概括
基因 201163
象征 flcn
同义词 BHD | flcl
描述 卵泡蛋白
参考 MIM:607273|HGNC:HGNC:27310|ENSEMBL:ENSG00000154803|HPRD:06278|Vega:Otthumg0000000059275
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17p11.2
Pascal P值 0.162
Sherlock P值 0.844
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 5.05E-05:Q = 0.0489
胎儿β -0.546
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS8065836 CHR17 16837364 flcn 201163 0.15 顺式
RS3803761 CHR17 17116411 flcn 201163 0.15 顺式
RS7010362 CHR8 23218100 flcn 201163 0.17 反式
RS2701130 CHR12 52429439 flcn 201163 0.03 反式
RS3899870 CHR13 97205717 flcn 201163 0.01 反式
RS9908205 17 17105615 flcn ENSG00000154803.8 1.916E-6 0 26428 gtex_brain_putamen_basal
RS9908150 17 17114061 flcn ENSG00000154803.8 2.774E-7 0 17982 gtex_brain_putamen_basal
RS4399589 17 17114586 flcn ENSG00000154803.8 2.834e-6 0 17457 gtex_brain_putamen_basal
RS7218795 17 17115566 flcn ENSG00000154803.8 2.834e-6 0 16477 gtex_brain_putamen_basal
RS3803761 17 17116412 flcn ENSG00000154803.8 1.909E-6 0 15631 gtex_brain_putamen_basal
RS7208065 17 17120204 flcn ENSG00000154803.8 1.115E-8 0 11839 gtex_brain_putamen_basal
RS4985705 17 17120668 flcn ENSG00000154803.8 4.575E-9 0 11375 gtex_brain_putamen_basal
RS4985752 17 17120812 flcn ENSG00000154803.8 1.17E-7 0 11231 gtex_brain_putamen_basal
RS8080386 17 17121624 flcn ENSG00000154803.8 7.52E-8 0 10419 gtex_brain_putamen_basal
RS1736221 17 17125595 flcn ENSG00000154803.8 7.52E-8 0 6448 gtex_brain_putamen_basal
RS1736220 17 17126792 flcn ENSG00000154803.8 7.52E-8 0 5251 gtex_brain_putamen_basal
RS1708618 17 17131869 flcn ENSG00000154803.8 7.532E-10 0 174 gtex_brain_putamen_basal
RS1736215 17 17132202 flcn ENSG00000154803.8 2.368E-9 0 -159 gtex_brain_putamen_basal
RS1736214 17 17132333 flcn ENSG00000154803.8 3.22e-9 0 -290 gtex_brain_putamen_basal
RS66460366 17 17132818 flcn ENSG00000154803.8 7.079E-8 0 -775 gtex_brain_putamen_basal
RS1613416 17 17133121 flcn ENSG00000154803.8 3.551E-9 0 -1078 gtex_brain_putamen_basal
RS1736213 17 17134528 flcn ENSG00000154803.8 9.897E-9 0 -2485 gtex_brain_putamen_basal
RS10459910 17 17136891 flcn ENSG00000154803.8 1.523E-7 0 -4848 gtex_brain_putamen_basal
RS1708629 17 17140297 flcn ENSG00000154803.8 9.197E-8 0 -8254 gtex_brain_putamen_basal
RS1736207 17 17144854 flcn ENSG00000154803.8 3.528e-7 0 -12811 gtex_brain_putamen_basal
RS1708626 17 17144908 flcn ENSG00000154803.8 3.69E-7 0 -12865 gtex_brain_putamen_basal
RS1736206 17 17144978 flcn ENSG00000154803.8 3.69E-7 0 -12935 gtex_brain_putamen_basal
RS1624963 17 17146368 flcn ENSG00000154803.8 1.641E-8 0 -14325 gtex_brain_putamen_basal
RS1708627 17 17146959 flcn ENSG00000154803.8 3.395E-6 0 -14916 gtex_brain_putamen_basal
RS1736203 17 17151664 flcn ENSG00000154803.8 2.792E-9 0 -19621 gtex_brain_putamen_basal
RS1736202 17 17151938 flcn ENSG00000154803.8 1.436E-9 0 -19895 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG肾细胞癌 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova在APL中甲基化 68 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nouzova维甲酸和H4乙酰化 143 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因