基因页面:EYA1
总结吗?
| GeneID | 2138年 |
| 象征 | EYA1 |
| 同义词 | 防喷器| BOR | BOS1 | OFC1 |
| 描述 | EYA转录共激活剂和磷酸酶1 |
| 参考 | MIM: 601653|HGNC: HGNC: 3519|运用:ENSG00000104313|HPRD: 03388|织女:OTTHUMG00000149894 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 8 q13.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.53 |
| 胎儿β | 0.387 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2890901 | chr9 | 10112765 | EYA1 | 2138年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs10958892 | chr9 | 10125117 | EYA1 | 2138年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs10958896 | chr9 | 10126894 | EYA1 | 2138年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs10958899 | chr9 | 10128700 | EYA1 | 2138年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs10958907 | chr9 | 10131580 | EYA1 | 2138年 | 0 | 反式 | ||
| rs1322159 | chr9 | 10132695 | EYA1 | 2138年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs10958910 | chr9 | 10134759 | EYA1 | 2138年 | 0.03 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| PRLR | 0.97 | 0.15 |
| CP | 0.97 | 0.62 |
| KCNJ13 | 0.96 | 0.28 |
| CLIC6 | 0.95 | 0.47 |
| SLC5A5 | 0.94 | 0.38 |
| SLC13A4 | 0.91 | 0.30 |
| ABCA4 | 0.90 | 0.40 |
| FOLR1 | 0.88 | 0.33 |
| RBM47 | 0.87 | 0.16 |
| TRPV4 | 0.87 | 0.22 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| NR2C2AP | -0.12 | -0.54 |
| OLFM2 | -0.12 | -0.43 |
| PLEKHO1 | -0.12 | -0.52 |
| ALKBH2 | -0.12 | -0.54 |
| ASGR1 | -0.12 | -0.41 |
| STMN1 | -0.12 | -0.45 |
| AC009133.1 | -0.11 | -0.46 |
| RFC2 | -0.11 | -0.45 |
| TUBB2B | -0.11 | -0.53 |
| MPND | -0.11 | -0.35 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0000287 | 镁离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0003824 | 催化活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0004725 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0016787 | 水解酶活性 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0045664 | 调节神经元分化 | 国际能源机构 | 神经元,神经发生(术语层面:9) | - - - - - - |
| 去:0001657 | 输尿管的萌芽发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006355 | 依赖dna的转录调节 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006350 | 转录 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0006470 | 蛋白质氨基酸脱磷酸作用 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009887 | 器官形态发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0009653 | 解剖结构形态发生 | 助教 | 9020840 | |
| 去:0008152 | 代谢过程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007605 | 感官知觉的声音 | 助教 | 9020840 | |
| 去:0007389 | 模式规范流程 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0007275 | 多细胞有机体的发展 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0043066 | 负调控细胞凋亡 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0042472 | 内耳形态发生 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0045165 | 细胞命运的承诺 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005737 | 细胞质 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DAVICIONI PAX FOXO1融合的目标 | 255年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI横纹肌肉瘤PAX FOXO1融合起来 | 64年 | 37 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合DN | 329年 | 219年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 留置权乳腺癌化生的VS导管 | 83年 | 51 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌8 q12如扩增子 | 132年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肿瘤对胎儿肾脏1 DN | 163年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 任肺泡横纹肌肉瘤了 | 98年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆衰老的大脑了 | 262年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KAAB心脏心房和心室DN | 261年 | 183年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 近藤H3K27ME3前列腺癌 | 196年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BONCI MIR15A MIR16 1的目标 | 91年 | 75年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BREDEMEYER抹布信号通过ATM不是通过NFKB DN | 38 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YAUCH刺猬信号旁分泌DN | 264年 | 159年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RUIZ过渡委员会的目标了 | 153年 | 107年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肿瘤 | 27 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069年 | 729年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PLASARI TGFB1目标10人力资源DN | 244年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4 | 227年 | 149年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ACEVEDO DN FGFR1在前列腺癌的目标模型 | 308年 | 187年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 101 | 1810年 | 1816年 | 1 | hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG | ||||
| hsa - mir - 101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG | ||||
| mir - 124.1 | 849年 | 855年 | m8 | hsa - mir - 124 a | UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA |
| miR-124/506 | 848年 | 855年 | 1、m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 128 | 200年 | 206年 | 1 | hsa - mir - 128 a | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU |
| hsa - mir - 128 b | UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC | ||||
| mir - 144 | 1810年 | 1816年 | 1 | hsa - mir - 144 | UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG |
| miR-15/16/195/424/497 | 1646年 | 1653年 | 1、m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
| hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
| hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
| hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
| hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
| hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU | ||||
| mir - 219 | 705年 | 712年 | 1、m8 | hsa - mir - 219大脑 | UGAUUGUCCAAACGCAAUUCU |
| miR-23 | 326年 | 332年 | m8 | hsa-miR-23a大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC |
| hsa-miR-23b大脑 | AUCACAUUGCCAGGGAUUACC | ||||
| miR-27 | 282年 | 288年 | 1 | hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC |
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| hsa-miR-27a大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC | ||||
| hsa-miR-27b大脑 | UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC | ||||
| mir - 323 | 326年 | 332年 | 1 | hsa - mir - 323大脑 | GCACAUUACACGGUCGACCUCU |
| mir - 369 - 3 - p | 1081年 | 1088年 | 1、m8 | hsa - mir - 369 - 3 - p | AAUAAUACAUGGUUGAUCUUU |
| mir - 374 | 1082年 | 1088年 | m8 | hsa - mir - 374 | UUAUAAUACAACCUGAUAAGUG |
| mir - 493 - 5 - p | 691年 | 697年 | m8 | hsa - mir - 493 - 5 - p | UUGUACAUGGUAGGCUUUCAUU |
| mir - 503 | 1647年 | 1653年 | 1 | hsa - mir - 503 | UAGCAGCGGGAACAGUUCUGCAG |
| mir - 543 | 229年 | 235年 | m8 | hsa - mir - 543 | AAACAUUCGCGGUGCACUUCU |