基因页面:KLHDC8B
总结吗?
GeneID | 200942年 |
象征 | KLHDC8B |
同义词 | 的背影 |
描述 | kelch域包含8 b |
参考 | MIM: 613169|HGNC: HGNC: 28557|运用:ENSG00000185909|HPRD: 14598|织女:OTTHUMG00000156814 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 p21.31 |
帕斯卡假定值 | 0.025 |
胎儿β | -0.653 |
DMG | 2(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg10255761 | 3 | 49210029 | KLHDC8B | 1.074的军医 | 0.267 | 0.028 | DMG: Wockner_2014 |
cg10872212 | 3 | 49209160 | KLHDC8B | 2.81 e-8 | -0.019 | 8.77 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs7370564 | 0 | KLHDC8B | 200942年 | 0.15 | 反式 | |||
rs10994209 | chr10 | 61877705 | KLHDC8B | 200942年 | 0.09 | 反式 | ||
rs7972594 | chr12 | 11724913 | KLHDC8B | 200942年 | 0.17 | 反式 | ||
rs10491979 | chr12 | 11727969 | KLHDC8B | 200942年 | 0.17 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/KLHDC8B_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
FULCHER凝集素与炎症反应有限合伙人DN | 463年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
金赛的目标EWSR1 FLII融合DN | 329年 | 219年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
罗德里格斯甲状腺癌分化不良DN | 805年 | 505年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
加西亚FLI1和DAX1的目标 | 57 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
小山SEMA3B DN的目标 | 411年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN CHYLA CBFA2T3目标 | 242年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |