SZGR2 - Beplay体育中心

概括？

基因ID	2185
Symbol	ptk2b
同义词	CadtK\|CAKB\|FADK2\|FAK2\|PKB\|PTK\|PYK2\|RAFTK
描述	蛋白酪氨酸激酶2β
参考	MIM：601212\|HGNC:HGNC:9612\|Ensembl：ENSG00000120899\|HPRD：03131\|Vega：Otthumg00000102082
基因类型	蛋白质编码
地图位置	8p21.1
Pascal p-value	0.003
Sherlock P值	0.278
t一个DA p-value	0.018
胎儿β	-1.84
DMG	2(# studies)
支持	G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.humanNRC G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP COMPOSITESET Darnell FMRP targets 潜在的突触基因

数据源中的基因

基因集名称	基因组方法	描述	信息
CV:PGCnp	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG：JAFFE_2016	全基因组DNA甲基化分析	this dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	2
DMG：Wockner_2014	全基因组DNA甲基化分析	该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。	2
DNM：Fromer_2014	Whole Exome Sequencing analysis	这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。
DNM：McCarthy_2014	Whole Exome Sequencing analysis	57个三重奏的整个外显子组测序，具有零星或家族性精神分裂症。
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I	基因组扫描荟萃分析	PSR：0.031
gsma_iie	基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品）	Psr: 0.00057
GSMA_IIA	基因组扫描荟萃分析(All samples)	PSR：0.03086
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	点击显示详细信息
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	Contribution to shortest path in PPI network: 0.5281

第一节遗传学和表观遗传学注释

DNM表

基因	染色体	位置	参考	一个lt	成绩单	一个一个change	Mutation type	Sift	CG46	特征	学习
ptk2b	CHR8	27308409	C	t	NM_173175	p.S786S	同义SNV			精神分裂症	DNM：McCarthy_2014
ptk2b	CHR8	27288396	一个	G	NM_004103 NM_004103 NM_173174 NM_173174 NM_173175 NM_173175 NM_173176 NM_173176	。 p.225K>E 。 p.225K>E 。 p.225K>E 。 p.225K>E	拼接错过拼接错过拼接错过拼接错过			精神分裂症	DNM：Fromer_2014

Differentially methylated gene

探测	染色体	位置	Nearest gene	p（dis）	beta（dis）	fdr（dis）	学习
CG18234130	8	27182889	ptk2b	5.772E-4	0.628	0.049	DMG：Wockner_2014
CG23725592	8	27169067	ptk2b	1.14E-9	-0.015	1.25E-6	DMG：JAFFE_2016

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

top co-expressed genes in brain regions

top 10 positively co-expressed genes
基因	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
NID2	0.84	0.77
NID1	0.81	0.68
LAMC1	0.78	0.71
COL6A3	0.77	0.43
FN1	0.77	0.69
羊羔1	0.77	0.73
Col1a2	0.76	0.52
Col4a1	0.76	0.60
SLC26A2	0.75	0.64
loxl2	0.75	0.65

top 10 negatively co-expressed genes
基因	Pearson's Correlation	Spearman's Correlation
AF347015.31	-0.49	-0.56
AF347015.21	-0.48	-0.59
MT-CO2	-0.48	-0.55
AF347015.27	-0.46	-0.50
FXYD1	-0.45	-0.47
IFI27	-0.45	-0.46
增强	-0.45	-0.55
AF347015.8	-0.45	-0.51
AF347015.33	-0.45	-0.47
higd1b	-0.45	-0.50

第三节。基因本体论注释

Molecular function	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0000166	核苷酸结合	IEA		-
去：0004871	信号传感器活性	nas		10867021
去：0005515	蛋白质结合	IPI		9020138
去：0005524	一个tP binding	IEA		-
去：0004715	非膜跨度蛋白酪氨酸激酶活性	塔斯		8497321
GO：0016740	transferase activity	IEA		-
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
GO:0007172	信号复合物组件	塔斯		7529876
GO:0006461	蛋白质复合物组件	塔斯		10867021
GO:0006468	蛋白氨基酸磷酸化	塔斯		7529876
去：0006950	对压力的反应	塔斯		8939945
GO:0007165	signal transduction	塔斯		7499242\|10867021
去：0008284	positive regulation of cell proliferation	塔斯		10867021
去：0006915	apoptosis	塔斯		10880513
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005856	细胞骨架	IEA		-
去：0005737	细胞质	塔斯		7499242
去：0005925	局灶性粘附	IEA		-
去：0005886	plasma membrane	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	别名b	官方全名b	实验	资源	PubMed ID
ASAP2	Amap2 \|Centb3 \|ddef2 \|FLJ42910 \|KIAA0400 \|pag3 \|PAP \|pap-alpha \|shag1	一个rfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2	-	HPRD，Biogrid	10022920
BCAR1	cas \|cas1 \|Cass1 \|crkas \|P130CAS	breast cancer anti-estrogen resistance 1	-	HPRD，Biogrid	8995252
CBL	C-CBL \| CBL2 \| RNF55	Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence	-	HPRD，Biogrid	11149930
CCR5	CC-CKR-5 \|CCCKR5 \|CD195 \|CKR-5 \|CKR5 \|CMKBR5	chemokine (C-C motif) receptor 5	-	HPRD	9446638
CD2AP	CMS \|DKFZP586H0519	CD2-associated protein	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	15128873
CRK	crkii	v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)	-	HPRD	10329689
DCC	CRC18 \|CRCR1	deleted in colorectal carcinoma	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	15494733
DLG3	KIAA1232 \|MRX \|MRX90 \|NE-DLG \|nedlg \|SAP102	圆盘，大型同源物3（果蝇神经内分泌-DLG，果蝇）	-	HPRD，Biogrid	12576483
DLG4	FLJ97752 \| FLJ98574 \| PSD95 \| SAP90	圆盘，大型同源物4（果蝇）	-	HPRD，Biogrid	12576483
EFS	cas3 \|Cass3 \|EFS1 \|EFS2 \|hefs \|罪	胚胎FYN相关的底物	-	HPRD	9750131
egfr	ERBB \|ERBB1 \|her1 \|PIG61 \|梅纳	表皮生长因子受体（红细胞性白血病病毒（V-ERB-B）癌基因同源物，鸟类）	-	HPRD，Biogrid	10777553
ERBB2	CD340 \| HER-2 \| HER-2/neu \| HER2 \| NEU \| NGL \| TKR1	V-ERB-B2红细胞白血病病毒性癌基因同源2，神经/胶质母细胞瘤衍生的癌基因同源物（Avian）	-	HPRD，Biogrid	10713673
ewsr1	EWS	尤因肉瘤断裂点区域1	-	HPRD，Biogrid	10322114
FYN	MGC45350 \|SLK \|syn	Fyn Oncogene与SRC，FGR，是的	-	HPRD，Biogrid	9091579\|9104812 \|10867021
GIT1	-	G蛋白偶联受体激酶相互作用ARFGAP 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	12629171
GNA13	G13 \|MGC46138	鸟嘌呤核苷酸结合蛋白（G蛋白），α13	-	HPRD，Biogrid	10821841
GRB2	灰\| EGFRBP-GRB2 \| Grb3-3 \| MST084 \|女士tP084	growth factor receptor-bound protein 2	-	HPRD，Biogrid	10329689\|10354709
grin2a	nmdar2a \|NR2A	谷氨酸受体，离子型，N-甲基D-天冬氨酸2A	-	HPRD，Biogrid	11478920
GSN	DKFZP313L0718	gelsolin (amyloidosis, Finnish type)	-	HPRD，Biogrid	12578912
IL7R	CD127 \|CDW127 \|IL-7R-Alpha \|IL7RA \|伊拉	白介素7受体	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	10702271
ITGB2	CD18 \|小伙子\|lcamb \|LFA-1 \|Mac-1 \|MF17 \|MFI7	整合素，β2（补体组件3受体3和4亚基）	-	HPRD，Biogrid	10961871
ITGB3	CD61 \|gp3a \|GPIIIA	整合素，β3（血小板糖蛋白IIIA，抗原CD61）	-	HPRD，Biogrid	11683411
JAK1	JAK1一个\|JAK1B \| JTK3	Janus kinase 1 (a protein tyrosine kinase)	-	HPRD，Biogrid	10702271
JAK2	JTK10	Janus kinase 2 (a protein tyrosine kinase)	-	HPRD，Biogrid	11818507
JAK3	JAK-3 \| JAK3_HUMAN \| JAKL \| L-JAK \| LJAK	Janus激酶3（蛋白质酪氨酸激酶，白细胞）	-	HPRD，Biogrid	9512511
KCNA2	HBK5 \|HK4 \|Hukiv \|KV1.2 \|MGC50217 \|Mk2 \|ngk1 \|RBK2	potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2	-	HPRD，Biogrid	11739373
LCK	YT16 \| p56lck \| pp58lck	lymphocyte-specific protein tyrosine kinase	-	HPRD，Biogrid	9091579
LPXN	LDPL	Leupaxin	-	HPRD，Biogrid	9565592
林恩	FLJ26625 \| JTK8	V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物	-	HPRD，Biogrid	11311138
matk	CHK \|CTK \|DKFZP434N1212 \|hhyltk \|hyl \|hyltk \|LSK \|MGC1708 \|MGC2101	巨核细胞相关的酪氨酸激酶	-	HPRD	12063569
MCAM	CD146 \| MUC18	melanoma cell adhesion molecule	-	HPRD	11036077
NEDD9	CAS-L \|cas2 \|卡斯尔\|Cass2 \|hef1 \|DJ49G10.2 \|DJ761I2.1	神经前体细胞表达，发育下调9	-	HPRD，Biogrid	9020138
NPHP1	FLJ97602 \|JBTS4 \|nph1 \|SLSN1	肾植物1（少年）	-	HPRD，Biogrid	11493697
PIK3R1	grb1 \|P85 \|p85-alpha	磷酸肌醇3-激酶，调节亚基1（alpha）	-	HPRD	10797305
PITPNM1	DRES9 \| FLJ44997 \| NIR2 \| PITPNM \| RDGB \| RDGB1 \| RDGBA \| RDGBA1 \| Rd9	phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 1	-	HPRD，Biogrid	10022914
PITPNM2	KIAA1457 \|NIR3 \|RDGB2 \|rdgba2	phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 2	-	HPRD，Biogrid	10022914
PITPNM3	CORD5 \| MGC157740 \| MGC157741 \| NIR1 \| RDGBA3	PITPNM家庭成员3	-	HPRD，Biogrid	10022914
prkcd	May1 \|MGC49908 \|PKCD \|npkc-delta	protein kinase C, delta	-	HPRD，Biogrid	11352632
ptk2b	Cadtk \|cakb \|fadk2 \|fak2 \|frnk \|PKB \|PTK \|pyk2 \|筏	PTK2B蛋白酪氨酸激酶2β	生化活动	Biogrid	9512511
PTPN11	BPTP3 \| CFC \| MGC14433 \| NS1 \| PTP-1D \| PTP2C \| SH-PTP2 \| SH-PTP3 \| SHP2	蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体11型	-	HPRD，Biogrid	10880513
PTPN12	ptp-pest \|PTPG1	蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体12型	-	HPRD，Biogrid	11337490
PTPN6	HCP \|HCPH \|HPTP1C \|PTP-1C \|SH-PTP1 \|SHP-1 \|SHP-1L \|SHP1	protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6	-	HPRD，Biogrid	10521452\|10747947
PXN	FLJ16691	paxillin	-	HPRD，Biogrid	9099734
rasa1	CM-AVM \| CMAVM \| DKFZp434N071 \| GAP \| PKWS \| RASA \| RASGAP \| p120GAP \| p120RASGAP	RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1	-	HPRD，Biogrid	8798684\|10708762 \|10713673
rb1cc1	CC1 \| DRAGOU14 \| FIP200	RB1-inducible coiled-coil 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩表型抑制重构的复合物两个杂交	Biogrid	10769033
SHC1	FLJ26504 \| SHC \| SHCA	SHC（SRC同源性2结构域）转化蛋白1	-	HPRD	7544443
SLC2A1	DYT17 \| DYT18 \| GLUT \| GLUT1 \| MGC141895 \| MGC141896 \| PED	solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1	-	HPRD，Biogrid	11007796
SORBS1	上限\|DKFZP451C066 \|DKFZP586P1422 \|flaf2 \|FLJ12406 \|KIAA1296 \|R85FL \|SH3D5 \|SH3P12 \|Sorb1	sorbin and SH3 domain containing 1	亲和力捕获 - 韦斯特恩	Biogrid	15128873
SORBS2	argbp2 \|FLJ93447 \|KIAA0777 \|Pro0618	sorbin and SH3 domain containing 2	ARGBP2与PYK2相互作用。	绑定	15128873
SORBS2	argbp2 \|FLJ93447 \|KIAA0777 \|Pro0618	sorbin and SH3 domain containing 2	-	HPRD，Biogrid	15128873
SRC	ASV \|src1 \|C-SRC \|P60-SRC	v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian)	-	HPRD	8849729\|10777553
SRC	ASV \|src1 \|C-SRC \|P60-SRC	v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian)	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物	Biogrid	8849729\|10521452 \|10777553
SYK	DKFZp313N1010 \| FLJ25043 \| FLJ37489	脾酪氨酸激酶	-	HPRD，Biogrid	10747947
TGFB1I1	ARA55 \|HIC-5 \|Hic5 \|TSC-5	转化生长因子β1诱导的转录本1	-	HPRD	9422762\|11856738
TGFB1I1	ARA55 \|HIC-5 \|Hic5 \|TSC-5	转化生长因子β1诱导的转录本1	亲和力捕获 - 韦斯特恩重构的复合物两个杂交	Biogrid	9422762\|9858471 \|11856738
tLN1	ILWEQ \| KIAA1027 \| TLN	塔林1	-	HPRD，Biogrid	9442086
VAV1	VAV	vav 1 guanine nucleotide exchange factor	-	HPRD，Biogrid	10867021
ZAP70	FLJ17670 \|FLJ17679 \|SRK \|std \|tzk \|ZAP-70	Zeta链（TCR）相关蛋白激酶70KDA	-	HPRD	10867021

V.途径注释

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
kegg钙信号通路	178	134	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG趋化因子信号传导途径	190	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NATURAL KILLER CELL MEDIATED CYTOTOXICITY	137	92	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG LEUKOCYTE TRANSENDOTHELIAL MIGRATION	118	78	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg gnRH信号通路	101	77	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta AT1R途径	36	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物卡丁生物肽途径	45	35	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CXCR4途径	24	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IL7途径	17	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Pyk2途径	31	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CCR5途径	20	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA NKCELLS PATHWAY	20	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA ACH PATHWAY	16	13	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta遇到了途径	37	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BIOCARTA PAR1 PATHWAY	37	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA PTEN途径	17	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ENDOTHELIN PATHWAY	63	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID溶物磷脂途径	66	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AR PATHWAY	61	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 OPN途径	31	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IL2 1 Pathway	55	43	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CXCR4途径	102	78	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3 INTEGRIN PATHWAY	75	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID VEGFR1 2 PATHWAY	69	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PIDα突触核蛋白途径	33	25	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID FGF途径	55	37	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID整合素A4B1途径	33	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome细胞通信	120	77	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ILS的Reactome信号传导	107	86	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SIGNAL REGULATORY PROTEIN SIRP FAMILY INTERACTIONS	12	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME IL 2 SIGNALING	41	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome免疫系统	933	616	该途径中的所有SZGR 2.0基因
免疫系统中的反应组细胞因子信号传导	270	204	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 UP	380	236	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP	418	263	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN	161	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP	197	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向	169	127	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应	134	93	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIRMEIER LMP1 RESPONSE EARLY	66	48	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS DN	261	155	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除	195	138	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MORI PRE BI LYMPHOCYTE DN	77	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN	160	110	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE UP	203	130	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HALMOS CEBPA目标	52	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟DN	128	90	该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU RESPONSE TO TRETINOIN UP	16	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basso CD40信号向上	101	76	该途径中的所有SZGR 2.0基因
莫迪海马后产后	63	50	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN	1237	837	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时的反应	953	554	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat的反应24小时	783	442	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定	491	310	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3 t淋巴细胞DN中的靶标	37	29	该途径中的所有SZGR 2.0基因
G一个ZIN EPIGENETIC SILENCING BY KRAS	26	16	该途径中的所有SZGR 2.0基因
一个MUNDSON POOR SURVIVAL AFTER GAMMA RADIATION 2G	171	96	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生	104	57	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Firestein CTNNB1途径	33	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络	1210	725	该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 8	49	36	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 30MIN UP	56	38	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up	548	370	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP	745	475	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PLASARI TGFB1 TARGETS 10HR UP	199	143	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 1 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF	516	308	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family	target position			mirna id	mirna seq
miRNA family	UTR开始	UTR结束	匹配方法	mirna id	mirna seq
miR-19	124	130	M8	HSA-MIR-19A	UGUGCAAAUCUAUGCAAAACUGA
miR-19	124	130	M8	HSA-MIR-19B	ugugcaaauccaugcaaaacuga
miR-23	515	521	M8	HSA-MIR-23A^脑	aucacauugccagggauucc
miR-23	515	521	M8	HSA-MIR-23B^脑	一个UCACAUUGCCAGGGAUUACC
mir-323	514	521	1A，M8	HSA-MIR-323^脑	GC一个C一个UUACACGGUCGACCUCU

SZ：在精神分裂症患者的脑皮质中差异表达的miRNA与使用微阵列进行对照样品进行比较。点击这里查看与SZ相关的miRNA列表。
Brain: miRNAs which are expressed in brain based on miRNA microarray expression studies. Click这里查看与大脑相关的miRNA列表。

基因Page:ptk2b