基因页面:ELAVL3

总结吗?
GeneID 1995年
象征 ELAVL3
同义词 HUC | HUCL | PLE21
描述 ELAV像特异性神经元RNA结合蛋白3
参考 MIM: 603458|HGNC: HGNC: 3314|运用:ENSG00000196361|HPRD: 16024|织女:OTTHUMG00000182030
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 p13.2
帕斯卡假定值 0.54
夏洛克假定值 0.94
胎儿β 0.75
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
DMG: Jaffe_2016 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 1
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:1

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg06808897 19 11590688 ELAVL3 4.25 e-9 -0.015 2.55 e-6 DMG: Jaffe_2016

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16888392 chr6 57076551 ELAVL3 1995年 0.2 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MRPS2 0.93 0.93
GNB2 0.91 0.92
SCAMP3 0.91 0.90
AIMP2 0.90 0.91
笨蛋 0.90 0.92
LRRC41 0.89 0.90
PTOV1 0.89 0.94
YIPF3 0.89 0.91
UNC119 0.89 0.89
HTRA2 0.89 0.88
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.75 -0.83
AF347015.8 -0.75 -0.85
AF347015.27 -0.75 -0.84
AF347015.33 -0.74 -0.82
MT-CYB -0.73 -0.82
AF347015.31 -0.73 -0.80
AF347015.15 -0.72 -0.82
AF347015.26 -0.71 -0.84
AF347015.2 -0.71 -0.82
AF347015.21 -0.69 -0.82

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0003723 核糖核酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007399 神经系统发育 国际能源机构 神经突(术语层面:5) - - - - - -
去:0007275 多细胞有机体的发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0030154 细胞分化 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
周炎症反应费马DN 284年 156年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP63目标 355年 243年 所有SZGR 2.0基因通路
MARTORIATI MDM4目标神经上皮DN 164年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
SCHAEFFER前列腺癌发展12小时DN 57 45 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 398年 262年 所有SZGR 2.0基因通路
FERRANDO T与MLL ENL融合起来 87年 67年 所有SZGR 2.0基因通路
MA骨髓分化了 39 29日 所有SZGR 2.0基因通路
RORIE EWSR1 FLI1融合DN的目标 30. 23 所有SZGR 2.0基因通路
JEPSEN SMRT目标 33 23 所有SZGR 2.0基因通路
由喀斯特IWANAGA致癌PTEN 181年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
损害阻力BCL2抑制剂 36 24 所有SZGR 2.0基因通路
八木AML和11 q23处重新安排 351年 238年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳人大HCP H3K4ME2和H3K27ME3 349年 234年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应通过TP53集团 898年 516年 所有SZGR 2.0基因通路
GOBERT少突细胞分化DN 1080年 713年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-10 146年 152年 m8 hsa-miR-10a UACCCUGUAGAUCCGAAUUUGUG
hsa-miR-10b UACCCUGUAGAACCGAAUUUGU
mir - 129 - 5 - p 669年 675年 1 hsa - mir - 129大脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
hsa - mir - 129 - 5 - p CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
hsa - mir - 129大脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
hsa - mir - 129 - 5 - p CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
miR-204/211 606年 613年 1、m8 hsa - mir - 204大脑 UUCCCUUUGUCAUCCUAUGCCU
hsa - mir - 211 UUCCCUUUGUCAUCCUUCGCCU
miR-26 651年 657年 1 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
miR-30-5p 713年 719年 m8 hsa-miR-30a-5p UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG
hsa-miR-30c大脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
hsa-miR-30d深圳 UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
hsa-miR-30b深圳 UGUAAACAUCCUACACUCAGCU
hsa-miR-30e-5p UGUAAACAUCCUUGACUGGA