SZGR2 - Beplay体育中心

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基因	2006
象征	Eln
Synonyms	svas \| wbs \| ws
Description	弹性
Reference	MIM：130160\|HGNC:HGNC:3327\|Ensembl：ENSG0000000049540\|HPRD：00556\|Vega：Otthumg00000150229
基因类型	蛋白质编码
地图上的位置	7q11.23
Pascal P值	0.008
胎儿β	-0.174

Gene in Data Sources

基因集名称	Method of gene set	Description
CNV：是的	复制number variation studies	Manual curation
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
go_annotation	将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释	与神经相关的关键字的命中：1

Section I. Genetics and epigenetics annotation

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
C19orf25	0.87	0.89
Scand1	0.87	0.87
C19orf20	0.85	0.87
ydjc	0.85	0.86
exosc4	0.84	0.86
ANAPC11	0.84	0.85
NME3	0.84	0.83
COPE	0.84	0.83
Znhit2	0.83	0.84
commd5	0.83	0.85

前10个负共表达基因
Gene	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
MT-ATP8	-0.50	-0.51
AF347015.26	-0.49	-0.49
AF347015.8	-0.48	-0.46
AF347015.27	-0.48	-0.47
AF347015.15	-0.46	-0.46
AF347015.18	-0.46	-0.48
AF347015.33	-0.45	-0.45
mt-cyb	-0.44	-0.45
Z83840.4	-0.44	-0.45
AF347015.2	-0.44	-0.43

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005515	蛋白质结合	IEA		-
去：0005525	GTP结合	IEA		-
去：0004519	核酸内切酶活性	IEA		-
GO：0030023	细胞外基质组成赋予弹性	nas		-
去：0005201	细胞外基质结构成分	IEA		-
去：0008415	酰基转移酶活性	IEA		-
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0007519	skeletal muscle development	IEA	神经元（GO期限：8）	-
去：0006281	DNA repair	IEA		-
去：0009887	器官形态发生	TAS		9580666
GO:0008283	cell proliferation	TAS		9607766
去：0008015	血液循环	TAS		8096434\|9873040
去：0007585	呼吸气态交换	TAS		9873040
GO:0043149	压力纤维形成	IEA		-
GO：0030833	regulation of actin filament polymerization	IEA		-
Cellular component	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005576	细胞外区域	IEA		-
去：0005578	proteinaceous extracellular matrix	IEA		-
去：0005578	proteinaceous extracellular matrix	nas		-
去：0005737	cytoplasm	IEA		-

Section IV. Protein-protein interaction annotation

互动者	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
屁股1	ASS \| CTLN1	精氨酸合成酶1	-	HPRD	1372742
BGN	DSPG1 \| PG-S1 \| PGI \| SLRR1A	大扫描	-	HPRD,BioGRID	11723132
DCN	CSCD \|DSPG2 \|PG40 \|PGII \|PGS2 \|slrr1b	装饰	-	HPRD,BioGRID	11723132
ELA2	GE \| HLE \| HNE \| NE \| PMN-E	弹性酶2，中性粒细胞	-	HPRD	10471600
FBLN1	FBLN	fibulin 1	-	HPRD,BioGRID	10544250
FBLN2	-	fibulin 2	-	HPRD,BioGRID	10544250
FBN1	FBN \| MASS \| MFS1 \| OCTD \| SGS \| WMS	纤维蛋白1	-	HPRD,BioGRID	10825173
FBN2	CCA \|DA9	纤维蛋白2	-	HPRD,BioGRID	10825173
FCN1	FCNM	纤维蛋白（胶原蛋白/纤维蛋白原结构域）1	-	HPRD,BioGRID	8947836
FKBP10	FKBP6 \|FKBP65 \|FLJ20683 \|FLJ22041 \|FLJ23833 \|HFKBP65	FK506结合蛋白10，65 kDa	-	HPRD	11071917
LGALS3	cbp35 \|gal3 \|galbp \|加利格\|LGALS2 \|Mac2	凝集素，半乳糖苷结合，可溶性，3	-	HPRD,BioGRID	10536372
LOX	MGC105112	lysyl oxidase	-	HPRD	6912069
莱兹	lzm	溶菌酶（肾脏淀粉样变性）	-	HPRD	9745729
MFAP2	马格普\|马格普-1 \|马格1	微纤维相关蛋白2	-	HPRD	8761465\|11723132
NID2	-	Nidogen 2（Osteonidogen）	Tropoelastin与Nidogen-2相互作用。	绑定	10544250
NID2	-	Nidogen 2（Osteonidogen）	-	HPRD,BioGRID	10544250
PRTN3	ACPA \|AGP7 \|c-anca \|MBT \|P29 \|PR-3	蛋白酶3	-	HPRD,BioGRID	11867344
SPINK1	PCTT \|PSTI \|Spink3 \|塔蒂	丝氨酸肽酶抑制剂，卡萨尔1型	-	HPRD	2093478

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	# SZGR 2.0 genes in pathway	信息
GESERICK TERT TARGETS DN	21	16	All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化Kras DN	142	95	All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN	153	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION UP	552	347	All SZGR 2.0 genes in this pathway
GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND SERUM DEPRIVATION UP	211	136	All SZGR 2.0 genes in this pathway
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2B	392	251	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KORKOLA畸胎瘤	39	25	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bertucci侵入性癌导管与小叶DN	46	34	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schaeffer前列腺开发48小时DN	428	306	All SZGR 2.0 genes in this pathway
POMEROY MEDULLOBLASTOMA PROGNOSIS UP	47	30	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Yao Hoxa10通过孕酮靶向	79	58	All SZGR 2.0 genes in this pathway
康（Kang）因tert而永生	89	61	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Iglesias E2F目标	151	103	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MLL AF9融合的Kumar目标	405	264	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Weston Vegfa目标6小时	59	38	All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克道尔急性肺损伤	45	29	All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦卡因可卡因奖励5D	79	62	All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦斯顿Vegfa目标12HR	35	23	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Simbulan Parp1靶向	31	23	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lindvall因TERT DN永生	80	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦斯顿Vegfa目标	108	71	All SZGR 2.0 genes in this pathway
敏锐的回应罗格列酮DN	106	68	All SZGR 2.0 genes in this pathway
韦斯顿·维加法（Weston Vegfa）目标3小时	74	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
DOUGLAS BMI1 TARGETS UP	566	371	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee转移和替代剪接	74	51	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1靶向DN	543	317	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARTINEZ TP53 TARGETS DN	593	372	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martinez RB1和TP53靶向DN	591	366	All SZGR 2.0 genes in this pathway
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发	315	197	All SZGR 2.0 genes in this pathway
SMID乳腺癌腔B DN	564	326	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础	648	398	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Thum mir21靶向心脏病	17	7	All SZGR 2.0 genes in this pathway
吴阿尔茨海默氏病DN	19	12	All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAO对孕酮簇2的时间反应2	86	50	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MIYAGAWA TARGETS OF EWSR1 ETS FUSIONS UP	259	159	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Plasari TGFB1靶向10小时	199	143	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM糖蛋白	196	99	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA CORE MATRISOME	275	148	All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA MATRISOME	1028	559	All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			miRNA ID	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	miRNA ID	mirna seq
mir-101	855	862	1A，M8	hsa-miR-101	uacaguacugauaacugaag
miR-144	856	862	1a	HSA-MIR-144	UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
miR-181	58	64	1a	HSA-MIR-181A^brain	AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
				HSA-MIR-181B^SZ	aacauucauugcugucggggg
				HSA-MIR-181C^brain	AACAUUCAACCUGUCGGUGAGU
				HSA-MIR-181D^brain	aacauucauuguugucggggguggguu
miR-184	661	668	1A，M8	HSA-MIR-184	uggacggaaCugauaagggu
mir-217	850	857	1A，M8	hsa-miR-217	uacugcaucagaacugauuggau
mir-29	310	316	M8	HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu
				HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu
				HSA-MIR-29A^SZ	uagcaccaucugaaaucgguu
				HSA-MIR-29B^SZ	UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
				HSA-MIR-29C^SZ	uagcaccauuugaaaucggu
mir-299-5p	62	68	M8	hsa-miR-299-5p	ugguuuaccgucccacauacau
miR-496	60	66	1a	HSA-MIR-496	Auuacauggccaaucuc

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击hereto see the list of SZ related miRNAs.
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击here查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：Eln