基因页：EMX2

Summary？
基因ID 2018
象征 EMX2
同义词 -
描述 空螺旋式同源2
参考 MIM：600035|HGNC：HGNC：3341|ENSEMBL：ENSG00000170370|HPRD：02495|Vega：Otthumg0000000019123
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q26.1
Pascal P值 0.938
Sherlock P值 0.023
胎儿β 0.911
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG20038591 10 119306659 EMX2 1.234E-4 -0.4 0.03 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4846033 CHR1 11788563 EMX2 2018 0.17 反式
RS11582961 CHR1 184023058 EMX2 2018 0.11 反式
RS10926019 CHR1 240095802 EMX2 2018 0.12 反式
RS17620480 CHR6 16035381 EMX2 2018 0.13 反式
RS11008425 Chr10 31534410 EMX2 2018 0.01 反式
RS2068673 CHR12 60333402 EMX2 2018 0.13 反式
RS6494052 CHR15 59295924 EMX2 2018 0.17 反式
RS17070904 CHR18 60917055 EMX2 2018 0.07 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
克雷布 0.98 0.98
trrap 0.98 0.98
insr 0.97 0.98
C11orf30 0.97 0.96
Arid1a 0.97 0.97
EP400 0.97 0.97
Zzef1 0.97 0.97
Pogz 0.96 0.97
Sec16a 0.96 0.97
gatad2b 0.96 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.70 -0.84
MT-CO2 -0.69 -0.84
FXYD1 -0.68 -0.82
ifi27 -0.68 -0.81
C5orf53 -0.68 -0.73
S100B -0.68 -0.79
higd1b -0.67 -0.84
AF347015.27 -0.67 -0.80
serpinb6 -0.66 -0.70
AF347015.33 -0.66 -0.77

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003700 转录因子活性 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IPI 15247416
GO：0043565 序列特异性DNA结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0030182 神经元分化 IEA 神经元（GO期限：8） -
去：0030900 前脑发展 IEA 大脑（GO期限：8） -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0009952 前/后模式形成 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 nas -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Lee神经Crest干细胞DN 118 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞发育DN 129 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein星形胶质细胞标记 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buckanovich T淋巴细胞在肿瘤DN上 24 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
winnepenninckx黑色素瘤转移DN 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAYAMA SOFT TISSUE TUMORS PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-130/301 498 504 M8 HSA-MIR-130A脑 cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b脑 CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-148/152 1123 1129 1a HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152脑 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-19 497 503 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-22 253 259 M8 HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-339 47 54 1A，M8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
miR-370 822 828 1a HSA-MIR-370脑 gccugggggguggaaccugg
miR-495 1228 1234 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu