基因页：EIF5
Summary？
| 基因 | 1983 |
| 象征 | EIF5 |
| Synonyms | EIF-5 | EIF-5A |
| Description | 真核翻译引发因子5 |
| 参考erence | MIM：601710|HGNC：HGNC：3299|ENSEMBL：ENSG00000100664|HPRD：03417|Vega：Otthumg00000171839 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| Map location | 14Q32.32 |
| Pascal P值 | 3.742E-7 |
| Sherlock p-value | 0.908 |
| 胎儿β | -1.295 |
| 主持人 | 前扣带回皮层BA24 元 |
| 支持 | CompositeSet |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Girard_2011 | 整个外显子组测序分析 | 数据集包括从14个精神分裂症概率及其父母的外部发现的15个DNM。 | |
| 表达 | 元-analysis of gene expression | p价值：2.502 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
DNM表
DNM表| Gene | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EIF5 | CHR14 | 103806120 | 一个 | G | NM_001969 NM_183004 |
p.351i> v p.351i> v |
missense missense |
Schizophrenia | DNM：Girard_2011 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS62006272 | 14 | 103972990 | EIF5 | ENSG00000100664.6 | 3.28551E-6 | 0.05 | 173109 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
一个total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| EPC1 | 0.97 | 0.94 |
| NUP160 | 0.96 | 0.94 |
| KDM4A | 0.96 | 0.94 |
| FUBP1 | 0.96 | 0.93 |
| RAF1 | 0.96 | 0.95 |
| VPRBP | 0.96 | 0.94 |
| setDB1 | 0.96 | 0.94 |
| SSRP1 | 0.95 | 0.93 |
| 加特 | 0.95 | 0.92 |
| C9orf97 | 0.95 | 0.94 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C5orf53 | -0.74 | -0.74 |
| AF347015.31 | -0.73 | -0.88 |
| AIFM3 | -0.73 | -0.76 |
| AF347015.27 | -0.73 | -0.87 |
| HLA-F | -0.73 | -0.74 |
| MT-CO2 | -0.72 | -0.89 |
| FXYD1 | -0.72 | -0.87 |
| ifi27 | -0.72 | -0.86 |
| AF347015.33 | -0.71 | -0.85 |
| S100B | -0.71 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | nucleotide binding | IEA | - | |
| GO:0003743 | 翻译引发因子活动 | nas | 8663286 | |
| 去：0003924 | GTPase activity | TAS | 8663286 | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006446 | regulation of translational initiation | TAS | 8663286 | |
| Cellular component | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0005829 | 细胞质 | nas | 8663286 | |
| 去：0005737 | cytoplasm | TAS | 8663286 |
Section V. Pathway annotation
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | miRNA ID | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-101 | 926 | 932 | 1a | hsa-miR-101 | uacaguacugauaacugaag |
| mir-103/107 | 32 | 39 | 1A，M8 | hsa-miR-103brain | agcagcauuguacggcuauga |
| hsa-miR-107brain | 一个GCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA | ||||
| miR-144 | 925 | 932 | 1A，M8 | HSA-MIR-144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| miR-149 | 57 | 63 | 1a | HSA-MIR-149brain | Ucuggcuccucuucuucacuccc |
| miR-182 | 1968年 | 1974 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca | ||||
| mir-26 | 2091 | 2097 | M8 | HSA-MIR-26Abrain | UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC |
| HSA-MIR-26BSZ | UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU | ||||
| mir-31 | 1036 | 1043 | 1A，M8 | hsa-miR-31 | Aggcaagaugcuggcauagcug |
| miR-494 | 220 | 226 | M8 | HSA-MIR-494brain | ugaaacauacgggaaaccucuu |
| miR-542-3p | 1710 | 1716年 | 1a | HSA-MIR-542-3P | UGUGACAGAUUGAUAACUGAAA |
| mir-9 | 1716年 | 1723年 | 1A，M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |
| mir-96 | 1039 | 1045 | 1a | HSA-MIR-96brain | uuuggcacuagcacauuuuugc |
| HSA-MIR-96brain | uuuggcacuagcacauuuuugc | ||||