基因页：FABP5

概括?
基因ID 2171
Symbol FABP5
同义词 e-fabp | efabp | kfabp | pa-fabp | pafabp
描述 fatty acid binding protein 5
参考 MIM：605168|HGNC：HGNC：3560|Ensembl:ENSG00000164687|HPRD:05524|Vega：Otthumg00000134313
基因type protein-coding
地图位置 8Q21.13
Pascal P值 0.628
Fetal beta 1.468
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2Cdb.humanNRC
G2Cdb.humanPSD
G2Cdb.humanPSP

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
CV：GWASDB 全基因组关联研究 gwasdbrecords for schizophrenia
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
Expression 基因表达的荟萃分析 Pvalue: 1.762
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.0044

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs4256179 chr3 169628328 FABP5 2171 0.14 trans
rs9870311 chr3 169641061 FABP5 2171 0.14 trans
rs10513763 chr3 179386743 FABP5 2171 0.19 trans
rs17109578 chr10 90351347 FABP5 2171 0.11 trans
rs11833888 chr12 59350152 FABP5 2171 0 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
SETD2 0.96 0.97
CHD2 0.96 0.97
spen 0.95 0.96
SMG1 0.95 0.96
AKAP9 0.95 0.96
NIPBL 0.95 0.96
BIRC6 0.95 0.95
SETD5 0.95 0.96
UBR5 0.95 0.95
TAF1 0.94 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.31 -0.70 -0.85
MT-CO2 -0.68 -0.83
IFI27 -0.68 -0.82
FXYD1 -0.67 -0.81
AF347015.27 -0.67 -0.79
higd1b -0.67 -0.85
TSC22D4 -0.67 -0.75
AIFM3 -0.66 -0.71
HLA-F -0.66 -0.70
RAMP1 -0.66 -0.76

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005504 fatty acid binding 塔斯 8092987
GO:0005515 protein binding IPI 12839573
GO:0005215 transporter activity IEA -
Biological process GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0008544 表皮发展 塔斯 1512466
去：0006810 transport IEA -
GO:0006629 lipid metabolic process 塔斯 8092987
细胞分量 GO term Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005737 细胞质 塔斯 16130169

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
KEGG PPAR SIGNALING PATHWAY 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA PROGENITOR DN 66 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU VMYB TARGETS UP 127 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NEWMAN ERCC6 TARGETS UP 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1 INFECTION UP 27 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCIBETTA KDM5B TARGETS DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL UP 316 190 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM CML DIVIDING VS NORMAL QUIESCENT UP 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM NORMAL QUIESCENT VS NORMAL DIVIDING DN 87 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌DN 232 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌群集1 121 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 3 DN 229 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马良性皮肤肿瘤向上 18 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肺癌 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS BASAL 330 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER BASAL VS LULMINAL 330 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶标和血清反应DN 47 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA ERCC3 ALLELE XPCS VS TTD DN 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIEN BREAST CARCINOMA METAPLASTIC VS DUCTAL UP 83 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
杨乳腺癌ESR1 DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM3 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC NETWORK 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO METASTASIS 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOUYER TATI TARGETS DN 17 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤分化了井和DN不良 382 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
pasqualucci淋巴瘤通过GC阶段 283 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SUNG METASTASIS STROMA UP 110 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIKOLSKY BREAST CANCER 8Q12 Q22 AMPLICON 132 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH HEMATOPOIESIS STEM CELL AND BRAIN QTL TRANS 185 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok up 87 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHUHMACHER MYC TARGETS UP 80 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SANA RESPONSE TO IFNG DN 85 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG GLUCOSE DEPRIVATION DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLLER MYC TARGETS UP 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHATTACHARYA EMBRYONIC STEM CELL 89 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟 114 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG TARGETS OF MLL CBP FUSION DN 45 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HESS TARGETS OF HOXA9 AND MEIS1 UP 65 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS ADIPOCYTE DIFFERENTIATION UP 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化新皮层DN 80 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN RESPONSE TO TROGLITAZONE UP 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE CALORIE RESTRICTION NEOCORTEX UP 83 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mody海马新生儿 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RUAN对TNF DN的反应 84 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE CALORIE RESTRICTION MUSCLE UP 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对Cantharidin DN的反应 69 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEDENFALK BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 163 113 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kayo卡路里限制肌肉 95 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GERHOLD ADIPOGENESIS UP 49 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein少突胶质细胞 74 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG GATA6 TARGETS DN 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION UP 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FUJII YBX1 TARGETS DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌萧述三腔的DN 564 326 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHUNG BLISTER CYTOTOXICITY UP 134 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRADE COLON CANCER UP 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LABBE WNT3A TARGETS UP 112 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移模型DN 43 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HUPER BREAST BASAL VS LUMINAL UP 54 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINTER HYPOXIA METAGENE 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee Liver Cancer生存DN 175 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G123 UP 45 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAMASHITA LIVER CANCER STEM CELL DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FONTAINE FOLLICULAR THYROID ADENOMA DN 68 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MESOTHELIOMA SURVIVAL UP 11 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOBAYASHI EGFR SIGNALING 24HR DN 251 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOYLAN MULTIPLE MYELOMA PCA3 UP 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD2 DN 46 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 16 79 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NOUSHMEHR GBM SILENCED BY METHYLATION 50 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTENS TRETINOIN RESPONSE DN 841 431 该途径中的所有SZGR 2.0基因
国外RB1目标GROWING 243 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang PPARG的经典成脂靶 26 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHYLA CBFA2T3 TARGETS UP 387 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FOSTER KDM1A TARGETS UP 266 142 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY STEM CELL UP 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIM MAMMARY LUMINAL MATURE DN 99 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 6HR 85 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU CELL CYCLE GENES IN IR RESPONSE 24HR 128 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因