概括
基因 219287
象征 amer2
同义词 FAM123A
描述 APC膜募集蛋白2
参考 MIM:614659|HGNC:HGNC:26360|ENSEMBL:ENSG00000165566|HPRD:08067|Vega:Otthumg0000000016602
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12.13
Pascal P值 0.165
DEG P值 DEG:ZHAO_2015:P = 5.38E-06:Q = 0.0257

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Zhao_2015 RNA测序分析 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17142759 Chr10 7581464 FAM123A 219287 0.19 反式
RS11076856 CHR16 4949814 FAM123A 219287 0.01 反式
RS6098023 CHR20 53113740 FAM123A 219287 0.02 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 789 795 1a HSA-MIR-125B ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A ucccugagacccuuaaccugug
mir-128 527 533 M8 HSA-MIR-128A ucacagugaaccggucuuuu
HSA-MIR-128B ucacagugaaccggucuuc
mir-140 57 63 M8 HSA-MIR-140 agugguuuuacccuaugguag
mir-153 631 637 1a HSA-MIR-153 Uugcauagucacaaaaguga
mir-448 630 637 1A,M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-544 327 334 1A,M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu