概括
基因 2167
Symbol FABP4
Synonyms a-fabp | afabp | albp | hel-s-104 | ap2
Description 脂肪酸结合蛋白4
参考erence MIM:600434|HGNC:HGNC:3559|ENSEMBL:ENSG00000170323|HPRD:02698|Vega:OTTHUMG00000164602
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q21
Pascal p-value 0.909
胎儿β -0.227
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 CompositeSet

数据源中的基因
基因集名称 Method of gene set Description 信息
DNM:Fromer_2014 Whole Exome Sequencing analysis 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
PMID:cooccur High-throughput literature-search PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
Literature High-throughput literature-search 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

Gene 染色体 位置 参考 alt 成绩单 一个一个change Mutation type CG46 特征 学习
FABP4 CHR8 82395386 一个 G NM_001442 p.6v> a 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS978631 CHR1 14295512 FABP4 2167 0.19 反式
RS16851160 CHR1 15354295 FABP4 2167 0.01 反式
RS17352302 CHR1 19035201 FABP4 2167 0 反式
RS7543090 CHR1 32231154 FABP4 2167 1.949E-6 反式
rs11264112 CHR1 35645342 FABP4 2167 0.01 反式
RS2746680 CHR1 55866732 FABP4 2167 0.17 反式
rs705517 CHR1 64366658 FABP4 2167 0.03 反式
rs705519 CHR1 64368534 FABP4 2167 0.03 反式
RS834487 CHR1 64486206 FABP4 2167 0.02 反式
RS17130039 CHR1 83964563 FABP4 2167 0 反式
rs7516109 CHR1 100984518 FABP4 2167 0 反式
RS1277217 CHR1 109358183 FABP4 2167 0.03 反式
rs16837638 CHR1 156724952 FABP4 2167 0.16 反式
rs4657644 CHR1 167138098 FABP4 2167 0.13 反式
RS16830489 CHR1 189347153 FABP4 2167 0.11 反式
RS10922207 CHR1 189513550 FABP4 2167 0.09 反式
RS12127748 CHR1 189526598 FABP4 2167 0.13 反式
RS646448 CHR1 201549496 FABP4 2167 0 反式
rs657888 CHR1 201556369 FABP4 2167 0 反式
rs4245717 CHR1 205595752 FABP4 2167 6.046e-5 反式
rs16856520 CHR1 205906384 FABP4 2167 0.03 反式
rs2275515 CHR1 208801567 FABP4 2167 0.08 反式
rs10864659 CHR1 231187052 FABP4 2167 0.06 反式
RS6696857 CHR1 231198027 FABP4 2167 0.06 反式
rs4369216 CHR1 231198331 FABP4 2167 0.06 反式
RS12089353 CHR1 231428408 FABP4 2167 0.19 反式
RS10910457 CHR1 234695592 FABP4 2167 0.04 反式
RS12093542 CHR1 236229346 FABP4 2167 0.04 反式
rs6760501 CHR2 2231465 FABP4 2167 0 反式
RS9309697 CHR2 2740901 FABP4 2167 0.13 反式
rs16865228 CHR2 6629622 FABP4 2167 0.03 反式
rs16865230 CHR2 6630187 FABP4 2167 0.03 反式
RS11691188 CHR2 6631799 FABP4 2167 0.03 反式
rs13011747 CHR2 52263123 FABP4 2167 3.675E-5 反式
RS17027385 CHR2 60317432 FABP4 2167 0.19 反式
RS17027670 CHR2 60321553 FABP4 2167 0.19 反式
rs17027920 CHR2 60324501 FABP4 2167 0.19 反式
RS17028210 CHR2 60328684 FABP4 2167 0.19 反式
RS4671677 CHR2 65869039 FABP4 2167 0 反式
RS2871926 CHR2 69144459 FABP4 2167 0.14 反式
rs6707577 CHR2 76055701 FABP4 2167 0.01 反式
RS1837425 CHR2 77404111 FABP4 2167 0.13 反式
rs2078524 CHR2 80392208 FABP4 2167 0.19 反式
RS12612468 CHR2 81935991 FABP4 2167 0.19 反式
RS17007441 CHR2 123017806 FABP4 2167 0.02 反式
RS17364261 CHR2 123134434 FABP4 2167 0 反式
RS17009403 CHR2 123851176 FABP4 2167 0 反式
RS11122994 CHR2 124412552 FABP4 2167 0.02 反式
RS2919747 CHR2 129965275 FABP4 2167 0.01 反式
RS10192459 CHR2 152517978 FABP4 2167 0.16 反式
RS1519647 CHR2 154460585 FABP4 2167 0.08 反式
RS10930700 CHR2 176320078 FABP4 2167 0 反式
RS10497695 CHR2 189850693 FABP4 2167 0 反式
RS12105340 CHR2 189865656 FABP4 2167 0 反式
RS17638935 CHR2 206403038 FABP4 2167 0.02 反式
RS16848675 CHR2 21334996 FABP4 2167 0.14 反式
RS1503380 CHR2 214324200 FABP4 2167 0.14 反式
rs10498007 CHR2 214345141 FABP4 2167 0.14 反式
rs16850416 CHR2 214354139 FABP4 2167 0.01 反式
RS1834768 CHR2 214646680 FABP4 2167 0.06 反式
RS6713877 CHR2 227086813 FABP4 2167 0.01 反式
rs6436607 CHR2 227150909 FABP4 2167 0.01 反式
RS7586700 CHR2 237769742 FABP4 2167 0 反式
RS7574988 CHR2 237770124 FABP4 2167 0 反式
RS10203144 CHR2 238024758 FABP4 2167 1.122E-4 反式
RS811272 CHR3 3804554 FABP4 2167 0.17 反式
snp_a-1972120 0 FABP4 2167 0.07 反式
rs10510602 CHR3 28023926 FABP4 2167 9.741E-5 反式
rs12054294 CHR3 28040721 FABP4 2167 0.02 反式
rs6769309 CHR3 40500750 FABP4 2167 0 反式
RS241673 CHR3 60544870 FABP4 2167 0.01 反式
RS2682982 CHR3 60545362 FABP4 2167 1.183E-5 反式
RS2856045 CHR3 60545428 FABP4 2167 0 反式
SNP_A-2197110 0 FABP4 2167 0.15 反式
RS3796213 CHR3 69157380 FABP4 2167 0.15 反式
RS6549186 CHR3 69211954 FABP4 2167 0.09 反式
RS9857064 CHR3 72828820 FABP4 2167 0 反式
RS7619888 CHR3 72834445 FABP4 2167 0 反式
RS2322853 CHR3 73360854 FABP4 2167 0.04 反式
RS9835654 CHR3 73363696 FABP4 2167 0.04 反式
RS9825654 CHR3 73370743 FABP4 2167 0.04 反式
rs4677259 CHR3 73373870 FABP4 2167 0.06 反式
RS7614346 CHR3 119021528 FABP4 2167 0.16 反式
RS2173764 CHR3 122328752 FABP4 2167 0 反式
RS1151560 CHR3 144362589 FABP4 2167 0.05 反式
RS10513250 CHR3 144593246 FABP4 2167 0.01 反式
rs6803324 CHR3 148335029 FABP4 2167 0.12 反式
RS12487278 CHR3 155733885 FABP4 2167 0 反式
RS12488777 CHR3 166430948 FABP4 2167 0.03 反式
RS7643415 CHR3 188007131 FABP4 2167 0.17 反式
RS2688497 CHR3 195476084 FABP4 2167 0.14 反式
rs16892270 CHR4 15725866 FABP4 2167 0.18 反式
RS6839686 CHR4 21268010 FABP4 2167 0.18 反式
RS6827600 CHR4 33091458 FABP4 2167 8.327E-4 反式
RS10517505 CHR4 61345971 FABP4 2167 6.507E-6 反式
RS986399 CHR4 73579164 FABP4 2167 0.02 反式
RS17000340 CHR4 76135365 FABP4 2167 4.158E-4 反式
rs17406380 CHR4 78433285 FABP4 2167 0.17 反式
RS931277 CHR4 79263127 FABP4 2167 0.12 反式
RS2126021 CHR4 87120762 FABP4 2167 0.14 反式
rs7676968 CHR4 92725663 FABP4 2167 1.802E-12 反式
RS4513527 CHR4 92756952 FABP4 2167 2.772E-5 反式
RS7683085 CHR4 92763938 FABP4 2167 2.772E-5 反式
RS17033461 CHR4 104103810 FABP4 2167 0.01 反式
RS17035917 CHR4 106520741 FABP4 2167 0.05 反式
RS17036076 CHR4 106575268 FABP4 2167 0.08 反式
RS17036090 CHR4 106593573 FABP4 2167 0.14 反式
RS17036156 CHR4 106663233 FABP4 2167 0.14 反式
rs11732298 CHR4 106701678 FABP4 2167 0.08 反式
SNP_A-1978461 0 FABP4 2167 0 反式
snp_a-2242962 0 FABP4 2167 0 反式
RS17040089 CHR4 110143189 FABP4 2167 0.04 反式
rs4834424 CHR4 115553988 FABP4 2167 0.17 反式
RS1492754 CHR4 125421168 FABP4 2167 0.17 反式
RS1492753 CHR4 125421324 FABP4 2167 0.17 反式
RS9995457 CHR4 128299300 FABP4 2167 0 反式
RS17051151 CHR4 132081115 FABP4 2167 0.01 反式
RS1005771 CHR4 148267572 FABP4 2167 0.02 反式
RS934142 CHR4 148289527 FABP4 2167 0.08 反式
RS6817192 CHR4 148295317 FABP4 2167 0.08 反式
RS17032180 CHR4 155803663 FABP4 2167 1.747E-4 反式
RS6816960 CHR4 155837513 FABP4 2167 1.747E-4 反式
RS17032301 CHR4 155869255 FABP4 2167 0 反式
RS1902499 CHR4 155923709 FABP4 2167 0.04 反式
RS2183142 CHR4 159232695 FABP4 2167 0.01 反式
RS6536498 CHR4 161096469 FABP4 2167 0.08 反式
RS17611747 CHR4 169257324 FABP4 2167 0.01 反式
rs4862035 CHR4 179614997 FABP4 2167 0.03 反式
RS6840589 CHR4 182775311 FABP4 2167 0.01 反式
RS4241849 CHR4 188964612 FABP4 2167 0.03 反式
RS30467 CHR5 4986094 FABP4 2167 0.1 反式
RS298572 CHR5 17287777 FABP4 2167 0.02 反式
RS10043237 CHR5 24855148 FABP4 2167 0.12 反式
RS638875 CHR5 32532230 FABP4 2167 0.18 反式
RS10076385 CHR5 33681785 FABP4 2167 0.06 反式
rs10080136 CHR5 33683088 FABP4 2167 0.06 反式
RS7720858 CHR5 43419858 FABP4 2167 0.13 反式
RS17627020 CHR5 54167839 FABP4 2167 0 反式
RS13179161 CHR5 82973565 FABP4 2167 0.06 反式
RS7735782 CHR5 82980448 FABP4 2167 0.12 反式
RS17284657 CHR5 83006477 FABP4 2167 0.04 反式
rs1500258 CHR5 85746870 FABP4 2167 0.06 反式
RS17331350 CHR5 94091611 FABP4 2167 0.01 反式
SNP_A-1904334 0 FABP4 2167 0.09 反式
RS17156288 CHR5 103556739 FABP4 2167 0.17 反式
RS1155837 CHR5 103580159 FABP4 2167 0.17 反式
SNP_A-2086826 0 FABP4 2167 0 反式
rs246836 CHR5 131459971 FABP4 2167 0.07 反式
RS4326194 CHR5 133786636 FABP4 2167 2.46E-4 反式
RS10063177 CHR5 145081194 FABP4 2167 5.803E-4 反式
RS2434733 CHR5 154431911 FABP4 2167 0.03 反式
RS67777 CHR5 169364816 FABP4 2167 0.16 反式
RS2659183 CHR5 173253605 FABP4 2167 0.12 反式
rs4379216 CHR5 177511275 FABP4 2167 3.135E-4 反式
RS7740880 CHR6 3848632 FABP4 2167 0.01 反式
RS7758688 CHR6 3848813 FABP4 2167 0.01 反式
RS2274516 CHR6 42932834 FABP4 2167 0.16 反式
RS3777582 CHR6 45914027 FABP4 2167 0.18 反式
RS7766231 CHR6 77290864 FABP4 2167 0.03 反式
RS1454460 CHR6 81380132 FABP4 2167 0.01 反式
RS9294325 CHR6 85767265 FABP4 2167 0 反式
RS16880568 CHR6 89152027 FABP4 2167 3.023e-5 反式
RS211218 CHR6 98978477 FABP4 2167 0.07 反式
RS9388545 CHR6 98979104 FABP4 2167 0.07 反式
RS7758767 CHR6 107860120 FABP4 2167 0.18 反式
RS12190009 CHR6 107865787 FABP4 2167 0.18 反式
RS4946518 CHR6 121174802 FABP4 2167 0.07 反式
RS6916205 CHR6 134378251 FABP4 2167 0.14 反式
RS9497950 CHR6 148493689 FABP4 2167 0.04 反式
RS2281658 CHR6 158094301 FABP4 2167 0.02 反式
RS2281657 0 FABP4 2167 0.02 反式
rs4709544 CHR6 158152455 FABP4 2167 0 反式
RS17167564 CHR7 13878761 FABP4 2167 0.01 反式
rs7786729 CHR7 14972376 FABP4 2167 0.03 反式
rs17840679 CHR7 24976077 FABP4 2167 0.01 反式
rs11972120 CHR7 24980025 FABP4 2167 0.04 反式
rs17150652 CHR7 25012054 FABP4 2167 0.02 反式
RS17156078 CHR7 27988688 FABP4 2167 0.01 反式
RS3750099 CHR7 29552212 FABP4 2167 6.661E-4 反式
rs687029 CHR7 42856861 FABP4 2167 0.04 反式
RS17172622 CHR7 46066785 FABP4 2167 0.01 反式
RS17306218 CHR7 88743380 FABP4 2167 0.2 反式
RS17769287 CHR7 89544863 FABP4 2167 0.19 反式
RS17165806 CHR7 93469599 FABP4 2167 0.03 反式
RS7777209 CHR7 93485280 FABP4 2167 0.03 反式
SNP_A-2308001 0 FABP4 2167 0.11 反式
rs10953482 CHR7 105548000 FABP4 2167 8.612E-4 反式
RS1181800 CHR7 124175844 FABP4 2167 1.85E-13 反式
RS1917357 CHR7 124268065 FABP4 2167 2.114E-20 反式
rs7791922 CHR7 125130234 FABP4 2167 0.01 反式
RS834758 CHR7 135840190 FABP4 2167 8.669E-4 反式
RS1731971 CHR7 137101514 FABP4 2167 0.04 反式
rs6982477 CHR8 2297290 FABP4 2167 0.14 反式
RS17069487 CHR8 2305916 FABP4 2167 9.195E-10 反式
RS2515456 CHR8 6382413 FABP4 2167 0.11 反式
RS2515463 CHR8 6384137 FABP4 2167 0.09 反式
rs2922867 CHR8 6409311 FABP4 2167 0 反式
rs10094528 CHR8 9740328 FABP4 2167 5.104E-5 反式
RS17120202 CHR8 14602826 FABP4 2167 0.01 反式
RS2720589 CHR8 17467802 FABP4 2167 0.09 反式
RS17088734 CHR8 22760260 FABP4 2167 0.02 反式
rs17058689 CHR8 28038005 FABP4 2167 0.18 反式
RS2614065 CHR8 28163476 FABP4 2167 0.16 反式
RS16882106 0 FABP4 2167 0.13 反式
RS11991652 CHR8 55342145 FABP4 2167 0.17 反式
RS7845814 CHR8 56256488 FABP4 2167 0.01 反式
rs16921658 CHR8 56260399 FABP4 2167 0.04 反式
rs16921659 CHR8 56271687 FABP4 2167 0.01 反式
rs2873586 CHR8 57958798 FABP4 2167 0.05 反式
RS16921567 CHR8 57981417 FABP4 2167 0.02 反式
RS16907075 CHR8 80599796 FABP4 2167 0.15 反式
RS17719818 CHR8 89078853 FABP4 2167 0.12 反式
RS2124040 CHR8 126618073 FABP4 2167 3.11E-4 反式
rs741870 CHR8 127341176 FABP4 2167 5.959E-4 反式
rs16926037 Chr9 10446061 FABP4 2167 0.13 反式
RS7037400 Chr9 14569261 FABP4 2167 9.98E-4 反式
RS17835770 Chr9 27484574 FABP4 2167 0 反式
RS1198006 Chr9 28043246 FABP4 2167 2.821E-8 反式
RS17619081 Chr9 74007790 FABP4 2167 8.859E-4 反式
RS12236682 Chr9 78532402 FABP4 2167 0.17 反式
RS7863426 Chr9 79029280 FABP4 2167 0 反式
rs12343115 Chr9 110154146 FABP4 2167 0 反式
RS2287296 Chr9 132395244 FABP4 2167 0.09 反式
RS16916914 Chr10 18457721 FABP4 2167 5.077E-6 反式
RS16916916 Chr10 18458706 FABP4 2167 0.17 反式
SNP_A-1997103 0 FABP4 2167 0.17 反式
rs1335812 Chr10 24119275 FABP4 2167 9.995E-4 反式
RS7068993 Chr10 25149898 FABP4 2167 0.03 反式
RS11014579 Chr10 25786907 FABP4 2167 0.01 反式
RS7090929 Chr10 25788432 FABP4 2167 0.04 反式
RS16928382 Chr10 28166357 FABP4 2167 0.02 反式
rs16931654 Chr10 30840640 FABP4 2167 5.239E-5 反式
RS4514358 Chr10 43861923 FABP4 2167 0 反式
RS266080 Chr10 44833893 FABP4 2167 0 反式
RS16911533 Chr10 59756285 FABP4 2167 0.07 反式
SNP_A-2022348 0 FABP4 2167 0.03 反式
rs12241007 Chr10 83689508 FABP4 2167 4.984e-4 反式
RS17094724 Chr10 118187359 FABP4 2167 0.12 反式
RS17667035 Chr10 120754330 FABP4 2167 7.681E-5 反式
RS4751702 Chr10 120979748 FABP4 2167 0.13 反式
RS11818005 Chr10 131147905 FABP4 2167 2.443E-4 反式
rs2918109 Chr10 133078726 FABP4 2167 0.13 反式
RS7103747 Chr11 7254498 FABP4 2167 0.15 反式
RS16908028 Chr11 10625562 FABP4 2167 0.01 反式
rs11823069 Chr11 10639788 FABP4 2167 0 反式
RS10500729 Chr11 10644598 FABP4 2167 0 反式
RS16908086 Chr11 10646521 FABP4 2167 0 反式
RS10500730 Chr11 10646550 FABP4 2167 0 反式
RS2131492 Chr11 12073760 FABP4 2167 0.12 反式
RS1530180 Chr11 12896635 FABP4 2167 0.01 反式
RS7113050 Chr11 19703367 FABP4 2167 7.474E-4 反式
RS4469890 Chr11 21058131 FABP4 2167 3.749E-9 反式
SNP_A-1782826 0 FABP4 2167 5.299E-4 反式
RS16929405 Chr11 36766361 FABP4 2167 0.01 反式
RS2048992 Chr11 36773749 FABP4 2167 0.01 反式
rs1356592 Chr11 36830375 FABP4 2167 0.16 反式
RS16929453 Chr11 36861229 FABP4 2167 2.936E-5 反式
RS1075193 Chr11 60357881 FABP4 2167 0.01 反式
RS1395405 Chr11 60422295 FABP4 2167 0.01 反式
RS17132911 Chr11 73995695 FABP4 2167 0.02 反式
RS12421228 Chr11 74007514 FABP4 2167 0.01 反式
RS17148600 Chr11 85628826 FABP4 2167 0.16 反式
rs12577444 Chr11 95192461 FABP4 2167 0.16 反式
RS17130042 Chr11 97215007 FABP4 2167 0.16 反式
RS2511844 Chr11 119176397 FABP4 2167 1.129E-5 反式
rs3866687 CHR12 30489305 FABP4 2167 0.02 反式
RS11050835 CHR12 30497192 FABP4 2167 0 反式
rs17103279 CHR12 67466934 FABP4 2167 0 反式
rs7979024 CHR12 84506011 FABP4 2167 0.07 反式
RS2408561 CHR12 91985616 FABP4 2167 0.02 反式
rs11106598 CHR12 92895713 FABP4 2167 0.13 反式
RS12230291 CHR12 102100263 FABP4 2167 0.2 反式
snp_a-4249110 0 FABP4 2167 0.2 反式
rs11111009 CHR12 102160626 FABP4 2167 0.2 反式
RS17032130 CHR12 102331171 FABP4 2167 0.2 反式
RS17032134 CHR12 102331946 FABP4 2167 0.2 反式
RS336259 CHR12 114182799 FABP4 2167 0.07 反式
RS17692679 CHR12 115692219 FABP4 2167 0 反式
RS11065205 CHR12 121113371 FABP4 2167 3.058E-4 反式
RS3751166 CHR12 121138276 FABP4 2167 2.099E-4 反式
RS11065235 CHR12 121172265 FABP4 2167 3.058E-4 反式
RS11065244 CHR12 121181607 FABP4 2167 3.058E-4 反式
RS356723 CHR13 75441714 FABP4 2167 0.04 反式
rs4884230 CHR13 84581119 FABP4 2167 0.01 反式
RS16949906 CHR13 95172522 FABP4 2167 0.14 反式
RS927797 CHR13 95190945 FABP4 2167 0.14 反式
RS7989660 CHR13 113551522 FABP4 2167 0.17 反式
RS10220616 CHR14 38710497 FABP4 2167 0 反式
RS17123746 CHR14 51797570 FABP4 2167 0.01 反式
RS8003401 CHR14 72838654 FABP4 2167 0.03 反式
RS362341 CHR14 73641457 FABP4 2167 2.159E-4 反式
RS7146378 CHR14 75756802 FABP4 2167 0.07 反式
RS10147554 CHR14 89902966 FABP4 2167 0.09 反式
RS11850762 CHR14 99083379 FABP4 2167 3.498E-4 反式
RS4906417 CHR14 104593017 FABP4 2167 0.16 反式
rs990438 CHR15 24322236 FABP4 2167 0.14 反式
rs713202 CHR15 34147171 FABP4 2167 0.02 反式
rs10519899 CHR15 34273903 FABP4 2167 0.11 反式
RS4780215 CHR15 34400938 FABP4 2167 0.1 反式
RS12592547 CHR15 34411786 FABP4 2167 0.07 反式
RS7497490 0 FABP4 2167 0.06 反式
RS10518904 CHR15 57530474 FABP4 2167 0.02 反式
RS16946329 CHR15 63324362 FABP4 2167 0.01 反式
rs16946913 CHR15 63653889 FABP4 2167 0.03 反式
rs4357883 CHR15 67054960 FABP4 2167 0.06 反式
RS11638992 CHR15 73756883 FABP4 2167 0.02 反式
RS16958010 CHR15 73857047 FABP4 2167 0.11 反式
RS16958014 CHR15 73858225 FABP4 2167 0.02 反式
RS11072435 CHR15 74003758 FABP4 2167 0.16 反式
rs1605864 CHR15 81420917 FABP4 2167 0 反式
RS4965140 CHR15 97402290 FABP4 2167 2.878E-4 反式
RS1001366 CHR16 910949 FABP4 2167 0.2 反式
RS4566169 CHR16 911716 FABP4 2167 0.12 反式
rs11865292 CHR16 8236684 FABP4 2167 0.02 反式
RS17145776 CHR16 8441408 FABP4 2167 0.09 反式
rs7405124 CHR16 51031708 FABP4 2167 0.06 反式
RS16957495 CHR16 82513057 FABP4 2167 0.15 反式
rs16951881 CHR17 1994643 FABP4 2167 0 反式
RS11656351 CHR17 9489574 FABP4 2167 0.01 反式
rs12450515 CHR17 9632246 FABP4 2167 0.18 反式
rs3744758 CHR17 43195662 FABP4 2167 0.02 反式
rs3744759 CHR17 43195698 FABP4 2167 0.04 反式
RS806928 CHR17 51370947 FABP4 2167 0.02 反式
RS1006512 CHR17 51498600 FABP4 2167 0.01 反式
rs8182262 CHR17 56608400 FABP4 2167 0.02 反式
RS1996925 CHR18 6198352 FABP4 2167 0.01 反式
RS1904905 CHR18 8969729 FABP4 2167 0.02 反式
rs12455718 CHR18 20769996 FABP4 2167 0.14 反式
RS4800152 CHR18 20784343 FABP4 2167 8.181e-11 反式
RS16965251 CHR18 31946345 FABP4 2167 0 反式
RS16976070 CHR18 40010874 FABP4 2167 0.05 反式
RS2586731 CHR18 48317158 FABP4 2167 0.04 反式
SNP_A-1953100 0 FABP4 2167 0.04 反式
RS9950944 CHR18 48325239 FABP4 2167 0.04 反式
RS1454734 CHR18 50014453 FABP4 2167 0.05 反式
rs16955094 CHR18 50028277 FABP4 2167 0.05 反式
RS17065451 CHR18 56764824 FABP4 2167 0 反式
RS8098530 CHR18 56766296 FABP4 2167 3.96E-5 反式
RS17080368 CHR18 66774697 FABP4 2167 0.02 反式
RS17083054 CHR18 68400575 FABP4 2167 0.02 反式
RS1893731 CHR18 70954644 FABP4 2167 0.11 反式
rs9953092 CHR18 74416085 FABP4 2167 0.02 反式
RS8106369 CHR19 23339162 FABP4 2167 0.05 反式
RS2215705 CHR19 28386385 FABP4 2167 0.01 反式
RS6082985 CHR20 289611 FABP4 2167 0.02 反式
RS6111448 CHR20 1770606 FABP4 2167 0.09 反式
RS6034171 CHR20 15380659 FABP4 2167 0.01 反式
RS965627 CHR20 16113272 FABP4 2167 0.17 反式
rs6045454 CHR20 18522318 FABP4 2167 0.04 反式
rs6102879 CHR20 41138766 FABP4 2167 0.15 反式
rs6063203 CHR20 46684515 FABP4 2167 0.04 反式
rs7272218 CHR20 46759945 FABP4 2167 0.09 反式
RS6099530 CHR20 55863422 FABP4 2167 0.04 反式
RS6092455 CHR20 55881917 FABP4 2167 0.15 反式
RS1002324 CHR20 55893550 FABP4 2167 0.15 反式
RS6099582 CHR20 55940425 FABP4 2167 0.15 反式
RS7362421 CHR20 55951039 FABP4 2167 0.15 反式
RS8139244 CHR22 27842206 FABP4 2167 0 反式
RS16992377 CHR22 33855382 FABP4 2167 0.02 反式
RS5994767 CHR22 33914823 FABP4 2167 0.04 反式
RS6000401 CHR22 37149335 FABP4 2167 0 反式
RS4822100 CHR22 42682785 FABP4 2167 0.05 反式
RS5765756 0 FABP4 2167 0 反式
RS9628605 CHR22 49110432 FABP4 2167 0.04 反式
rs2337492 CHR22 49112681 FABP4 2167 0.13 反式
rs2337493 CHR22 49112795 FABP4 2167 0.13 反式
RS7286059 CHR22 49145127 FABP4 2167 0.18 反式
rs7888427 Chrx 47606898 FABP4 2167 0.1 反式
rs2301864 Chrx 75394712 FABP4 2167 2.756E-22 反式
rs11093623 Chrx 75406380 FABP4 2167 2.756E-22 反式
RS2367716 Chrx 75410637 FABP4 2167 7.425E-16 反式
rs7877504 Chrx 75443298 FABP4 2167 2.756E-22 反式
RS1604728 Chrx 75563484 FABP4 2167 2.756E-22 反式
RS7056756 Chrx 75641088 FABP4 2167 2.756E-22 反式
RS7057091 Chrx 75641247 FABP4 2167 2.756E-22 反式
RS12014980 Chrx 75654215 FABP4 2167 1.257E-13 反式
RS4892433 Chrx 75676726 FABP4 2167 2.476E-7 反式
RS6607729 Chrx 75719233 FABP4 2167 2.835E-6 反式
rs5982228 Chrx 75901960 FABP4 2167 2.835E-6 反式
rs5982233 Chrx 75911295 FABP4 2167 1.1e-11 反式
RS7059710 Chrx 75917211 FABP4 2167 1.547E-7 反式
RS7878182 Chrx 75926263 FABP4 2167 2.874E-5 反式
rs5982248 Chrx 75928669 FABP4 2167 2.196E-5 反式
RS2079184 Chrx 75938315 FABP4 2167 1.547E-7 反式
RS234254 Chrx 75955780 FABP4 2167 2.835E-6 反式
RS190169 Chrx 76135654 FABP4 2167 1.71E-6 反式
RS232944 Chrx 76151286 FABP4 2167 2.835E-6 反式
RS5909713 Chrx 119532315 FABP4 2167 0.12 反式
RS7057148 Chrx 119534534 FABP4 2167 0.12 反式
rs970665 Chrx 122445270 FABP4 2167 2.403E-7 反式
RS1125816 Chrx 136346943 FABP4 2167 0.16 反式
RS1413645 Chrx 136348410 FABP4 2167 0.16 反式
RS6528444 Chrx 136354194 FABP4 2167 0.16 反式
rs4825140 Chrx 141864364 FABP4 2167 0.13 反式
RS6637217 Chrx 143443905 FABP4 2167 0.02 反式
rs6634590 Chrx 143486048 FABP4 2167 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
PGM2L1 0.92 0.95
CLASP2 0.91 0.93
SLC9A6 0.90 0.93
CNTN1 0.90 0.93
pafah1b1 0.89 0.92
STX12 0.88 0.90
PAK3 0.88 0.91
ywhaz 0.88 0.91
克拉斯 0.87 0.90
aasdhppt 0.87 0.91
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
EIF4EBP3 -0.64 -0.71
FXYD1 -0.64 -0.67
MT-CO2 -0.61 -0.67
AF347015.31 -0.60 -0.66
AF347015.33 -0.60 -0.64
SLC25A18 -0.60 -0.63
一个C021016.1 -0.60 -0.65
higd1b -0.60 -0.67
rom1 -0.60 -0.64
AF347015.2 -0.60 -0.65

V.途径注释

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
kegg ppar信号通路 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AP1 PATHWAY 70 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME METABOLISM OF LIPIDS AND LIPOPROTEINS 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 72 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组激素敏感脂肪酶HSL介导的三酰基甘油水解 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome脂质消化和运输 46 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PARENT MTOR SIGNALING UP 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP 408 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY DN 367 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SABATES COLORECTAL ADENOMA DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
G一个USSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS D UP 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE PAPILLOMA RISK HIGH UP 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DARWICHE SQUAMOUS CELL CARCINOMA UP 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Buytaert光动力疗法应力DN 637 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bertucci侵入性癌导管与小叶DN 46 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时 176 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 11 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER C 113 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 94 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee肝癌ACOX1 UP 64 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 UP 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肝癌电抗 60 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer Dena Up 60 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE LIVER CANCER E2F1 UP 62 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION UP 114 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴vs血液 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS脂肪细胞分化 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAL PRMT5 TARGETS DN 29 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSENG IRS1 TARGETS DN 135 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TSENG ADIPOGENIC POTENTIAL DN 46 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化的PPARG的LI脂肪生成 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
约瑟夫对丁酸钠的反应 31 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS UP 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUZUKI RESPONSE TO TSA 22 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durchdewald皮肤致癌DN 264 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KONDO EZH2 TARGETS 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG GATA6 TARGETS UP 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺DN中的Smid乳腺癌复发 37 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER LUMINAL A UP 84 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP 476 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 159 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CADWELL ATG16L1靶向 93 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers 80 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌作用 89 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP 104 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang PPARG的经典成脂靶 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向 504 321 该途径中的所有SZGR 2.0基因
STEGER ADIPOGENESIS UP 21 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS UP 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND WITH H4K20ME1 MARK 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vernochet脂肪形成 19 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang MLL目标 289 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过p38完成的phong TNF响应 227 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DURAND STROMA S UP 297 194 该途径中的所有SZGR 2.0基因