概括
基因 2160
象征 F11
同义词 fxi
描述 凝结因子XI
参考 MIM:264900|HGNC:HGNC:3529|HPRD:07524|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4Q35
Pascal P值 0.502
胎儿β -0.139
主持人 尾状基底神经节
皮质
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2221843 4 187144200 F11 ENSG00000088926.9 1.581E-7 0 -42899 gtex_brain_putamen_basal
RS10014399 4 187146359 F11 ENSG00000088926.9 2.399E-8 0 -40740 gtex_brain_putamen_basal
RS4253251 4 187156473 F11 ENSG00000088926.9 8.246e-8 0 -30626 gtex_brain_putamen_basal
RS28380417 4 187161506 F11 ENSG00000088926.9 9.407E-8 0 -25593 gtex_brain_putamen_basal
RS4253274 4 187163652 F11 ENSG00000088926.9 1.14e-8 0 -23447 gtex_brain_putamen_basal
RS4253277 4 187163881 F11 ENSG00000088926.9 2.387E-8 0 -23218 gtex_brain_putamen_basal
RS199825982 4 187166964 F11 ENSG00000088926.9 7.684e-8 0 -20135 gtex_brain_putamen_basal
RS2175494 4 187168782 F11 ENSG00000088926.9 1.984E-7 0 -18317 gtex_brain_putamen_basal
RS2137145 4 187169266 F11 ENSG00000088926.9 2.695E-8 0 -17833 gtex_brain_putamen_basal
RS4253299 4 187171355 F11 ENSG00000088926.9 1.984E-7 0 -15744 gtex_brain_putamen_basal
RS4241821 4 187176834 F11 ENSG00000088926.9 1.982E-7 0 -10265 gtex_brain_putamen_basal
RS4253326 4 187178599 F11 ENSG00000088926.9 3.848e-8 0 -8500 gtex_brain_putamen_basal
RS3822055 4 187179678 F11 ENSG00000088926.9 1.643E-6 0 -7421 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
TTC31 0.93 0.88
CHTF18 0.93 0.93
WDR90 0.92 0.91
Haus5 0.92 0.89
Lepre1 0.91 0.90
Lig1 0.90 0.89
cntrob 0.90 0.90
DVL2 0.90 0.89
CPSF1 0.90 0.90
0.89 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.62 -0.82
AF347015.27 -0.62 -0.82
MT-CO2 -0.60 -0.80
mt-cyb -0.59 -0.79
AF347015.33 -0.59 -0.77
AIFM3 -0.58 -0.68
AF347015.8 -0.58 -0.79
C5orf53 -0.57 -0.67
S100B -0.57 -0.72
ifi27 -0.57 -0.73

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004252 丝氨酸型内肽酶活性 nas 谷氨酸(GO期限:7) 9593722
去:0008201 肝素约束 IEA -
去:0008233 肽酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006508 蛋白水解 IEA -
去:0007596 血液凝血 nas 9593722
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 nas 9593722
去:0016020 nas 9593722

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg补充和凝结级联 69 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物核心内在途径 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta血小板途径 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纤维蛋白凝块凝结级联反应组的形成 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome内在途径 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Mycn扩增靶向 92 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Amundson Gamma辐射阻力 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP 295 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未经注释 85 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向DN 149 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向DN 157 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因