基因页:Elavl4
概括?
基因 | 1996 |
象征 | Elavl4 |
同义词 | hud | pnem |
描述 | 像神经元特异性RNA结合蛋白4 |
参考 | MIM:168360|HGNC:HGNC:3315|ENSEMBL:ENSG00000162374|HPRD:01343|Vega:Otthumg00000007877 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 134 |
Pascal P值 | 4.049E-5 |
Sherlock P值 | 0.952 |
胎儿β | 0.282 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7132043 | CHR12 | 80968399 | Elavl4 | 1996 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ELAVL4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AL117209.1 | 0.94 | 0.94 |
ube2o | 0.92 | 0.92 |
SIN3B | 0.91 | 0.92 |
BRPF3 | 0.91 | 0.92 |
tecpr1 | 0.91 | 0.92 |
arfgap1 | 0.91 | 0.89 |
AP3D1 | 0.91 | 0.90 |
DNAJC11 | 0.90 | 0.87 |
brsk2 | 0.90 | 0.90 |
rundc1 | 0.90 | 0.90 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.79 | -0.75 |
AF347015.31 | -0.77 | -0.70 |
MT-CO2 | -0.76 | -0.69 |
AF347015.8 | -0.73 | -0.67 |
C1orf54 | -0.72 | -0.78 |
higd1b | -0.72 | -0.66 |
mt-cyb | -0.72 | -0.64 |
AF347015.33 | -0.71 | -0.63 |
AF347015.27 | -0.71 | -0.67 |
AF347015.2 | -0.70 | -0.60 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
刘sox4靶向 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时DN | 57 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino DN | 200 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB目标 | 74 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard粉碎和燃烧突变体DN | 185 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pomeroy髓母细胞瘤脱毛质vs经典DN | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Magrangeas多发性骨髓瘤Igll vs Iglk | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标2小时 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞长期 | 302 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ABE VEGFA目标30分钟 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Labbe TGFB1靶向 | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向DN | 68 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy Mitoxantrone抗性 | 57 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |