基因页:ephx2
概括?
基因 | 2053 |
象征 | ephx2 |
同义词 | CEH | SEH |
描述 | 环氧水解酶2 |
参考 | MIM:132811|HGNC:HGNC:3402|Ensembl:ENSG00000120915|HPRD:00582|Vega:Otthumg00000102115 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8p21 |
Pascal P值 | 8.982e-5 |
Sherlock P值 | 0.262 |
胎儿β | -1.162 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.00057 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.03086 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS73229090 | CHR8 | 27442127 | 交流 | 1.952E-8 | 基因间 | Ephx2,Clu | dist = 39688; dist = 12307 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10958899 | Chr9 | 10128700 | ephx2 | 2053 | 0.11 | 反式 | ||
RS10958907 | Chr9 | 10131580 | ephx2 | 2053 | 0.09 | 反式 | ||
RS1322159 | Chr9 | 10132695 | ephx2 | 2053 | 0.17 | 反式 | ||
RS192069 | Chrx | 76053555 | ephx2 | 2053 | 0.07 | 反式 | ||
RS16983508 | Chrx | 99747940 | ephx2 | 2053 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EPHX2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AMAMP | 0.90 | 0.88 |
grk6 | 0.89 | 0.88 |
Cobra1 | 0.89 | 0.88 |
ATG4B | 0.89 | 0.87 |
STK25 | 0.89 | 0.86 |
BBS1 | 0.89 | 0.88 |
thap4 | 0.89 | 0.85 |
RIC8A | 0.89 | 0.88 |
B4GALT7 | 0.88 | 0.87 |
TMUB2 | 0.88 | 0.86 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.75 | -0.70 |
AF347015.21 | -0.75 | -0.74 |
AF347015.8 | -0.74 | -0.71 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.70 |
AF347015.27 | -0.73 | -0.72 |
mt-cyb | -0.72 | -0.69 |
AF347015.33 | -0.72 | -0.68 |
AF347015.2 | -0.71 | -0.68 |
AF347015.15 | -0.70 | -0.67 |
AF347015.26 | -0.69 | -0.66 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0004301 | 环氧水解酶活性 | 艾达 | 10862610 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0042803 | 蛋白质同构化活性 | nas | 10862610 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008217 | 血压调节 | nas | 10862610 | |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0009636 | 对毒素的反应 | nas | 10862610 | |
GO:0017144 | 药物代谢过程 | nas | 10862610 | |
去:0006805 | 异生物代谢过程 | nas | 10862610 | |
去:0006800 | 氧和活性氧代谢过程 | nas | 10862610 | |
去:0006954 | 炎症反应 | nas | 10862610 | |
去:0006874 | 细胞钙离子稳态 | nas | 10862610 | |
GO:0019439 | 芳族复合分解代谢过程 | IEA | - | |
GO:0045909 | 血管舒张的阳性调节 | nas | 10862610 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | nas | 10862610 | |
去:0005625 | 可溶性部分 | nas | 10862610 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005777 | 过氧化物酶体 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg蛛网膜酸代谢 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg过氧化物酶体 | 78 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1突变签名1 DN | 126 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis乳腺癌进展DN | 70 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN | 149 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标DN | 366 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C7的反应 | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG MUC2靶标十二指肠3MO DN | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YANG MUC2靶标十二指肠6MO DN | 21 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G123 DN | 51 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaposi肝癌满足DN | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森平滑肌肉瘤DN | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BAE BRCA1靶向 | 75 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Noushmehr GBM被甲基化沉默 | 50 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang PPARG的经典成脂靶 | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wierenga Stat5a靶向DN | 213 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 | 152 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |