基因页面:C2orf69
总结吗?
| GeneID | 205327年 |
| 象征 | C2orf69 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | 染色体2开放阅读框69 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 26799|运用:ENSG00000178074|HPRD: 08797|织女:OTTHUMG00000154480 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 q33.1 |
| 帕斯卡假定值 | 3.334 e-12 |
| 胎儿β | -0.03 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| 路:是的 | 全基因组关联研究 | 这个数据集包括99个基因映射到22个地区。前24个snp也包括在简历:Ripke_2013 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg18202627 | 2 | 200776533 | C2orf69 | 3.2 e-8 | -0.009 | 9.65 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs823123 | chr1 | 205725345 | C2orf69 | 205327年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs823066 | chr1 | 205771172 | C2orf69 | 205327年 | 0 | 反式 | ||
| rs11120206 | chr1 | 206610593 | C2orf69 | 205327年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs2716734 | chr2 | 39947720 | C2orf69 | 205327年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs2716736 | chr2 | 39947946 | C2orf69 | 205327年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs6770074 | chr3 | 5496504 | C2orf69 | 205327年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs9882137 | chr3 | 29494146 | C2orf69 | 205327年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs9882501 | chr3 | 29494429 | C2orf69 | 205327年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs467856 | chr5 | 3128168 | C2orf69 | 205327年 | 0.13 | 反式 | ||
| snp_a - 2169623 | 0 | C2orf69 | 205327年 | 4.897 e-5 | 反式 | |||
| rs13175086 | chr5 | 174691428 | C2orf69 | 205327年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs16894557 | chr6 | 28999825 | C2orf69 | 205327年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs2016128 | chr6 | 42442743 | C2orf69 | 205327年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs4947631 | chr7 | 50603378 | C2orf69 | 205327年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs17139868 | chr7 | 117079228 | C2orf69 | 205327年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs2195588 | chr8 | 40356699 | C2orf69 | 205327年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs10124277 | chr9 | 8499294 | C2orf69 | 205327年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs12352894 | chr9 | 38197383 | C2orf69 | 205327年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs6559219 | 0 | C2orf69 | 205327年 | 0.18 | 反式 | |||
| rs12255258 | chr10 | 106306927 | C2orf69 | 205327年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs998923 | chr13 | 35507810 | C2orf69 | 205327年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs4943304 | chr13 | 36058065 | C2orf69 | 205327年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs1503026 | chr18 | 70842605 | C2orf69 | 205327年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs12326929 | chr18 | 70864592 | C2orf69 | 205327年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs12327665 | chr19 | 39622639 | C2orf69 | 205327年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs6040607 | chr20 | 11371092 | C2orf69 | 205327年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs225434 | chr21 | 43724740 | C2orf69 | 205327年 | 0.1 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN NUYTTEN EZH2目标 | 1024年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 常它由HPV31 | 84年 | 55 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林NPAS4目标了 | 163年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| WHITFIELD细胞周期G2 | 182年 | 102年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 马顿斯维甲酸反应DN | 841年 | 431年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN CHYLA CBFA2T3目标 | 242年 | 146年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |