基因页:FABP6
概括?
基因 | 2172 |
象征 | FABP6 |
同义词 | i-15p | i-babp | i-balb | i-bap | ilbp | ilbp3 | illbp |
描述 | 脂肪酸结合蛋白6 |
参考 | MIM:600422|HGNC:HGNC:3561|ENSEMBL:ENSG00000170231|HPRD:02689|Vega:Otthumg00000130329 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q33.3-Q34 |
Pascal P值 | 0.221 |
Sherlock P值 | 0.026 |
胎儿β | -0.903 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01718 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00459 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS962101 | CHR5 | 160353230 | FABP6 | 2172 | 0.04 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FABP6_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SMC4 | 0.82 | 0.59 |
sgol2 | 0.82 | 0.63 |
C14orf106 | 0.82 | 0.65 |
RTKN2 | 0.82 | 0.56 |
KIF11 | 0.82 | 0.63 |
SMC2 | 0.82 | 0.70 |
ECT2 | 0.82 | 0.62 |
atad2 | 0.82 | 0.62 |
Brip1 | 0.82 | 0.60 |
MCM8 | 0.81 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CXCL14 | -0.41 | -0.60 |
ifi27 | -0.41 | -0.59 |
pth1r | -0.41 | -0.54 |
CST3 | -0.41 | -0.59 |
MT-CO2 | -0.40 | -0.55 |
AF347015.31 | -0.40 | -0.54 |
AC011427.1 | -0.39 | -0.51 |
AIFM3 | -0.38 | -0.50 |
mt-cyb | -0.38 | -0.53 |
FXYD1 | -0.38 | -0.55 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
去:0008289 | 脂质结合 | IEA | - | |
去:0008289 | 脂质结合 | 塔斯 | 7588781 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | 塔斯 | 9250612 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
去:0006629 | 脂质代谢过程 | nas | 9250612 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 7588781 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 | 27 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cdx2靶向 | 36 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肺癌分化标记 | 14 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kobayashi对romidepsin的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌 | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yokoe Cancer testis抗原 | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过KDM3A的Krieg缺氧 | 53 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |