基因页:Elavl1
概括?
基因 | 1994 |
象征 | Elavl1 |
同义词 | elav1 | hur | hua |梅尔格 |
描述 | 像elav这样的RNA结合蛋白1 |
参考 | MIM:603466|HGNC:HGNC:3312|Ensembl:ENSG0000000066044|HPRD:16025|Vega:Otthumg00000182470 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.2 |
Pascal P值 | 0.146 |
Sherlock P值 | 0.008 |
胎儿β | 0.831 |
主持人 | 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ELAVL1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DAB1 | 0.96 | 0.87 |
AFF3 | 0.95 | 0.94 |
提亚姆2 | 0.95 | 0.91 |
Bach2 | 0.94 | 0.92 |
SEZ6 | 0.94 | 0.94 |
SSBP2 | 0.94 | 0.89 |
Dact1 | 0.93 | 0.90 |
FAT4 | 0.93 | 0.90 |
LRCH1 | 0.93 | 0.92 |
ankrd44 | 0.93 | 0.92 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
serpinb6 | -0.65 | -0.73 |
C5orf53 | -0.62 | -0.76 |
AIFM3 | -0.62 | -0.80 |
HSD17B14 | -0.61 | -0.82 |
hepn1 | -0.61 | -0.74 |
TNFSF12 | -0.61 | -0.66 |
AC007405.8 | -0.61 | -0.66 |
SLC16A11 | -0.61 | -0.67 |
LHPP | -0.60 | -0.59 |
RAMP1 | -0.60 | -0.80 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Anp32a | C15orf1 |i1pp2a |lanp |mapm |MGC119787 |MGC150373 |phap1 |phapi |pp32 | 酸性(富含亮氨酸)核磷蛋白32家族,成员A | - | HPRD | 11018049|11565755 |11729309 |
Anp32b | 四月|phapi2 |SSP29 | 酸性(富含亮氨酸)核磷蛋白32家族,成员B | - | HPRD | 11018049|11565755 |11729309 |
Carm1 | PRMT4 | 共激活剂相关的精氨酸甲基转移酶1 | - | HPRD | 12237300 |
HNRNPA1 | HNRPA1 |MGC102835 | 异质核核糖核蛋白A1 | - | HPRD | 11565755 |
hnrnpab | ABBP1 |FLJ40338 |hnrpab | 异质核核糖核蛋白A/B | - | HPRD | 11565755 |
KPNA1 | IPOA5 |NPI-1 |RCH2 |SRP1 | 核桃蛋白α1(importin alpha 5) | - | HPRD | 15342649 |
KPNB1 | IMB1 |IPOB |impnb |MGC2155 |MGC2156 |MGC2157 |NTF97 | 核桃蛋白(importin)beta 1 | - | HPRD | 15037768|15342649 |
PAIP2 | MGC72018 |paip2a | 聚(A)结合蛋白相互作用蛋白2 | - | HPRD | 15175342 |
PTMA | MGC104802 |TMSA | 螺赛蛋白,α | Elavl1(HUR)与PMTA(Prot-Alpha)mRNA相互作用。 | 绑定 | 15861128 |
放 | 2pp2a |i2pp2a |igaad |ipp2a2 |phapii |taf-i |taf-ibeta | 设置核癌 | - | HPRD | 11018049|11565755 |
SFRS12 | DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 | 剪接因子,精氨酸/丝氨酸富集12 | - | HPRD | 14559993 |
TNPO1 | IPO2 |kpnb2 |mip |MIP1 |trn | 运输1 | - | HPRD | 15037768|15342649 |
TNPO2 | FLJ12155 |IPO3 |kpnb2b |trn2 | Transportin 2(Importin 3,Karyopherin beta 2b) | - | HPRD | 11729309|14981248 |15037768 |
XPO1 | CRM1 |DKFZP686B1823 | Exportin 1(CRM1同源物,酵母) | - | HPRD,Biogrid | 11565755 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta VEGF途径 | 29 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
mRNA的反应组代谢 | 284 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
READEM RNA的代谢 | 330 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名2 DN | 77 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移 | 214 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 | 177 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高 | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌 | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mohankumar TLX1靶向 | 414 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向DN | 848 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petretto心脏质量QTL顺式DN | 24 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期24小时 | 43 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CCND1和CDK4 DN的Molenaar靶标 | 58 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌 | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类polymomy7 | 79 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kamminga衰老 | 41 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由PML Rara Fusion绑定的Martens | 456 | 287 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标3 DN | 918 | 550 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir133靶向 | 43 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |