基因页：EIF4EBP1
概括？
| 基因 | 1978年 |
| 象征 | EIF4EBP1 |
| 同义词 | 4e-bp1 | 4ebp1 | bp-1 | phas-i |
| 描述 | 真核翻译起始因子4E结合蛋白1 |
| 参考 | MIM：602223|HGNC：HGNC：3288|ENSEMBL：ENSG00000187840|HPRD：03746|Vega：Otthumg00000164012 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 8p12 |
| Pascal P值 | 0.607 |
| Sherlock P值 | 0.875 |
| 胎儿β | 2.209 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0067 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18350458 | 8 | 37887952 | EIF4EBP1 | 3.69e-8 | -0.012 | 1.07E-5 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1560659 | CHR5 | 166951510 | EIF4EBP1 | 1978年 | 0.03 | 反式 | ||
| RS16902003 | CHR8 | 128188054 | EIF4EBP1 | 1978年 | 0.07 | 反式 | ||
| RS9738671 | 0 | EIF4EBP1 | 1978年 | 0.15 | 反式 | |||
| RS17052029 | CHR13 | 35874849 | EIF4EBP1 | 1978年 | 0.11 | 反式 | ||
| RS4501739 | Chrx | 35960848 | EIF4EBP1 | 1978年 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ATF2 | 0.91 | 0.94 |
| OCRL | 0.91 | 0.92 |
| WDR47 | 0.91 | 0.93 |
| ythdf3 | 0.91 | 0.92 |
| Elavl4 | 0.91 | 0.94 |
| Spin1 | 0.91 | 0.92 |
| FEM1B | 0.91 | 0.93 |
| BZW1 | 0.91 | 0.91 |
| pafah1b2 | 0.91 | 0.90 |
| GFPT1 | 0.90 | 0.93 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FXYD1 | -0.73 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.80 |
| AF347015.31 | -0.69 | -0.78 |
| AF347015.33 | -0.68 | -0.77 |
| higd1b | -0.68 | -0.78 |
| TSC22D4 | -0.67 | -0.73 |
| mt-cyb | -0.67 | -0.76 |
| hepn1 | -0.66 | -0.71 |
| ifi27 | -0.66 | -0.77 |
| SLC25A18 | -0.66 | -0.74 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15094042|15153109|17353931 |
|
| 去：0008190 | 真核引发因子4E结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008286 | 胰岛素受体信号通路 | IEA | - | |
| GO：0045947 | 翻译启动的负调节 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 7935836|15809305 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg erbb信号通路 | 87 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg mtor信号通路 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg急性髓样白血病 | 60 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta mtor途径 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta EIF4途径 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta IGF1MTOR途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID胰岛素途径 | 45 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MTOR 4 Pathway | 69 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID p38 alpha beta下游途径 | 38 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome翻译 | 222 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 盖结合复合物和EIF的结合后，mRNA的反应组激活，然后与43S结合 | 84 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome PKB介导的事件 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome MTORC1介导的信号传导 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chemnitz对前列腺素E2的反应 | 146 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Davicioni分子臂与ERMS DN | 182 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Corre多发性骨髓瘤 | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合单核细胞的TONKS目标 | 204 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC3靶向DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向DN | 459 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德里格甲状腺癌的分化不佳 | 633 | 376 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的甲状腺癌间变性 | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应表皮增强 | 293 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN | 153 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| landis erbb2乳房肿瘤型DN | 55 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN | 149 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗斯蒂宫颈癌增殖簇 | 140 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dacosta UV响应通过ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Amundson对砷的回应 | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mohankumar TLX1靶向DN | 193 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ozen mir125b1靶标 | 25 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ropero HDAC2目标 | 114 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PTCH1和Sufu的Lee目标 | 53 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌8p12 P11扩增子 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭亮氨酸剥夺 | 142 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Greenbaum E2A靶向 | 33 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| XU对维甲酸和NSC682994 DN的响应 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramalho Stemness | 206 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HU遗传毒性损伤24小时 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 海勒被甲基化DN沉默 | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 怀特福德小儿癌标记 | 116 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 对Salirasib的反应 | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chang Core血清反应 | 212 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应13 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向低血清 | 100 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标增长 | 243 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1目标汇合 | 567 | 365 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-125/351 | 142 | 148 | M8 | HSA-MIR-125B脑 | ucccugagacccuaacuuguga |
| HSA-MIR-125A脑 | ucccugagacccuuaaccugug | ||||