基因页:FABP4
概括?
基因 | 2167 |
Symbol | FABP4 |
Synonyms | a-fabp | afabp | albp | hel-s-104 | ap2 |
Description | 脂肪酸结合蛋白4 |
参考erence | MIM:600434|HGNC:HGNC:3559|ENSEMBL:ENSG00000170323|HPRD:02698|Vega:OTTHUMG00000164602 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q21 |
Pascal p-value | 0.909 |
胎儿β | -0.227 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | CompositeSet |
数据源中的基因
基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
---|---|---|---|
DNM:Fromer_2014 | Whole Exome Sequencing analysis | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
PMID:cooccur | High-throughput literature-search | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
Literature | High-throughput literature-search | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
Gene | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | 一个一个change | Mutation type | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
FABP4 | CHR8 | 82395386 | 一个 | G | NM_001442 | p.6v> a | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS978631 | CHR1 | 14295512 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS16851160 | CHR1 | 15354295 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS17352302 | CHR1 | 19035201 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS7543090 | CHR1 | 32231154 | FABP4 | 2167 | 1.949E-6 | 反式 | ||
rs11264112 | CHR1 | 35645342 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS2746680 | CHR1 | 55866732 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
rs705517 | CHR1 | 64366658 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
rs705519 | CHR1 | 64368534 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS834487 | CHR1 | 64486206 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS17130039 | CHR1 | 83964563 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
rs7516109 | CHR1 | 100984518 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS1277217 | CHR1 | 109358183 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
rs16837638 | CHR1 | 156724952 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
rs4657644 | CHR1 | 167138098 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
RS16830489 | CHR1 | 189347153 | FABP4 | 2167 | 0.11 | 反式 | ||
RS10922207 | CHR1 | 189513550 | FABP4 | 2167 | 0.09 | 反式 | ||
RS12127748 | CHR1 | 189526598 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
RS646448 | CHR1 | 201549496 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
rs657888 | CHR1 | 201556369 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
rs4245717 | CHR1 | 205595752 | FABP4 | 2167 | 6.046e-5 | 反式 | ||
rs16856520 | CHR1 | 205906384 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
rs2275515 | CHR1 | 208801567 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
rs10864659 | CHR1 | 231187052 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS6696857 | CHR1 | 231198027 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
rs4369216 | CHR1 | 231198331 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS12089353 | CHR1 | 231428408 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS10910457 | CHR1 | 234695592 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS12093542 | CHR1 | 236229346 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
rs6760501 | CHR2 | 2231465 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS9309697 | CHR2 | 2740901 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
rs16865228 | CHR2 | 6629622 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
rs16865230 | CHR2 | 6630187 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS11691188 | CHR2 | 6631799 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
rs13011747 | CHR2 | 52263123 | FABP4 | 2167 | 3.675E-5 | 反式 | ||
RS17027385 | CHR2 | 60317432 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS17027670 | CHR2 | 60321553 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
rs17027920 | CHR2 | 60324501 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS17028210 | CHR2 | 60328684 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS4671677 | CHR2 | 65869039 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS2871926 | CHR2 | 69144459 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
rs6707577 | CHR2 | 76055701 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS1837425 | CHR2 | 77404111 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
rs2078524 | CHR2 | 80392208 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS12612468 | CHR2 | 81935991 | FABP4 | 2167 | 0.19 | 反式 | ||
RS17007441 | CHR2 | 123017806 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS17364261 | CHR2 | 123134434 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS17009403 | CHR2 | 123851176 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS11122994 | CHR2 | 124412552 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS2919747 | CHR2 | 129965275 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS10192459 | CHR2 | 152517978 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
RS1519647 | CHR2 | 154460585 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
RS10930700 | CHR2 | 176320078 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS10497695 | CHR2 | 189850693 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS12105340 | CHR2 | 189865656 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS17638935 | CHR2 | 206403038 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS16848675 | CHR2 | 21334996 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
RS1503380 | CHR2 | 214324200 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
rs10498007 | CHR2 | 214345141 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
rs16850416 | CHR2 | 214354139 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS1834768 | CHR2 | 214646680 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS6713877 | CHR2 | 227086813 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
rs6436607 | CHR2 | 227150909 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS7586700 | CHR2 | 237769742 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS7574988 | CHR2 | 237770124 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS10203144 | CHR2 | 238024758 | FABP4 | 2167 | 1.122E-4 | 反式 | ||
RS811272 | CHR3 | 3804554 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
snp_a-1972120 | 0 | FABP4 | 2167 | 0.07 | 反式 | |||
rs10510602 | CHR3 | 28023926 | FABP4 | 2167 | 9.741E-5 | 反式 | ||
rs12054294 | CHR3 | 28040721 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
rs6769309 | CHR3 | 40500750 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS241673 | CHR3 | 60544870 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS2682982 | CHR3 | 60545362 | FABP4 | 2167 | 1.183E-5 | 反式 | ||
RS2856045 | CHR3 | 60545428 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
SNP_A-2197110 | 0 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | |||
RS3796213 | CHR3 | 69157380 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | ||
RS6549186 | CHR3 | 69211954 | FABP4 | 2167 | 0.09 | 反式 | ||
RS9857064 | CHR3 | 72828820 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS7619888 | CHR3 | 72834445 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS2322853 | CHR3 | 73360854 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS9835654 | CHR3 | 73363696 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS9825654 | CHR3 | 73370743 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
rs4677259 | CHR3 | 73373870 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS7614346 | CHR3 | 119021528 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
RS2173764 | CHR3 | 122328752 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS1151560 | CHR3 | 144362589 | FABP4 | 2167 | 0.05 | 反式 | ||
RS10513250 | CHR3 | 144593246 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
rs6803324 | CHR3 | 148335029 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
RS12487278 | CHR3 | 155733885 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS12488777 | CHR3 | 166430948 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS7643415 | CHR3 | 188007131 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
RS2688497 | CHR3 | 195476084 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
rs16892270 | CHR4 | 15725866 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
RS6839686 | CHR4 | 21268010 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
RS6827600 | CHR4 | 33091458 | FABP4 | 2167 | 8.327E-4 | 反式 | ||
RS10517505 | CHR4 | 61345971 | FABP4 | 2167 | 6.507E-6 | 反式 | ||
RS986399 | CHR4 | 73579164 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS17000340 | CHR4 | 76135365 | FABP4 | 2167 | 4.158E-4 | 反式 | ||
rs17406380 | CHR4 | 78433285 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
RS931277 | CHR4 | 79263127 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
RS2126021 | CHR4 | 87120762 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
rs7676968 | CHR4 | 92725663 | FABP4 | 2167 | 1.802E-12 | 反式 | ||
RS4513527 | CHR4 | 92756952 | FABP4 | 2167 | 2.772E-5 | 反式 | ||
RS7683085 | CHR4 | 92763938 | FABP4 | 2167 | 2.772E-5 | 反式 | ||
RS17033461 | CHR4 | 104103810 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS17035917 | CHR4 | 106520741 | FABP4 | 2167 | 0.05 | 反式 | ||
RS17036076 | CHR4 | 106575268 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
RS17036090 | CHR4 | 106593573 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
RS17036156 | CHR4 | 106663233 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
rs11732298 | CHR4 | 106701678 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
SNP_A-1978461 | 0 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | |||
snp_a-2242962 | 0 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | |||
RS17040089 | CHR4 | 110143189 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
rs4834424 | CHR4 | 115553988 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
RS1492754 | CHR4 | 125421168 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
RS1492753 | CHR4 | 125421324 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
RS9995457 | CHR4 | 128299300 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS17051151 | CHR4 | 132081115 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS1005771 | CHR4 | 148267572 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS934142 | CHR4 | 148289527 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
RS6817192 | CHR4 | 148295317 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
RS17032180 | CHR4 | 155803663 | FABP4 | 2167 | 1.747E-4 | 反式 | ||
RS6816960 | CHR4 | 155837513 | FABP4 | 2167 | 1.747E-4 | 反式 | ||
RS17032301 | CHR4 | 155869255 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS1902499 | CHR4 | 155923709 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS2183142 | CHR4 | 159232695 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS6536498 | CHR4 | 161096469 | FABP4 | 2167 | 0.08 | 反式 | ||
RS17611747 | CHR4 | 169257324 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
rs4862035 | CHR4 | 179614997 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS6840589 | CHR4 | 182775311 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS4241849 | CHR4 | 188964612 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS30467 | CHR5 | 4986094 | FABP4 | 2167 | 0.1 | 反式 | ||
RS298572 | CHR5 | 17287777 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS10043237 | CHR5 | 24855148 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
RS638875 | CHR5 | 32532230 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
RS10076385 | CHR5 | 33681785 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
rs10080136 | CHR5 | 33683088 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS7720858 | CHR5 | 43419858 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
RS17627020 | CHR5 | 54167839 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS13179161 | CHR5 | 82973565 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS7735782 | CHR5 | 82980448 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
RS17284657 | CHR5 | 83006477 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
rs1500258 | CHR5 | 85746870 | FABP4 | 2167 | 0.06 | 反式 | ||
RS17331350 | CHR5 | 94091611 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
SNP_A-1904334 | 0 | FABP4 | 2167 | 0.09 | 反式 | |||
RS17156288 | CHR5 | 103556739 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
RS1155837 | CHR5 | 103580159 | FABP4 | 2167 | 0.17 | 反式 | ||
SNP_A-2086826 | 0 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | |||
rs246836 | CHR5 | 131459971 | FABP4 | 2167 | 0.07 | 反式 | ||
RS4326194 | CHR5 | 133786636 | FABP4 | 2167 | 2.46E-4 | 反式 | ||
RS10063177 | CHR5 | 145081194 | FABP4 | 2167 | 5.803E-4 | 反式 | ||
RS2434733 | CHR5 | 154431911 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS67777 | CHR5 | 169364816 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
RS2659183 | CHR5 | 173253605 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
rs4379216 | CHR5 | 177511275 | FABP4 | 2167 | 3.135E-4 | 反式 | ||
RS7740880 | CHR6 | 3848632 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS7758688 | CHR6 | 3848813 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS2274516 | CHR6 | 42932834 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
RS3777582 | CHR6 | 45914027 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
RS7766231 | CHR6 | 77290864 | FABP4 | 2167 | 0.03 | 反式 | ||
RS1454460 | CHR6 | 81380132 | FABP4 | 2167 | 0.01 | 反式 | ||
RS9294325 | CHR6 | 85767265 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS16880568 | CHR6 | 89152027 | FABP4 | 2167 | 3.023e-5 | 反式 | ||
RS211218 | CHR6 | 98978477 | FABP4 | 2167 | 0.07 | 反式 | ||
RS9388545 | CHR6 | 98979104 | FABP4 | 2167 | 0.07 | 反式 | ||
RS7758767 | CHR6 | 107860120 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
RS12190009 | CHR6 | 107865787 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
RS4946518 | CHR6 | 121174802 | FABP4 | 2167 | 0.07 | 反式 | ||
RS6916205 | CHR6 | 134378251 | FABP4 | 2167 | 0.14 | 反式 | ||
RS9497950 | CHR6 | 148493689 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS2281658 | CHR6 | 158094301 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
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rs6102879 | CHR20 | 41138766 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | ||
rs6063203 | CHR20 | 46684515 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
rs7272218 | CHR20 | 46759945 | FABP4 | 2167 | 0.09 | 反式 | ||
RS6099530 | CHR20 | 55863422 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS6092455 | CHR20 | 55881917 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | ||
RS1002324 | CHR20 | 55893550 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | ||
RS6099582 | CHR20 | 55940425 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | ||
RS7362421 | CHR20 | 55951039 | FABP4 | 2167 | 0.15 | 反式 | ||
RS8139244 | CHR22 | 27842206 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS16992377 | CHR22 | 33855382 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
RS5994767 | CHR22 | 33914823 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
RS6000401 | CHR22 | 37149335 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | ||
RS4822100 | CHR22 | 42682785 | FABP4 | 2167 | 0.05 | 反式 | ||
RS5765756 | 0 | FABP4 | 2167 | 0 | 反式 | |||
RS9628605 | CHR22 | 49110432 | FABP4 | 2167 | 0.04 | 反式 | ||
rs2337492 | CHR22 | 49112681 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
rs2337493 | CHR22 | 49112795 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
RS7286059 | CHR22 | 49145127 | FABP4 | 2167 | 0.18 | 反式 | ||
rs7888427 | Chrx | 47606898 | FABP4 | 2167 | 0.1 | 反式 | ||
rs2301864 | Chrx | 75394712 | FABP4 | 2167 | 2.756E-22 | 反式 | ||
rs11093623 | Chrx | 75406380 | FABP4 | 2167 | 2.756E-22 | 反式 | ||
RS2367716 | Chrx | 75410637 | FABP4 | 2167 | 7.425E-16 | 反式 | ||
rs7877504 | Chrx | 75443298 | FABP4 | 2167 | 2.756E-22 | 反式 | ||
RS1604728 | Chrx | 75563484 | FABP4 | 2167 | 2.756E-22 | 反式 | ||
RS7056756 | Chrx | 75641088 | FABP4 | 2167 | 2.756E-22 | 反式 | ||
RS7057091 | Chrx | 75641247 | FABP4 | 2167 | 2.756E-22 | 反式 | ||
RS12014980 | Chrx | 75654215 | FABP4 | 2167 | 1.257E-13 | 反式 | ||
RS4892433 | Chrx | 75676726 | FABP4 | 2167 | 2.476E-7 | 反式 | ||
RS6607729 | Chrx | 75719233 | FABP4 | 2167 | 2.835E-6 | 反式 | ||
rs5982228 | Chrx | 75901960 | FABP4 | 2167 | 2.835E-6 | 反式 | ||
rs5982233 | Chrx | 75911295 | FABP4 | 2167 | 1.1e-11 | 反式 | ||
RS7059710 | Chrx | 75917211 | FABP4 | 2167 | 1.547E-7 | 反式 | ||
RS7878182 | Chrx | 75926263 | FABP4 | 2167 | 2.874E-5 | 反式 | ||
rs5982248 | Chrx | 75928669 | FABP4 | 2167 | 2.196E-5 | 反式 | ||
RS2079184 | Chrx | 75938315 | FABP4 | 2167 | 1.547E-7 | 反式 | ||
RS234254 | Chrx | 75955780 | FABP4 | 2167 | 2.835E-6 | 反式 | ||
RS190169 | Chrx | 76135654 | FABP4 | 2167 | 1.71E-6 | 反式 | ||
RS232944 | Chrx | 76151286 | FABP4 | 2167 | 2.835E-6 | 反式 | ||
RS5909713 | Chrx | 119532315 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
RS7057148 | Chrx | 119534534 | FABP4 | 2167 | 0.12 | 反式 | ||
rs970665 | Chrx | 122445270 | FABP4 | 2167 | 2.403E-7 | 反式 | ||
RS1125816 | Chrx | 136346943 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
RS1413645 | Chrx | 136348410 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
RS6528444 | Chrx | 136354194 | FABP4 | 2167 | 0.16 | 反式 | ||
rs4825140 | Chrx | 141864364 | FABP4 | 2167 | 0.13 | 反式 | ||
RS6637217 | Chrx | 143443905 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 | ||
rs6634590 | Chrx | 143486048 | FABP4 | 2167 | 0.02 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FABP4_DE_GTEx.png)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
PGM2L1 | 0.92 | 0.95 |
CLASP2 | 0.91 | 0.93 |
SLC9A6 | 0.90 | 0.93 |
CNTN1 | 0.90 | 0.93 |
pafah1b1 | 0.89 | 0.92 |
STX12 | 0.88 | 0.90 |
PAK3 | 0.88 | 0.91 |
ywhaz | 0.88 | 0.91 |
克拉斯 | 0.87 | 0.90 |
aasdhppt | 0.87 | 0.91 |
Top 10 negatively co-expressed genes | ||
Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
EIF4EBP3 | -0.64 | -0.71 |
FXYD1 | -0.64 | -0.67 |
MT-CO2 | -0.61 | -0.67 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.60 | -0.64 |
SLC25A18 | -0.60 | -0.63 |
一个C021016.1 | -0.60 | -0.65 |
higd1b | -0.60 | -0.67 |
rom1 | -0.60 | -0.64 |
AF347015.2 | -0.60 | -0.65 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | # SZGR 2.0 genes in pathway | 信息 |
---|---|---|---|
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AP1 PATHWAY | 70 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME METABOLISM OF LIPIDS AND LIPOPROTEINS | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
白色脂肪细胞分化的Reactome转录调节 | 72 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组激素敏感脂肪酶HSL介导的三酰基甘油水解 | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome脂质消化和运输 | 46 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PARENT MTOR SIGNALING UP | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sengupta鼻咽癌,LMP1 UP | 408 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VECCHI GASTRIC CANCER EARLY DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SABATES COLORECTAL ADENOMA DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
G一个USSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS D UP | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche皮肤肿瘤启动子 | 142 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低 | 162 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DARWICHE PAPILLOMA RISK HIGH UP | 147 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DARWICHE SQUAMOUS CELL CARCINOMA UP | 146 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nuytten Nipp1靶向 | 769 | 437 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Buytaert光动力疗法应力DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bertucci侵入性癌导管与小叶DN | 46 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发6小时 | 176 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 12HR UP | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发和癌症Box4 | 11 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RICKMAN HEAD AND NECK CANCER C | 113 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q12 Q22 AMPLICON | 132 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼古斯基在乳腺癌中突变并扩增 | 94 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌ACOX1 UP | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER MYC E2F1 UP | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌电抗 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena Up | 60 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEE LIVER CANCER E2F1 UP | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LENAOUR DENDRITIC CELL MATURATION UP | 114 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴vs血液 | 131 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS脂肪细胞分化 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21 TARGETS 2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成5 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PAL PRMT5 TARGETS DN | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSENG IRS1 TARGETS DN | 135 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TSENG ADIPOGENIC POTENTIAL DN | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化的PPARG的LI脂肪生成 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
约瑟夫对丁酸钠的反应 | 31 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GERHOLD ADIPOGENESIS UP | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SUZUKI RESPONSE TO TSA | 22 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durchdewald皮肤致癌DN | 264 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KONDO EZH2 TARGETS | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ZHANG GATA6 TARGETS UP | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肺DN中的Smid乳腺癌复发 | 37 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID BREAST CANCER LUMINAL A UP | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SMID BREAST CANCER BASAL DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOQUEST STEM CELL CULTURED VS FRESH DN | 31 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2 CDC25A DN的射线肿瘤发生 | 159 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向 | 93 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Vav3前列腺致癌作用 | 89 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA2 DN | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAKAMURA ADIPOGENESIS LATE UP | 104 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang PPARG的经典成脂靶 | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
STEGER ADIPOGENESIS UP | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS UP | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND WITH H4K20ME1 MARK | 145 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vernochet脂肪形成 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过p38完成的phong TNF响应 | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DURAND STROMA S UP | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |