Gene Page:STOM

概括?
基因 2040
Symbol STOM
Synonyms BND7|EPB7|EPB72
Description stomatin
Reference MIM:133090|HGNC:HGNC:3383|Ensembl:ENSG00000148175|HPRD:00585|Vega:OTTHUMG00000020590
Gene type protein-coding
Map location 9q34.1
Pascal p-value 0.406
Sherlock p-value 0.529
Fetal beta -1.56
eGene Myers' cis & trans
Support G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSENSUS
CompositeSet

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:GWAScat Genome-wide Association Studies This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies GWASdb records for schizophrenia
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs3924628 chr16 8631062 STOM 2040 0.19 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
死神:胎儿(13 - 26 postconception凌晨ks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
ATP11A 0.88 0.89
WNK1 0.85 0.84
DENND5A 0.84 0.86
ARHGEF10 0.83 0.83
USP54 0.83 0.80
TBC1D9B 0.82 0.86
SPTLC2 0.80 0.82
SHROOM4 0.80 0.73
CNTN2 0.80 0.82
MAN2A2 0.79 0.83
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
ST20 -0.43 -0.48
AF347015.21 -0.41 -0.38
IL32 -0.41 -0.43
Sycp3 -0.39 -0.45
C8orf59 -0.39 -0.39
SPDYA -0.39 -0.45
COX16 -0.38 -0.40
AC087071.1 -0.38 -0.39
C1orf61 -0.38 -0.36
PFDN5 -0.38 -0.39

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
LIU PROSTATE CANCER DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FULCHER INFLAMMATORY RESPONSE LECTIN VS LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOANE RESPONSE TO ANDROGEN DN 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROY WOUND BLOOD VESSEL UP 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CLIM2 TARGETS DN 186 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP 1821 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC DN 537 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 6 7WK UP 197 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE PAPILLOMA PROGRESSION RISK 74 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOTZMANN EPITHELIAL TO MESENCHYMAL TRANSITION DN 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCH GATA1 TARGETS 22 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOLUB ALL VS AML DN 24 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL QTL TRANS 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWN MYELOID CELL DEVELOPMENT UP 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 VS CD2 UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALCALAY AML BY NPM1 LOCALIZATION DN 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG CISPLATIN RESPONSE AND XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUNINGER IGF1 VS PDGFB TARGETS DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING NEOCORTEX UP 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG HYPOXIA NORMAL 311 205 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG SMARCE1 TARGETS UP 280 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS UP 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ TP53 TARGETS UP 602 364 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS UP 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOLENAAR TARGETS OF CCND1 AND CDK4 UP 67 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN UP 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING 510 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG IL22 SIGNALING UP 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE TARGETS OF TGFB1 AND WNT3A DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C CLUSTER UP 38 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VILIMAS NOTCH1 TARGETS DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO CSF2RB AND IL4 UP 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF UP 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 UP 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOFFMANN IMMATURE TO MATURE B LYMPHOCYTE UP 43 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 36HR UP 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR UP 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS UP 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COULOUARN TEMPORAL TGFB1 SIGNATURE DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA3 DN 69 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEGER ADIPOGENESIS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS UP 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND WITH H4K20ME1 MARK 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ALFANO MYC TARGETS 239 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUILLAUMOND KLF10 TARGETS UP 51 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN PREDNISOLONE RESISTANCE B ALL DN 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLEMAN PREDNISOLONE RESISTANCE ALL DN 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因