基因页：阿尔卡姆

概括？
基因 214
象征 阿尔卡姆
同义词 CD166 | MEMD
描述 活化的白细胞细胞粘附分子
参考 MIM：601662|HGNC：HGNC：400|Ensembl：ENSG00000170017|HPRD：03389|Vega：Otthumg00000159192
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q13.1
Pascal P值 0.022
胎儿β -0.886
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM：Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.04047
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） PSR：0.04359
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：4

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
阿尔卡姆 CHR3 105269062 一个 t NM_001243280
NM_001243281
NM_001627		 p.489n> i
p.489n> i
p.489n> i		 错过
错过
错过		 精神分裂症 DNM：Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1578978 CHR8 118196802 阿尔卡姆 214 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
aldh4a1 0.90 0.88
ACSBG1 0.90 0.85
htra1 0.88 0.86
GPR37L1 0.88 0.82
Selenbp1 0.88 0.79
PBXIP1 0.88 0.84
chdh 0.88 0.84
ATP1A2 0.87 0.85
SFXN5 0.86 0.84
赫帕卡姆 0.86 0.83
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
FRG1 -0.56 -0.63
CCAR1 -0.56 -0.63
AC026786.2 -0.56 -0.64
RTF1 -0.55 -0.58
CYP2R1 -0.54 -0.62
PHF14 -0.54 -0.60
C11orf57 -0.53 -0.66
Med19 -0.53 -0.54
DUSP12 -0.53 -0.55
AC011491.1 -0.52 -0.57

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005102 受体结合 塔斯 神经递质（GO期限：4） 7760007
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0008045 电机轴突指导 IEA 神经元，轴突（GO术语级别：14） -
去：0007155 细胞粘附 塔斯 7760007
去：0007165 信号转导 塔斯 7760007
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0043025 细胞体 IEA Axon，Dendrite（GO期限：4） -
GO：0030424 轴突 IEA 神经元，轴突，神经递质（GO期限：6） -
去：0016020 膜 IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
去：0009897 质膜的外侧 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
kegg细胞粘附分子凸轮 134 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌，LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS 579 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不良DN 60 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘vmyb的目标 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多恩乳腺癌课程 72 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向DN 536 332 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee神经Crest干细胞向上 146 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 77 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chow rassf1靶向 27 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Berenjeno由Rhoa转变为可逆DN 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2A DN 141 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与基础 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌簇7 20 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borlak肝癌EGF UP 57 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wood EBV EBNA1目标DN 47 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mohankumar TLX1靶向DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏2 DN 51 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 229 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wotton Runx目标DN 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Koyama Sema3b靶向DN 411 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Nanog目标 988 594 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath SOX2目标 734 436 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir192和Mir215的Georges目标 893 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱歌转移基质 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UEDA PERIFERAL CHICK 169 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Okumura炎症反应LPS 183 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
宁慢性阻塞性肺疾病 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
修道院LIF信号1 DN 26 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕色髓样细胞的发育 165 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
welcsh brca1靶向 198 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成11 57 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein神经元标记 69 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P4 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 97 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Worschech肿瘤排斥 56 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 174 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脑DN中的乳腺癌复发 85 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌ERBB2 UP 147 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ITO PTTG1靶向 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe TGFB1靶向DN 108 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
huper乳房基础与腔内DN 59 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D DN 252 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应 346 192 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wendt粘蛋白靶向 33 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamanaka胶质母细胞瘤生存DN 9 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黑川肝癌早期复发 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA1 UP 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤PCA3 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤 207 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤PR DN 44 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Karlsson TGFB1靶向DN 207 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转化特征dn 103 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ISSAEVA MLL2目标 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1目标1小时DN 6 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38部分的phong TNF响应 160 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WARTERS对IR皮肤的反应 83 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 900 907 1A，M8 HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-124/506 900 906 1a HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-142-5p 1165 1172 1A，M8 HSA-MIR-142-5P cauaaaguagaaagcacuac
mir-150 1969年 1975年 1a HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-18 1057 1063 M8 HSA-MIR-18A uaagguggaugugcagaua
HSA-MIR-18B uaaggugcaucuagugcagua
mir-192/215 227 233 M8 HSA-MIR-192 cugaccuaugaauugacagcc
HSA-MIR-215 Augaccuaugaauugacagac
mir-223 681 688 1A，M8 HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-299-5p 1758年 1764年 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-34/449 897 903 M8 HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-34b 898 904 M8 HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-376c 1133 1140 1A，M8 HSA-MIR-376C aacauagaggaaauuccacg
mir-409-3p 1150 1156 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-495 1865年 1871年 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 304 310 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-9 1761年 1767年 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga
HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga