基因页：EIF4E

概括?
基因 1977年
年代ymbol EIF4E
同义词 auts19 | cbp | eif4e1 | eif4el1 | eif4f | eif-4e
描述 真核翻译起始因子4E
参考 MIM:133440|HGNC：HGNC：3287|HPRD：00591|
基因type protein-coding
地图位置 4q23
Pascal P值 0.511
Sherlock P值 0.315
Fetal beta 0.776
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 3
PMID:cooccur 高通量文献搜索 年代ystematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0067

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position 最近的基因 P (dis) beta（dis） FDR (dis) 年代tudy
CG11037477 4 99851008 EIF4E 1.465E-4 0.563 0.031 DMG:Wockner_2014
cg15633390 4 99851211 EIF4E 3.028e-4 0.657 0.04 DMG:Wockner_2014
cg14972143 4 99851003 EIF4E 3.611E-4 0.664 0.042 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

年代NP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs4729109 chr7 93760673 EIF4E 1977年 0.18 trans
RS7035652 chr9 117779879 EIF4E 1977年 0.08 trans

年代ection II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AP003117.1 0.79 0.84
CTBS 0.77 0.73
cryl1 0.77 0.76
TMBIM1 0.77 0.81
年代ERPINB6 0.76 0.78
GRAMD3 0.75 0.81
lactb2 0.75 0.78
CD9 0.74 0.80
PIR 0.74 0.75
CSRP1 0.74 0.79
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KIAA1543 -0.60 -0.64
Nova2 -0.60 -0.64
CHD3 -0.60 -0.63
DPF1 -0.59 -0.64
MARCH4 -0.59 -0.63
ZNF821 -0.59 -0.63
KIAA1949 -0.58 -0.60
mpp3 -0.58 -0.61
GPSM1 -0.58 -0.60
kif21b -0.58 -0.62

年代ection III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0000339 RNA cap binding 塔斯 3469651
去：0003743 翻译引发因子活动 ISS -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 9878069|10856257|15153109
|15247416|16739988
|17353931
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006413 翻译启动 IEA -
GO:0006417 翻译调节 IEA -
GO：0044419 生物之间的种间相互作用 IEA -
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005829 cytosol 经验 7935836|8449919|12588972
|15809305
GO:0005737 细胞质 IEA -
GO:0016281 真核翻译起始因子4F复合物 塔斯 3469651

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
EIF3B EIF3-ETA | EIF3-P110 | EIF3-P116 | EIF3S9 | MGC104664 | MGC131875 | PRT1 eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B Affinity Capture-Western BioGRID 16541103
EIF4A1 DDX2A | EIF-4A | EIF4A eukaryotic translation initiation factor 4A, isoform 1 亲和力捕获ms
Affinity Capture-Western		 BioGRID 16648488|17353931
EIF4A2 BM-010 |ddx2b |EIF4A |EIF4F eukaryotic translation initiation factor 4A, isoform 2 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
EIF4E CBP |EIF4E1 |EIF4EL1 |EIF4F |MGC111573 真核翻译起始因子4E Affinity Capture-Western BioGRID 16648488
EIF4EBP1 4e-bp1 |4EBP1 |BP-1 |MGC4316 |phas-i 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 EIF4E与EIF4EBP1（4EBP1）相互作用。 BIND 10022874
EIF4EBP1 4e-bp1 |4EBP1 |BP-1 |MGC4316 |phas-i 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 - HPRD，Biogrid 11605658
EIF4EBP2 4 ebp2 | PHASII 真核翻译起始因子4E结合蛋白2 - HPRD，Biogrid 7651417|7935836
EIF4EBP3 4E-BP3 真核翻译起始因子4Ebinding protein 3 - HPRD，Biogrid 12482586
EIF4ENIF1 4E-T | Clast4 | FLJ21601 | FLJ26551 真核翻译起始因子4E核进口因子1 - HPRD，Biogrid 10856257
EIF4G1 DKFZp686A1451 | EIF4F | EIF4G | p220 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 1 - HPRD，Biogrid 10600798
EIF4G1 DKFZp686A1451 | EIF4F | EIF4G | p220 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 1 - HPRD 9372926|10600798 | 10600798
EIF4G1 DKFZp686A1451 | EIF4F | EIF4G | p220 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 1 EIF4E与EIF4G1相互作用。这种相互作用是在小鼠EIF4E和人EIF4G1之间证明的相互作用上建模的。 BIND 9878069
EIF4G1 DKFZp686A1451 | EIF4F | EIF4G | p220 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 1 eIF4GI interacts with eIF4E. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human eIF4GI and monkey eIF4E. BIND 15361857
EIF4G1 DKFZp686A1451 | EIF4F | EIF4G | p220 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 1 EIF-4E与EIF-4G的未指定同工型相互作用。 BIND 15897904
EIF4G2 AAG1 |DAP5 |FLJ41344 |nat1 |P97 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 2 Affinity Capture-Western
远西方		 BioGRID 9418880
EIF4G2 AAG1 |DAP5 |FLJ41344 |nat1 |P97 eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 2 - HPRD 10394359
EIF4G3 eIF4GII eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 3 - HPRD 9418880
MAPKAPK5 PRAK mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 5 - HPRD 9628874
MKNK1 MNK1 MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1 Affinity Capture-Western BioGRID 9878069
MKNK1 MNK1 MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1 EIF4E与MNK1相互作用。这种相互作用是在小鼠EIF4E和人MNK1之间的相互作用上建模的。 BIND 9878069
PML MYL | PP8675 | RNF71 | TRIM19 Promyelocytic白血病 - HPRD，Biogrid 11500381


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG MTOR SIGNALING PATHWAY 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EIF途径 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA MTOR PATHWAY 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EIF4途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IGF1MTOR途径 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA SARS通路 10 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代T ERK1 ERK2 MAPK PATHWAY 32 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST P38 MAPK途径 37 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID遇到了路径 80 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MYC活动途径 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID MTOR 4PATHWAY 69 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRANSLATION 222 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IFN刺激基因的反应组抗病毒机制 66 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PROCESSING OF CAPPED INTRON CONTAINING PRE MRNA 140 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
盖结合复合物和EIF的结合后，mRNA的反应组激活，然后与43S结合 84 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
成熟转录本向细胞质的反应组传输 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MRNA PROCESSING 161 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF PROTEINS 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome 3 UTR介导的翻译调节 176 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
源自内在转录本的成熟mRNA的反应组传输 33 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DEADENYLATION OF MRNA 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF MRNA 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME DEADENYLATION DEPENDENT MRNA DECAY 48 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME INTERFERON SIGNALING 159 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKB介导的事件 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNALING BY INSULIN RECEPTOR 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统 933 616 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME MTORC1 MEDIATED SIGNALLING 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导 270 204 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PI3K CASCADE 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC LYMPHOMA DN 136 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU INFLAMMATORY RESPONSE LIVE UP 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up 431 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIDUS METASTASIS UP 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chow rassf1靶向 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO PML TARGETS BOUND BY MYC UP 23 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
liang造血细胞数量小vs巨大 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH CYCLING GENES 648 385 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代TARK PREFRONTAL CORTEX 22Q11 DELETION DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
年代HEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP 197 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERNANDEZ BOUND BY MYC 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染的Debiasi凋亡 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS DN 371 218 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV ALL UP 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D2 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YIH RESPONSE TO ARSENITE C4 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHU CMV 24 HR UP 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng环境压力反应 56 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAIRKEE CANCER PRONE RESPONSE BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WHITFIELD CELL CYCLE M G1 148 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THILLAINADESAN ZNF217 TARGETS UP 44 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOINUMA TARGETS OF SMAD2 OR SMAD3 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir1靶标dn 7 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-1/206 790 796 m8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ UGGAAUGUAAGGAAGUGUGUGG
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-15/16/195/424/497 496 502 1a HSA-MIR-15a脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15b脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
hsa-miR-497 CAGCAGCACACUGUGGUUUGU
mir-150 52 58 m8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-186 652 658 m8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-203.1 709 715 1a HSA-MIR-203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
miR-205 601 607 1a HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
miR-330 869 875 m8 HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-376c 729 735 m8 HSA-MIR-376C AACAUAGAGGAAAUUCCACG
mir-377 737 743 m8 hsa-miR-377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir-493-5p 924 930 1a hsa-miR-493-5p UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU
miR-503 496 502 1a HSA-MIR-503 uagcagcgggaacaguucugcag
miR-9 63 69 m8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga