概括
基因 2172
象征 FABP6
同义词 i-15p | i-babp | i-balb | i-bap | ilbp | ilbp3 | illbp
描述 脂肪酸结合蛋白6
参考 MIM:600422|HGNC:HGNC:3561|ENSEMBL:ENSG00000170231|HPRD:02689|Vega:Otthumg00000130329
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q33.3-Q34
Pascal P值 0.221
Sherlock P值 0.026
胎儿β -0.903
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00459

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS962101 CHR5 160353230 FABP6 2172 0.04 顺式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SMC4 0.82 0.59
sgol2 0.82 0.63
C14orf106 0.82 0.65
RTKN2 0.82 0.56
KIF11 0.82 0.63
SMC2 0.82 0.70
ECT2 0.82 0.62
atad2 0.82 0.62
Brip1 0.82 0.60
MCM8 0.81 0.69
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CXCL14 -0.41 -0.60
ifi27 -0.41 -0.59
pth1r -0.41 -0.54
CST3 -0.41 -0.59
MT-CO2 -0.40 -0.55
AF347015.31 -0.40 -0.54
AC011427.1 -0.39 -0.51
AIFM3 -0.38 -0.50
mt-cyb -0.38 -0.53
FXYD1 -0.38 -0.55

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
去:0008289 脂质结合 IEA -
去:0008289 脂质结合 塔斯 7588781
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 塔斯 9250612
去:0006810 运输 IEA -
去:0006629 脂质代谢过程 nas 9250612
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 塔斯 7588781

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg ppar信号通路 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 27 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
sabates结直肠腺瘤 141 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cdx2靶向 36 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肺癌分化标记 14 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kobayashi对romidepsin的反应 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼头颈癌 100 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yokoe Cancer testis抗原 38 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过KDM3A的Krieg缺氧 53 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因