基因页：Epha4

概括？
基因 2043
象征 Epha4
同义词 hek8 | sek | tyro1
描述 EPH受体A4
参考 MIM：602188|HGNC：HGNC：3388|Ensembl：ENSG00000116106|HPRD：03719|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q36.1
Pascal P值 0.02
胎儿β -1.404
支持 酪氨酸激酶信号传导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01016
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00916
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
polr2b 0.97 0.96
DHX57 0.97 0.97
CSDE1 0.97 0.97
DHX29 0.96 0.97
MATR3 0.96 0.96
CCT6A 0.96 0.96
cdc5l 0.96 0.96
WDR3 0.96 0.96
XRCC5 0.96 0.97
SUPT16H 0.95 0.97
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.77 -0.91
MT-CO2 -0.77 -0.91
AF347015.27 -0.76 -0.88
AF347015.33 -0.76 -0.89
FXYD1 -0.75 -0.89
ifi27 -0.75 -0.89
HLA-F -0.74 -0.81
AF347015.8 -0.74 -0.89
mt-cyb -0.74 -0.87
higd1b -0.72 -0.88

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0000166 核苷酸结合 IEA -
去：0004872 受体活性 IEA -
去：0005003 ephrin受体活性 IEA -
去：0005524 ATP结合 IEA -
GO：0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 IEA -
去：0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去：0007165 信号转导 塔斯 7898931
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0016020 膜 IEA -
去：0005887 质膜的积分 塔斯 7898931

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
KEGG轴突指导 129 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Epha4途径 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Epha FWDPathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂红色DN的反应 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斋丁嫩造血干细胞DN 226 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向F 185 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX3 FOXO1融合的Begum目标 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP63目标 355 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射5的响应5 147 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制目标 81 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HALMOS CEBPA目标 52 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nguyen Notch1靶向DN 86 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu Crebbp目标DN 44 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21靶向 37 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时 156 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2向上 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bild HRAS致癌特征 261 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌正常 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦加维因结肠癌的甲基化沉默 42 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein增殖 175 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Beier神经胶质瘤干细胞向上 39 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记 165 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gabriely miR21靶标 289 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 88 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Katsanou Elavl1靶向 169 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1通过NFIC 10小时信号传导 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ghandhi旁观者辐射DN 12 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 39 45 1a HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 agagguaguagguugcauagu
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 ugagguaaguuguauuguu
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
mir-10 2389 2395 M8 HSA-MIR-10A uacccuguagauccgaauuugug
HSA-MIR-10B uacccuguagaaccgaauuugu
mir-125/351 2299 2305 1a HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-136 1795年 1801年 1a HSA-MIR-136 Acuccauuuuuuugaugaugaugga
mir-137 2928 2935 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-138 1094 1100 M8 HSA-MIR-138脑 Agcugguuguguugaauc
mir-153 2479 2485 M8 HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 70 76 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-181 1471 1477 M8 HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
HSA-MIR-181A脑 aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C脑 aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D脑 aacauucauuguugucggggguggguu
mir-183 1315 1321 M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-188 2468 2474 M8 HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-193 1 7 1a HSA-MIR-193A Aacuggccuacaaagucccag
HSA-MIR-193B aacuggcccucaaagucccgcuuu
mir-21 2281 2288 1A，M8 HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
HSA-MIR-590 gagcuuauucauaaaaagugcag
mir-219 756 762 M8 HSA-MIR-219脑 ugauuguccaaacgcaauucu
mir-22 2098 2104 1a HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-27 2835 2841 1a HSA-MIR-27A脑 uucacaguggcuaaguuccgc
HSA-MIR-27B脑 uucacaguggcuaaguucugc
mir-30-3p 2493 2499 1a HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-329 1382 1388 1a HSA-MIR-329脑 aacacaccugguaaccucuuu
mir-33 3289 3295 1a HSA-MIR-33 Gugcauuguuguugcauug
HSA-MIR-33B Gugcauugcuguugcauugca
mir-335 2011 2017 1a HSA-MIR-335脑 UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU
mir-339 2388 2394 M8 HSA-MIR-339 ucccuccuccaggagcuca
mir-34/449 2207 2213 1a HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-374 3068 3075 1A，M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-381 2823 2829 M8 HSA-MIR-381 uauacaagggcaagcucucugu
mir-433-3p 3205 3211 1a HSA-MIR-433脑 aucaugauggggcuccucggugu
mir-448 2094 2100 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-539 220 226 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu
mir-543 1472 1478 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu