概括
基因 1996
象征 Elavl4
同义词 hud | pnem
描述 像神经元特异性RNA结合蛋白4
参考 MIM:168360|HGNC:HGNC:3315|ENSEMBL:ENSG00000162374|HPRD:01343|Vega:Otthumg00000007877
基因类型 蛋白质编码
地图位置 134
Pascal P值 4.049E-5
Sherlock P值 0.952
胎儿β 0.282
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 Elavl4 1996 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL117209.1 0.94 0.94
ube2o 0.92 0.92
SIN3B 0.91 0.92
BRPF3 0.91 0.92
tecpr1 0.91 0.92
arfgap1 0.91 0.89
AP3D1 0.91 0.90
DNAJC11 0.90 0.87
brsk2 0.90 0.90
rundc1 0.90 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.79 -0.75
AF347015.31 -0.77 -0.70
MT-CO2 -0.76 -0.69
AF347015.8 -0.73 -0.67
C1orf54 -0.72 -0.78
higd1b -0.72 -0.66
mt-cyb -0.72 -0.64
AF347015.33 -0.71 -0.63
AF347015.27 -0.71 -0.67
AF347015.2 -0.70 -0.60

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
刘sox4靶向 137 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时DN 57 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN 45 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB目标 74 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN 59 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤Igll vs Iglk 42 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标2小时 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ABE VEGFA目标30分钟 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向 102 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向DN 68 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy Mitoxantrone抗性 57 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC DN监管 253 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因