概括
基因 2011
象征 标记2
同义词 EMK-1 | EMK1 | PAR-1 | PAR-1B | PAR1B
描述 微管亲和调节激酶2
参考 MIM:600526|HGNC:HGNC:3332|Ensembl:ENSG0000000072518|HPRD:02753|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q13.1
Pascal P值 9.716E-6
Sherlock P值 0.523
胎儿β -0.911
DMG 1(#研究)
支持 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15801751 11 63640504 标记2 3.64e-4 -0.238 0.042 DMG:Wockner_2014
CG24769295 11 63676485 标记2 4.518E-4 0.414 0.045 DMG:Wockner_2014
CG05815958 11 63606719 标记2 4.573E-4 -0.405 0.046 DMG:Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SV2A 0.94 0.93
战争 0.91 0.90
SLC27A4 0.91 0.92
DCTN1 0.90 0.90
Prkaca 0.90 0.88
AP2M1 0.90 0.89
ATP6AP1 0.90 0.89
clstn3 0.90 0.92
ATP1A3 0.89 0.90
FAM134A 0.89 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.61 -0.51
AP002478.3 -0.59 -0.59
AF347015.2 -0.58 -0.44
MT-CO2 -0.57 -0.47
ACSF2 -0.56 -0.55
AF347015.31 -0.56 -0.47
AF347015.8 -0.56 -0.46
AF347015.18 -0.56 -0.49
PLA2G5 -0.56 -0.45
higd1b -0.55 -0.47

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
PID Notch途径 59 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID LKB1途径 47 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁与HDAC互动 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔卡拉凋亡 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova在APL中甲基化 68 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染8小时 105 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV全部 120 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MMS小鼠淋巴高4小时 36 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhu CMV 24小时 93 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dairkee Cancer俯卧反应BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan变量早期分化基因DN 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 162 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 174 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky被突变的TP53绑定 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIF1A和FOXA2的Qi缺氧靶标 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪形成PPARG绑定8D 658 397 该途径中的所有SZGR 2.0基因