基因页面:LINC00116
总结吗?
| GeneID | 205251年 |
| 象征 | LINC00116 |
| 同义词 | NCRNA00116 |
| 描述 | 116年长基因间的非蛋白编码RNA |
| 参考 | HGNC: HGNC: 27339|HPRD: 14131| |
| 基因型 | ncRNA |
| 地图上的位置 | 2问题 |
| 帕斯卡假定值 | 0.011 |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 海马体 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs143585021 | 2 | 111032140 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 1.959 e-6 | 0.03 | -51624年 | gtex_brain_ba24 |
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| rs10177824 | 2 | 110883709 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 3.058 e-6 | 0 | 96807年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs73954642 | 2 | 110973612 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 3.036平台以及 | 0 | 6904年 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs9326629 | 2 | 110980108 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 3.036平台以及 | 0 | 408年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10170204 | 2 | 110980494 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 1.052 e-8 | 0 | 22 | gtex_brain_putamen_basal |
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| rs7604411 | 2 | 110983320 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 1.058 e-8 | 0 | -2804年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs137856165 | 2 | 110984277 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 3.052平台以及 | 0 | -3761年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11965102 | 2 | 110985230 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 3.075平台以及 | 0 | -4714年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs182392917 | 2 | 110985990 | LINC00116 | ENSG00000175701.6 | 1.005平台以及 | 0 | -5474年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 鲜明的前额叶皮层22 q11删除DN | 517年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李最近胸腺移民 | 227年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化了 | 570年 | 339年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FORTSCHEGGER PHF8目标了 | 279年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |