | ||
RS2875492 | CHR3 | 86006209 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS16843128 | CHR3 | 100713413 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS1381835 | CHR3 | 110600595 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS4631023 | CHR4 | 8101794 | Egr4 | 1961年 | 0.18 | 反式 | ||
RS7684087 | CHR4 | 21673380 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS16989064 | CHR4 | 33639397 | Egr4 | 1961年 | 0.06 | 反式 | ||
RS4469113 | CHR4 | 41461062 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS2643038 | CHR4 | 62313218 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS6827713 | CHR4 | 79936877 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS6881821 | CHR5 | 8578465 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS1697073 | CHR5 | 30907267 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | ||
RS2115110 | CHR5 | 38193428 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS16873956 | CHR5 | 44312488 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS10040715 | CHR5 | 57594207 | Egr4 | 1961年 | 3.821E-8 | 反式 | ||
RS13189446 | CHR5 | 61572988 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS16890628 | CHR5 | 61612280 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS16890651 | CHR5 | 61629538 | Egr4 | 1961年 | 0.18 | 反式 | ||
RS153869 | CHR5 | 61754994 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS40290 | CHR5 | 61817141 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS32170 | CHR5 | 61847072 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
SNP_A-4217300 | 0 | Egr4 | 1961年 | 3.294E-4 | 反式 | |||
RS1862599 | CHR5 | 82095088 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS163953 | CHR5 | 92289536 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS17134275 | CHR5 | 100634998 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS10063272 | CHR5 | 103540974 | Egr4 | 1961年 | 0.06 | 反式 | ||
RS2963232 | CHR5 | 103713882 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS2900115 | CHR5 | 117414349 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS2141482 | CHR5 | 136760477 | Egr4 | 1961年 | 2.881E-5 | 反式 | ||
RS2189803 | CHR5 | 137684661 | Egr4 | 1961年 | 8.811E-6 | 反式 | ||
RS17209139 | CHR5 | 142552525 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS259913 | CHR5 | 169370782 | Egr4 | 1961年 | 7.35e-4 | 反式 | ||
RS2116811 | CHR5 | 171820051 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS195429 | CHR6 | 37354434 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS17069168 | CHR6 | 108335432 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS17069171 | CHR6 | 108335593 | Egr4 | 1961年 | 0.11 | 反式 | ||
RS4289676 | CHR6 | 123999302 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS2030024 | CHR6 | 131014624 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS10485094 | CHR6 | 131071433 | Egr4 | 1961年 | 3.882e-4 | 反式 | ||
RS17059517 | CHR6 | 131076254 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS9402280 | CHR6 | 131102770 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS7767456 | CHR6 | 134356119 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS12164028 | CHR6 | 136929934 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS17080121 | CHR6 | 151009189 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS12529269 | CHR6 | 153543829 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS10872699 | CHR6 | 153544252 | Egr4 | 1961年 | 2.708E-4 | 反式 | ||
RS1321606 | CHR6 | 153545278 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS10945911 | CHR6 | 164047509 | Egr4 | 1961年 | 3.734E-4 | 反式 | ||
RS6461881 | CHR7 | 25837688 | Egr4 | 1961年 | 0.11 | 反式 | ||
RS13239699 | CHR7 | 26377619 | Egr4 | 1961年 | 0.2 | 反式 | ||
RS17156078 | CHR7 | 27988688 | Egr4 | 1961年 | 0.11 | 反式 | ||
RS12701006 | CHR7 | 30147298 | Egr4 | 1961年 | 5.332E-4 | 反式 | ||
RS1419793 | CHR7 | 34697630 | Egr4 | 1961年 | 3.562E-4 | 反式 | ||
RS17621151 | CHR7 | 53572911 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS10245449 | CHR7 | 80935100 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS10487383 | CHR7 | 117671737 | Egr4 | 1961年 | 0.06 | 反式 | ||
RS6958821 | CHR7 | 153253566 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS11779237 | CHR8 | 1227664 | Egr4 | 1961年 | 0.11 | 反式 | ||
RS10109456 | CHR8 | 19565941 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS10102886 | CHR8 | 51805574 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS10504194 | CHR8 | 56419808 | Egr4 | 1961年 | 0.2 | 反式 | ||
RS1457044 | CHR8 | 59257567 | Egr4 | 1961年 | 7.696E-5 | 反式 | ||
RS1457032 | CHR8 | 59290536 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS7465259 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | |||
RS10104622 | CHR8 | 63333773 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS2218911 | CHR8 | 63371015 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS1551199 | CHR8 | 63388117 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS1733950 | CHR8 | 90062516 | Egr4 | 1961年 | 4.767E-8 | 反式 | ||
RS1240028 | CHR8 | 90093357 | Egr4 | 1961年 | 5.466E-4 | 反式 | ||
RS1240087 | CHR8 | 90113945 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS318307 | CHR8 | 90185459 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS1483373 | CHR8 | 90186442 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS11776005 | CHR8 | 90187416 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS1159499 | CHR8 | 90196948 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS1355060 | CHR8 | 118717710 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS2280828 | CHR8 | 118762435 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS4976941 | CHR8 | 142744439 | Egr4 | 1961年 | 8.703E-4 | 反式 | ||
RS9298651 | Chr9 | 10076275 | Egr4 | 1961年 | 3.826E-4 | 反式 | ||
RS16931013 | Chr9 | 10076859 | Egr4 | 1961年 | 3.826E-4 | 反式 | ||
RS16931018 | Chr9 | 10077048 | Egr4 | 1961年 | 3.826E-4 | 反式 | ||
RS1109460 | Chr9 | 79410224 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS11791891 | Chr9 | 87512411 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS2165893 | Chr9 | 87531423 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS17087869 | Chr9 | 87535284 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS763623 | Chr9 | 87539663 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS3780642 | Chr9 | 87553144 | Egr4 | 1961年 | 4.094E-5 | 反式 | ||
RS10992752 | Chr9 | 96240578 | Egr4 | 1961年 | 0.19 | 反式 | ||
RS10981864 | Chr9 | 116416735 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | ||
RS2807706 | Chr9 | 121744331 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS10739527 | Chr9 | 121772512 | Egr4 | 1961年 | 0.18 | 反式 | ||
RS2417062 | Chr9 | 130715921 | Egr4 | 1961年 | 0.18 | 反式 | ||
RS6537944 | Chr9 | 137312827 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS11252514 | Chr10 | 499572 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS772394 | Chr10 | 35980024 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS1908351 | Chr10 | 57877117 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS3104871 | Chr10 | 57878502 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS901309 | Chr10 | 72571899 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS485305 | Chr10 | 116048044 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS862785 | Chr11 | 20175604 | Egr4 | 1961年 | 0.17 | 反式 | ||
RS16911034 | Chr11 | 23302320 | Egr4 | 1961年 | 0.17 | 反式 | ||
RS1789300 | Chr11 | 95463631 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS1255149 | Chr11 | 95484493 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS3748251 | Chr11 | 95519156 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS16922543 | Chr11 | 95526116 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS16922622 | Chr11 | 95567387 | Egr4 | 1961年 | 0.07 | 反式 | ||
RS2239031 | CHR12 | 2336168 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS733593 | CHR12 | 6636391 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS374484 | CHR12 | 27627159 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS10771436 | CHR12 | 28744556 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS8490 | CHR12 | 51453904 | Egr4 | 1961年 | 2.772E-4 | 反式 | ||
RS1344796 | CHR12 | 76397104 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS12302525 | CHR12 | 89726424 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS10850201 | CHR12 | 109903061 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS7296098 | CHR12 | 113228993 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS11833075 | CHR12 | 122114592 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS9300277 | CHR12 | 128564195 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS3803214 | CHR13 | 25740255 | Egr4 | 1961年 | 0.16 | 反式 | ||
RS7982110 | CHR13 | 59723428 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS9528250 | CHR13 | 61410190 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS7330331 | CHR13 | 67403122 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS7327697 | CHR13 | 83227456 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS7321205 | CHR13 | 89949815 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS17667894 | CHR13 | 92014308 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | ||
RS7156088 | CHR14 | 27821865 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS8022005 | CHR14 | 61345380 | Egr4 | 1961年 | 2.207E-4 | 反式 | ||
RS10148418 | CHR14 | 67003872 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS941539 | CHR14 | 93561214 | Egr4 | 1961年 | 0.18 | 反式 | ||
RS1885073 | CHR14 | 104357181 | Egr4 | 1961年 | 5.229E-4 | 反式 | ||
RS4465541 | CHR14 | 105016846 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS17761129 | CHR15 | 24262387 | Egr4 | 1961年 | 0.19 | 反式 | ||
RS16973929 | CHR15 | 47395709 | Egr4 | 1961年 | 0.19 | 反式 | ||
RS2414703 | CHR15 | 61904602 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS289171 | CHR15 | 62576053 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS289161 | CHR15 | 62589888 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS4777108 | CHR15 | 69383464 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS9635390 | CHR15 | 90809632 | Egr4 | 1961年 | 3.235E-4 | 反式 | ||
RS16948375 | CHR15 | 94236354 | Egr4 | 1961年 | 0.19 | 反式 | ||
RS8047151 | CHR16 | 17209696 | Egr4 | 1961年 | 4.888e-7 | 反式 | ||
RS4271578 | CHR16 | 17213886 | Egr4 | 1961年 | 1.363E-5 | 反式 | ||
RS7200513 | CHR16 | 17219474 | Egr4 | 1961年 | 1.674E-4 | 反式 | ||
RS3829495 | CHR16 | 17221986 | Egr4 | 1961年 | 1.174E-5 | 反式 | ||
RS7193763 | CHR16 | 17225534 | Egr4 | 1961年 | 1.488E-4 | 反式 | ||
RS4316748 | CHR16 | 55781757 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS276966 | CHR16 | 86233753 | Egr4 | 1961年 | 0.17 | 反式 | ||
RS1867231 | CHR17 | 13678834 | Egr4 | 1961年 | 0.04 | 反式 | ||
RS7219986 | CHR17 | 53263206 | Egr4 | 1961年 | 0.06 | 反式 | ||
RS17817797 | CHR17 | 53332496 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS16951770 | CHR18 | 7444826 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS7244394 | CHR18 | 32223105 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS17074993 | CHR18 | 63260128 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS9319807 | CHR18 | 68766779 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
SNP_A-1821751 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | |||
RS1942461 | CHR18 | 70509159 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS1942462 | CHR18 | 70509823 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS1942463 | CHR18 | 70509841 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS1942464 | CHR18 | 70509877 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS1942466 | CHR18 | 70517154 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS2156494 | CHR18 | 70518084 | Egr4 | 1961年 | 0.05 | 反式 | ||
RS17056922 | CHR18 | 73086804 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | ||
RS16980096 | CHR19 | 15000921 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
SNP_A-2138575 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0.09 | 反式 | |||
RS234337 | CHR19 | 40458724 | Egr4 | 1961年 | 0.03 | 反式 | ||
RS234363 | CHR19 | 40474607 | Egr4 | 1961年 | 0.02 | 反式 | ||
RS1797040 | CHR20 | 23907743 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | ||
RS2424603 | 0 | Egr4 | 1961年 | 0.13 | 反式 | |||
RS6102879 | CHR20 | 41138766 | Egr4 | 1961年 | 0.18 | 反式 | ||
RS6026122 | CHR20 | 56769083 | Egr4 | 1961年 | 0.01 | 反式 | ||
RS2847443 | CHR21 | 14595263 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS2834872 | CHR21 | 36634845 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS2834875 | CHR21 | 36656119 | Egr4 | 1961年 | 0.08 | 反式 | ||
RS877910 | CHR21 | 36658376 | Egr4 | 1961年 | 0.14 | 反式 | ||
RS134028 | CHR22 | 28048448 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS5762317 | CHR22 | 28094988 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 | ||
RS5768165 | CHR22 | 48318197 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS5768168 | CHR22 | 48319334 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS5768173 | CHR22 | 48321475 | Egr4 | 1961年 | 0.15 | 反式 | ||
RS16978981 | Chrx | 13538144 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS4825301 | Chrx | 19476433 | Egr4 | 1961年 | 0.1 | 反式 | ||
RS7879159 | Chrx | 19481591 | Egr4 | 1961年 | 0 | 反式 | ||
RS5909301 | Chrx | 19493776 | Egr4 | 1961年 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003700 | 转录因子活性 | nas | 1584812 | |
去:0008270 | 锌离子结合 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
去:0006350 | 转录 | IEA | - | |
去:0008284 | 细胞增殖的阳性调节 | 塔斯 | 1658795 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PC12细胞中的ST分化途径 | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid nfat tfpathway | 47 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima NRG1信号向上发出 | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nagashima EGF信号向上 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP63目标 | 355 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄Foxa2靶向 | 45 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MATZUK精子细胞 | 72 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk精子 | 114 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hunsberger运动调节基因 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP | 142 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-326 | 324 | 331 | 1A,M8 | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
mir-330 | 414 | 420 | M8 | HSA-MIR-330脑 | GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA |