基因页:ESRRG
概括?
基因 | 2104 |
象征 | ESRRG |
同义词 | err3 | errgamma | nr3b3 |
描述 | 雌激素相关受体伽马 |
参考 | MIM:602969|HGNC:HGNC:3474|ENSEMBL:ENSG00000196482|HPRD:04274|Vega:Otthumg0000000037025 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 1q41 |
Sherlock P值 | 0.708 |
胎儿β | -1.477 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG12636169 | 1 | 217309970 | ESRRG | 3.353E-4 | 0.55 | 0.041 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4854547 | CHR2 | 69342532 | ESRRG | 2104 | 0.13 | 反式 | ||
RS7644174 | CHR3 | 112722325 | ESRRG | 2104 | 0.15 | 反式 | ||
RS17302994 | CHR5 | 14299830 | ESRRG | 2104 | 0.14 | 反式 | ||
RS6578951 | Chr11 | 8321127 | ESRRG | 2104 | 0.03 | 反式 | ||
RS17825002 | CHR14 | 94887676 | ESRRG | 2104 | 0.17 | 反式 | ||
RS12101606 | CHR15 | 79264036 | ESRRG | 2104 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ESRRG_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SPRED2 | 0.85 | 0.83 |
LMTK2 | 0.83 | 0.79 |
SHC3 | 0.82 | 0.85 |
AP000751.3 | 0.82 | 0.77 |
ATP2B2 | 0.82 | 0.81 |
PLCB1 | 0.81 | 0.79 |
PER2 | 0.81 | 0.79 |
Arhgef3 | 0.81 | 0.78 |
DLGAP1 | 0.81 | 0.76 |
KIAA1045 | 0.80 | 0.75 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DBI | -0.43 | -0.44 |
Rab34 | -0.40 | -0.39 |
AC011475.1 | -0.39 | -0.39 |
C1orf54 | -0.38 | -0.37 |
AF347015.21 | -0.38 | -0.29 |
C1orf61 | -0.38 | -0.40 |
AL050337.1 | -0.37 | -0.40 |
RP9P | -0.37 | -0.44 |
FAM159B | -0.37 | -0.52 |
AL139819.3 | -0.37 | -0.35 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome核受体转录途径 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THUM收缩心力衰竭DN | 244 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
哈马凋亡通过Trail Up | 584 | 356 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝克莫昔芬抵抗DN | 52 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU GH1外源目标DN | 120 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Medulla标记 | 81 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
克莱门特乳腺癌复制号码 | 23 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤MF DN | 41 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TERAO AOX4靶向皮肤DN | 27 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ikeda mir30目标dn | 27 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |