基因页:F9
概括?
基因 | 2158 |
象征 | F9 |
同义词 | F9 P22 | FIX | HEMB | P19 | PTC | THPH8 |
描述 | 凝血因子IX |
参考 | MIM:300746|HGNC:HGNC:3551|ENSEMBL:ENSG00000101981|HPRD:02385|Vega:Otthumg0000000022536 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | XQ27.1-Q27.2 |
胎儿β | 0.041 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10994209 | Chr10 | 61877705 | F9 | 2158 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/F9_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DOK5 | 0.82 | 0.71 |
SNX7 | 0.82 | 0.77 |
PTPN2 | 0.82 | 0.68 |
ZNF435 | 0.81 | 0.71 |
ZNF642 | 0.79 | 0.75 |
ZNF193 | 0.79 | 0.67 |
heatr1 | 0.77 | 0.62 |
ZNF302 | 0.77 | 0.65 |
GPR85 | 0.76 | 0.60 |
SLC44A5 | 0.76 | 0.70 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FBXO2 | -0.62 | -0.74 |
HLA-F | -0.61 | -0.73 |
ZNF385A | -0.59 | -0.71 |
ARHGAP22 | -0.59 | -0.75 |
LDHD | -0.59 | -0.70 |
ATP10A | -0.58 | -0.78 |
aldoc | -0.58 | -0.67 |
AIFM3 | -0.58 | -0.64 |
HLA-C | -0.58 | -0.69 |
CA4 | -0.57 | -0.70 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | 塔斯 | 谷氨酸(GO期限:7) | 2472424 |
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
去:0007598 | 血液凝血,外部途径 | 经验 | 7598447 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | 经验 | 8626656 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 14718574 | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005886 | 质膜 | 经验 | 2110473|8626656 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg补充和凝结级联 | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物核心内在途径 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta血小板途径 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PTM伽马羧酸羧酸盐酸盐和芳基硫酸酯酶激活 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Gamma羧化运输和蛋白质的氨基末端切割 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纤维蛋白凝块凝结级联反应组的形成 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome术后翻译蛋白修饰 | 188 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome内在途径 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕色髓样细胞发育DN | 129 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
苏肝 | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavazoie转移 | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA ECM监管机构 | 238 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA女性相关 | 753 | 411 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |