基因页面:CREG2
总结吗?
| GeneID | 200407年 |
| 象征 | CREG2 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 细胞抑制因子刺激E1A基因2 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 14272|HPRD: 16753| |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q11.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.031 |
| 夏洛克假定值 | 0.661 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0004 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17014160 | chr1 | 206855799 | CREG2 | 200407年 | 0 | 反式 | ||
| snp_a - 2090942 | 0 | CREG2 | 200407年 | 0.01 | 反式 | |||
| rs17014165 | chr1 | 206856485 | CREG2 | 200407年 | 0.01 | 反式 | ||
| snp_a - 2305437 | 0 | CREG2 | 200407年 | 0.04 | 反式 | |||
| snp_a - 4300010 | 0 | CREG2 | 200407年 | 0.04 | 反式 | |||
| rs6813178 | chr4 | 71575238 | CREG2 | 200407年 | 4.665 e-5 | 反式 | ||
| rs6447043 | chr4 | 71592053 | CREG2 | 200407年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs17146240 | chr5 | 119522933 | CREG2 | 200407年 | 0 | 反式 | ||
| rs17146261 | chr5 | 119534252 | CREG2 | 200407年 | 0 | 反式 | ||
| rs2131824 | chr6 | 125775939 | CREG2 | 200407年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs2248 | chr6 | 125777720 | CREG2 | 200407年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs1494158 | chr6 | 125785156 | CREG2 | 200407年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs4901739 | chr14 | 57345856 | CREG2 | 200407年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs6015314 | chr20 | 57167224 | CREG2 | 200407年 | 0.01 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005794 | 高尔基体 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005783 | 内质网 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除 | 195年 | 138年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳人大HCP H3K4ME2 | 491年 | 319年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 | 308年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 380 - 5 - p | 1774年 | 1780年 | m8 | hsa - mir - 380 - 5 - p | UGGUUGACCAUAGAACAUGCGC |
| hsa - mir - 563 | AGGUUGACAUACGUUUCCC | ||||
| mir - 381 | 1415年 | 1421年 | 1 | hsa - mir - 381 | UAUACAAGGGCAAGCUCUCUGU |