基因页面:EPHB3

总结吗?
GeneID 2049年
象征 EPHB3
同义词 ETK2 | HEK2 | TYRO6
描述 弗受体B3
参考 MIM: 601839|HGNC: HGNC: 3394|运用:ENSG00000182580|HPRD: 03502|织女:OTTHUMG00000156710
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 3 q27.1
帕斯卡假定值 0.568
胎儿β -0.63

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
认为:Fromer_2014 全外显子组测序分析 本研究报告623年韦斯研究精神分裂症三人小组,报告认为使用基因组DNA。
GO_Annotation neuro-related关键字映射到基因本体论注释 支安打与neuro-related关键词:2

部分即遗传学和表观遗传学注释

@认为表

基因 染色体 位置 裁判 Alt 成绩单 AA变化 突变类型 筛选 CG46 特征 研究
EPHB3 chr3 184295448 C T NM_004443
NM_004443		 。
。		 沉默
拼接		 精神分裂症 认为:Fromer_2014


第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AL161668.2 0.91 0.91
MRC2 0.90 0.79
SMO 0.90 0.87
EPHB4 0.88 0.81
MMP14 0.88 0.83
CHST14 0.87 0.84
PALLD 0.87 0.81
PRKD2 0.87 0.75
PTBP1 0.86 0.85
DDR1 0.86 0.82
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.41 -0.43
CA4 -0.39 -0.39
EPHX4 -0.38 -0.40
SERPINI1 -0.38 -0.39
CHN1 -0.37 -0.35
RERGL -0.37 -0.46
KMO -0.37 -0.43
ABCC12 -0.36 -0.42
AF347015.21 -0.36 -0.46
AF347015.31 -0.36 -0.40

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0008046 轴突引导受体活动 国际能源机构 轴突(术语层面:6) - - - - - -
去:0000166 核苷酸绑定 国际能源机构 - - - - - -
去:0004872 受体的活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005003 ephrin受体活动 国际能源机构 - - - - - -
去:0005524 ATP结合 国际能源机构 - - - - - -
去:0016740 转移酶的活动 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007411 轴突的指导 国际能源机构 轴突(术语层面:13) - - - - - -
去:0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路 国际能源机构 - - - - - -
去:0006468 蛋白质磷酸化氨基酸 国际能源机构 - - - - - -
去:0007165 信号转导 助教 8397371
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -
去:0005887 不可或缺的质膜 助教 8397371

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG轴突引导 129年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
PID EPHB FWD通路 40 38 所有SZGR 2.0基因通路
DAVICIONI分子武器VS erm DN 182年 111年 所有SZGR 2.0基因通路
DN HOOI ST7目标 123年 78年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 450年 256年 所有SZGR 2.0基因通路
MULLIGHAN MLL签名1 380年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
ENK紫外线反应角化细胞 530年 342年 所有SZGR 2.0基因通路
DELYS甲状腺癌了 443年 294年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP53的目标 1174年 695年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP63目标 355年 243年 所有SZGR 2.0基因通路
佩雷斯TP53和TP63目标 205年 145年 所有SZGR 2.0基因通路
HUMMERICH皮肤癌症恶化DN One hundred. 64年 所有SZGR 2.0基因通路
艾亚尔COBRA1 DN的目标 29日 18 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN NIPP1目标 848年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH SUZ12目标 1038年 678年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH速度的目标 1062年 725年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH ES与H3K27ME3 1118年 744年 所有SZGR 2.0基因通路
BENPORATH PRC2目标 652年 441年 所有SZGR 2.0基因通路
不知道背景目标1 140年 85年 所有SZGR 2.0基因通路
甜蜜的喀斯特DN的目标 66年 39 所有SZGR 2.0基因通路
BYSTRYKH造血干细胞RUNX1 9 6 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC目标了 126年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
HOEGERKORP CD44目标直接DN 14 7 所有SZGR 2.0基因通路
写到响应干扰素β 71年 49 所有SZGR 2.0基因通路
击倒老化肌肉了 244年 165年 所有SZGR 2.0基因通路
VERRECCHIA应对TGFB1 C1 19 15 所有SZGR 2.0基因通路
德拉TSA和丁酸 21 17 所有SZGR 2.0基因通路
VERRECCHIA TGFB1早期反应 58 43 所有SZGR 2.0基因通路
伯顿脂肪形成11 57 40 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆APC的目标 212年 121年 所有SZGR 2.0基因通路
桑塞姆需要MYC WNT通路 58 43 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三骨DN乳腺癌复发 315年 197年 所有SZGR 2.0基因通路
萧述三乳腺癌基底 648年 398年 所有SZGR 2.0基因通路
VART KSHV感染血管生成标记 165年 118年 所有SZGR 2.0基因通路
VART KSHV感染血管生成标记DN 138年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
黄成人组织干细胞模块 721年 492年 所有SZGR 2.0基因通路
棕熊短波紫外线反应中间 98年 56 所有SZGR 2.0基因通路
MIYAGAWA EWSR1 ETS的目标融合起来 259年 159年 所有SZGR 2.0基因通路
DN FEVR CTNNB1目标 553年 343年 所有SZGR 2.0基因通路
GHANDHI旁观者辐照DN 12 10 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 149 610年 617年 1、m8 hsa - mir - 149大脑 UCUGGCUCCGUGUCUUCACUCC
miR-19 485年 492年 1、m8 hsa-miR-19a UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
hsa-miR-19b UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
miR-29 538年 544年 m8 hsa-miR-29a深圳 UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU
hsa-miR-29b深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU
hsa-miR-29c深圳 UAGCACCAUUUGAAAUCGGU
mir - 326 592年 599年 1、m8 hsa - mir - 326 CCUCUGGGCCCUUCCUCCAG
mir - 339 490年 496年 1 hsa - mir - 339 UCCCUGUCCUCCAGGAGCUCA