基因页：EN2

Summary？
基因 2020
象征 EN2
同义词 -
Description 插入的同源词2
Reference MIM：131310|HGNC:HGNC:3343|ENSEMBL：ENSG00000164778|HPRD：08836|Vega：Otthumg00000151354
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q36
Pascal P值 0.158
胎儿β -0.581
DMG 1(# studies)
主持人 Myers' cis & trans

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
PMID：cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：3

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
cg12242086 7 155252796 EN2 2.711E-4 0.514 0.038 DMG：Wockner_2014
CG09134794 7 155252701 EN2 4.551E-4 0.75 0.045 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16829545 CHR2 151977407 EN2 2020 3.662E-8 反式
RS7584986 CHR2 184111432 EN2 2020 9.639E-4 反式
rs170776 CHR4 173276735 EN2 2020 0.15 反式
RS1396222 CHR4 173279496 EN2 2020 0.09 反式
rs335993 CHR4 173321789 EN2 2020 0.12 反式
RS10491487 CHR5 80323367 EN2 2020 0.01 反式
RS6996695 CHR8 77540580 EN2 2020 0.16 反式
rs11139334 Chr9 84209393 EN2 2020 0.05 反式
rs7111644 Chr11 93300259 EN2 2020 0.13 反式
rs16955618 CHR15 29937543 EN2 2020 7.926E-8 反式
RS16945437 CHR17 11797650 EN2 2020 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CNOT6 0.96 0.93
ATAD2B 0.95 0.88
PBRM1 0.95 0.93
ARID2 0.95 0.93
Med1 0.94 0.93
IGF2BP3 0.94 0.77
MBTD1 0.94 0.92
CASP2 0.94 0.92
myst3 0.94 0.92
ZNF445 0.94 0.92
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.70 -0.76
pth1r -0.69 -0.76
LHPP -0.69 -0.62
HLA-F -0.68 -0.73
AIFM3 -0.68 -0.73
aldoc -0.68 -0.68
FBXO2 -0.68 -0.65
TNFSF12 -0.67 -0.69
SLC16A11 -0.67 -0.69
AF347015.31 -0.66 -0.88

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0003700 反式cription factor activity IEA -
GO：0043565 sequence-specific DNA binding IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0048666 神经元发展 IEA 神经元（GO期限：9） -
GO:0030902 后脑发展 IEA 大脑(术语层面:8) -
GO:0030901 中脑的发展 IEA 大脑(术语层面:8) -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 TAS 1672471
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 nucleus IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
Perez TP53目标 1174 695 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Koyama Sema3b靶向 292 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Suz12目标 1038 678 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath EED目标 1062 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath PRC2目标 652 441 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染20小时 240 152 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 681 420 All SZGR 2.0 genes in this pathway
LEIN CEREBELLUM MARKERS 85 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
H3K27me3 97 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
H3K27me3 196 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A4 196 124 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARTENS TRETINOIN RESPONSE UP 857 456 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vandesluis Commd1目标3 DN 39 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 384 390 1a hsa-miR-103brain agcagcauuguacggcuauga
hsa-miR-107brain AGCAGCAUUGUACAGGGCUAUCA
mir-124.1 1754 1761 1A，M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 1754 1760 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
miR-128 400 406 1a hsa-miR-128a ucacagugaaccggucuuuu
hsa-miR-128b ucacagugaaccggucuuc
miR-138 86 92 1a HSA-MIR-138brain Agcugguuguguugaauc
mir-181 2024 2030 M8 HSA-MIR-181Abrain AACAUUCAACGCUGUCGGUGAGU
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181Cbrain aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181Dbrain aacauucauuguugucggggguggguu
miR-193 66 72 M8 HSA-MIR-193A AACUGGCCUACAAAGUCCCAG
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu
mir-203.1 389 395 1a hsa-miR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-25/32/92/363/367 43 49 1a hsa-miR-25brain Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-27 400 407 1A，M8 HSA-MIR-27Abrain uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27Bbrain uucacaguggcuaaguucugc
mir-28 418 425 1A，M8 hsa-miR-28brain Aaggagcucacagucuauugag
mir-33 40 47 1A，M8 HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33b GUGCAUUGCUGUUGCAUUGCA
miR-370 1912年 1918年 1a HSA-MIR-370brain gccugggggguggaaccugg
mir-376c 136 143 1A，M8 HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-378* 365 372 1A，M8 hsa-miR-422b cuggacuuggagagaaggcc
hsa-miR-422a CUGGACUUAGGGUCAGAAGGCC
miR-382 354 360 M8 HSA-MIR-382brain Gaaguuucgugguggauucg
mir-543 2025 2031 M8 hsa-miR-543 aaacauucgcggugcacuucu
mir-9 369 375 1a HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga