概括
基因 1994
象征 Elavl1
同义词 elav1 | hur | hua |梅尔格
描述 像elav这样的RNA结合蛋白1
参考 MIM:603466|HGNC:HGNC:3312|Ensembl:ENSG0000000066044|HPRD:16025|Vega:Otthumg00000182470
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p13.2
Pascal P值 0.146
Sherlock P值 0.008
胎儿β 0.831
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DAB1 0.96 0.87
AFF3 0.95 0.94
提亚姆2 0.95 0.91
Bach2 0.94 0.92
SEZ6 0.94 0.94
SSBP2 0.94 0.89
Dact1 0.93 0.90
FAT4 0.93 0.90
LRCH1 0.93 0.92
ankrd44 0.93 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
serpinb6 -0.65 -0.73
C5orf53 -0.62 -0.76
AIFM3 -0.62 -0.80
HSD17B14 -0.61 -0.82
hepn1 -0.61 -0.74
TNFSF12 -0.61 -0.66
AC007405.8 -0.61 -0.66
SLC16A11 -0.61 -0.67
LHPP -0.60 -0.59
RAMP1 -0.60 -0.80

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
Anp32a C15orf1 |i1pp2a |lanp |mapm |MGC119787 |MGC150373 |phap1 |phapi |pp32 酸性(富含亮氨酸)核磷蛋白32家族,成员A - HPRD 11018049|11565755
|11729309
Anp32b 四月|phapi2 |SSP29 酸性(富含亮氨酸)核磷蛋白32家族,成员B - HPRD 11018049|11565755
|11729309
Carm1 PRMT4 共激活剂相关的精氨酸甲基转移酶1 - HPRD 12237300
HNRNPA1 HNRPA1 |MGC102835 异质核核糖核蛋白A1 - HPRD 11565755
hnrnpab ABBP1 |FLJ40338 |hnrpab 异质核核糖核蛋白A/B - HPRD 11565755
KPNA1 IPOA5 |NPI-1 |RCH2 |SRP1 核桃蛋白α1(importin alpha 5) - HPRD 15342649
KPNB1 IMB1 |IPOB |impnb |MGC2155 |MGC2156 |MGC2157 |NTF97 核桃蛋白(importin)beta 1 - HPRD 15037768|15342649
PAIP2 MGC72018 |paip2a 聚(A)结合蛋白相互作用蛋白2 - HPRD 15175342
PTMA MGC104802 |TMSA 螺赛蛋白,α Elavl1(HUR)与PMTA(Prot-Alpha)mRNA相互作用。 绑定 15861128
2pp2a |i2pp2a |igaad |ipp2a2 |phapii |taf-i |taf-ibeta 设置核癌 - HPRD 11018049|11565755
SFRS12 DKFZP564B176 |MGC133045 |SRRP508 |SRRP86 剪接因子,精氨酸/丝氨酸富集12 - HPRD 14559993
TNPO1 IPO2 |kpnb2 |mip |MIP1 |trn 运输1 - HPRD 15037768|15342649
TNPO2 FLJ12155 |IPO3 |kpnb2b |trn2 Transportin 2(Importin 3,Karyopherin beta 2b) - HPRD 11729309|14981248
|15037768
XPO1 CRM1 |DKFZP686B1823 Exportin 1(CRM1同源物,酵母) - HPRD,Biogrid 11565755


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta VEGF途径 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
mRNA的反应组代谢 284 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
READEM RNA的代谢 330 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过结合富元元素的蛋白质对mRNA稳定性的反应组调节 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名2 DN 77 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移 214 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hahtola兄弟姐妹Fungoides皮肤 177 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petretto心脏质量QTL顺式DN 24 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期24小时 43 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CCND1和CDK4 DN的Molenaar靶标 58 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin DN的反应 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性 374 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类polymomy7 79 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dang myc的目标 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kamminga衰老 41 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir133靶向 43 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因