基因页面:TMEM17
总结吗?
| GeneID | 200728年 |
| 象征 | TMEM17 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 跨膜蛋白17 |
| 参考 | MIM: 614950|HGNC: HGNC: 26623|运用:ENSG00000186889|HPRD: 15528|织女:OTTHUMG00000129455 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 p15 |
| 帕斯卡假定值 | 3.805的军医 |
| 夏洛克假定值 | 0.201 |
| 胎儿β | -1.062 |
| DMG | 2(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg26234543 | 2 | 62732450 | TMEM17 | 3.425的军医 | 0.493 | 0.041 | DMG: Wockner_2014 |
| cg12385425 | 2 | 62733576 | TMEM17 | 2.71 e-9 | -0.019 | 1.95 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs17115591 | chr14 | 45262026 | TMEM17 | 200728年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs2280379 | chr16 | 86024103 | TMEM17 | 200728年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs12917789 | chr16 | 86029348 | TMEM17 | 200728年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs9306764 | chrX | 22142353 | TMEM17 | 200728年 | 0.11 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乔治MIR192和MIR215的目标 | 893年 | 528年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 张IKK抑制剂和TNF DN | 103年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOLENAAR CCND1和到的目标 | 67年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆EZH2 DN的目标 | 414年 | 237年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |