基因页:F11
概括?
基因 | 2160 |
象征 | F11 |
同义词 | fxi |
描述 | 凝结因子XI |
参考 | MIM:264900|HGNC:HGNC:3529|HPRD:07524| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 4Q35 |
Pascal P值 | 0.502 |
胎儿β | -0.139 |
主持人 | 尾状基底神经节 皮质 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中:1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2221843 | 4 | 187144200 | F11 | ENSG00000088926.9 | 1.581E-7 | 0 | -42899 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10014399 | 4 | 187146359 | F11 | ENSG00000088926.9 | 2.399E-8 | 0 | -40740 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4253251 | 4 | 187156473 | F11 | ENSG00000088926.9 | 8.246e-8 | 0 | -30626 | gtex_brain_putamen_basal |
RS28380417 | 4 | 187161506 | F11 | ENSG00000088926.9 | 9.407E-8 | 0 | -25593 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4253274 | 4 | 187163652 | F11 | ENSG00000088926.9 | 1.14e-8 | 0 | -23447 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4253277 | 4 | 187163881 | F11 | ENSG00000088926.9 | 2.387E-8 | 0 | -23218 | gtex_brain_putamen_basal |
RS199825982 | 4 | 187166964 | F11 | ENSG00000088926.9 | 7.684e-8 | 0 | -20135 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2175494 | 4 | 187168782 | F11 | ENSG00000088926.9 | 1.984E-7 | 0 | -18317 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2137145 | 4 | 187169266 | F11 | ENSG00000088926.9 | 2.695E-8 | 0 | -17833 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4253299 | 4 | 187171355 | F11 | ENSG00000088926.9 | 1.984E-7 | 0 | -15744 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4241821 | 4 | 187176834 | F11 | ENSG00000088926.9 | 1.982E-7 | 0 | -10265 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4253326 | 4 | 187178599 | F11 | ENSG00000088926.9 | 3.848e-8 | 0 | -8500 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3822055 | 4 | 187179678 | F11 | ENSG00000088926.9 | 1.643E-6 | 0 | -7421 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/F11_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TTC31 | 0.93 | 0.88 |
CHTF18 | 0.93 | 0.93 |
WDR90 | 0.92 | 0.91 |
Haus5 | 0.92 | 0.89 |
Lepre1 | 0.91 | 0.90 |
Lig1 | 0.90 | 0.89 |
cntrob | 0.90 | 0.90 |
DVL2 | 0.90 | 0.89 |
CPSF1 | 0.90 | 0.90 |
极 | 0.89 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.31 | -0.62 | -0.82 |
AF347015.27 | -0.62 | -0.82 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.80 |
mt-cyb | -0.59 | -0.79 |
AF347015.33 | -0.59 | -0.77 |
AIFM3 | -0.58 | -0.68 |
AF347015.8 | -0.58 | -0.79 |
C5orf53 | -0.57 | -0.67 |
S100B | -0.57 | -0.72 |
ifi27 | -0.57 | -0.73 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | nas | 谷氨酸(GO期限:7) | 9593722 |
去:0008201 | 肝素约束 | IEA | - | |
去:0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006508 | 蛋白水解 | IEA | - | |
去:0007596 | 血液凝血 | nas | 9593722 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | nas | 9593722 | |
去:0016020 | 膜 | nas | 9593722 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg补充和凝结级联 | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
生物核心内在途径 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta血小板途径 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纤维蛋白凝块凝结级联反应组的形成 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome内在途径 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌DN | 203 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim Mycn扩增靶向 | 92 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amundson Gamma辐射阻力 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类未经注释 | 85 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向DN | 149 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向DN | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |