概括
基因 2104
象征 ESRRG
同义词 err3 | errgamma | nr3b3
描述 雌激素相关受体伽马
参考 MIM:602969|HGNC:HGNC:3474|ENSEMBL:ENSG00000196482|HPRD:04274|Vega:Otthumg0000000037025
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1q41
Sherlock P值 0.708
胎儿β -1.477
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG12636169 1 217309970 ESRRG 3.353E-4 0.55 0.041 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4854547 CHR2 69342532 ESRRG 2104 0.13 反式
RS7644174 CHR3 112722325 ESRRG 2104 0.15 反式
RS17302994 CHR5 14299830 ESRRG 2104 0.14 反式
RS6578951 Chr11 8321127 ESRRG 2104 0.03 反式
RS17825002 CHR14 94887676 ESRRG 2104 0.17 反式
RS12101606 CHR15 79264036 ESRRG 2104 0.09 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SPRED2 0.85 0.83
LMTK2 0.83 0.79
SHC3 0.82 0.85
AP000751.3 0.82 0.77
ATP2B2 0.82 0.81
PLCB1 0.81 0.79
PER2 0.81 0.79
Arhgef3 0.81 0.78
DLGAP1 0.81 0.76
KIAA1045 0.80 0.75
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
DBI -0.43 -0.44
Rab34 -0.40 -0.39
AC011475.1 -0.39 -0.39
C1orf54 -0.38 -0.37
AF347015.21 -0.38 -0.29
C1orf61 -0.38 -0.40
AL050337.1 -0.37 -0.40
RP9P -0.37 -0.44
FAM159B -0.37 -0.52
AL139819.3 -0.37 -0.35

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome核受体转录途径 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝克莫昔芬抵抗DN 52 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔衰老肾脏无血DN 150 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1外源目标DN 120 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Medulla标记 81 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱门特乳腺癌复制号码 23 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌子类CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤MF DN 41 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TERAO AOX4靶向皮肤DN 27 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标dn 27 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因