概括
基因 2072
象征 ERCC4
同义词 ercc11 | fancq | rad1 | xfeps | xpf
描述 切除修复交叉补偿组4
参考 MIM:133520|HGNC:HGNC:3436|Ensembl:ENSG00000175595|HPRD:00594|Vega:Otthumg0000000048194
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p13.12
Pascal P值 0.046
主持人 小脑半球
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 ERCC4 2072 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0003684 DNA结合受损 小鬼 11790111
去:0003697 单链DNA结合 艾达 10413517
去:0004520 脱氧核糖核酸酶活性 艾达 10413517|14734547
去:0004520 脱氧核糖核酸酶活性 艾达 8797827
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
去:0008022 蛋白C末端结合 IPI 9722633
GO:0047485 蛋白质N末端结合 IPI 14734547
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000718 核苷酸拆卸,DNA损伤去除 经验 10583946
GO:0000724 通过同源重组的双链断裂修复 小鬼 14728600
去:0006295 核苷酸拆卸,DNA切口,3'TO病变 小鬼 11790111
去:0006296 核苷酸拆卸,DNA切口,5'TO病变 小鬼 11790111|14728600
去:0009650 紫外线保护 IEA -
GO:0032205 端粒维护的负法规 小鬼 17055345
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000109 核苷酸拆卸修复复合物 艾达 10413517
GO:0000784 核染色体,端粒区域 艾达 14690602
去:0005634 艾达 12571280
去:0005654 核质 经验 10214908|11313499

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG核苷酸切除修复 44 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome转录耦合ner tc ner 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组核苷酸切除修复 51 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
转录耦合NER TC NER修复复合物的反应组形成 30 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome DNA修复 112 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome全球基因组NER GG NER 35 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GG NER中切口复合物的反应组形成 23 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang LMO4靶向DN 352 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wakasugi有Znf143绑定位点 58 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标 212 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC MYC目标 217 138 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sansom APC目标需要MYC 210 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 该途径中的所有SZGR 2.0基因
格雷希克癌症复制号码 323 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因