概括
基因 1961年
象征 Egr4
同义词 ngfi-c | ngfic | pat133
描述 早期增长反应4
参考 MIM:128992|HGNC:HGNC:3241|ENSEMBL:ENSG00000135625|HPRD:00550|Vega:Otthumg00000129774
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P13
Pascal P值 1.631E-6
Sherlock P值 0.938
胎儿β -2.285
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.547
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7607353 CHR2 72577225 Egr4 1961年 0.04 顺式
RS12059674 CHR1 57630277 Egr4 1961年 0.14 反式
RS17126801 CHR1 65098162 Egr4 1961年 0.04 反式
RS7511937 0 Egr4 1961年 0.09 反式
RS2782784 CHR1 71195282 Egr4 1961年 0.17 反式
RS17689089 CHR1 77740105 Egr4 1961年 0.08 反式
RS17100231 CHR1 77761339 Egr4 1961年 0.01 反式
RS17100274 CHR1 77774412 Egr4 1961年 4.884e-5 反式
RS6664544 CHR1 92524192 Egr4 1961年 0.05 反式
RS12403481 CHR1 109503655 Egr4 1961年 0.13 反式
RS17029293 CHR1 112567844 Egr4 1961年 0.2 反式
RS17649760 CHR1 150425940 Egr4 1961年 0.12 反式
RS16837984 CHR1 157042626 Egr4 1961年 0.01 反式
RS16837989 CHR1 157046286 Egr4 1961年 0.09 反式
RS16838012 CHR1 157048974 Egr4 1961年 0.01 反式
RS16838014 0 Egr4 1961年 0.01 反式
RS6666937 CHR1 170286842 Egr4 1961年 1.092E-5 反式
RS12071422 CHR1 185573879 Egr4 1961年 0.07 反式
RS16843112 CHR1 198420657 Egr4 1961年 0.15 反式
RS697455 CHR1 202512075 Egr4 1961年 0.17 反式
RS3748669 CHR1 207077022 Egr4 1961年 0.1 反式
RS6673109 CHR1 207253132 Egr4 1961年 0 反式
RS12034521 CHR1 239717679 Egr4 1961年 0 反式
SNP_A-1990354 0 Egr4 1961年 7.102E-4 反式
RS6432434 CHR2 14160930 Egr4 1961年 0.1 反式
RS12329305 CHR2 19552912 Egr4 1961年 0.12 反式
RS12611832 CHR2 31196248 Egr4 1961年 0.16 反式
RS12614732 CHR2 31199913 Egr4 1961年 0.16 反式
RS7560081 CHR2 62793238 Egr4 1961年 0.03 反式
RS17029079 CHR2 64736071 Egr4 1961年 0.12 反式
RS17038084 CHR2 85192280 Egr4 1961年 0 反式
RS17024035 CHR2 100968559 Egr4 1961年 0.01 反式
RS7574684 CHR2 100992911 Egr4 1961年 0.01 反式
RS17024129 CHR2 100995144 Egr4 1961年 0.01 反式
RS17024136 CHR2 100995382 Egr4 1961年 0.1 反式
RS7585898 CHR2 100998292 Egr4 1961年 0.01 反式
RS6716367 CHR2 101000013 Egr4 1961年 0.13 反式
RS1370627 CHR2 101009384 Egr4 1961年 0.01 反式
RS4149509 CHR2 101023698 Egr4 1961年 0.05 反式
RS6707117 CHR2 136855504 Egr4 1961年 7.911E-8 反式
RS10189091 CHR2 143471999 Egr4 1961年 0.05 反式
SNP_A-2198363 0 Egr4 1961年 0.16 反式
RS16838911 CHR2 156087569 Egr4 1961年 0 反式
RS7608942 CHR2 182820100 Egr4 1961年 0 反式
RS16829401 CHR2 233538391 Egr4 1961年 0.02 反式
RS17040622 CHR3 4440673 Egr4 1961年 0.08 反式
RS17684934 CHR3 4443547 Egr4 1961年 0 反式
RS17040633 CHR3 4446836 Egr4 1961年 0 反式
RS17756483 CHR3 4451309 Egr4 1961年 0 反式
RS17685441 CHR3 4465165 Egr4 1961年 0 反式
RS9863778 CHR3 55375950 Egr4 1961年 0.05 反式
RS997245 CHR3 61844600 Egr4 1961年 6.689E-5 反式
RS2875492 CHR3 86006209 Egr4 1961年 0.16 反式
RS16843128 CHR3 100713413 Egr4 1961年 0.02 反式
RS1381835 CHR3 110600595 Egr4 1961年 0.15 反式
RS4631023 CHR4 8101794 Egr4 1961年 0.18 反式
RS7684087 CHR4 21673380 Egr4 1961年 0.07 反式
RS16989064 CHR4 33639397 Egr4 1961年 0.06 反式
RS4469113 CHR4 41461062 Egr4 1961年 0 反式
RS2643038 CHR4 62313218 Egr4 1961年 0.13 反式
RS6827713 CHR4 79936877 Egr4 1961年 0.15 反式
RS6881821 CHR5 8578465 Egr4 1961年 0.01 反式
RS1697073 CHR5 30907267 Egr4 1961年 0.09 反式
RS2115110 CHR5 38193428 Egr4 1961年 0 反式
RS16873956 CHR5 44312488 Egr4 1961年 0.1 反式
RS10040715 CHR5 57594207 Egr4 1961年 3.821E-8 反式
RS13189446 CHR5 61572988 Egr4 1961年 0.16 反式
RS16890628 CHR5 61612280 Egr4 1961年 0.15 反式
RS16890651 CHR5 61629538 Egr4 1961年 0.18 反式
RS153869 CHR5 61754994 Egr4 1961年 0.16 反式
RS40290 CHR5 61817141 Egr4 1961年 0.08 反式
RS32170 CHR5 61847072 Egr4 1961年 0.16 反式
SNP_A-4217300 0 Egr4 1961年 3.294E-4 反式
RS1862599 CHR5 82095088 Egr4 1961年 0.07 反式
RS163953 CHR5 92289536 Egr4 1961年 0.1 反式
RS17134275 CHR5 100634998 Egr4 1961年 0.02 反式
RS10063272 CHR5 103540974 Egr4 1961年 0.06 反式
RS2963232 CHR5 103713882 Egr4 1961年 0.03 反式
RS2900115 CHR5 117414349 Egr4 1961年 0.07 反式
RS2141482 CHR5 136760477 Egr4 1961年 2.881E-5 反式
RS2189803 CHR5 137684661 Egr4 1961年 8.811E-6 反式
RS17209139 CHR5 142552525 Egr4 1961年 0.08 反式
RS259913 CHR5 169370782 Egr4 1961年 7.35e-4 反式
RS2116811 CHR5 171820051 Egr4 1961年 0.02 反式
RS195429 CHR6 37354434 Egr4 1961年 0.15 反式
RS17069168 CHR6 108335432 Egr4 1961年 0.16 反式
RS17069171 CHR6 108335593 Egr4 1961年 0.11 反式
RS4289676 CHR6 123999302 Egr4 1961年 0.01 反式
RS2030024 CHR6 131014624 Egr4 1961年 0 反式
RS10485094 CHR6 131071433 Egr4 1961年 3.882e-4 反式
RS17059517 CHR6 131076254 Egr4 1961年 0 反式
RS9402280 CHR6 131102770 Egr4 1961年 0.01 反式
RS7767456 CHR6 134356119 Egr4 1961年 0.12 反式
RS12164028 CHR6 136929934 Egr4 1961年 0.12 反式
RS17080121 CHR6 151009189 Egr4 1961年 0.14 反式
RS12529269 CHR6 153543829 Egr4 1961年 0.02 反式
RS10872699 CHR6 153544252 Egr4 1961年 2.708E-4 反式
RS1321606 CHR6 153545278 Egr4 1961年 0.01 反式
RS10945911 CHR6 164047509 Egr4 1961年 3.734E-4 反式
RS6461881 CHR7 25837688 Egr4 1961年 0.11 反式
RS13239699 CHR7 26377619 Egr4 1961年 0.2 反式
RS17156078 CHR7 27988688 Egr4 1961年 0.11 反式
RS12701006 CHR7 30147298 Egr4 1961年 5.332E-4 反式
RS1419793 CHR7 34697630 Egr4 1961年 3.562E-4 反式
RS17621151 CHR7 53572911 Egr4 1961年 0.02 反式
RS10245449 CHR7 80935100 Egr4 1961年 0.13 反式
RS10487383 CHR7 117671737 Egr4 1961年 0.06 反式
RS6958821 CHR7 153253566 Egr4 1961年 0.08 反式
RS11779237 CHR8 1227664 Egr4 1961年 0.11 反式
RS10109456 CHR8 19565941 Egr4 1961年 0.05 反式
RS10102886 CHR8 51805574 Egr4 1961年 0.03 反式
RS10504194 CHR8 56419808 Egr4 1961年 0.2 反式
RS1457044 CHR8 59257567 Egr4 1961年 7.696E-5 反式
RS1457032 CHR8 59290536 Egr4 1961年 0.01 反式
RS7465259 0 Egr4 1961年 0.08 反式
RS10104622 CHR8 63333773 Egr4 1961年 0.08 反式
RS2218911 CHR8 63371015 Egr4 1961年 0.08 反式
RS1551199 CHR8 63388117 Egr4 1961年 0.08 反式
RS1733950 CHR8 90062516 Egr4 1961年 4.767E-8 反式
RS1240028 CHR8 90093357 Egr4 1961年 5.466E-4 反式
RS1240087 CHR8 90113945 Egr4 1961年 0.02 反式
RS318307 CHR8 90185459 Egr4 1961年 0 反式
RS1483373 CHR8 90186442 Egr4 1961年 0.04 反式
RS11776005 CHR8 90187416 Egr4 1961年 0.04 反式
RS1159499 CHR8 90196948 Egr4 1961年 0.04 反式
RS1355060 CHR8 118717710 Egr4 1961年 0.05 反式
RS2280828 CHR8 118762435 Egr4 1961年 0.02 反式
RS4976941 CHR8 142744439 Egr4 1961年 8.703E-4 反式
RS9298651 Chr9 10076275 Egr4 1961年 3.826E-4 反式
RS16931013 Chr9 10076859 Egr4 1961年 3.826E-4 反式
RS16931018 Chr9 10077048 Egr4 1961年 3.826E-4 反式
RS1109460 Chr9 79410224 Egr4 1961年 0.15 反式
RS11791891 Chr9 87512411 Egr4 1961年 0.03 反式
RS2165893 Chr9 87531423 Egr4 1961年 0.01 反式
RS17087869 Chr9 87535284 Egr4 1961年 0.15 反式
RS763623 Chr9 87539663 Egr4 1961年 0.02 反式
RS3780642 Chr9 87553144 Egr4 1961年 4.094E-5 反式
RS10992752 Chr9 96240578 Egr4 1961年 0.19 反式
RS10981864 Chr9 116416735 Egr4 1961年 0.09 反式
RS2807706 Chr9 121744331 Egr4 1961年 0.07 反式
RS10739527 Chr9 121772512 Egr4 1961年 0.18 反式
RS2417062 Chr9 130715921 Egr4 1961年 0.18 反式
RS6537944 Chr9 137312827 Egr4 1961年 0.04 反式
RS11252514 Chr10 499572 Egr4 1961年 0.04 反式
RS772394 Chr10 35980024 Egr4 1961年 0.03 反式
RS1908351 Chr10 57877117 Egr4 1961年 0.03 反式
RS3104871 Chr10 57878502 Egr4 1961年 0 反式
RS901309 Chr10 72571899 Egr4 1961年 0.16 反式
RS485305 Chr10 116048044 Egr4 1961年 0.02 反式
RS862785 Chr11 20175604 Egr4 1961年 0.17 反式
RS16911034 Chr11 23302320 Egr4 1961年 0.17 反式
RS1789300 Chr11 95463631 Egr4 1961年 0.04 反式
RS1255149 Chr11 95484493 Egr4 1961年 0.05 反式
RS3748251 Chr11 95519156 Egr4 1961年 0.07 反式
RS16922543 Chr11 95526116 Egr4 1961年 0.07 反式
RS16922622 Chr11 95567387 Egr4 1961年 0.07 反式
RS2239031 CHR12 2336168 Egr4 1961年 0.15 反式
RS733593 CHR12 6636391 Egr4 1961年 0.12 反式
RS374484 CHR12 27627159 Egr4 1961年 0.01 反式
RS10771436 CHR12 28744556 Egr4 1961年 0.14 反式
RS8490 CHR12 51453904 Egr4 1961年 2.772E-4 反式
RS1344796 CHR12 76397104 Egr4 1961年 0 反式
RS12302525 CHR12 89726424 Egr4 1961年 0.08 反式
RS10850201 CHR12 109903061 Egr4 1961年 0.04 反式
RS7296098 CHR12 113228993 Egr4 1961年 0.14 反式
RS11833075 CHR12 122114592 Egr4 1961年 0 反式
RS9300277 CHR12 128564195 Egr4 1961年 0.1 反式
RS3803214 CHR13 25740255 Egr4 1961年 0.16 反式
RS7982110 CHR13 59723428 Egr4 1961年 0.02 反式
RS9528250 CHR13 61410190 Egr4 1961年 0.05 反式
RS7330331 CHR13 67403122 Egr4 1961年 0.04 反式
RS7327697 CHR13 83227456 Egr4 1961年 0.01 反式
RS7321205 CHR13 89949815 Egr4 1961年 0.03 反式
RS17667894 CHR13 92014308 Egr4 1961年 0.09 反式
RS7156088 CHR14 27821865 Egr4 1961年 0.01 反式
RS8022005 CHR14 61345380 Egr4 1961年 2.207E-4 反式
RS10148418 CHR14 67003872 Egr4 1961年 0.05 反式
RS941539 CHR14 93561214 Egr4 1961年 0.18 反式
RS1885073 CHR14 104357181 Egr4 1961年 5.229E-4 反式
RS4465541 CHR14 105016846 Egr4 1961年 0.03 反式
RS17761129 CHR15 24262387 Egr4 1961年 0.19 反式
RS16973929 CHR15 47395709 Egr4 1961年 0.19 反式
RS2414703 CHR15 61904602 Egr4 1961年 0.15 反式
RS289171 CHR15 62576053 Egr4 1961年 0.01 反式
RS289161 CHR15 62589888 Egr4 1961年 0.01 反式
RS4777108 CHR15 69383464 Egr4 1961年 0.14 反式
RS9635390 CHR15 90809632 Egr4 1961年 3.235E-4 反式
RS16948375 CHR15 94236354 Egr4 1961年 0.19 反式
RS8047151 CHR16 17209696 Egr4 1961年 4.888e-7 反式
RS4271578 CHR16 17213886 Egr4 1961年 1.363E-5 反式
RS7200513 CHR16 17219474 Egr4 1961年 1.674E-4 反式
RS3829495 CHR16 17221986 Egr4 1961年 1.174E-5 反式
RS7193763 CHR16 17225534 Egr4 1961年 1.488E-4 反式
RS4316748 CHR16 55781757 Egr4 1961年 0.03 反式
RS276966 CHR16 86233753 Egr4 1961年 0.17 反式
RS1867231 CHR17 13678834 Egr4 1961年 0.04 反式
RS7219986 CHR17 53263206 Egr4 1961年 0.06 反式
RS17817797 CHR17 53332496 Egr4 1961年 0.01 反式
RS16951770 CHR18 7444826 Egr4 1961年 0.08 反式
RS7244394 CHR18 32223105 Egr4 1961年 0.13 反式
RS17074993 CHR18 63260128 Egr4 1961年 0.13 反式
RS9319807 CHR18 68766779 Egr4 1961年 0.02 反式
SNP_A-1821751 0 Egr4 1961年 0 反式
RS1942461 CHR18 70509159 Egr4 1961年 0.05 反式
RS1942462 CHR18 70509823 Egr4 1961年 0.05 反式
RS1942463 CHR18 70509841 Egr4 1961年 0.05 反式
RS1942464 CHR18 70509877 Egr4 1961年 0.01 反式
RS1942466 CHR18 70517154 Egr4 1961年 0.05 反式
RS2156494 CHR18 70518084 Egr4 1961年 0.05 反式
RS17056922 CHR18 73086804 Egr4 1961年 0.09 反式
RS16980096 CHR19 15000921 Egr4 1961年 0.1 反式
SNP_A-2138575 0 Egr4 1961年 0.09 反式
RS234337 CHR19 40458724 Egr4 1961年 0.03 反式
RS234363 CHR19 40474607 Egr4 1961年 0.02 反式
RS1797040 CHR20 23907743 Egr4 1961年 0.13 反式
RS2424603 0 Egr4 1961年 0.13 反式
RS6102879 CHR20 41138766 Egr4 1961年 0.18 反式
RS6026122 CHR20 56769083 Egr4 1961年 0.01 反式
RS2847443 CHR21 14595263 Egr4 1961年 0.15 反式
RS2834872 CHR21 36634845 Egr4 1961年 0.14 反式
RS2834875 CHR21 36656119 Egr4 1961年 0.08 反式
RS877910 CHR21 36658376 Egr4 1961年 0.14 反式
RS134028 CHR22 28048448 Egr4 1961年 0 反式
RS5762317 CHR22 28094988 Egr4 1961年 0.12 反式
RS5768165 CHR22 48318197 Egr4 1961年 0.15 反式
RS5768168 CHR22 48319334 Egr4 1961年 0.15 反式
RS5768173 CHR22 48321475 Egr4 1961年 0.15 反式
RS16978981 Chrx 13538144 Egr4 1961年 0 反式
RS4825301 Chrx 19476433 Egr4 1961年 0.1 反式
RS7879159 Chrx 19481591 Egr4 1961年 0 反式
RS5909301 Chrx 19493776 Egr4 1961年 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003700 转录因子活性 nas 1584812
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006355 调节转录,DNA依赖性的调节 IEA -
去:0006350 转录 IEA -
去:0008284 细胞增殖的阳性调节 塔斯 1658795
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PC12细胞中的ST分化途径 45 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pid nfat tfpathway 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CD8 TCR下游途径 65 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima NRG1信号向上发出 176 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nagashima EGF信号向上 58 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄Foxa2靶向 45 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK精子细胞 72 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hunsberger运动调节基因 31 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME3和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 142 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-326 324 331 1A,M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-330 414 420 M8 HSA-MIR-330 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA