基因页:EMD
概括?
基因 | 2010年 |
象征 | EMD |
同义词 | EDMD | LEMD5 | Sta |
描述 | Emerin |
参考 | MIM:300384|HGNC:HGNC:3331|ENSEMBL:ENSG00000102119|HPRD:02309|Vega:Otthumg0000000033186 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ28 |
Sherlock P值 | 0.81 |
胎儿β | 0.318 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG09229960 | X | 153607856 | EMD | 1.712E-4 | 5.115 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EMD_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
动作 | PS1TP5BP1 | Actin,Beta | - | HPRD | 12670476 |
ACTG2 | 行为|acta3 |演员|actl3 |actsg | 肌动蛋白,伽马2,平滑肌,肠 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 12670476 |
AKAP8L | DKFZP434L0650 |ha95 |hap95 |nakap |NAKAP95 | 激酶(PRKA)锚固蛋白8样 | - | HPRD,Biogrid | 11034899 |
Banf1 | BAF |BCRP1 |D14S1460 |MGC111161 | 自动化因子1的障碍 | Emerin与BAF相互作用。 | 绑定 | 11792821 |
Banf1 | BAF |BCRP1 |D14S1460 |MGC111161 | 自动化因子1的障碍 | - | HPRD,Biogrid | 11792822 |
BCLAF1 | BTF |KIAA0164 |BK211L9.1 | BCl2相关转录因子1 | - | HPRD | 15009215 |
bend7 | C10orf30 |FLJ40283 |MGC35247 | 包含7的本域 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
COPS6 | CSN6 |MOV34-34KD | COP9本构型显微类同源物亚基6(拟南芥) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
CREB3 | Luman |lzip |MGC15333 |MGC19782 | cAMP响应元件结合蛋白3 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
DPPA4 | 2410091m23rik |FLJ10713 | 发育多能相关4 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Fate1 | 命运 | 胎儿和成人睾丸表达1 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
GMCL1 | BTBD13 |GCL |GCL1 | 细胞无细胞同源物1(果蝇) | - | HPRD,Biogrid | 12493765 |
LMNA | cdcd1 |CDDC |cmd1a |CMT2B1 |emd2 |fpl |fpld |HGPS |IDC |LDP1 | LFP | LGMD1B | LMN1 | LMNC | PRO1 | lamin a/c | - | HPRD,Biogrid | 10673356|11173535 |
LMNB1 | ADLD |LMN |lmn2 |lmnb |MGC111419 | Lamin B1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12670476 |
LPL | HDLCQ11 |Lipd | 脂蛋白脂肪酶 | 两个杂交 | Biogrid | 12755701 |
PSME1 | ifi5111 |MGC8628 |PA28A |PA28ALPHA |富豪 | 蛋白酶体(Prosome,大型)激活剂亚基1(PA28 alpha) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 两个杂交 |
Biogrid | 12755701 |
SH3GL2 | CNSA2 |een-b1 |FLJ20276 |FLJ25015 |SH3D2A |SH3P4 | SH3域grb2样2 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
SH3GL3 | CNSA3 |een-2b-l3 |een-b2 |HST19371 |SH3D2C |SH3P13 | SH3域grb2状3 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Syne1 | 8b |CPG2 |DKFZP781J13156 |FLJ30878 |FLJ41140 |KIAA0796 |KIAA1262 |KIAA1756 |myne1 |疤痕8 | 光谱重复包含核包膜1 | - | HPRD,Biogrid | 12163176 |
vav1 | VAV | VAV 1鸟嘌呤核苷酸交换因子 | 两个杂交 | Biogrid | 12755701 |
ythdc1 | KIAA1966 |YT521 |YT521-B | 包含1的Yth域 | - | HPRD,Biogrid | 12755701 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG肥厚性心肌病HCM | 85 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG扩张心肌病 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发12小时 | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成年时期峰值2小时 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn暂时TGFB1签名 | 109 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga PML Interactome | 42 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Roessler肝癌转移 | 107 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |