基因页：CLN8

概括？
基因 2055
象征 CLN8
同义词 C8orf61 | EPMR
描述 粘膜脂肪肌动病，神经元8
参考 MIM：607837|HGNC：HGNC：2079|ENSEMBL：ENSG00000182372|HPRD：06383|Vega：Otthumg0000000090343
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p23
Pascal P值 0.756
Sherlock P值 0.334
胎儿β -0.477
DMG 1（＃研究）
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG17927889 8 1733497 CLN8 8.75e-6 -0.401 0.013 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS270917 CHR2 161607017 CLN8 2055 0.01 反式
RS270916 CHR2 161607046 CLN8 2055 0.01 反式
RS270909 CHR2 161610477 CLN8 2055 0.09 反式
RS270914 CHR2 161611917 CLN8 2055 0.01 反式
RS270996 CHR2 161670759 CLN8 2055 0.04 反式
RS271001 CHR2 161674742 CLN8 2055 0.05 反式
RS7595584 CHR2 175652187 CLN8 2055 0.05 反式
SNP_A-1882582 0 CLN8 2055 0.14 反式
RS9965053 CHR18 3166191 CLN8 2055 0.16 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
引用 0.80 0.76
C3orf57 0.79 0.66
SGPP2 0.79 0.72
inpp4b 0.78 0.74
Emb 0.77 0.66
WNT2 0.77 0.62
KCNC2 0.77 0.65
MCF2 0.77 0.61
PHACTR2 0.76 0.63
BTBD11 0.76 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
WDR86 -0.39 -0.46
plekho1 -0.39 -0.46
NR2C2AP -0.37 -0.44
RPL18 -0.36 -0.61
emid1 -0.36 -0.45
RPL12 -0.36 -0.53
rps19p3 -0.36 -0.61
RPL14 -0.36 -0.47
traf4 -0.36 -0.54
RPLP1 -0.36 -0.53

第三节。基因本体论注释

生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0051935 神经冲动传播期间的谷氨酸摄取 IEA 神经元，谷氨酸，神经递质，神经胶质（GO期限：11） -
GO：0021522 脊髓运动神经元分化 IEA 神经元，大脑（GO期限：9） -
去：0007399 神经系统的发展 小鬼 神经突（GO期限：5） 10508524
去：0001306 年龄依赖对氧化应激的反应 IEA -
去：0007006 线粒体膜组织 IEA -
去：0008203 胆固醇代谢过程 小鬼 16086686
去：0008306 协会学习 IEA -
去：0008610 脂质生物合成过程 nas 12151215
去：0008361 细胞尺寸调节 IEA -
去：0007628 成人步行行为 IEA -
去：0007040 溶酶体组织 IEA -
去：0006644 磷脂代谢过程 小鬼 16086686
去：0006869 脂质运输 nas 12151215
去：0043066 凋亡的负调节 IEA -
GO：0050885 神经肌肉过程控制平衡 IEA -
GO：0050881 肌肉骨骼运动 IEA -
GO：0051348 转移酶活性的负调节 IEA -
GO：0035176 社会行为 IEA -
GO：0045861 蛋白水解的负调控 nas 12151215
GO：0050884 神经肌肉过程控制姿势 IEA -
GO：0044257 细胞蛋白分解代谢过程 IEA -
GO：0046513 神经酰胺生物合成过程 nas 12151215
GO：0045494 光感受器细胞维护 IEA -
GO：0060041 摄像机型视网膜开发 IEA -
GO：0060052 神经丝细胞骨架组织 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005789 内质网膜 IEA -
去：0005783 内质网 艾达 10861296
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 nas 10508524|10861296
去：0033116 er-golgi中间室膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
中村肿瘤区周围与中央 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1突变签名1向上 276 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 341 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向 414 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
康（Kang）因tert而永生 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McClung Delta FOSB目标2WK 48 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌的王转移ESR1 DN 30 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMAD1和SMAD5 DN抑制Pangas肿瘤 157 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应很晚 317 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因