Summary
基因ID 2155
象征 F7
同义词 SPCA
描述 凝结因子VII
参考 MIM:613878|HGNC:HGNC:3544|Ensembl:ENSG00000057593|HPRD: 01965|Vega:Otthumg0000000017373
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13q34
Pascal P值 0.273
胎儿β -1.135
DMG 1(#研究)
主持人 前扣带回皮层BA24
尾状基底神经节
弗伦联盟tal Cortex BA9
伏隔核基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 Hits with neuro-related keywords: 2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG03338754 13 113765397 F7 2.574E-4 0.445 0.038 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10994209 Chr10 61877705 F7 2155 0.16 反式
RS200301834 13 113759753 F7 ENSG00000057593.9 9.20784E-7 0.02 -352 gtex_brain_ba24
RS2774033 13 113765235 F7 ENSG00000057593.9 8.73488e-7 0.02 5130 gtex_brain_ba24
RS491098 13 113769346 F7 ENSG00000057593.9 9.71241 e - 0.02 9241 gtex_brain_ba24
RS493833 13 113769639 F7 ENSG00000057593.9 9.41633e-7 0.02 9534 gtex_brain_ba24
RS569557 13 113769917 F7 ENSG00000057593.9 8.96006E-7 0.02 9812 gtex_brain_ba24
RS6042 13 113770068 F7 ENSG00000057593.9 9.08646e-7 0.02 9963 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
GNG3 0.78 0.83
STX1A 0.77 0.85
CAMK1 0.75 0.82
NPM2 0.75 0.84
pnoc 0.74 0.82
LEPREL2 0.74 0.85
TCEAL1 0.74 0.82
Prkcz 0.73 0.81
STK32C 0.73 0.83
SNCA 0.72 0.78
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
PLXNB1 -0.42 -0.42
PXN -0.41 -0.42
RAB13 -0.40 -0.49
GPR125 -0.40 -0.39
REST -0.39 -0.37
Caskin2 -0.39 -0.40
GRTP1 -0.38 -0.40
Epha2 -0.38 -0.41
Sorbs3 -0.37 -0.39
TP53BP2 -0.37 -0.33

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 IEA 谷氨酸(GO期限:7) -
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 塔斯 谷氨酸(GO期限:7) 3037537
去:0003824 催化活性 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 18267072
去:0008233 肽酶活性 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0007598 血液凝血,外部途径 EXP 7598447
去:0007596 blood coagulation IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 EXP 3527261|8598903|8639673
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005576 细胞外区域 塔斯 3037537
去:0005886 质膜 EXP 2271516|3527261|8598903

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg补充和凝结级联 69 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta AMI途径 20 13 All SZGR 2.0 genes in this pathway
生物卡尔塔外途径 13 9 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome PTM伽马羧酸羧酸盐酸盐和芳基硫酸酯酶激活 27 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome BMAL1时钟NPAS2激活昼夜节律表达 36 27 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome Gamma羧化运输和蛋白质的氨基末端切割 11 8 All SZGR 2.0 genes in this pathway
蛋白质的反应组代谢 518 242 All SZGR 2.0 genes in this pathway
纤维蛋白凝块凝结级联反应组的形成 32 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME CIRCADIAN CLOCK 53 40 All SZGR 2.0 genes in this pathway
反应组止血 466 331 All SZGR 2.0 genes in this pathway
乳腺癌腔与基础 380 215 All SZGR 2.0 genes in this pathway
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rashi对电离辐射5的响应5 147 89 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Akt1 48hr DN诱导的XU HGF靶标 27 17 All SZGR 2.0 genes in this pathway
刘普通癌基因 79 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Shepard BMYB Morpholino DN 200 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 All SZGR 2.0 genes in this pathway
HSIAO肝特异性基因 244 154 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHU CMV 24 HR DN 91 64 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhu CMV全部DN 128 93 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王顺铂响应和XPC向上 202 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stearman肿瘤场效应 36 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
coates巨噬细胞M1与M2 DN 78 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
克拉斯的iwanaga致癌作用 170 107 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Cheng由雌二醇印记 110 68 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿塞维多肝癌DN 540 340 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN 701 446 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bochkis foxa2目标 425 261 All SZGR 2.0 genes in this pathway
VART KSHV感染血管生成标记DN 138 92 All SZGR 2.0 genes in this pathway
甜肺癌克拉斯 491 316 All SZGR 2.0 genes in this pathway
陈代谢综合征网络 1210 725 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML WITH INV 16 TRANSLOCATION 422 277 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸的反应 857 456 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vanloo SP3靶向DN 89 47 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA ECM监管机构 238 125 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA女性相关 753 411 All SZGR 2.0 genes in this pathway
NABA矩阵 1028 559 All SZGR 2.0 genes in this pathway