Gene Page:SLC29A1

Summary？
基因 2030
象征 SLC29A1
Synonyms ENT1
Description solute carrier family 29 member 1
Reference MIM:602193|HGNC：HGNC：11003|Ensembl：ENSG00000112759|HPRD：03724|Vega：Otthumg0000000014759
基因类型 蛋白质编码
Map location 6p21.1
Pascal p-value 0.177
Sherlock p-value 0.741
胎儿β -1.152
DMG 1(# studies)
主持人 Myers' cis & trans

Gene in Data Sources
基因集名称 Method of gene set Description 信息
CV:PGCnp 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
gsma_iie Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) PSR：0.04433

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

Probe 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
CG10519140 6 44187076 SLC29A1 -0.023 0.75 DMG：Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS703982 Chr10 80942720 SLC29A1 2030 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ROBO2 0.92 0.95
XPR1 0.90 0.93
IGSF3 0.89 0.94
用手 0.89 0.94
USP6NL 0.89 0.93
KDM5B 0.89 0.94
Kidins220 0.89 0.95
ZFP14 0.89 0.90
NFYA 0.88 0.88
PPP2R3A 0.88 0.90
前10个负共表达基因
Gene 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
serpinb6 -0.62 -0.74
AIFM3 -0.61 -0.81
C5orf53 -0.61 -0.75
TNFSF12 -0.61 -0.66
HEPN1 -0.61 -0.79
TSC22D4 -0.60 -0.81
HLA-F -0.60 -0.77
aldoc -0.60 -0.73
AC018755.7 -0.59 -0.72
pth1r -0.59 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IPI 14667819
去：0005337 核苷跨膜转运蛋白活性 TAS 8986748
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006139 nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolic process TAS 8986748
GO:0015858 核苷转运 TAS 8986748
GO:0006810 运输 IEA -
Cellular component 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005624 膜分数 TAS 8986748
去：0016020 membrane IEA -
去：0005887 integral to plasma membrane TAS 8986748

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 All SZGR 2.0 genes in this pathway
维生素核苷和相关分子的反应组转运 31 16 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UDayakumar Med1靶向 135 82 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP 1278 748 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge缺氧DN 146 94 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG DN 59 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Elvidge Hif1a靶向 67 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS UP 41 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化Kras DN 142 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
chiaradonna肿瘤转化CDC25 DN 153 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Landis Erbb2乳腺肿瘤324向上 150 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过小径dn 186 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 1 DN 38 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PATIL LIVER CANCER 747 453 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wood EBV EBNA1靶向 110 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NUYTTEN EZH2 TARGETS DN 1024 594 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MANTOVANI NFKB TARGETS UP 43 33 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Caffarel对THC 24小时5的响应 34 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath ES 1 379 235 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MORI PRE BI LYMPHOCYTE UP 80 54 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori大型BII淋巴细胞向上 86 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mori未成熟B淋巴细胞DN 90 55 All SZGR 2.0 genes in this pathway
尼尔森对雄激素DN的反应 19 14 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Lee肝癌ACOX1 DN 65 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PENG LEUCINE DEPRIVATION DN 187 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pomeroy髓母细胞瘤预后DN 43 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
SHIPP DLBCL VS FOLLICULAR LYMPHOMA UP 45 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
彭雷帕霉素反应dn 245 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PENG GLUTAMINE DEPRIVATION DN 337 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
中岛嗜酸性粒细胞 30 20 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ferrando T与MLL ENR融合DN一起 87 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JAIN NFKB信号 75 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Affar YY1靶向DN 234 137 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang Smarce1靶向DN 371 218 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mahajan对IL1A DN的反应 76 57 All SZGR 2.0 genes in this pathway
IE86 CMV蛋白的歌曲目标 60 42 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伯顿成生7 51 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染24小时 148 96 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Han Jnk Singaling DN 39 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
DOUGLAS BMI1 TARGETS UP 566 371 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时的反应 953 554 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Li cytidine模拟途径 17 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 1 528 324 All SZGR 2.0 genes in this pathway
近藤公关OSTATE CANCER HCP WITH H3K27ME3 97 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
丰田MIR34B和MIR34C的目标 463 262 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Izadpanah干细胞脂肪与骨DN 108 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chen Hoxa5目标9小时DN 41 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 All SZGR 2.0 genes in this pathway
公园APL发病机理DN 50 35 All SZGR 2.0 genes in this pathway
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 163 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shedden肺癌良好生存A5 70 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI假足趋化性DN 457 302 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G12 UP 39 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Coulouarn暂时TGFB1签名 109 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 162 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 174 100 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MARSON FOXP3目标DN 54 38 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kobayashi EGFR信令24小时DN 251 151 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染2小时 39 30 All SZGR 2.0 genes in this pathway
li诱导了自然杀手DN 116 83 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CHYLA CBFA2T3 TARGETS DN 242 146 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ACOSTA PROLIFERATION INDEPENDENT MYC TARGETS UP 84 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1 TARGETS NOT VIA AKT1 UP 211 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1 TARGETS VIA AKT1 UP 281 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
pasini suz12靶向 112 65 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-124/506 567 573 M8 hsa-miR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124brain UAAGGCACGCGGUGAAUGCC