基因页:ERCC4
概括?
基因 | 2072 |
象征 | ERCC4 |
同义词 | ercc11 | fancq | rad1 | xfeps | xpf |
描述 | 切除修复交叉补偿组4 |
参考 | MIM:133520|HGNC:HGNC:3436|Ensembl:ENSG00000175595|HPRD:00594|Vega:Otthumg0000000048194 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p13.12 |
Pascal P值 | 0.046 |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1578978 | CHR8 | 118196802 | ERCC4 | 2072 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ERCC4_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0003684 | DNA结合受损 | 小鬼 | 11790111 | |
去:0003697 | 单链DNA结合 | 艾达 | 10413517 | |
去:0004520 | 脱氧核糖核酸酶活性 | 艾达 | 10413517|14734547 | |
去:0004520 | 脱氧核糖核酸酶活性 | 艾达 | 8797827 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0008022 | 蛋白C末端结合 | IPI | 9722633 | |
GO:0047485 | 蛋白质N末端结合 | IPI | 14734547 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000718 | 核苷酸拆卸,DNA损伤去除 | 经验 | 10583946 | |
GO:0000724 | 通过同源重组的双链断裂修复 | 小鬼 | 14728600 | |
去:0006295 | 核苷酸拆卸,DNA切口,3'TO病变 | 小鬼 | 11790111 | |
去:0006296 | 核苷酸拆卸,DNA切口,5'TO病变 | 小鬼 | 11790111|14728600 | |
去:0009650 | 紫外线保护 | IEA | - | |
GO:0032205 | 端粒维护的负法规 | 小鬼 | 17055345 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0000109 | 核苷酸拆卸修复复合物 | 艾达 | 10413517 | |
GO:0000784 | 核染色体,端粒区域 | 艾达 | 14690602 | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 12571280 | |
去:0005654 | 核质 | 经验 | 10214908|11313499 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG核苷酸切除修复 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome转录耦合ner tc ner | 45 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组核苷酸切除修复 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
转录耦合NER TC NER修复复合物的反应组形成 | 30 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome DNA修复 | 112 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome全球基因组NER GG NER | 35 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GG NER中切口复合物的反应组形成 | 23 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wakasugi有Znf143绑定位点 | 58 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标 | 212 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC MYC目标 | 217 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sansom APC目标需要MYC | 210 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |