基因页：EPRS

概括?
基因ID 2058
Symbol EPRS
同义词 耳朵| glupror | pars | pig32 | qars | qprs
描述 谷氨酰基 - 丙酰基-TRNA合成酶
参考 MIM:138295|HGNC：HGNC：3418|ENSEMBL：ENSG00000136628|HPRD：00703|Vega：Otthumg0000000037433
基因type protein-coding
地图位置 1q41
Sherlock P值 0.227
Fetal beta 0.752
支持 COMPOSITESET
Ascano FMRP targets

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统atic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenic,schizophrenics,schizophrenias Click to show details
GO_Annotation Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations Hits with neuro-related keywords: 2
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0069

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
ythdc1 0.93 0.94
TPR 0.92 0.93
ZNF638 0.92 0.94
SENP6 0.91 0.92
SMC6 0.91 0.93
BRD8 0.91 0.92
SLTM 0.91 0.91
DMTF1 0.90 0.92
PRPF3 0.90 0.91
ZC3H7A 0.90 0.91
Top 10 negatively co-expressed genes
基因 Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.77 -0.86
IFI27 -0.76 -0.86
MT-CO2 -0.75 -0.85
higd1b -0.73 -0.85
AF347015.27 -0.73 -0.82
AF347015.33 -0.72 -0.81
FXYD1 -0.72 -0.82
MT-CYB -0.71 -0.80
AF347015.21 -0.71 -0.84
AF347015.8 -0.71 -0.82

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0004818 谷氨酸-TRNA连接酶活性 IEA glutamate (GO term level: 7) -
GO:0000166 核苷酸结合 IEA -
GO:0005515 protein binding 新闻学会 17353931
GO:0005524 ATP binding IEA -
去：0004827 脯氨酸-TRNA连接酶活性 IEA -
GO:0016874 ligase activity IEA -
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006424 glutamyl-tRNA aminoacylation IEA 谷氨酸（GO期限：11） -
GO:0006433 prolyl-tRNA aminoacylation IEA -
GO:0006461 蛋白质复合物组件 塔斯 8188258
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005625 可溶性部分 塔斯 8188258
GO:0005737 细胞质 塔斯 8188258

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ARL4D ARF4L | ARL6 ADP-ribosylation factor-like 4D 两个杂交 BioGRID 16169070
CP CP-2 ceruloplasmin (ferroxidase) 步态元素与glupror相互作用。 BIND 15479637
EEF1G EF1G |GIG35 真核翻译伸长因子1伽玛 EPRS interacts with EF-1-gamma. BIND 11829477
HSP90AA1 FLJ31884 | HSP86 | HSP89A | HSP90A | HSP90N | HSPC1 | HSPCA | HSPCAL1 | HSPCAL4 | HSPN | Hsp89 | Hsp90 | LAP2 热休克蛋白90KDAα（胞质），A类成员1 - HPRD，Biogrid 10913161
IARS FLJ20736 | IARS1 | ILRS | PRO0785 isoleucyl-tRNA synthetase - HPRD，Biogrid 9556618
IKBKE IKK-i | IKKE | IKKI | KIAA0151 | MGC125294 | MGC125295 | MGC125297 inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase epsilon 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
JTV1 AIMP2 |p38 |Pro0992 JTV1 gene p38 interacts with GluProRS. BIND 15479637
JTV1 AIMP2 |p38 |Pro0992 JTV1 gene - HPRD 9878398
MAP3K7 tak1 |TGF1A mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 - HPRD 14743216
火星 FLJ35667 | METRS | MTRNS methionyl-tRNA synthetase - HPRD 1651330|9878398
MCC DKFZP762O1615 |FLJ38893 |FLJ46755 |MCC1 mutated in colorectal cancers 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
POU2F1 OCT1 |OTF1 POU 2级同型1 远西方
Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 9537509
RARS ArgRS | DALRD1 | MGC8641 arginyl-tRNA synthetase - HPRD，Biogrid 9556618
SYNCRIP gry-rbp |HNRPQ1 |NSAP1 |RP1-3J17.2 |DJ3J17.2 |HNRNP-Q |pp68 synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein NSAP-1与glupror相互作用。 BIND 15479637
TFE3 RCCP2 | TFEA | bHLHe33 transcription factor binding to IGHM enhancer 3 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
th1l HSPC130 | NELF-C | NELF-D | TH1 Th1样（果蝇） 两个杂交 BioGRID 16169070


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG PORPHYRIN AND CHLOROPHYLL METABOLISM 41 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TRNA AMINOACYLATION 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CASORELLI ACUTE PROMYELOCYTIC LEUKEMIA DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Laiho结直肠癌锯齿状 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶DN中的Oswald造血干细胞 275 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION MONOCYTE UP 204 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德里格甲状腺癌的分化不佳 633 376 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP 722 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PROVENZANI METASTASIS UP 194 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN 394 258 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HAMAI APOPTOSIS VIA TRAIL UP 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER WITH LOH IN CHR9Q 116 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIYAR COBRA1 TARGETS UP 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 DN 156 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HYPOXIA VIA ELK3 ONLY UP 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSSEN MYC TARGETS 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NING CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE UP 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATTACHARYA EMBRYONIC STEM CELL 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GREENBAUM E2A TARGETS UP 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C8 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JIANG AGING HYPOTHALAMUS DN 40 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APRELIKOVA BRCA1 TARGETS 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING CEREBELLUM UP 84 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Calorie限制新皮层DN 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL AND PROGENITOR 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BACOLOD RESISTANCE TO ALKYLATING AGENTS DN 60 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD CTNNB1致癌特征 82 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 TARGETS DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTINEZ RB1 AND TP53 TARGETS DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAIRKEE CANCER PRONE RESPONSE BPA E2 118 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER TUMOR VS NORMAL ADJACENT TISSUE UP 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN DN 249 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌 285 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR UP 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN 127 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP 245 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D UP 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG TLX TARGETS 60HR DN 277 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FONTAINE FOLLICULAR THYROID ADENOMA DN 68 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 11 103 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因