SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

基因	2035
象征	EPB41
同义词	4.1r \| el1 \|他
描述	红细胞膜蛋白带4.1
参考	MIM：130500\|HGNC：HGNC：3377\|ENSEMBL：ENSG00000159023\|HPRD：00558\|Vega：Otthumg00000003644
基因类型	蛋白质编码
地图位置	1p33-p32
Pascal P值	8.17e-5
胎儿β	2.665
DMG	1（＃研究）
主持人	小脑
支持	COMPOSITESET

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	1
DNM：Fromer_2014	整个外显子组测序分析	这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	PPI网络中最短路径的贡献：3.9116

第一节遗传学和表观遗传学注释

DNM表

基因	染色体	位置	参考	alt	成绩单	AA更改	突变类型	筛	CG46	特征	学习
EPB41	CHR1	29344918	t	ttga	NM_001166005 NM_001166006 NM_001166007 NM_004437 NM_203342 NM_203343	。。。。。。	框架外插入框架外插入框架外插入框架外插入框架外插入框架外插入			精神分裂症	DNM：Fromer_2014

差异甲基化基因

探测	染色体	位置	最近的基因	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG07154196	1	29214064	EPB41	1.895E-4	-0.338	0.034	DMG：Wockner_2014

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
PTBP1	0.93	0.82
TGIF2	0.92	0.73
smo	0.90	0.80
TP53	0.89	0.73
itprip	0.89	0.74
CHST14	0.89	0.79
ERBB2	0.88	0.81
tead2	0.88	0.66
TCF19	0.88	0.61
CDK2	0.88	0.66

前10个负共表达基因
基因	皮尔逊的相关性	斯皮尔曼的相关性
C5orf53	-0.46	-0.53
CCNI2	-0.41	-0.45
chn1	-0.41	-0.48
我的天啊	-0.41	-0.48
CA11	-0.40	-0.46
serpini1	-0.40	-0.49
ephx4	-0.40	-0.51
CKMT1A	-0.40	-0.45
ACOT13	-0.40	-0.50
ACYP2	-0.39	-0.45

第三节。基因本体论注释

分子功能	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0003779	肌动蛋白结合	IEA		-
去：0005545	磷脂酰肌醇结合	艾达		16669616
去：0005488	捆绑	IEA		-
去：0005198	结构分子活性	IEA		-
去：0005200	细胞骨架的结构成分	塔斯		6894932
生物过程	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0008015	血液循环	塔斯		6894932
GO：0030866	皮质肌动蛋白细胞骨架组织	IEA		-
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005856	细胞骨架	IEA		-
去：0005634	核	IEA		-
去：0005737	细胞质	IEA		-
去：0008091	光谱	塔斯		6894932
去：0005886	质膜	塔斯		9598318
GO：0019898	外膜到膜	IEA		-
GO：0043234	蛋白质复合物	艾达		16060676
去：0030863	皮质细胞骨架	艾达		16254212

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
acta1	Acta \|Asma \|CFTD \|CFTD1 \|CFTDM \|mpfd \|Nem1 \|Nem2 \|NEM3	肌动蛋白，α1，骨骼肌	-	HPRD	11071908
卡尔	CRT \|FLJ26680 \|ro \|SSA \|CC1QR	钙网蛋白	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
桶	CAGH39 \|CMG \|FLJ22219 \|FLJ31914 \|lin2 \|Micpch \|TNRC8	钙/钙调蛋白依赖性丝氨酸蛋白激酶（Maguk家族）	-	HPRD，Biogrid	9660868
CD44	CDW44 \|CSPG8 \|ECMR-III \|hcell \|在\|lhr \|MC56 \|mdu2 \|mdu3 \|MGC10468 \| MIC4 \| MUTCH-I \| Pgp1	CD44分子（印度血型）	-	HPRD	12901833
CDK2	p33（CDK2）	细胞周期蛋白依赖性激酶2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
cenpj	BM032 \|CPAP \|圈\|lip1 \|MCPH6 \|MGC131581 \|MGC131582 \|MGC142222 \|MGC142224	Centromere蛋白J	-	HPRD，Biogrid	11003675
DCTN1	DAP-150 \|DP-150 \|HMN7B \|P135	Dynactin 1（P150，胶合同源物，果蝇）	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10189366
DLG1	DKFZP761P0818 \|DKFZP781B0426 \|dlgh1 \|SAP97 \|DJ1061C18.1.1 \|HDLG	圆盘，大型同源物1（果蝇）	-	HPRD，Biogrid	7937897
drd2	D2DR \|d2r	多巴胺受体D2	-	HPRD	12181426
DRD3	D3DR \|ETM1 \|FET1 \|MGC149204 \|MGC149205	多巴胺受体D3	-	HPRD	12181426
Dync1H1	DHC1 \|DHC1A \|DKFZP686P2245 \|dnch1 \|DNCL \|dnecl \|dyhc \|DNCHC1 \|HL-3 \|KIAA0325 \| p22	动力蛋白，细胞质1，重链1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10189366
echs1	SCEH	Enoyl辅酶A水合物，短链，1，线粒体	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
EIF3G	EIF3-P42 \|EIF3S4 \|eif3-delta \|EIF3-P44	真核翻译起始因子3，亚基G	-	HPRD，Biogrid	10887144
EPB42	MGC116735 \|MGC116737 \|PA	红细胞膜蛋白带4.2	-	HPRD	2968981
GYPC	CD236 \|CD236R \|GE \|GPC \|GYPD \|MGC117309 \|MGC126191 \|MGC126192	糖蛋白C（Gerbich血型）	-	HPRD	11423550
KPNA2	IPOA1 \|qip2 \|RCH1 \|srp1alpha	核桃蛋白α2（抹布队1，importin alpha 1）	-	HPRD，Biogrid	10359596
myh9	DFNA17 \|EPSTS \|ftns \|MGC104539 \|MHA \|NMHC-II-A \|nmmhca	肌球蛋白，重链9，非肌肉	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
myl1	MLC1F \|MLC3F	肌球蛋白，轻链1，碱；骨骼，快	-	HPRD	11071908
NPPA	anf \|ANP \|ATFB6 \|CDD-ANF \|PND	亚钠肽前体A	重构的复合物	Biogrid	12542678
numa1	numa	核有丝分裂设备蛋白1	-	HPRD，Biogrid	10189366
PAICS	ADE2 \|ADE2H1 \|AIRC \|DKFZP781N1372 \|MGC1343 \|MGC5024 \|佩斯	磷酸氨基氨基咪唑羧化酶，磷酸氨基氨基咪唑辅助辅助酰胺合成酶合成酶	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
PFA	fgams \|fgarat \|KIAA0361 \|金银丝	磷酸贝糖基甘氨酸合酶	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
SLC4A1	AE1 \|BND3 \|CD233 \|di \|EMPB3 \|EPB3 \|fr \|MGC116750 \|MGC116753 \|MGC126619 \| MGC126623 \| RTA1A \| SW \| WD \| WD1 \| WR	溶质载体家族4，阴离子交换器，成员1（红细胞膜蛋白带3，迭戈血型）	-	HPRD	1639060
SPTAN1	（alpha）ii-spectrin \|FLJ44613 \|Neas	光谱，α，非肉毒细胞1（阿尔法 - - - - - - - --------）	重构的复合物	Biogrid	12044158
SPTAN1	（alpha）ii-spectrin \|FLJ44613 \|Neas	光谱，α，非肉毒细胞1（阿尔法 - - - - - - - --------）	-	HPRD	12049649
SPTB	HSPTB1	光谱，β，红细胞	-	HPRD，Biogrid	7673158
SPTBN1	精灵\|SPTB2 \|Betaspii	光谱，β，非肉毒杆菌1	-	HPRD	12901833
tagln2	HA1756 \|KIAA0120	Transgelin 2	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931
TJP2	MGC26306 \|x104 \|ZO-2 \|ZO2	紧密连接蛋白2（Zona occludens 2）	-	HPRD，Biogrid	10874042
TPM1	C15orf13 \|CMD1Y \|htm-alpha \|TMSA	肌球蛋白1（α）	-	HPRD	11071908
U2AF1	dkfzp313j1712 \|FP793 \|RN \|RNU2AF1 \|U2AF35 \|U2AFBP	U2小核RNA辅助因子1	-	HPRD	9645944
var	g7a \|vars1 \|vars2	瓣膜-TRNA合成酶	亲和力捕获ms	Biogrid	17353931

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
kegg thright连接点	134	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Syndecan 2途径	33	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci髓质与导管乳腺癌	206	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活	485	293	该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病	368	234	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病有关	30	19	该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应lps up	431	237	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标	1278	748	该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧化物素的浓凋亡	239	157	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G	238	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn	800	473	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标	1174	695	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射5的响应5	147	89	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络	1652	1023	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络	1442	892	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络	779	480	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标	148	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好，而不是很差	236	139	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sakai肿瘤浸润单核细胞DN	81	51	该途径中的所有SZGR 2.0基因
苏胰腺	54	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Creb1靶向DN	57	39	该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过nova2拼接	43	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung可卡因奖励4WK	75	47	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN	160	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin dn的反应	271	175	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定	491	310	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标百里香DN中的目标	12	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标	217	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN	270	181	该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌Kras DN	435	289	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞	200	115	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向	395	249	该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络	1210	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集7	28	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位	368	247	该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移	221	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应11	103	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro	177	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN	505	328	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5A靶向	217	131	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标	259	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦纳红细胞膜基因	15	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞DN	428	246	该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族	目标位置			mirna id	mirna seq
mirna家族	UTR开始	UTR结束	匹配方法	mirna id	mirna seq
mir-128	703	709	1a	HSA-MIR-128A	ucacagugaaccggucuuuu
mir-128	703	709	1a	HSA-MIR-128B	ucacagugaaccggucuuc
mir-144	701	707	M8	HSA-MIR-144	uacaguauagauguauguaguag
mir-205	2991	2998	1A，M8	HSA-MIR-205	uccuucauucccggagucug
mir-27	703	710	1A，M8	HSA-MIR-27A^脑	uucacaguggcuaaguuccgc
mir-27	703	710	1A，M8	HSA-MIR-27B^脑	uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-5p	3042	3049	1A，M8	HSA-MIR-30A-5P	uguaaaacauccuccugagaag
				HSA-MIR-30C^脑	uguaaacauccuacucucucucucagc
				HSA-MIR-30D^SZ	uguaaacauccccgacuggaag
				HSA-MIR-30B^SZ	uguaaacauccuaccucucagcu
				HSA-MIR-30E-5P	uguaaacauccuugacugga
mir-331	944	950	1a	HSA-MIR-331^脑	gccccugggccuauccuagaa
mir-377	2495	2502	1A，M8	HSA-MIR-377	aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-381	3190	3196	M8	HSA-MIR-381	uauacaagggcaagcucucugu
mir-504	2560	2567	1A，M8	HSA-MIR-504	agacccugucugcacucuau

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里查看与SZ相关的miRNA列表。
大脑：基于miRNA微阵列表达研究在大脑中表达的miRNA。点击这里查看与大脑相关的miRNA列表。

基因页：EPB41

第一节遗传学和表观遗传学注释

DNM表

差异甲基化基因

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

时间变化的基因表达（brainspan）

大脑区域的顶级共表达基因

第三节。基因本体论注释

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

V.途径注释

第六节。microRNA注释