基因页：ETV6
概括？
| 基因 | 2120 |
| 象征 | ETV6 |
| 同义词 | 电话| TEL/ABL | THC5 |
| 描述 | ETS变体6 |
| 参考 | MIM：600618|HGNC：HGNC：3495|ENSEMBL：ENSG00000139083|HPRD：15976|Vega：Otthumg00000168538 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12p13 |
| Pascal P值 | 0.028 |
| Sherlock P值 | 0.388 |
| 胎儿β | -0.267 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG15062795 | 12 | 11802217 | ETV6 | -0.023 | 0.43 | DMG：Nishioka_2013 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS6893753 | CHR5 | 35451871 | ETV6 | 2120 | 0.1 | 反式 | ||
| RS3812061 | CHR5 | 126213763 | ETV6 | 2120 | 0.03 | 反式 | ||
| RS12655258 | CHR5 | 126267350 | ETV6 | 2120 | 0.2 | 反式 | ||
| RS17165234 | CHR5 | 126403634 | ETV6 | 2120 | 0.01 | 反式 | ||
| RS12655006 | CHR5 | 126407601 | ETV6 | 2120 | 0.11 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| BBS7 | 0.84 | 0.83 |
| SACM1L | 0.84 | 0.82 |
| VPS35 | 0.84 | 0.89 |
| Insig2 | 0.83 | 0.82 |
| GFM1 | 0.83 | 0.83 |
| 纳尔 | 0.83 | 0.83 |
| 税务1BP1 | 0.82 | 0.85 |
| TUBGCP5 | 0.82 | 0.82 |
| RSRC1 | 0.82 | 0.79 |
| Trim37 | 0.82 | 0.79 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.54 | -0.55 |
| AF347015.2 | -0.54 | -0.56 |
| AF347015.31 | -0.53 | -0.58 |
| AF347015.8 | -0.52 | -0.57 |
| MT-CO2 | -0.52 | -0.58 |
| mt-cyb | -0.51 | -0.56 |
| AF347015.18 | -0.50 | -0.57 |
| C16orf74 | -0.50 | -0.59 |
| EIF4EBP3 | -0.50 | -0.56 |
| higd1b | -0.49 | -0.53 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| acta1 | Acta |Asma |CFTD |CFTD1 |CFTDM |mpfd |Nem1 |Nem2 |NEM3 | 肌动蛋白，α1，骨骼肌 | 共定位 | Biogrid | 9695962 |
| CRKL | - | V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物（Avian）类似 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15143164 |
| ETV6 | 电话|电话/abl | ETS变体6 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9651344|9695962 |
| FLI1 | ewsr2 |SIC-1 | 朋友白血病病毒整合1 | - | HPRD，Biogrid | 9651344 |
| GAB2 | KIAA0571 | GRB2相关的结合蛋白2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 15143164 |
| GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 远西方 |
Biogrid | 15143164 |
| HDAC9 | DKFZP779K1053 |HD7 |HDAC |HDAC7 |HDAC7B |HDAC9B |HDAC9FL |HDRP |KIAA0744 |mitr | 组蛋白脱乙酰基酶9 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12590135 |
| Kat5 | esa1 |htatip |htatip1 |plip |提示|TIP60 |CPLA2 | K（赖氨酸）乙酰转移酶5 | - | HPRD，Biogrid | 12737628 |
| L3MBTL | DKFZP586P1522 |FLJ41181 |H-L（3）MBT |KIAA0681 |L3MBTL1 |DJ138B7.3 | L（3）MBT样（果蝇） | - | HPRD | 12588862 |
| sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A，转录调节剂（酵母） | - | HPRD | 12527908 |
| ube2i | C358B7.1 |P18 |UBC9 | 泛素结合酶E2I（UBC9同源物，酵母） | - | HPRD | 10377438 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg dorso腹轴形成 | 25 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| korkola胚胎癌 | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Korkola Teratoma Up | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Liu Sox4靶向DN | 309 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci髓质与导管乳腺癌 | 206 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang LMO4靶向 | 372 | 227 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 马丁与HDAC互动 | 44 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大目标DN | 97 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath ES核心九相关 | 100 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯·泰特（Smith Tert） | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YIH对砷C4的反应 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| safford t淋巴细胞厌食 | 87 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rizki肿瘤侵入性3D | 210 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |