总结吗?
GeneID 2033年
象征 EP300
同义词 KAT3B | RSTS2 | p300
描述 E1A结合蛋白p300
参考 MIM: 602700|HGNC: HGNC: 3373|运用:ENSG00000100393|HPRD: 04078|织女:OTTHUMG00000150937
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 22 q13.2
帕斯卡假定值 6.924 e-6
夏洛克假定值 0.807
胎儿β 0.728
eGene 小脑半球
迈尔斯的顺式和反式
支持 CompositeSet
达内尔FMRP目标
Ascano FMRP目标
染色质重塑基因

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2
网络 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 贡献在PPI网络最短路径:0.0862

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
EP300 chr22 41546041 C G NM_001429 p.886P >一 错义 精神分裂症 认为:Fromer_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs16829545 chr2 151977407 EP300 2033年 1.229的军医 反式
rs9810143 chr3 5060209 EP300 2033年 0.11 反式
rs11186601 chr10 93287199 EP300 2033年 0.11 反式
rs16955618 chr15 29937543 EP300 2033年 0 反式
rs16990575 chrX 32691327 EP300 2033年 0.18 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
DLG5 0.96 0.95
EHMT1 0.95 0.90
ZXDC 0.95 0.94
NUP62 0.95 0.97
pfa 0.95 0.97
RBM15B 0.95 0.97
小鼠 0.95 0.93
DNMT1 0.95 0.97
GPR161 0.95 0.94
PHF2 0.94 0.93
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.73 -0.80
AIFM3 -0.71 -0.79
HLA-F -0.71 -0.78
AF347015.31 -0.70 -0.92
AF347015.27 -0.70 -0.92
S100B -0.70 -0.87
ALDOC -0.70 -0.73
MT-CO2 -0.69 -0.93
AF347015.33 -0.69 -0.90
TSC22D4 -0.68 -0.80

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0003700 转录因子的活动 助教 10893273
去:0003713 转录辅激活活动 艾达 12435739|12586840
去:0004402 组蛋白乙酰转移酶的活动 艾达 12040021
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0008270 锌离子结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0008022 蛋白质糖基绑定 助教 10205054
去:0016407 乙酰转移酶活性 小鬼 12435739
去:0046872 金属离子结合 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007519 骨骼肌发展 国际能源机构 神经元(术语层面:8) - - - - - -
去:0007399 神经系统发育 助教 神经突(术语层面:5) 10205054
去:0001756 somitogenesis 国际能源机构 - - - - - -
去:0001666 应对缺氧 艾达 15261140
去:0006355 依赖dna的转录调节 国际能源机构 - - - - - -
去:0009887 器官形态发生 国际能源机构 - - - - - -
去:0007165 信号转导 NAS 15261140
去:0007049 细胞周期 国际能源机构 - - - - - -
去:0007507 心发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0006915 细胞凋亡 小鬼 9194565
去:0018076 氨基端peptidyl-lysine乙酰化作用 艾达 12435739
去:0051091 积极调节转录因子的活动 艾达 10518217
去:0016573 组蛋白乙酰化作用 国际能源机构 - - - - - -
去:0042592 自我平衡的过程 助教 15261140
去:0030324 肺发展 国际能源机构 - - - - - -
去:0045944 积极的监管RNA聚合酶II启动子的转录 国际能源机构 - - - - - -
去:0044419 生物种间相互作用 国际能源机构 - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0000123 组蛋白乙酰转移酶复杂 国际能源机构 - - - - - -
去:0005634 艾达 9194565
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005737 细胞质 艾达 18029348

第四部分,注释蛋白质间交互作用

扶少团团员 别名B 官方全名B 实验 PubMed ID
ALX1 CART1 ALX同源框1 - - - - - - HPRD 12929931
ARNTL BMAL1 | BMAL1c | JAP3 | MGC47515 | MOP3 | PASD3 |抽搐| bHLHe5 芳基碳氢化合物核translocator-like受体 重新组成复杂 BioGRID 14645221
ASCL1 ASH1 | HASH1 | MASH1 | bHLHa46 achaete-scute复杂同族体1(果蝇) 亲和力Capture-Western BioGRID 11564735
BCL3 BCL4 | D19S37 b细胞慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤3 重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 10497212
BIRC3 AIP1 | API2 | CIAP2 | HAIP1 | HIAP1 | MALT2 | MIHC | RNF49 baculoviral IAP repeat-containing 3 cIAP-2启动子与p300。 绑定 15494311
乳腺癌易感基因1 虹膜BRCAI | BRCC1 | | PSCP | RNF53 早发性乳腺癌 - - - - - - HPRD, BioGRID 10655477
乳腺癌易感基因1 虹膜BRCAI | BRCC1 | | PSCP | RNF53 早发性乳腺癌 p300与BRCA1。 绑定 10655477
CARM1 PRMT4 coactivator-associated精氨酸甲基转移酶1 CARM1与p300。 绑定 15616592
CCND1 BCL1 | D11S287E | PRAD1 | U21B31 细胞周期蛋白D1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11788592
CDX2 CDX-3 | CDX3 尾型同源框2 - - - - - - HPRD, BioGRID 10506141
CEBPB C / EBP-beta | CRP2 | IL6DBP | |圈MGC32080 | NF-IL6 | TCF5 CCAAT /增强子结合蛋白(C / EBP),β - - - - - - HPRD, BioGRID 9343424
CITED1 MSG1 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10722728
CITED2 MRG1 | P35SRJ 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,2 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 9887100|10593900
|11744733|12586840
CITED2 MRG1 | P35SRJ 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,2 - - - - - - HPRD 9887100|12586840
CITED4 - - - - - - 海关与边境保护局/ p300-interacting反式激活因子,Glu / Asp-rich carboxy-terminal域,4 - - - - - - HPRD, BioGRID 11744733
时钟 KAT13D | KIAA0334 | bHLHe8 时钟同族体(鼠标) 重新组成复杂 BioGRID 14645221
CNTN2 AXT | DKFZp781D102 | FLJ42746 | MGC157722 | TAG-1 | |税收TAX1 contactin 2(轴突) 表型抑制 BioGRID 11264182
COPS6 CSN6 | MOV34-34KD COP9本构photomorphogenic同族体亚基6(拟南芥) 2台混合动力 BioGRID 16169070
CREB1 分子| MGC9284 营反应元件结合蛋白1 亲和力Capture-Western BioGRID 10506141
CTBP1 酒吧| MGC104684 c端结合蛋白1 CTBP1与EP300 (p300) 绑定 15834423
CXCL10 C7 | IFI10 | INP10 | IP-10 | SCYB10 | crg-2 | gIP-10 | mob-1 趋化因子配体(C-X-C主题)10 p300与启动子IP-10交互。 绑定 15315758
DDX5 DKFZp686J01190 | G17P1 | HLR1 | HUMP68 | 2 死(Asp-Glu-Ala-Asp)框多肽5 亲和力Capture-Western BioGRID 12527917
DTX1 hDx-1 deltex同族体1(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 11564735
EGR1 AT225 | G0S30 | KROX-24 | ngfi - a | TIS8 | zif - 268 | ZNF225 早期生长反应1 p300与Egr1启动子。 绑定 15225550
EGR1 AT225 | G0S30 | KROX-24 | ngfi - a | TIS8 | zif - 268 | ZNF225 早期生长反应1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9806899
EGR1 AT225 | G0S30 | KROX-24 | ngfi - a | TIS8 | zif - 268 | ZNF225 早期生长反应1 p300与Egr1交互。 绑定 15225550
EID1 C15orf3 | CRI1 | EID-1 | IRO45620 | MGC138883 | MGC138884 | PNAS-22 | PTD014 | RBP21 EP300抑制剂相互作用的区别1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11073989|11073990
EID2 CRI2 | EID-2 | MGC20452 EP300分化2的相互作用的抑制剂 - - - - - - HPRD 14585496
ELK1 - - - - - - ELK1, ETS致癌基因家族的成员 亲和力Capture-Western
表型增强
重新组成复杂
BioGRID 12514134
EP300 KAT3B | p300 E1A结合蛋白p300 生化活动 BioGRID 10567538
EP300 KAT3B | p300 E1A结合蛋白p300 EP300 autoacetylates (p300)。这种交互是仿照了交互使用EP300从一个未指明的物种。 绑定 14761960
ESR1 ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 雌激素受体1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11782371
ESR1 ER DKFZp686N23123 | | ESR |将有关| |时代NR3A1 雌激素受体1 EP300 (p300)乙醯化ESR1 (ER-alpha)。之间的交互是仿照了交互EP300从物种和ESR1不详不详的物种。 绑定 14761960
ETS1 ETS-1 | EWSR2 | FLJ10768 v-ets E26母红血球病病毒致癌基因同族体1(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 10942770
ETS2 ETS2IT1 v-ets E26母红血球病病毒致癌基因同族体2(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 10942770
FEN1 FEN-1 | MF1 | RAD2 皮瓣structure-specific核酸内切酶1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11430825
GATA6 - - - - - - 叫结合蛋白6 - - - - - - HPRD, BioGRID 10851229
GPS2 AMF-1 | MGC104294 | MGC119287 | MGC119288 | MGC119289 G蛋白通路抑制2 - - - - - - HPRD, BioGRID 10846067
GTF2B TF2B | TFIIB IIB通用转录因子 p300与TFIIB交互。这种交互是模仿了人类p300和TFIIB不明物种之间的相互作用。 绑定 8621548
H3F3A H3.3A | H3F3 | MGC87782 | MGC87783 H3组蛋白、家庭3 EP300 (p300)与H3F3A(组3)。 绑定 15834423
HAND2 DHAND2 | FLJ16260 | Hed | MGC125303 | MGC125304 |事件| bHLHa26 | dHand 心脏和神经嵴衍生品表示2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11994297
HIF1A HIF-1alpha | HIF1 | HIF1-ALPHA | MOP1 | PASD8 低氧诱导因子1α亚基(基本helix-loop-helix转录因子) - - - - - - HPRD, BioGRID 11823643
HIST4H4 H4 / p | MGC24116 集群组蛋白H4 EP300 (p300)与HIST4H4(组蛋白4) 绑定 15834423
HNF1A HNF1 | LFB1 | MODY3 | TCF1 HNF1同源框一个 - - - - - - HPRD, BioGRID 11978637
HNRNPU HNRPU | SAF-A | U21.1 异构核核糖核蛋白U(支架附件因素) - - - - - - HPRD, BioGRID 11909954
IL8 CXCL8 | GCP-1 | GCP1 |收| LUCT | LYNAP | MDNCF | MONAP |氟化钠| NAP-1 | NAP1 白介素8 引发剂与p300交互。 绑定 15494311
ING1 p24ING1c | p33 | p33ING1 | p33ING1b | p47 | p47ING1a 抑制增长的家庭,成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12015309
ING4 MGC12557 | my036 | p29ING4 抑制增长的家庭成员4 p300与p29ING4交互。 绑定 12750254
ING4 MGC12557 | my036 | p29ING4 抑制增长的家庭成员4 - - - - - - HPRD, BioGRID 12750254
ING5 FLJ23842 | p28ING5 抑制增长的家庭,成员5 - - - - - - HPRD, BioGRID 12750254
ING5 FLJ23842 | p28ING5 抑制增长的家庭,成员5 p300与p28ING5交互。 绑定 12750254
IRF2 DKFZp686F0244 | IRF-2 干扰素调节因子2 亲和力Capture-Western
生化活动
重新组成复杂
BioGRID 11304541
JDP2 JUNDM2 6月二聚蛋白2 - - - - - - HPRD 12101239
JMY FLJ37870 | MGC163496 junction-mediating蛋白质和监管 - - - - - - HPRD, BioGRID 10518217
KAT2B CAF P P / CAF | | | PCAF K(赖氨酸)乙酰转移酶2 b 生化活动 BioGRID 12419806
KLF5 BTEB2 | CKLF | IKLF Kruppel-like因子5(肠) 亲和力Capture-Western BioGRID 14612398
LEF1 DKFZp586H0919 | TCF1ALPHA 淋巴enhancer-binding因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12446687
MGC71685 | c-MAF v-maf肌肉筋膜纤维肉瘤癌基因相同器官(禽流感) p300与c-Maf交互。之间的交互是仿照了交互c-Maf不详来源和人类p300。 绑定 11943779
MGC71685 | c-MAF v-maf肌肉筋膜纤维肉瘤癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 11943779
MAML1 KIAA0200 | Mam-1 | Mam1 mastermind-like 1(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 12050117|12391150
MAML1 KIAA0200 | Mam-1 | Mam1 mastermind-like 1(果蝇) p300与MAML1交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类MAML1 p300。 绑定 12391150
MDM2 HDMX | MGC71221 | hdm2 Mdm2 p53结合蛋白同系物(鼠标) - - - - - - HPRD, BioGRID 9809062
MDM4 DKFZp781B1423 | HDMX | MDMX | MGC132766 | MRP1 Mdm4 p53结合蛋白同系物(鼠标) - - - - - - HPRD, BioGRID 12483531
MEF2A ADCAD1 | RSRFC4 | RSRFC9 肌细胞增强因子2 a - - - - - - HPRD, BioGRID 12371907
MEF2C - - - - - - 肌细胞增强因子2摄氏度 表型增强
重新组成复杂
BioGRID 9001254
MEF2D DKFZp686I1536 肌细胞增强因子2 d 亲和力Capture-Western BioGRID 10825153|10933397
管理 - - - - - - O-6-methylguanine-DNA甲基转移酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 11564893
英里/加仑 亚美大陆煤层气有限公司| APNG | CRA36.1 | MDG | Mid1 | PIG11 | PIG16 | anpg N-methylpurine-DNA糖基化酶 EP300 (p300)乙醯化英里/加仑。之间的交互是仿照了交互EP300从物种和MPG不详不详的物种。 绑定 14761960
MYB Cmyb | c-myb | c-myb_CDS | efg v-myb成髓细胞瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感) c-Myb与p300。 绑定 15691758
MYBL2 B-MYB | BMYB | MGC15600 v-myb成髓细胞瘤病毒致癌基因相同器官(禽流感)——2 - - - - - - HPRD, BioGRID 11733503
MYOD1 抽水机MYF3 | MYOD | | bHLHc1 肌原性的分化1 - - - - - - HPRD, BioGRID 9001254
MYOD1 抽水机MYF3 | MYOD | | bHLHc1 肌原性的分化1 p300与MyoD交互。这种交互是模仿了人类之间的相互作用和鼠标p300和MyoD鼠标和一个未指明的物种。 绑定 8621548
N4BP2 B3BP | FLJ10680 | KIAA1413 NEDD4结合蛋白2 - - - - - - HPRD, BioGRID 12730195
NCOA1 F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 核受体共激活剂1 - - - - - - HPRD 11113179
NCOA1 F-SRC-1 | KAT13A | MGC129719 | MGC129720 | NCoA-1 | RIP160 | SRC-1 | SRC1 | bHLHe42 核受体共激活剂1 NCOA1 (SRC-1)与EP300 (p300)。 绑定 15688032
NCOA2 GRIP1 | KAT13C | MGC138808 | NCoA-2 | TIF2 核受体共激活剂2 GRIP1与p300。这种交互是仿照人类p300演示鼠标GRIP1和之间的相互作用。 绑定 9920895
NCOA3 ACTR | AIB-1 | AIB1 | CAGH16 | CTG26 | KAT13B | MGC141848 | RAC3 | SRC3 | TNRC14 | TNRC16 | TRAM-1 | pCIP 核受体共激活剂3 亲和力Capture-Western BioGRID 10655477
NCOA6 AIB3 | ANTP | ASC2 | HOX1.1 | HOXA7 | KIAA0181 | NRC | PRIP | RAP250 | TRBP 核受体共激活剂6 - - - - - - HPRD, BioGRID 10823961
NEIL2 FLJ31644 | MGC2832 | MGC4505 | NEH2 | NEI2 nei像2(大肠杆菌) - - - - - - HPRD 15175427
NEUROD1 BETA2 | BHF-1 | NEUROD | bHLHa3 神经源性分化1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10545951
NEUROG1 又名| Math4C | NEUROD3 | bHLHa6 | ngn1 neurogenin 1 表型增强 BioGRID 11239394
NFATC2 KIAA0611 | NFAT1 | NFATP 核转录因子激活t细胞,细胞质,calcineurin-dependent 2 - - - - - - HPRD, BioGRID 9625762
NPAS2 FLJ23138 | MGC71151 | MOP4 | PASD4 | bHLHe9 神经元不是域蛋白2 重新组成复杂 BioGRID 14645221
NR4A1 GFRP1 | HMR | MGC9485 | N10 | NAK-1 | NGFIB | NP10 | NUR77 |古墓 核受体亚科4,A组,成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 12082103
NUP98 ADIR2 | NUP196 | NUP96 nucleoporin 98 kda 亲和力Capture-Western BioGRID 9858599
NUPR1 COM1 | P8 核内蛋白1 p8与p300,乙酰化。 绑定 11940591
P53AIP1 - - - - - - p53-regulated凋亡诱导蛋白1 p300与p53AIP1启动子。 绑定 15893728
PAX6 一个| AN2 | D11S812E | MGC17209 | MGDA | WAGR 双箱6 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10506141
PCNA MGC8367 增殖细胞核抗原 - - - - - - HPRD, BioGRID 11268218
PELP1 HMX3 | MNAR | P160 脯氨酸、谷氨酸和亮氨酸丰富蛋白质1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11481323
PIAS3 FLJ14651 | ZMIZ5 蛋白质抑制剂激活统计,3 亲和力Capture-Western BioGRID 14691252
POLR2A MGC75453 | POLR2 | POLRA | RPB1 | RPBh1 | RPO2 | RPOL2 | RpIILS | hRPB220 | hsRPB1 DNA聚合酶(RNA) II(导演)多肽,220 kda 亲和力Capture-Western
Co-purification
BioGRID 9443979|9710619
POU3F2 BRN2 | OCT7 | OTF7 | POUF3 POU类3同源框2 Brn-2与p300。 绑定 11029584
PPARA MGC2237 | MGC2452 | NR1C1 | PPAR | hPPAR 过氧物酶体proliferator-activated受体α - - - - - - HPRD, BioGRID 9407140
PPARD FAAR | MGC3931 | NR1C2 | NUC1 | NUCI | NUCII | PPAR-beta | PPARB 过氧物酶体proliferator-activated受体δ - - - - - - HPRD 10567538
PPARG NR1C3 | PPARG1 | PPARG2 | PPARgamma 过氧物酶体proliferator-activated受体γ 重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 10944516|12479814
PROX1 - - - - - - 普洛斯彼罗同源框1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11943779
PROX1 - - - - - - 普洛斯彼罗同源框1 p300与Prox-1交互。之间的交互是仿照了交互Prox-1不详来源和人类p300。 绑定 11943779
PTMA MGC104802 | TMSA prothymosinα - - - - - - HPRD, BioGRID 11967287
RAD23A HHR23A | MGC111083 RAD23同族体(酵母) hHR23A与p300。之间的交互是仿照了交互hHR23A从人类和p300未知物种。 绑定 11196199
RBM14 COAA | DKFZp779J0927 | MGC15912 | MGC31756 | PSP2 SIP | | SYTIP1 | TMEM137 RNA结合主题蛋白14 - - - - - - HPRD, BioGRID 11443112
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) p300与p65交互。 绑定 9096323
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) p300与p65交互。 绑定 15616592
RELA MGC131774 | NFKB3 | p65 v-rel reticuloendotheliosis病毒致癌基因相同器官(禽流感) - - - - - - HPRD, BioGRID 9096323
RORA基因 DKFZp686M2414 | MGC119326 | MGC119329 | NR1F1 | ROR1 | ROR2 | ROR3 | RZR-ALPHA | RZRA RAR-related孤儿受体一 - - - - - - HPRD, BioGRID 9862959
RUNX3 AML2 | CBFA3 | FLJ34510 | MGC16070 | PEBP2aC runt-related转录因子3 - - - - - - HPRD 15138260
SMAD1 BSP1 | JV4-1 | JV41 | MADH1 | MADR1 SMAD家庭成员1 - - - - - - HPRD, BioGRID 10673036
SMAD2 JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 SMAD家庭成员2 p300与Smad2交互。之间的交互是仿照了交互从一个未指明的物种和人类Smad2 p300。 绑定 9679056
SMAD2 JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 SMAD家庭成员2 亲和力Capture-Western BioGRID 10199400|11371641
SMAD2 JV18 | JV18-1 | MADH2 | MADR2 | MGC22139 | MGC34440 | hMAD-2 | hSMAD2 SMAD家庭成员2 - - - - - - HPRD 11264182
SMAD3 DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 SMAD家庭成员3 Smad3与p300。这种交互是仿照Smad3之间的交互和p300不详来源。 绑定 10497242
SMAD3 DKFZp586N0721 | DKFZp686J10186 | HSPC193 | HsT17436 | JV15-2 | MADH3 | MGC60396 SMAD家庭成员3 SMAD3与EP300 (p300)。 绑定 15688032
SMAD4 DPC4似|吉格| MADH4 SMAD家庭成员4 亲和力Capture-Western BioGRID 10887155
SMAD4 DPC4似|吉格| MADH4 SMAD家庭成员4 p300与Smad4片段。p300与完整的交互Smad4不能证明体外。这种交互是仿照了p300从一个未指明的物种之间的相互作用和人类Smad4片段。 绑定 9679056
SMAD7 CRCS3 | FLJ16482 | MADH7 | MADH8 SMAD家庭成员7 - - - - - - HPRD, BioGRID 12408818
SNIP1 FLJ12553 | rp3 - 423 b22.3 | dJ423B22.2 1 Smad核相互作用的蛋白质 - - - - - - HPRD, BioGRID 10887155
SRC c - src ASV | SRC1 | | p60-Src v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) 重新组成复杂 BioGRID 10973497
SREBF2 SREBP2 | bHLHd2 固醇调节元件结合转录因子2 - - - - - - HPRD, BioGRID 8918891
SS18 MGC116875 | SSXT | SYT | SYT-SSX1 | SYT-SSX2 滑膜肉瘤易位染色体18 - - - - - - HPRD, BioGRID 11030627
SS18L1 佳洁士| KIAA0693 | LP2261 | MGC26711 | MGC78386 滑膜肉瘤易位18-like 1号染色体上的基因 - - - - - - HPRD, BioGRID 14716005
STAT1 DKFZp686B04100 | ISGF-3 | STAT91 信号传感器和转录激活91 kda 亲和力Capture-Western BioGRID 10464260
STAT1 DKFZp686B04100 | ISGF-3 | STAT91 信号传感器和转录激活91 kda Stat1-beta与p300。这种交互是仿照人类Stat1-beta证明之间的交互和p300从一个未指明的物种。 绑定 8986769
STAT2 ISGF-3 | MGC59816 | P113 | STAT113 信号传感器和转录激活113 kda 重新组成复杂 BioGRID 10464260
STAT2 ISGF-3 | MGC59816 | P113 | STAT113 信号传感器和转录激活113 kda Stat2与p300。 绑定 10464260
STAT3 APRF | FLJ20882 |麻疹| MGC16063 信号传感器和转录激活3(急性期反应的因素) Stat3与p300。 绑定 15653507
STAT3 APRF | FLJ20882 |麻疹| MGC16063 信号传感器和转录激活3(急性期反应的因素) - - - - - - HPRD, BioGRID 10205054
STAT6 D12S1644 | IL-4-STAT | STAT6B | STAT6C 信号传感器和激活转录6日interleukin-4诱导 - - - - - - HPRD, BioGRID 10454341
SUB1 MGC102747 | P15 | PC4 |好 SUB1同族体(酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 11279157
TACC2 AZU-1 | ECTACC 改变,含蛋白质酸性卷曲螺旋2 TACC2与p300。 绑定 14767476
TADA3L ADA3 | FLJ20221 | FLJ21329 | hADA3 转录适配器3 (NGG1同系物、酵母)的地方 - - - - - - HPRD, BioGRID 11707411
TAL1 sci | TCL5 | bHLHa17 | tal-1 t细胞急性淋巴细胞白血病1 亲和力Capture-Western
重新组成复杂
BioGRID 10490830
真沸点 GTF2D | GTF2D1 | MGC117320 | MGC126054 | MGC126055 | SCA17 | TFIID TATA盒结合蛋白 p300与真沸点。 绑定 8621548
TCF12 来| HTF4 | HsT17266 | bHLHb20 转录因子12 ”赫与p300。 绑定 15333839
TCF12 来| HTF4 | HsT17266 | bHLHb20 转录因子12 HEBa与p300。这种交互建模与p300证明之间的交互。 绑定 15333839
TCF3 ea2 | ITF1 | MGC129647 | MGC129648 | bHLHb21 转录因子3 (ea2免疫球蛋白增强器绑定因素E12汽油/ E47) - - - - - - HPRD, BioGRID 12435739
隔离 - - - - - - thymine-DNA糖基化酶 - - - - - - HPRD, BioGRID 11864601
TFAP2A AP-2 | AP-2alpha | AP2TF |转炉| TFAP2 转录因子AP-2α(激活剂结合蛋白2α) - - - - - - HPRD, BioGRID 12586840
TFF1 BCEI | D21S21 | HP1。一个| HPS2 | pNR-2 | pS2 三叶草因子1 p300与pS2。 绑定 10490106
TGS1 DKFZp762A163 | FLJ22995 | NCOA6IP | PIMT | PIPMT trimethylguanosine合成酶同族体(酵母) - - - - - - HPRD, BioGRID 11912212
THRA AR7 | EAR7 | ERB-T-1 | ERBA | ERBA1 | MGC000261 | MGC43240 | NR1A1 | THRA1 | THRA2 | c-ERBA-1 甲状腺激素受体α(erythroblastic白血病病毒(v-erb-a)致癌基因相同器官,鸟类) 亲和力Capture-Western BioGRID 12371907
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 p300与p53 绑定 15558054
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 p300与p53交互。这种交互是仿照了p300从一个未指明的物种之间的相互作用和人类p53。 绑定 15186775
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 p300与p53和乙醯化。这种交互是仿照了p300从一个未指明的物种之间的相互作用和人类p53。 绑定 15933712
TP53 FLJ92943 | LFS1 | TRP53 | p53 肿瘤蛋白质p53 - - - - - - HPRD, BioGRID 10942770
TP73 P73 肿瘤蛋白质p73 p73-alpha与p300。这种交互是仿照人类p73-alpha证明之间的交互和p300从一个未指明的物种。 绑定 15175157
TRERF1 BCAR2 | FLJ21198 | HSA277276 |拉伯|一国- 139 d8.5 | trep - 132 | dJ139D8.5 转录调节因子1 - - - - - - HPRD, BioGRID 11349124
远方 HsT17391 甲状腺激素受体关联4 - - - - - - HPRD, BioGRID 10454579
TSG101 TSG10 | VPS23 肿瘤易感性基因101 - - - - - - HPRD, BioGRID 10440698
TWIST1 ACS3 | BPES2 | BPES3 | SCS | |转折bHLHa38 捻同族体1(果蝇) - - - - - - HPRD, BioGRID 10025406
UBE2I C358B7.1 | P18 | UBC9 ubiquitin-conjugating酶E2I (UBC9同系物、酵母) - - - - - - HPRD 8824223
USF2 工厂检验计划| bHLHb12 上游转录因子2,c-fos交互 - - - - - - HPRD, BioGRID 10434034
XPA XP1 | XPAC 着色性干皮病,互补群 亲和力Capture-Western BioGRID 11268218
YY1 三角洲| INO80S | NF-E1 | UCRBP | YIN-YANG-1 YY1转录因子 亲和力Capture-Western
生化活动
重新组成复杂
2台混合动力
BioGRID 7758944|11486036
ZBTB17 MIZ-1 | ZNF151 | ZNF60 | phz - 67 锌指和BTB域包含17 亲和力Capture-Western BioGRID 11283613
ZRANB2 DKFZp686J1831 | DKFZp686N09117 | FLJ41119 |子| ZIS1 | ZIS2 | ZNF265 锌指,RAN-binding域包含2 - - - - - - HPRD 11448987


部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG细胞周期 128年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG WNT信号通路 151年 112年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG NOTCH信号通路 47 35 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG TGFβ信号通路 86年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG ADHERENS结 75年 53 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG木菠萝STAT信号通路 155年 105年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG长期势差现象 70年 57 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG杀菌作用 102年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG亨廷顿疾病 185年 109年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG通路在癌症 328年 259年 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG肾细胞癌 70年 60 所有SZGR 2.0基因通路
KEGG前列腺癌 89年 75年 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA RELA通路 16 12 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM ER通路 35 27 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA G2通路 24 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA VDR通路 12 7 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA P53HYPOXIA通路 23 21 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA诱导途径 15 12 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA IL7通路 17 14 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PPARA通路 58 43 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA PITX2通路 15 15 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA NTHI通路 24 20. 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA HER2通路 22 17 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA MEF2D通路 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA TGFB通路 19 14 所有SZGR 2.0基因通路
BIOCARTA CARM1通路 13 11 所有SZGR 2.0基因通路
WNT信号 89年 71年 所有SZGR 2.0基因通路
PID SMAD2 3核通路 82年 63年 所有SZGR 2.0基因通路
PID NOTCH通路 59 49 所有SZGR 2.0基因通路
PID P73PATHWAY 79年 59 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC CLASSIII通路 25 20. 所有SZGR 2.0基因通路
PID E2F通路 74年 48 所有SZGR 2.0基因通路
PID HIF2PATHWAY 34 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID联邦铁路局通路 37 28 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC活性途径 79年 62年 所有SZGR 2.0基因通路
PID HDAC抚慰心灵的途径 66年 50 所有SZGR 2.0基因通路
PID NFAT 3通路 54 47 所有SZGR 2.0基因通路
PID REG GR通路 82年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID FOXO通路 49 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53下游通路 137年 94年 所有SZGR 2.0基因通路
PID AR TF通路 53 38 所有SZGR 2.0基因通路
PID IFNG通路 40 34 所有SZGR 2.0基因通路
PID ATF2通路 59 43 所有SZGR 2.0基因通路
PID AP1通路 70年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID FOXM1通路 40 30. 所有SZGR 2.0基因通路
PID CMYB通路 84年 61年 所有SZGR 2.0基因通路
PID时代基因组途径 65年 37 所有SZGR 2.0基因通路
PID视黄酸途径 30. 23 所有SZGR 2.0基因通路
PIDβ连环蛋白NUC途径 80年 60 所有SZGR 2.0基因通路
PID MYC抑制通路 63年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID HIF1 TFPATHWAY 66年 52 所有SZGR 2.0基因通路
PID TAP63通路 54 40 所有SZGR 2.0基因通路
PID P53监管途径 59 50 所有SZGR 2.0基因通路
PID 1 RB通路 65年 46 所有SZGR 2.0基因通路
PID HNF3A通路 44 29日 所有SZGR 2.0基因通路
PID他嘿通路 48 39 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME发育生物学 396年 292年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME BMAL1时钟NPAS2激活生理表现 36 27 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME PPARA激活基因表达 104年 72年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME前切口转录和翻译 29日 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME RORA基因激活生理表现 24 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME前切口表达和处理 44 24 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME NOTCH1胞内域调节转录 46 28 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME昼夜镇压ERBA牧师的表达式 23 16 所有SZGR 2.0基因通路
由NOTCH1 REACTOME信号 70年 46 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME调节缺氧诱导因子诱导的氧气 25 17 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME代谢脂质和脂蛋白 478年 302年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 168年 115年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRAF6 IRF7激活介导的 30. 26 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME生物钟 53 40 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME因素参与巨核细胞和血小板的生产发展 132年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME TRAF3依赖IRF激活途径 14 10 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME钻机我MDA5介导的诱导干扰素αβ通路 73年 57 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME转录调控的白色脂肪细胞的分化 72年 53 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME信号通过切口 103年 64年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME止血 466年 331年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME先天免疫系统 279年 178年 所有SZGR 2.0基因通路
REACTOME免疫系统 933年 616年 所有SZGR 2.0基因通路
中村肿瘤区周边与中央DN 634年 384年 所有SZGR 2.0基因通路
MYLLYKANGAS放大热点22 13 9 所有SZGR 2.0基因通路
DN SCHLOSSER血清反应 712年 443年 所有SZGR 2.0基因通路
通过SMAD4 JAZAG TGFB1信号 108年 66年 所有SZGR 2.0基因通路
蔡对电离辐射的反应 149年 101年 所有SZGR 2.0基因通路
SPIELMAN淋巴母细胞欧洲和亚洲 479年 299年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA乳腺癌点燃INT网络 101年 73年 所有SZGR 2.0基因通路
PUJANA ATM PCC网络 1442年 892年 所有SZGR 2.0基因通路
布伊泰尔特说光动力治疗压力 811年 508年 所有SZGR 2.0基因通路
阿斯顿重度抑郁症DN 160年 110年 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病早期布莱洛克的了 390年 242年 所有SZGR 2.0基因通路
HEDENFALK乳腺癌BRACX DN 20. 14 所有SZGR 2.0基因通路
阿尔茨海默病了布莱洛克的 1691年 1088年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒10人力资源 101年 69年 所有SZGR 2.0基因通路
DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡DN 287年 208年 所有SZGR 2.0基因通路
林黑色素瘤拷贝数 73年 53 所有SZGR 2.0基因通路
FIRESTEIN扩散 175年 125年 所有SZGR 2.0基因通路
GRESHOCK癌症拷贝数 323年 240年 所有SZGR 2.0基因通路
HOSHIDA肝癌子类S2 115年 74年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 129 - 5 - p 989年 995年 m8 hsa - mir - 129大脑 CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC
hsa - mir - 129 - 5 - p CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU
miR-132/212 1065年 1072年 1、m8 hsa - mir - 212深圳 UAACAGUCUCCAGUCACGGCC
hsa - mir - 132大脑 UAACAGUCUACAGCCAUGGUCG
mir - 142 - 5 - p 417年 423年 m8 hsa - mir - 142 - 5 - p CAUAAAGUAGAAAGCACUAC
miR-148/152 259年 265年 m8 hsa - mir - 148 a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa - mir - 152大脑 UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa - mir - 148 b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d 416年 422年 1 hsa-miR-17-5p CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU
hsa-miR-20a大脑 UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 106 a AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC
hsa - mir - 106 b深圳 UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU
hsa-miR-20b深圳 CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG
hsa - mir - 519 d CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU
mir - 182 733年 739年 1 hsa - mir - 182 UUUGGCAAUGGUAGAACUCACA
mir - 186 559年 565年 m8 hsa - mir - 186 CAAAGAAUUCUCCUUUUGGGCUU
mir - 200 bc / 429 669年 675年 1 hsa - mir - 200 b UAAUACUGCCUGGUAAUGAUGAC
hsa - mir - 200 c UAAUACUGCCGGGUAAUGAUGG
hsa - mir - 429 UAAUACUGUCUGGUAAAACCGU
mir - 203.1 436年 442年 m8 hsa - mir - 203 UGAAAUGUUUAGGACCACUAG
mir - 217 128年 134年 1 hsa - mir - 217 UACUGCAUCAGGAACUGAUUGGAU
miR-22 727年 733年 m8 hsa-miR-22大脑 AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU
miR-26 978年 984年 1 hsa-miR-26a大脑 UUCAAGUAAUCCAGGAUAGGC
hsa-miR-26b深圳 UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
miR-30-3p 60 67年 1、m8 hsa-miR-30a-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUGCAGC
hsa-miR-30e-3p CUUUCAGUCGGAUGUUUACAGC
mir - 342 1108年 1115年 1、m8 hsa - mir - 342大脑 UCUCACACAGAAAUCGCACCCGUC
mir - 363 545年 551年 1 hsa - mir - 363 AUUGCACGGUAUCCAUCUGUAA
mir - 369 - 3 - p 745年 752年 1、m8 hsa - mir - 369 - 3 - p AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU
mir - 374 746年 752年 m8 hsa - mir - 374 UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG
mir - 377 1107年 1113年 m8 hsa - mir - 377 AUCACACAAAGGCAACUUUUGU
mir - 450 989年 995年 1 hsa - mir - 450 UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA
mir - 495 202年 208年 1 hsa - mir - 495大脑 AAACAAACAUGGUGCACUUCUUU
mir - 500 544年 550年 1 hsa - mir - 500 AUGCACCUGGGCAAGGAUUCUG
mir - 543 466年 472年 1 hsa - mir - 543 AAACAUUCGCGGUGCACUUCU
mir - 96 733年 739年 1 hsa - mir - 96大脑 UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC