概括
基因 2053
象征 ephx2
同义词 CEH | SEH
描述 环氧水解酶2
参考 MIM:132811|HGNC:HGNC:3402|Ensembl:ENSG00000120915|HPRD:00582|Vega:Otthumg00000102115
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p21
Pascal P值 8.982e-5
Sherlock P值 0.262
胎儿β -1.162
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS73229090 CHR8 27442127 交流 1.952E-8 基因间 Ephx2,Clu dist = 39688; dist = 12307

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10958899 Chr9 10128700 ephx2 2053 0.11 反式
RS10958907 Chr9 10131580 ephx2 2053 0.09 反式
RS1322159 Chr9 10132695 ephx2 2053 0.17 反式
RS192069 Chrx 76053555 ephx2 2053 0.07 反式
RS16983508 Chrx 99747940 ephx2 2053 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AMAMP 0.90 0.88
grk6 0.89 0.88
Cobra1 0.89 0.88
ATG4B 0.89 0.87
STK25 0.89 0.86
BBS1 0.89 0.88
thap4 0.89 0.85
RIC8A 0.89 0.88
B4GALT7 0.88 0.87
TMUB2 0.88 0.86
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
MT-CO2 -0.75 -0.70
AF347015.21 -0.75 -0.74
AF347015.8 -0.74 -0.71
AF347015.31 -0.74 -0.70
AF347015.27 -0.73 -0.72
mt-cyb -0.72 -0.69
AF347015.33 -0.72 -0.68
AF347015.2 -0.71 -0.68
AF347015.15 -0.70 -0.67
AF347015.26 -0.69 -0.66

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0004301 环氧水解酶活性 艾达 10862610
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0042803 蛋白质同构化活性 nas 10862610
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008217 血压调节 nas 10862610
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0009636 对毒素的反应 nas 10862610
GO:0017144 药物代谢过程 nas 10862610
去:0006805 异生物代谢过程 nas 10862610
去:0006800 氧和活性氧代谢过程 nas 10862610
去:0006954 炎症反应 nas 10862610
去:0006874 细胞钙离子稳态 nas 10862610
GO:0019439 芳族复合分解代谢过程 IEA -
GO:0045909 血管舒张的阳性调节 nas 10862610
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005829 细胞质 nas 10862610
去:0005625 可溶性部分 nas 10862610
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0005777 过氧化物酶体 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg蛛网膜酸代谢 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg过氧化物酶体 78 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1 DN 126 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis乳腺癌进展DN 70 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Landis Erbb2乳腺肿瘤324 DN 149 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc TGFA DN 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN 64 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena DN 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标DN 366 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C7的反应 68 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG MUC2靶标十二指肠3MO DN 23 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YANG MUC2靶标十二指肠6MO DN 21 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G123 DN 51 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaposi肝癌满足DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Woo肝癌复发DN 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森平滑肌肉瘤DN 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向 75 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Noushmehr GBM被甲基化沉默 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang PPARG的经典成脂靶 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wierenga Stat5a靶向DN 213 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成pparg rxra绑定36小时 152 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rao由Sall4绑定 227 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因