基因页:标记2
概括?
基因 | 2011 |
象征 | 标记2 |
同义词 | EMK-1 | EMK1 | PAR-1 | PAR-1B | PAR1B |
描述 | 微管亲和调节激酶2 |
参考 | MIM:600526|HGNC:HGNC:3332|Ensembl:ENSG0000000072518|HPRD:02753| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q13.1 |
Pascal P值 | 9.716E-6 |
Sherlock P值 | 0.523 |
胎儿β | -0.911 |
DMG | 1(#研究) |
支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15801751 | 11 | 63640504 | 标记2 | 3.64e-4 | -0.238 | 0.042 | DMG:Wockner_2014 |
CG24769295 | 11 | 63676485 | 标记2 | 4.518E-4 | 0.414 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
CG05815958 | 11 | 63606719 | 标记2 | 4.573E-4 | -0.405 | 0.046 | DMG:Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SV2A | 0.94 | 0.93 |
战争 | 0.91 | 0.90 |
SLC27A4 | 0.91 | 0.92 |
DCTN1 | 0.90 | 0.90 |
Prkaca | 0.90 | 0.88 |
AP2M1 | 0.90 | 0.89 |
ATP6AP1 | 0.90 | 0.89 |
clstn3 | 0.90 | 0.92 |
ATP1A3 | 0.89 | 0.90 |
FAM134A | 0.89 | 0.87 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.61 | -0.51 |
AP002478.3 | -0.59 | -0.59 |
AF347015.2 | -0.58 | -0.44 |
MT-CO2 | -0.57 | -0.47 |
ACSF2 | -0.56 | -0.55 |
AF347015.31 | -0.56 | -0.47 |
AF347015.8 | -0.56 | -0.46 |
AF347015.18 | -0.56 | -0.49 |
PLA2G5 | -0.56 | -0.45 |
higd1b | -0.55 | -0.47 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
PID Notch途径 | 59 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID LKB1途径 | 47 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁与HDAC互动 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔卡拉凋亡 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
郭十六进制目标 | 81 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova在APL中甲基化 | 68 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 | 143 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染8小时 | 105 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV全部 | 120 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MMS小鼠淋巴高4小时 | 36 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhu CMV 24小时 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时 | 71 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 | 118 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan变量早期分化基因DN | 30 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 | 162 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stambolsky被突变的TP53绑定 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |