基因页：SLC36A1

Summary？
GeneID 206358
象征 SLC36A1
同义词 dct1 | lyaat1 | pat1 | tramd3
描述 Solute Carrier家族36成员1
参考 MIM：606561|HGNC：HGNC：18761|ENSEMBL：ENSG00000123643|HPRD：07584|Vega：Otthumg00000130125
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q33.1
Pascal P值 0.286
胎儿β -0.769
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00459
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS16869851 CHR4 20690056 SLC36A1 206358 0.05 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005280 氢：氨基酸分类蛋白活性 IEA -
GO：0015293 分类者活动 IEA -
GO：0015193 L-丙烯跨膜转运蛋白活性 IEA -
GO：0015187 甘氨酸跨膜转运蛋白活性 IEA -
GO：0015180 L-丙氨酸跨膜转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0015816 甘氨酸运输 IEA -
GO：0015824 脯氨酸运输 IEA -
GO：0015808 L-丙氨酸运输 IEA -
去：0006810 运输 IEA -
去：0006865 氨基酸转运 IEA -
GO：0015992 质子运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005765 lysosomal membrane IEA -
去：0005783 内质网 艾达 11256614
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
REACTOME AMINO ACID TRANSPORT ACROSS THE PLASMA MEMBRANE 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome SLC介导的跨膜运输 241 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
无机阳离子阴离子和氨基酸寡肽的反应组转运 94 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组氨基酸和寡肽SLC转运蛋白 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli apl Secondary vs de从头上升 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McCabe Hoxc6靶向癌症 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病 181 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML与11q23重新排列 351 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu eszh2靶向DN 414 237 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-142-5p 341 347 M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-15/16/195/424/497 3023 3029 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 340 346 1a HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-30-5p 1222 1229 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
HSA-MIR-30DSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
HSA-MIR-30DSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga