基因页：ABCA2
概括？
| 基因 | 20 |
| 象征 | ABCA2 |
| 同义词 | ABC2 |
| 描述 | ATP绑定盒子亚家族成员2 |
| 参考 | MIM：600047|HGNC：HGNC：32|ENSEMBL：ENSG00000107331|HPRD：08967|Vega：Otthumg00000020958 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9q34 |
| Pascal P值 | 0.968 |
| Sherlock P值 | 0.801 |
| 胎儿β | -0.544 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG13970341 | 9 | 139923093 | ABCA2 | 1.72E-9 | -0.015 | 1.5e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7670908 | CHR4 | 110892624 | ABCA2 | 20 | 0.19 | 反式 | ||
| RS9991367 | CHR4 | 110894300 | ABCA2 | 20 | 0.19 | 反式 | ||
| RS7830259 | CHR8 | 14087643 | ABCA2 | 20 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ranbp3 | 0.92 | 0.93 |
| AGPAT6 | 0.92 | 0.94 |
| UBTF | 0.91 | 0.95 |
| NOP14 | 0.91 | 0.93 |
| RNF40 | 0.91 | 0.93 |
| SF3B2 | 0.91 | 0.92 |
| DDX42 | 0.91 | 0.90 |
| DHX16 | 0.91 | 0.92 |
| SFRS15 | 0.90 | 0.93 |
| SUPT6H | 0.90 | 0.90 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.83 | -0.85 |
| MT-CO2 | -0.80 | -0.83 |
| AF347015.21 | -0.79 | -0.86 |
| AF347015.27 | -0.79 | -0.82 |
| FXYD1 | -0.78 | -0.80 |
| AF347015.33 | -0.77 | -0.79 |
| higd1b | -0.76 | -0.80 |
| ifi27 | -0.76 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.76 | -0.79 |
| AF347015.8 | -0.76 | -0.80 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG ABC转运蛋白 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg溶酶体 | 121 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ABCA转运蛋白在脂质稳态中 | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome ABC家族蛋白介导的运输 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 DN | 163 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lein少突胶质细胞 | 74 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ERBB2 cdc25a的射线肿瘤发生 | 104 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheok对胃嘌呤和高清MTX DN的反应 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |