基因页：ELK1
概括？
| 基因 | 2002 |
| 象征 | ELK1 |
| 同义词 | - |
| 描述 | ELK1，ETS转录因子 |
| 参考 | MIM：311040|HGNC：HGNC：3321|ENSEMBL：ENSG00000126767|HPRD：02407|Vega：Otthumg00000021452 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | XP11.2 |
| Sherlock P值 | 0.234 |
| DEG P值 | DEG：SANDERS_2014：DS1_P = 0.162：DS1_BETA = 0.019600：DS2_P = 3.20E-01：DS2_BETA = 0.050：DS2_FDR = 5.73E-01 |
| 胎儿β | -0.472 |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| SMG5 | 0.87 | 0.88 |
| flii | 0.85 | 0.86 |
| gripap1 | 0.85 | 0.85 |
| RECQL5 | 0.84 | 0.85 |
| XPC | 0.84 | 0.85 |
| FAM160B2 | 0.84 | 0.86 |
| mybbp1a | 0.84 | 0.85 |
| FKBP15 | 0.84 | 0.84 |
| DDX27 | 0.83 | 0.85 |
| 波尔 | 0.83 | 0.84 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.70 | -0.68 |
| AF347015.31 | -0.65 | -0.60 |
| C1orf54 | -0.64 | -0.62 |
| clec2b | -0.61 | -0.62 |
| MT-CO2 | -0.60 | -0.56 |
| GNG11 | -0.59 | -0.59 |
| AF347015.27 | -0.58 | -0.56 |
| ifi27 | -0.58 | -0.53 |
| VAMP5 | -0.58 | -0.57 |
| higd1b | -0.58 | -0.54 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003700 | 转录因子活性 | 艾达 | 14970218 | |
| 去：0003700 | 转录因子活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 16291755|16533805 | |
| GO：0043565 | 序列特异性DNA结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| 去：0006350 | 转录 | IEA | - | |
| GO：0045944 | RNA聚合酶II启动子的转录阳性调节 | 艾达 | 14970218 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 我知道了 | 14970218 | |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| BRCA1 | Brcai |BRCC1 |虹膜|PSCP |RNF53 | 乳腺癌1，早发 | - | HPRD | 11313879 |
| CEBPB | C/EBP-beta |CRP2 |IL6DBP |圈|MGC32080 |nf-il6 |TCF5 | CCAAT/增强子结合蛋白（C/EBP），β | - | HPRD | 1547942 |
| EP300 | kat3b |P300 | E1a结合蛋白p300 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 表型增强 重构的复合物 |
Biogrid | 12514134 |
| ewsr1 | ews | 尤因肉瘤断裂点区域1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9010223 |
| FLI1 | ewsr2 |SIC-1 | 朋友白血病病毒整合1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9010223 |
| fos | AP-1 |c-fos | V-FOS FBJ鼠骨肉瘤病毒性癌基因同源物 | - | HPRD | 7540136 |
| FOSL1 | fra |fra1 |FRA-1 | FOS样抗原1 | ELK1与包含SRE和ATF位点的FRA-1启动子的区域相互作用。 | 绑定 | 15806162 |
| GRB10 | grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS | 生长因子受体结合蛋白10 | - | HPRD | 8798570 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD | 8798570 |
| MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | MAPK1（P42MAPK）在Ser383处磷酸化ELK1。 | 绑定 | 15782123 |
| MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | - | HPRD | 8208531|8586671 |
| MAPK1 | ERK |ERK2 |ERT1 |MAPK2 |p42mapk |prkm1 |prkm2 |p38 |P40 |P41 | p41mapk | 有丝分裂原激活的蛋白激酶1 | 生化活动 重构的复合物 |
Biogrid | 8586671|12594221 |
| MAPK11 | p38b |p38beta2 |prkm11 |SAPK2 |SAPK2B |p38-2 |p38beta | 有丝分裂原激活的蛋白激酶11 | p38-2与ELK1相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 9235954 |
| MAPK14 | CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA | 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 | ELK-1由p38 MAPK的未指定同工型磷酸化。这种相互作用是基于未指定物种的人类ELK-1和p38 MAPK之间的相互作用建模的。 | 绑定 | 9130707 |
| MAPK14 | CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA | 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 | - | HPRD | 8622669 |
| MAPK14 | CSBP1 |CSBP2 |CSPB1 |Exip |mxi2 |PRKM14 |PRKM15 |RK |SAPK2A |p38 | p38ALPHA | 有丝分裂原激活的蛋白激酶14 | p38的未指定同工型与ELK-1相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 9155018 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | ELK-1被ERK-1磷酸化。这种相互作用是基于未指定物种的人类ELK-1和ERK-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 9130707 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | - | HPRD | 8208531|12473660 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | MAPK3（P44MAPK）在Ser383处磷酸化ELK1。 | 绑定 | 15782123 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | ERK1与ELK1相互作用并磷酸化。这种相互作用是建立在大鼠ERK1和人ELK1之间的相互作用上的模型。 | 绑定 | 9235954 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | ELK-1被ERK-1磷酸化。这种相互作用是基于未指定物种的人类ELK-1和ERK-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 9020136 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | ERK1与ELK-1相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 9155018 |
| MAPK3 | ERK1 |HS44KDAP |Humker1a |MGC20180 |p44erk1 |p44mapk |prkm3 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶3 | ERK1磷酸化ELK-1。这种相互作用是基于未指定物种的ERK1和ELK-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 10431817 |
| MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | JNK1的未指定同工型与ELK1相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 9235954 |
| MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | 生化活动 | Biogrid | 8586671 |
| MAPK8 | jnk |JNK1 |JNK1A2 |JNK21B1/2 |prkm8 |SAPK1 | 有丝分裂原激活的蛋白激酶8 | ELK-1被JNK-1磷酸化。这种相互作用是基于未指定物种的人类ELK-1和JNK-1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 9020136 |
| MAPK9 | JNK-55 |jnk2 |jnk2a |jnk2alpha |JNK2B |jnk2beta |prkm9 |SAPK |p54a |P54ASAPK | 有丝分裂原激活的蛋白激酶9 | JNK2的未指定同工型与ELK-1相互作用并磷酸化。 | 绑定 | 9155018 |
| PIAS2 | MGC102682 |Miz1 |piasx |piasx-alpha |piasx-beta |siz2 |zmiz4 |Miz | 活化统计的蛋白质抑制剂2 | ELK1与PIAS2A（PIASX-ALPHA）相互作用。 | 绑定 | 15920481 |
| SNCA | MGC110988 |NACP |park1 |park4 |PD1 | 突触核蛋白，α（淀粉样蛋白前体的非A4成分） | - | HPRD | 11279280 |
| SRF | MCM1 | 血清反应因子（C-FOS血清响应元件结合转录因子） | - | HPRD，Biogrid | 9010223 |
| STK16 | FLJ39635 |KRCT |mpsk |PKL12 |TSF1 | 丝氨酸/苏氨酸激酶16 | - | HPRD，Biogrid | 10947953 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg erbb信号通路 | 87 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg gnRH信号通路 | 101 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Prion疾病 | 35 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg Leishmania感染 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta AT1R途径 | 36 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta BCR途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta EGF途径 | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta EPO途径 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta ERK途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta FCER1途径 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta FMLP途径 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta IGF1途径 | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta IL2途径 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta IL6途径 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 生物卡塔胰岛素途径 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta MAPK途径 | 87 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta NGF途径 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta P38MAPK途径 | 40 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta PDGF途径 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta RAS途径 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta遇到了途径 | 37 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta GPCR途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta TCR途径 | 49 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta收费途径 | 37 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PC12细胞中的ST分化途径 | 45 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SA B细胞受体复合物 | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ST P38 MAPK途径 | 37 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SA TRKA受体 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID BCR 5 Pathway | 65 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID HIF2Pathway | 34 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID血管生成素受体途径 | 50 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TCR RAS途径 | 14 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ERBB1下游途径 | 105 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRB途径 | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRA途径 | 22 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID S1P S1P2途径 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID MAPK TRK途径 | 34 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CD8 TCR下游途径 | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NGF的Reactome信号传导 | 217 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Trif介导的TLR3信号传导 | 74 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NGF信号通过TRKA从质膜发出 | 137 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome核事件激酶和转录因子激活 | 24 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Erk MAPK目标 | 21 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TLR级联反应组MAP激酶激活 | 50 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome MAPK靶向由MAP激酶介导的核事件 | 30 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Traf6在TLR7 8或9激活上介导的NFKB和MAP激酶的诱导 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome NFKB和MAP激酶激活由TLR4信号传导介导 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome myd88 mal级联反应于质膜发起 | 83 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome先天免疫系统 | 279 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome激活的TLR4信号传导 | 93 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome免疫系统 | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome收费受体级联 | 118 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 刘前列腺癌 | 96 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Turjanski MAPK1和MAPK2目标 | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Turjanski MAPK8和MAPK9目标 | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Turjanski MAPK11目标 | 5 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Turjanski MAPK14目标 | 10 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana乳腺癌点燃int网络 | 101 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 费尔南德斯（Fernandez）由迈克（Myc）约束 | 182 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HNE和H2O2的Weigel氧化应激 | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YIH对砷C4的反应 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 级结肠癌DN | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hunsberger运动调节基因 | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hofmann骨髓增生综合征高风险 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-135 | 678 | 684 | M8 | HSA-MIR-135A | Uauggcuuuuuuuuccuauga |
| HSA-MIR-135B | Uauggcuuuucauuccuaugug | ||||
| mir-136 | 729 | 735 | M8 | HSA-MIR-136 | Acuccauuuuuuugaugaugaugga |
| mir-150 | 541 | 547 | M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
| HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug | ||||
| mir-185 | 49 | 56 | 1A，M8 | HSA-MIR-185脑 | Uggagaaaggcaguuc |
| mir-219 | 365 | 371 | M8 | HSA-MIR-219脑 | ugauuguccaaacgcaauucu |
| mir-326 | 1251 | 1258 | 1A，M8 | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
| mir-382 | 191 | 197 | M8 | HSA-MIR-382脑 | Gaaguuucgugguggauucg |
| mir-539 | 405 | 412 | 1A，M8 | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |