概括
基因 2010年
象征 EMD
同义词 EDMD | LEMD5 | Sta
描述 Emerin
参考 MIM:300384|HGNC:HGNC:3331|ENSEMBL:ENSG00000102119|HPRD:02309|Vega:Otthumg0000000033186
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ28
Sherlock P值 0.81
胎儿β 0.318
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG09229960 X 153607856 EMD 1.712E-4 5.115 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
动作 PS1TP5BP1 Actin,Beta - HPRD 12670476
ACTG2 行为|acta3 |演员|actl3 |actsg 肌动蛋白,伽马2,平滑肌,肠 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 12670476
AKAP8L DKFZP434L0650 |ha95 |hap95 |nakap |NAKAP95 激酶(PRKA)锚固蛋白8样 - HPRD,Biogrid 11034899
Banf1 BAF |BCRP1 |D14S1460 |MGC111161 自动化因子1的障碍 Emerin与BAF相互作用。 绑定 11792821
Banf1 BAF |BCRP1 |D14S1460 |MGC111161 自动化因子1的障碍 - HPRD,Biogrid 11792822
BCLAF1 BTF |KIAA0164 |BK211L9.1 BCl2相关转录因子1 - HPRD 15009215
bend7 C10orf30 |FLJ40283 |MGC35247 包含7的本域 两个杂交 Biogrid 16189514
COPS6 CSN6 |MOV34-34KD COP9本构型显微类同源物亚基6(拟南芥) 两个杂交 Biogrid 16169070
CREB3 Luman |lzip |MGC15333 |MGC19782 cAMP响应元件结合蛋白3 两个杂交 Biogrid 16189514
DPPA4 2410091m23rik |FLJ10713 发育多能相关4 两个杂交 Biogrid 16169070
Fate1 命运 胎儿和成人睾丸表达1 两个杂交 Biogrid 16189514
GMCL1 BTBD13 |GCL |GCL1 细胞无细胞同源物1(果蝇) - HPRD,Biogrid 12493765
LMNA cdcd1 |CDDC |cmd1a |CMT2B1 |emd2 |fpl |fpld |HGPS |IDC |LDP1 | LFP | LGMD1B | LMN1 | LMNC | PRO1 lamin a/c - HPRD,Biogrid 10673356|11173535
LMNB1 ADLD |LMN |lmn2 |lmnb |MGC111419 Lamin B1 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12670476
LPL HDLCQ11 |Lipd 脂蛋白脂肪酶 两个杂交 Biogrid 12755701
PSME1 ifi5111 |MGC8628 |PA28A |PA28ALPHA |富豪 蛋白酶体(Prosome,大型)激活剂亚基1(PA28 alpha) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
两个杂交
Biogrid 12755701
SH3GL2 CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 SH3域grb2样2 两个杂交 Biogrid 16169070
SH3GL3 CNSA3 |een-2b-l3 |een-b2 |HST19371 |SH3D2C |SH3P13 SH3域grb2状3 两个杂交 Biogrid 16169070
Syne1 8b |CPG2 |DKFZP781J13156 |FLJ30878 |FLJ41140 |KIAA0796 |KIAA1262 |KIAA1756 |myne1 |疤痕8 光谱重复包含核包膜1 - HPRD,Biogrid 12163176
vav1 VAV VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 两个杂交 Biogrid 12755701
ythdc1 KIAA1966 |YT521 |YT521-B 包含1的Yth域 - HPRD,Biogrid 12755701


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肥厚性心肌病HCM 85 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG心律失常右心肌病ARVC 76 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG扩张心肌病 92 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌DN 406 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Tert目标 380 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成年时期峰值2小时 51 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存DN 113 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga PML Interactome 42 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Roessler肝癌转移 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因