基因页：aldh1a1
概括？
| 基因 | 216 |
| 象征 | aldh1a1 |
| 同义词 | aldc | aldh-e1 | aldh1 | aldh11 | Hel-9 | Hel-S-53e | Hel12 | Pumb1 | Raldh1 |
| 描述 | 醛脱氢酶1家族成员A1 |
| 参考 | MIM：100640|HGNC：HGNC：402|Ensembl：ENSG00000165092|HPRD：00001|Vega：Otthumg00000020019 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9Q21.13 |
| Pascal P值 | 0.332 |
| Sherlock P值 | 0.501 |
| 胎儿β | -3.479 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1020772 | Chr9 | 76532511 | aldh1a1 | 216 | 0.09 | 顺式 | ||
| RS16829545 | CHR2 | 151977407 | aldh1a1 | 216 | 0.18 | 反式 | ||
| RS7584986 | CHR2 | 184111432 | aldh1a1 | 216 | 0.18 | 反式 | ||
| RS2393316 | Chr10 | 59333070 | aldh1a1 | 216 | 0.17 | 反式 | ||
| RS16955618 | CHR15 | 29937543 | aldh1a1 | 216 | 8.55e-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Trim27 | 0.88 | 0.89 |
| MOCS3 | 0.87 | 0.89 |
| LDOC1L | 0.87 | 0.89 |
| EHD1 | 0.87 | 0.83 |
| PPAPDC2 | 0.87 | 0.90 |
| UBQLN4 | 0.87 | 0.87 |
| ZNF689 | 0.87 | 0.88 |
| CAPN1 | 0.87 | 0.91 |
| FAM40A | 0.87 | 0.91 |
| UBA1 | 0.87 | 0.89 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.31 | -0.71 | -0.82 |
| MT-CO2 | -0.70 | -0.83 |
| AF347015.27 | -0.69 | -0.80 |
| AF347015.33 | -0.68 | -0.78 |
| mt-cyb | -0.68 | -0.80 |
| AF347015.8 | -0.68 | -0.82 |
| FXYD1 | -0.67 | -0.78 |
| AF347015.15 | -0.65 | -0.78 |
| HLA-F | -0.65 | -0.70 |
| AF347015.21 | -0.65 | -0.84 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0001758 | 视网膜脱氢酶活性 | IEA | - | |
| 去：0004029 | 醛脱氢酶（NAD）活性 | 经验 | 224930 | |
| 去：0004029 | 醛脱氢酶（NAD）活性 | 塔斯 | 1709013 | |
| 去：0005099 | RAS GTPase激活剂活性 | 塔斯 | 1709013 | |
| 去：0005497 | 雄激素结合 | 塔斯 | 1709013 | |
| GO：0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006081 | 细胞醛代谢过程 | 塔斯 | 1709013 | |
| 去：0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
| GO：0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005829 | 细胞质 | 经验 | 224930 | |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
| 去：0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 2987944 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg视黄醇代谢 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组乙醇氧化 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN | 463 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 | 182 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9 Fusion 10D的Takeda目标 | 194 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Runx1 runx1t1融合的tonks靶标在粒细胞中维持 | 15 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合粒细胞的tonks目标向上 | 55 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合DN的Kinsey目标 | 329 | 219 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散dn | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Graham正常静止与正常分裂 | 66 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冷吉非替尼抵抗 | 85 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chiaradonna肿瘤转化Kras DN | 142 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gaussmann MLL AF4融合目标D DN | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa永远转变 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal TGFB1靶向DN | 62 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mahadevan伊马替尼抵抗 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Abdulrahman肾癌VHL DN | 14 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 李肺癌 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| maina vhl目标 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Khetchoumian Trim24靶向DN | 8 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bertucci侵入性癌导管与小叶DN | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗里德曼衰老DN | 13 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发6小时DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schaeffer前列腺开发和癌症Box5 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 里克曼头颈癌E | 89 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Myc TGFA DN | 65 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORSAM HOXA9靶向 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SANA TNF信号DN | 90 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fab M7类型的Ross Aml | 68 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee肝癌E2F1 DN | 64 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Haddad T淋巴细胞和NK祖细胞 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴vs血液 | 131 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li Wilms肿瘤与胎儿肾脏1 | 182 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yagi AML Fab标记 | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhan多发性骨髓瘤DN | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 约瑟夫对丁酸钠DN的反应 | 64 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Varela ZMPSTE24靶向DN | 38 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染24小时DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 敏锐的回应罗格列酮DN | 106 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee衰老的肌肉 | 45 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌正常 | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boquest干细胞向上 | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Labbe Wnt3a靶向 | 112 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G1 DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaposi肝癌满足DN | 6 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K4Me3 | 162 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Katsanou Elavl1靶向 | 169 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |