基因页:Fasn
概括?
基因 | 2194 |
象征 | Fasn |
同义词 | FAS | OA-519 | SDR27X1 |
描述 | 脂肪酸合酶 |
参考 | MIM:600212|HGNC:HGNC:3594|Ensembl:ENSG00000169710|HPRD:02567|Vega:Otthumg00000178527 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q25 |
Pascal P值 | 0.025 |
胎儿β | 0.906 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | 细胞代谢 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG03386722 | 17 | 80056517 | Fasn | 3.37E-8 | -0.016 | 1.01E-5 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16920533 | CHR12 | 33180150 | Fasn | 2194 | 0.07 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FASN_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
FPR1 | 0.87 | 0.68 |
VSIG4 | 0.85 | 0.70 |
trem2 | 0.78 | 0.67 |
HCK | 0.78 | 0.60 |
serpina1 | 0.78 | 0.58 |
FOLR2 | 0.76 | 0.64 |
FCGR3A | 0.74 | 0.59 |
SIGLEC10 | 0.73 | 0.54 |
SAMSN1 | 0.73 | 0.63 |
SLC7A7 | 0.72 | 0.57 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
黑手党 | -0.31 | -0.39 |
SSPO | -0.27 | -0.32 |
MUC5B | -0.26 | -0.31 |
PNPLA7 | -0.24 | -0.29 |
GPR79 | -0.24 | -0.33 |
AL031587.2 | -0.24 | -0.31 |
PPP1R13L | -0.23 | -0.25 |
AC016705.1 | -0.23 | -0.30 |
AC012366.1 | -0.23 | -0.26 |
ERVWE1 | -0.22 | -0.32 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Chrebp2途径 | 42 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID P73Pathway | 79 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Delta NP63途径 | 47 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Vitamin B5泛肽代谢 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维生素和辅因子的反应组代谢 | 51 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组甘油三酸酯的生物合成 | 38 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Fatty Acyl COA生物合成 | 18 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组脂肪酸三酰甘油和酮体代谢 | 168 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多恩乳腺癌课程 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Horiuchi WTAP目标DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno岩石信号不是通过Rhoa DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
受甲基化DN调节的Missiaglia | 122 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
悍马皮肤癌进度DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与腔内 | 326 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌根源与基础 | 330 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌基础与仙女 | 330 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
农民乳腺癌簇7 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meinhold卵巢癌低级DN | 20 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dirmeier LMP1响应迟到 | 57 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wood EBV EBNA1靶向 | 110 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
仅通过ELK3 DN的缺氧总缺氧 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath MYC带Ebox的目标 | 230 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Peng Leucine剥夺DN | 187 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UEDA PERIFERAL CHICK | 169 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MANALO缺氧DN | 289 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast DN | 309 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schuhmacher MYC的目标 | 80 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素反应dn | 245 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭谷氨酰胺剥夺DN | 337 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MLL AF9融合的Kumar目标 | 405 | 264 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
怀特塞德顺铂耐药性 | 11 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF Troglitazone DN的反应 | 42 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mody海马新生儿 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
RUAN对TNF DN的反应 | 84 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Calorie限制肌肉 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血细胞和祖细胞 | 681 | 420 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramaswamy转移 | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江缺氧正常 | 311 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化的PPARG的LI脂肪生成 | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克道尔急性肺损伤DN | 48 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI对FSH的响应 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成 | 49 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤DN相邻 | 354 | 216 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌克拉斯 | 491 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zhan多发性骨髓瘤CD2 DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dang myc的目标 | 143 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村脂肪形成晚期 | 104 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dasu IL6信号向上 | 59 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763 DN的响应 | 374 | 217 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 UP | 140 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kasler HDAC7靶向1个 | 194 | 133 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍顿SREBF目标 | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |